MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Shewanella baltica OS678 chromosome

Total Repeats: 263

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016901	TAGCCT	2	12	2697	2708	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016901	AATATT	2	12	21624	21635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016901	AGATTA	2	12	25467	25478	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016901	TGAAGG	2	12	47638	47649	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016901	AAACGC	2	12	49537	49548	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_016901	TAACAC	2	12	67707	67718	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_016901	CTCAAG	2	12	75737	75748	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_016901	GCAATT	2	12	103166	103177	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_016901	GCTGAC	2	12	111373	111384	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_016901	CGATCT	2	12	124408	124419	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_016901	CCATTA	2	12	153830	153841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_016901	GACTTT	2	12	169009	169020	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_016901	GACTGG	2	12	189027	189038	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_016901	TGAAGG	2	12	223965	223976	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016901	AAACGC	2	12	225859	225870	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_016901	CTTTAA	2	12	258814	258825	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_016901	TGAAGG	2	12	275315	275326	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016901	AAACGC	2	12	277213	277224	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_016901	AAAGAT	2	12	277553	277564	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016901	ATAACT	2	12	302830	302841	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_016901	AATGAA	2	12	303562	303573	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016901	CTAACT	2	12	306293	306304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_016901	GCTCAA	2	12	347137	347148	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_016901	AGCTAA	2	12	370689	370700	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_016901	TCAAAG	2	12	370709	370720	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_016901	CGCCAC	2	12	417716	417727	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_016901	AGGAAA	2	12	472010	472021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016901	TGAAGG	2	12	484777	484788	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016901	AAACGC	2	12	486676	486687	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_016901	AAACGC	2	12	486943	486954	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_016901	CTCGTT	2	12	541049	541060	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_016901	TTATTT	2	12	606614	606625	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016901	TTGAGC	2	12	615650	615661	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_016901	GATATA	2	12	620505	620516	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016901	AGCGTA	2	12	623767	623778	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_016901	GCTTTA	2	12	625672	625683	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_016901	AAAGTC	2	12	626709	626720	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_016901	AGCGAT	2	12	633919	633930	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_016901	GGTTAC	2	12	686250	686261	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_016901	AATGCA	2	12	686515	686526	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_016901	ATTAGC	2	12	686888	686899	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_016901	TTTAAA	2	12	696109	696120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016901	TAGATA	2	12	699546	699557	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016901	TGGCGA	2	12	724727	724738	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_016901	AAATCA	2	12	726651	726662	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_016901	GTCGGA	2	12	727022	727033	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_016901	ATAAAA	2	12	727279	727290	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016901	TTTTAT	2	12	741601	741612	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016901	TCTGTT	4	24	748617	748640	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_016901	TTTGTT	2	12	751554	751565	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016901	TTTGTT	2	12	781216	781227	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016901	GTCTAA	2	12	804154	804165	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_016901	GCAGTA	2	12	841910	841921	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_016901	TAAGTG	2	12	842794	842805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016901	TCCCTA	2	12	845792	845803	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_016901	AGCTCA	2	12	881060	881071	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_016901	GTTGAA	2	12	913721	913732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016901	AAAAAC	2	12	977240	977251	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_016901	GCAAGC	2	12	977290	977301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_016901	AGGATT	2	12	979161	979172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016901	TGAAGG	2	12	999793	999804	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016901	AAACGC	2	12	1001691	1001702	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_016901	CTTTAT	2	12	1004543	1004554	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_016901	TCAATC	2	12	1022475	1022486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_016901	TCTAAG	2	12	1064278	1064289	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_016901	ATTTTA	2	12	1101508	1101519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016901	TAGGGT	2	12	1133481	1133492	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016901	TTTTGA	2	12	1140694	1140705	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016901	AAATGT	2	12	1186813	1186824	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016901	TTTATC	2	12	1209540	1209551	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_016901	GAATCC	2	12	1220968	1220979	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_016901	AGCTTC	2	12	1232814	1232825	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_016901	AATGAT	2	12	1248760	1248771	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016901	AATCCC	2	12	1304885	1304896	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_016901	AGCACC	2	12	1318605	1318616	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
76	NC_016901	AGCACC	2	12	1318778	1318789	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
77	NC_016901	ATTTAT	2	12	1321794	1321805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016901	TGAAGG	2	12	1330123	1330134	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016901	AAACGC	2	12	1332073	1332084	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_016901	AATAAA	2	12	1355537	1355548	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016901	TTTATT	2	12	1366437	1366448	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016901	ATGAAT	2	12	1391095	1391106	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016901	TTTTTA	2	12	1410557	1410568	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016901	TTTTTG	2	12	1465252	1465263	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016901	TTTAGT	2	12	1485380	1485391	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016901	AGGGCT	2	12	1538115	1538126	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_016901	ACTAAC	2	12	1538468	1538479	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_016901	CTTCAT	2	12	1549781	1549792	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_016901	GACTAA	2	12	1573773	1573784	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_016901	TATATT	2	12	1585649	1585660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016901	TCATTA	2	12	1598702	1598713	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_016901	ATTGTG	2	12	1602321	1602332	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016901	AAGCTT	2	12	1666760	1666771	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_016901	AGCATT	2	12	1693507	1693518	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_016901	GTTTTT	2	12	1709221	1709232	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016901	ATGCCC	2	12	1769467	1769478	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
97	NC_016901	TTTATA	2	12	1770526	1770537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016901	CTGGCT	2	12	1799103	1799114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_016901	TTTACG	2	12	1826972	1826983	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_016901	CATAAA	2	12	1873169	1873180	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_016901	TCAAAG	4	24	1876040	1876063	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_016901	TAGTGA	2	12	1903079	1903090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016901	CGCATT	4	24	1923403	1923426	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_016901	GGAGAA	2	12	1923769	1923780	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016901	TTTTAT	2	12	1925672	1925683	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016901	AAGATA	2	12	1926173	1926184	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016901	CAAAGT	2	12	1930034	1930045	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_016901	GTTAAG	2	12	2038914	2038925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016901	GCTAAA	2	12	2058461	2058472	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_016901	GCAAAG	2	12	2080332	2080343	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_016901	ATTTTC	2	12	2080438	2080449	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_016901	GTTTTT	2	12	2082963	2082974	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016901	TCTTGG	2	12	2085064	2085075	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_016901	GAGATA	2	12	2085097	2085108	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016901	TGTTTT	2	12	2109227	2109238	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016901	TTTTTA	2	12	2116159	2116170	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016901	AATAAG	2	12	2122487	2122498	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016901	TATTGA	2	12	2129728	2129739	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016901	TTCAAC	3	18	2134104	2134121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_016901	TTGCAA	2	12	2155039	2155050	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_016901	GTTTTC	2	12	2166554	2166565	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_016901	AGTATA	2	12	2191384	2191395	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016901	ATTAAA	2	12	2191977	2191988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016901	ATATGA	2	12	2226625	2226636	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016901	GATATT	2	12	2252201	2252212	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016901	CATAAA	2	12	2258516	2258527	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_016901	TGTTTT	2	12	2350667	2350678	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016901	CTTTGA	2	12	2379505	2379516	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_016901	TTTGAA	2	12	2383431	2383442	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016901	AAAATA	2	12	2430433	2430444	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016901	CTAAAA	2	12	2445722	2445733	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_016901	TATCAA	2	12	2475651	2475662	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_016901	TGAAAT	2	12	2484938	2484949	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016901	TAAAGC	2	12	2542095	2542106	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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138	NC_016901	AAATAA	2	12	2598746	2598757	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016901	ATTTTT	2	12	2629212	2629223	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016901	AAGCGC	2	12	2676591	2676602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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155	NC_016901	CATGTA	2	12	2883417	2883428	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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157	NC_016901	ATTTTG	2	12	2948434	2948445	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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245	NC_016901	GCGTTT	2	12	4709436	4709447	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
246	NC_016901	CCTTCA	2	12	4711334	4711345	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
247	NC_016901	CACCAT	2	12	4739444	4739455	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
248	NC_016901	TGATTG	2	12	4830927	4830938	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
249	NC_016901	AATAGC	2	12	4927163	4927174	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
250	NC_016901	GCGTTT	2	12	4927469	4927480	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
251	NC_016901	CCTTCA	2	12	4929368	4929379	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
252	NC_016901	CAGGGA	2	12	4933349	4933360	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
253	NC_016901	TCCCAC	4	24	4952886	4952909	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
254	NC_016901	ACCCGA	2	12	5007637	5007648	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
255	NC_016901	TTTATC	2	12	5008374	5008385	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
256	NC_016901	CTAAAT	2	12	5127856	5127867	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
257	NC_016901	TACCTG	2	12	5142574	5142585	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
258	NC_016901	TTTGCT	2	12	5157339	5157350	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
259	NC_016901	TATAAA	2	12	5237077	5237088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
260	NC_016901	CAATAA	2	12	5242963	5242974	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
261	NC_016901	GCGTTT	2	12	5255276	5255287	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
262	NC_016901	CCTTCA	2	12	5257171	5257182	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
263	NC_016901	TTTTAA	2	12	5263968	5263979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.