MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Gluconacetobacter xylinus NBRC 3288 plasmid pGXY060

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016900	TCTG	2	8	15	22	0 %	50 %	25 %	25 %	377643907
2	NC_016900	GACG	2	8	93	100	25 %	0 %	50 %	25 %	377643907
3	NC_016900	AGGA	2	8	232	239	50 %	0 %	50 %	0 %	377643907
4	NC_016900	CCGG	2	8	248	255	0 %	0 %	50 %	50 %	377643907
5	NC_016900	CCGG	2	8	377	384	0 %	0 %	50 %	50 %	377643907
6	NC_016900	AGGG	2	8	600	607	25 %	0 %	75 %	0 %	377643907
7	NC_016900	CGGT	2	8	815	822	0 %	25 %	50 %	25 %	377643907
8	NC_016900	GAGG	2	8	858	865	25 %	0 %	75 %	0 %	377643907
9	NC_016900	AGGA	2	8	877	884	50 %	0 %	50 %	0 %	377643907
10	NC_016900	TGTA	2	8	1089	1096	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016900	TGAA	2	8	1365	1372	50 %	25 %	25 %	0 %	377643908
12	NC_016900	CTGA	2	8	1391	1398	25 %	25 %	25 %	25 %	377643908
13	NC_016900	TGCG	2	8	1886	1893	0 %	25 %	50 %	25 %	377643909
14	NC_016900	GCTC	2	8	2921	2928	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_016900	AAGA	2	8	3039	3046	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016900	CGGG	2	8	3125	3132	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17	NC_016900	CCAG	2	8	3261	3268	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_016900	CCGG	2	8	3403	3410	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_016900	TCCG	2	8	3459	3466	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_016900	TCTG	2	8	3964	3971	0 %	50 %	25 %	25 %	377643911
21	NC_016900	TGCG	2	8	4204	4211	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_016900	TTCC	2	8	4221	4228	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.