MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Shewanella baltica OS678 chromosome

Total Repeats: 2462

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016901	TTCG	2	8	7266	7273	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_016901	AAGC	2	8	10783	10790	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_016901	CGAG	2	8	19261	19268	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_016901	TTGC	2	8	21530	21537	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_016901	AGCT	2	8	29607	29614	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_016901	TCAC	2	8	29936	29943	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_016901	TTTA	2	8	30073	30080	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016901	CTTA	2	8	32204	32211	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_016901	AGTT	2	8	36443	36450	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016901	ACTG	2	8	36453	36460	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_016901	ACCG	2	8	39976	39983	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_016901	AATA	2	8	43340	43347	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016901	CTAA	2	8	43416	43423	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_016901	GTTT	2	8	44453	44460	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016901	TGTT	2	8	46092	46099	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016901	TGTC	2	8	46220	46227	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_016901	TTAC	2	8	46234	46241	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_016901	GCGA	2	8	46686	46693	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_016901	CTGA	2	8	46865	46872	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_016901	CGTC	2	8	47390	47397	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_016901	AAAG	2	8	47513	47520	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016901	ATTG	2	8	48293	48300	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016901	CAAA	2	8	49409	49416	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_016901	TGGC	2	8	55544	55551	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_016901	TCGA	2	8	56243	56250	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_016901	AAAG	2	8	57954	57961	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016901	CAAT	2	8	58084	58091	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_016901	CGAA	2	8	59314	59321	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_016901	TAAA	2	8	59426	59433	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016901	TTCG	2	8	59482	59489	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_016901	TGAG	2	8	59781	59788	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016901	GTTT	2	8	62017	62024	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016901	TACT	2	8	62025	62032	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_016901	TGCC	2	8	62190	62197	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_016901	TAAT	2	8	62205	62212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016901	AAAG	2	8	66077	66084	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016901	GCTA	2	8	66288	66295	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_016901	TGCC	2	8	66305	66312	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_016901	TTAG	2	8	67284	67291	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016901	TGAT	2	8	67758	67765	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016901	TCAT	2	8	70180	70187	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_016901	CTGC	2	8	72514	72521	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_016901	CTTT	2	8	73019	73026	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_016901	AATG	2	8	75677	75684	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016901	ATTG	2	8	77301	77308	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016901	GGCT	2	8	77419	77426	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_016901	GAGT	2	8	77482	77489	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016901	TGGG	2	8	79000	79007	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016901	CCGC	2	8	82567	82574	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
50	NC_016901	TGGA	2	8	83345	83352	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016901	TATT	2	8	83421	83428	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016901	GTTT	2	8	102613	102620	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016901	ATCA	2	8	106409	106416	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_016901	TGAG	2	8	108306	108313	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016901	TGCA	2	8	109358	109365	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_016901	GGTA	2	8	111052	111059	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016901	ATCA	2	8	111192	111199	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_016901	GTAA	2	8	114441	114448	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016901	AATT	2	8	116510	116517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016901	TCGT	2	8	116595	116602	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_016901	TCAA	2	8	116791	116798	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_016901	AAAC	2	8	118164	118171	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_016901	AGCA	2	8	119665	119672	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_016901	GAGT	2	8	123862	123869	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016901	TATT	3	12	124367	124378	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016901	CTCG	2	8	124492	124499	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_016901	GATT	2	8	136099	136106	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016901	TTTC	2	8	138628	138635	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_016901	CTTG	2	8	140912	140919	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_016901	CTTA	2	8	141033	141040	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_016901	GCTC	2	8	150151	150158	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_016901	AAGC	2	8	153163	153170	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_016901	AGAT	2	8	153809	153816	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016901	CTGA	2	8	154312	154319	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_016901	TGAA	2	8	158625	158632	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016901	CAGT	2	8	158713	158720	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_016901	CAAA	2	8	162992	162999	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_016901	ATTT	2	8	164397	164404	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016901	GTTA	2	8	167043	167050	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016901	TTAT	2	8	169051	169058	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016901	GGGT	2	8	169212	169219	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016901	AGAA	2	8	174601	174608	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016901	TTTA	2	8	176321	176328	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016901	TCCA	2	8	176462	176469	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_016901	ATCG	2	8	178219	178226	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_016901	GAAA	2	8	180860	180867	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016901	ATTT	2	8	196702	196709	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016901	ATGT	2	8	196737	196744	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016901	CAAA	2	8	207875	207882	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_016901	TTTA	2	8	210177	210184	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016901	AAAC	2	8	210230	210237	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_016901	TTGG	2	8	218333	218340	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016901	CAAA	2	8	219275	219282	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_016901	ATAA	2	8	219795	219802	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016901	ATAA	2	8	219913	219920	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016901	AAAG	2	8	220062	220069	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016901	GTTT	2	8	220332	220339	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016901	TGTT	2	8	221972	221979	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016901	AAAG	2	8	222006	222013	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016901	TCCT	2	8	222195	222202	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_016901	CTTA	2	8	222305	222312	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_016901	GCCT	2	8	222356	222363	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_016901	TAAT	2	8	222563	222570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016901	GTGA	2	8	222743	222750	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016901	GCGA	2	8	223014	223021	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_016901	CTGA	2	8	223193	223200	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_016901	CGTC	2	8	223717	223724	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_016901	AAAG	2	8	223840	223847	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016901	ATTG	2	8	224620	224627	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016901	TTAG	2	8	229506	229513	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016901	TAAA	2	8	232177	232184	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016901	GCTG	2	8	234214	234221	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_016901	TTAT	2	8	234827	234834	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016901	TAAG	2	8	243768	243775	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016901	ACTG	2	8	246522	246529	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_016901	GTTT	2	8	253071	253078	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016901	AACA	2	8	260258	260265	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_016901	GGAA	2	8	265706	265713	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016901	TAAG	2	8	265952	265959	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016901	GTTT	2	8	272064	272071	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016901	TGTC	2	8	273897	273904	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_016901	TTAC	2	8	273911	273918	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_016901	GCGA	2	8	274363	274370	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_016901	CTGA	2	8	274542	274549	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_016901	CGTC	2	8	275067	275074	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
126	NC_016901	AAAG	2	8	275190	275197	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016901	ATTG	2	8	275970	275977	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016901	CAAA	2	8	277085	277092	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_016901	TTCT	2	8	278505	278512	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_016901	TGTT	2	8	278755	278762	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016901	TTGA	2	8	279693	279700	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016901	AATT	2	8	282561	282568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016901	ATTT	2	8	286785	286792	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016901	AAAG	2	8	286810	286817	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016901	TTAT	2	8	286834	286841	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016901	ATTG	2	8	288639	288646	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016901	CTTT	2	8	291045	291052	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_016901	GCAG	2	8	291081	291088	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_016901	TAAA	2	8	294528	294535	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016901	TAAG	2	8	296807	296814	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016901	TAAT	2	8	303551	303558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016901	GGTA	2	8	305103	305110	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016901	GAAC	2	8	306969	306976	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_016901	TTAA	2	8	309755	309762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016901	CTGA	2	8	309832	309839	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_016901	TCAA	2	8	310745	310752	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_016901	TTTG	2	8	311212	311219	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016901	TTGG	2	8	311282	311289	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_016901	TGAA	2	8	311389	311396	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_016901	TGAG	2	8	313513	313520	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_016901	TATC	2	8	315759	315766	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_016901	GTTG	2	8	317905	317912	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_016901	TTTA	2	8	317916	317923	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_016901	ATTT	2	8	324102	324109	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_016901	GCAA	2	8	324228	324235	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
156	NC_016901	TGTT	2	8	324247	324254	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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179	NC_016901	GTTG	2	8	404140	404147	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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192	NC_016901	ATTG	2	8	434720	434727	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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