MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Escherichia coli KO11FL chromosome

Total Repeats: 70289

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016902	CCG	2	6	41	46	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378710837
2	NC_016902	GCA	2	6	63	68	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378710837
3	NC_016902	TAA	2	6	213	218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378710837
4	NC_016902	TGC	2	6	369	374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378710837
5	NC_016902	TCG	2	6	467	472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378710837
6	NC_016902	GGC	2	6	501	506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378710837
7	NC_016902	GTT	2	6	546	551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378710837
8	NC_016902	GGC	2	6	559	564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378710837
9	NC_016902	CTG	2	6	586	591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378710837
10	NC_016902	AAC	2	6	691	696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378710837
11	NC_016902	CTA	2	6	717	722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378710837
12	NC_016902	CTG	2	6	739	744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378710837
13	NC_016902	CGA	2	6	747	752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378710837
14	NC_016902	TAA	2	6	768	773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378710837
15	NC_016902	CTG	2	6	814	819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378710837
16	NC_016902	TGA	2	6	962	967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378710837
17	NC_016902	CGA	2	6	975	980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378710837
18	NC_016902	AGA	2	6	1184	1189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378710837
19	NC_016902	TAC	2	6	1201	1206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378710837
20	NC_016902	TGG	2	6	1332	1337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378710837
21	NC_016902	ACG	2	6	1348	1353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378710837
22	NC_016902	AGA	2	6	1410	1415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378710837
23	NC_016902	TTA	2	6	1481	1486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378710838
24	NC_016902	ACA	2	6	1495	1500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378710838
25	NC_016902	GGT	2	6	1517	1522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378710838
26	NC_016902	CTG	2	6	1550	1555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378710838
27	NC_016902	TGG	2	6	1611	1616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378710838
28	NC_016902	CGA	2	6	1653	1658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378710838
29	NC_016902	GCG	2	6	1790	1795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378710838
30	NC_016902	GAA	2	6	1946	1951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378710838
31	NC_016902	CGG	2	6	2077	2082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378710838
32	NC_016902	GCA	2	6	2109	2114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378710838
33	NC_016902	TGG	2	6	2160	2165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378710838
34	NC_016902	CCG	2	6	2185	2190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378710838
35	NC_016902	GAA	2	6	2200	2205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378710838
36	NC_016902	CAA	2	6	2335	2340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378710838
37	NC_016902	GAA	2	6	2351	2356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378710838
38	NC_016902	ATG	2	6	2465	2470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378710838
39	NC_016902	TGT	2	6	2530	2535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378710838
40	NC_016902	TTG	2	6	2569	2574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378710839
41	NC_016902	AGG	2	6	2747	2752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378710839
42	NC_016902	CGG	2	6	2931	2936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378710839
43	NC_016902	AGA	2	6	2947	2952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378710839
44	NC_016902	AGC	2	6	3029	3034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378710839
45	NC_016902	GCG	2	6	3040	3045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378710839
46	NC_016902	GAT	2	6	3457	3462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378710839
47	NC_016902	TGA	3	9	3477	3485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378710839
48	NC_016902	GCT	2	6	3495	3500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378710839
49	NC_016902	CTC	2	6	3673	3678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378710840
50	NC_016902	CAC	2	6	3764	3769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378710840
51	NC_016902	GGT	2	6	3781	3786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378710840
52	NC_016902	CGA	2	6	3799	3804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378710840
53	NC_016902	CGG	3	9	3921	3929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378710840
54	NC_016902	CGG	2	6	3991	3996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378710840
55	NC_016902	GTA	2	6	4019	4024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378710840
56	NC_016902	AGA	2	6	4291	4296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378710840
57	NC_016902	GGC	2	6	4313	4318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378710840
58	NC_016902	TCT	2	6	4374	4379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378710840
59	NC_016902	CAA	2	6	4465	4470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378710840
60	NC_016902	GGT	2	6	4487	4492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378710840
61	NC_016902	AAG	2	6	4551	4556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378710840
62	NC_016902	TCC	2	6	4652	4657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378710840
63	NC_016902	TCT	2	6	4679	4684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378710840
64	NC_016902	CGG	2	6	4695	4700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378710840
65	NC_016902	CAG	2	6	4706	4711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378710840
66	NC_016902	CTG	2	6	4736	4741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378710840
67	NC_016902	TGC	2	6	4786	4791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378710840
68	NC_016902	GCG	2	6	4805	4810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378710840
69	NC_016902	CCG	2	6	4831	4836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378710840
70	NC_016902	TGG	2	6	4920	4925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378710840
71	NC_016902	GGC	2	6	4940	4945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378710840
72	NC_016902	CAT	4	12	5131	5142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378710840
73	NC_016902	GCT	2	6	5179	5184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378710840
74	NC_016902	CTT	2	6	5191	5196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378710840
75	NC_016902	GCC	2	6	5248	5253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378710840
76	NC_016902	GAA	2	6	5266	5271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378710840
77	NC_016902	GAC	2	6	5297	5302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378710840
78	NC_016902	CGT	2	6	5450	5455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378710840
79	NC_016902	TCG	2	6	5716	5721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378710840
80	NC_016902	GAA	2	6	5759	5764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378710840
81	NC_016902	CGT	2	6	5789	5794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378710840
82	NC_016902	ACC	2	6	5912	5917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378710840
83	NC_016902	GTC	2	6	5931	5936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378710840
84	NC_016902	TGC	2	6	5940	5945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378710840
85	NC_016902	TGC	2	6	5968	5973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378710840
86	NC_016902	CAC	2	6	5986	5991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378710840
87	NC_016902	GCG	2	6	6050	6055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378710840
88	NC_016902	AAG	2	6	6190	6195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016902	ATC	2	6	6215	6220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_016902	ATC	2	6	6252	6257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_016902	TGA	2	6	6321	6326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378710841
92	NC_016902	GAG	2	6	6388	6393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378710841
93	NC_016902	GGC	2	6	6397	6402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378710841
94	NC_016902	TGC	2	6	6410	6415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378710841
95	NC_016902	GGC	2	6	6433	6438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378710841
96	NC_016902	ATT	2	6	6607	6612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378710841
97	NC_016902	CTG	2	6	6682	6687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378710841
98	NC_016902	CTG	2	6	6865	6870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378710842
99	NC_016902	CCG	2	6	6890	6895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378710842
100	NC_016902	ACG	2	6	6946	6951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378710842
101	NC_016902	ACT	2	6	7013	7018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378710842
102	NC_016902	GAC	2	6	7093	7098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378710842
103	NC_016902	CAC	2	6	7158	7163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378710842
104	NC_016902	CTA	2	6	7191	7196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378710842
105	NC_016902	CCA	2	6	7220	7225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378710842
106	NC_016902	TGA	3	9	7283	7291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378710842
107	NC_016902	TGA	2	6	7293	7298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378710842
108	NC_016902	GAA	2	6	7459	7464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378710842
109	NC_016902	AAG	2	6	7556	7561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378710842
110	NC_016902	ATT	2	6	7680	7685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378710843
111	NC_016902	ATG	2	6	7727	7732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378710843
112	NC_016902	TGC	2	6	7759	7764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378710843
113	NC_016902	GAT	2	6	7824	7829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378710843
114	NC_016902	TCT	2	6	7958	7963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378710843
115	NC_016902	AGT	3	9	7974	7982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378710843
116	NC_016902	CTT	2	6	8381	8386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_016902	CCT	2	6	8389	8394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_016902	GTA	2	6	8477	8482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016902	CAA	2	6	8483	8488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_016902	TAC	2	6	8499	8504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_016902	TCA	2	6	8530	8535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_016902	TAC	2	6	8542	8547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_016902	AGA	2	6	8585	8590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016902	CAT	2	6	8743	8748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378710844
125	NC_016902	TGG	2	6	8925	8930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378710844
126	NC_016902	GCA	2	6	8951	8956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378710844
127	NC_016902	GAT	2	6	9007	9012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378710844
128	NC_016902	CAA	2	6	9016	9021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378710844
129	NC_016902	TGC	2	6	9072	9077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378710844
130	NC_016902	GGC	2	6	9250	9255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378710844
131	NC_016902	GCA	2	6	9503	9508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378710845
132	NC_016902	ATT	2	6	9601	9606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378710845
133	NC_016902	GCG	2	6	9650	9655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378710845
134	NC_016902	TGA	2	6	9773	9778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378710845
135	NC_016902	CAT	2	6	9790	9795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378710845
136	NC_016902	GCC	2	6	9831	9836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378710845
137	NC_016902	TTG	2	6	9982	9987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378710845
138	NC_016902	CGG	2	6	10112	10117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378710845
139	NC_016902	CGA	2	6	10216	10221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378710846
140	NC_016902	CCG	2	6	10444	10449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378710846
141	NC_016902	GGC	2	6	10625	10630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378710846
142	NC_016902	GCA	2	6	10732	10737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378710846
143	NC_016902	GCA	3	9	10739	10747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378710846
144	NC_016902	TGA	2	6	11012	11017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378710847
145	NC_016902	GGC	2	6	11095	11100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378710847
146	NC_016902	CGG	2	6	11136	11141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378710847
147	NC_016902	CGG	2	6	11150	11155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378710847
148	NC_016902	GAA	2	6	11221	11226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378710847
149	NC_016902	TAC	2	6	11431	11436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378710847
150	NC_016902	GGC	2	6	11445	11450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378710847
151	NC_016902	GGC	2	6	11469	11474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378710847
152	NC_016902	ATG	2	6	11609	11614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378710847
153	NC_016902	GGC	2	6	11655	11660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378710847
154	NC_016902	ACA	2	6	11726	11731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378710847
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156	NC_016902	GGC	2	6	11785	11790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378710847
157	NC_016902	CGA	2	6	11832	11837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378710847
158	NC_016902	GCA	2	6	12063	12068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378710848
159	NC_016902	TGA	2	6	12100	12105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378710848
160	NC_016902	GGT	2	6	12116	12121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378710848
161	NC_016902	CGG	2	6	12254	12259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378710848
162	NC_016902	CCG	2	6	12463	12468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378710848
163	NC_016902	GCT	2	6	12518	12523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378710848
164	NC_016902	TGG	2	6	12572	12577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378710848
165	NC_016902	GCC	2	6	12620	12625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378710848
166	NC_016902	GGC	2	6	12675	12680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378710848
167	NC_016902	TGG	2	6	12685	12690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378710848
168	NC_016902	GAA	2	6	12707	12712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378710848
169	NC_016902	CTG	2	6	12948	12953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378710848
170	NC_016902	GAT	3	9	13055	13063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378710848
171	NC_016902	TTC	2	6	13086	13091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378710848
172	NC_016902	CGG	2	6	13163	13168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378710848
173	NC_016902	GGT	2	6	13185	13190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378710848
174	NC_016902	GGC	2	6	13194	13199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378710848
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180	NC_016902	CTG	2	6	13862	13867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378710849
181	NC_016902	TGA	2	6	13890	13895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378710849
182	NC_016902	CGC	2	6	13911	13916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378710849
183	NC_016902	TGC	2	6	13965	13970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378710849
184	NC_016902	ATC	2	6	14006	14011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378710849
185	NC_016902	TGG	2	6	14059	14064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378710849
186	NC_016902	GCG	2	6	14145	14150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378710849
187	NC_016902	CAG	2	6	14249	14254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378710849
188	NC_016902	CCG	2	6	14256	14261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378710849
189	NC_016902	AAT	2	6	14372	14377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378710849
190	NC_016902	TCA	2	6	14413	14418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
191	NC_016902	ATG	2	6	14463	14468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
192	NC_016902	CGT	2	6	14602	14607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378710850
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214	NC_016902	CAT	3	9	16114	16122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
215	NC_016902	GGC	2	6	16136	16141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
216	NC_016902	TGC	2	6	16162	16167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
217	NC_016902	GGC	2	6	16446	16451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378710852
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219	NC_016902	GTG	2	6	16563	16568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378710852
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222	NC_016902	CTT	2	6	16856	16861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
223	NC_016902	ACA	2	6	16981	16986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378710853
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228	NC_016902	CAA	2	6	17362	17367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
229	NC_016902	TGG	2	6	17540	17545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378710854
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233	NC_016902	ATC	2	6	17623	17628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378710854
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236	NC_016902	TCA	2	6	17804	17809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378710854
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238	NC_016902	GCA	2	6	17919	17924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378710854
239	NC_016902	CAG	2	6	18073	18078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378710854
240	NC_016902	GGC	2	6	18100	18105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378710854
241	NC_016902	GAA	2	6	18220	18225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378710854
242	NC_016902	ATT	2	6	18253	18258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378710854
243	NC_016902	TGC	2	6	18272	18277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378710854
244	NC_016902	TGG	2	6	18281	18286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378710854
245	NC_016902	AGG	2	6	18329	18334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378710854
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247	NC_016902	GTT	2	6	18451	18456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378710854
248	NC_016902	TGG	2	6	18536	18541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378710854
249	NC_016902	GCA	2	6	18588	18593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378710854
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252	NC_016902	TGG	2	6	18852	18857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378710854
253	NC_016902	CCG	2	6	18923	18928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378710854
254	NC_016902	TCC	2	6	19020	19025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378710854
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256	NC_016902	GCG	3	9	19066	19074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378710854
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