MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Gluconacetobacter xylinus NBRC 3288 plasmid pGXY060

Total Repeats: 62

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016900	CGT	2	6	54	59	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377643907
2	NC_016900	GCT	3	9	61	69	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377643907
3	NC_016900	GGA	2	6	144	149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	377643907
4	NC_016900	TGG	2	6	332	337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	377643907
5	NC_016900	GTG	2	6	349	354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	377643907
6	NC_016900	CAC	2	6	420	425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	377643907
7	NC_016900	GGC	2	6	660	665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377643907
8	NC_016900	CAG	2	6	913	918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377643907
9	NC_016900	GGC	2	6	927	932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377643907
10	NC_016900	GCC	2	6	949	954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377643907
11	NC_016900	AGC	2	6	971	976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377643907
12	NC_016900	TGT	2	6	1060	1065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016900	GAT	2	6	1130	1135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016900	CAT	2	6	1152	1157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_016900	ATT	2	6	1253	1258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016900	CTT	2	6	1269	1274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_016900	TAT	2	6	1279	1284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	377643908
18	NC_016900	ATC	3	9	1290	1298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377643908
19	NC_016900	TCA	4	12	1417	1428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377643908
20	NC_016900	CCA	2	6	1509	1514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	377643908
21	NC_016900	GTT	2	6	1680	1685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016900	GGC	2	6	1742	1747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377643909
23	NC_016900	AGC	2	6	1764	1769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377643909
24	NC_016900	TGG	2	6	1849	1854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	377643909
25	NC_016900	GGC	2	6	1922	1927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377643909
26	NC_016900	GCC	2	6	1996	2001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_016900	GGC	2	6	2100	2105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_016900	TCG	2	6	2110	2115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_016900	GTT	2	6	2149	2154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016900	CCA	2	6	2330	2335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	377643910
31	NC_016900	GGA	2	6	2337	2342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	377643910
32	NC_016900	TAA	2	6	2424	2429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	377643910
33	NC_016900	CGT	2	6	2471	2476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377643910
34	NC_016900	CGG	2	6	2480	2485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377643910
35	NC_016900	ATG	2	6	2513	2518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377643910
36	NC_016900	AGC	2	6	2573	2578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377643910
37	NC_016900	ATC	2	6	2647	2652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377643910
38	NC_016900	GTA	2	6	2738	2743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377643910
39	NC_016900	TTC	2	6	2824	2829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	377643910
40	NC_016900	GCT	2	6	2844	2849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377643910
41	NC_016900	GCC	2	6	2852	2857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377643910
42	NC_016900	TCC	2	6	2867	2872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	377643910
43	NC_016900	GCT	2	6	2883	2888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377643910
44	NC_016900	TGG	2	6	2892	2897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	377643910
45	NC_016900	CGC	2	6	3136	3141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_016900	CAG	2	6	3357	3362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_016900	GCC	2	6	3430	3435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_016900	CGA	2	6	3497	3502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_016900	CCA	2	6	3511	3516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_016900	CCA	2	6	3521	3526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_016900	AGG	2	6	3535	3540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016900	CCT	2	6	3599	3604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_016900	CTG	2	6	3663	3668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_016900	GAA	2	6	3701	3706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016900	TCG	2	6	3775	3780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_016900	TCA	2	6	3853	3858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377643911
57	NC_016900	CAG	2	6	3908	3913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377643911
58	NC_016900	CTG	2	6	4010	4015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377643911
59	NC_016900	TCC	2	6	4043	4048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_016900	TGT	2	6	4072	4077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016900	GTG	2	6	4142	4147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016900	AAC	2	6	4152	4157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.