MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Sulfobacillus acidophilus DSM 10332 plasmid unnamed

Total Repeats: 32

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016888	ACTTTC	2	12	4008	4019	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	379009188
2	NC_016888	CTGCCA	2	12	4375	4386	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3	NC_016888	GCCGGG	2	12	8329	8340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_016888	TCGGCC	2	12	8575	8586	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	379009194
5	NC_016888	CTTCCG	2	12	8660	8671	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	379009194
6	NC_016888	CCGGGC	2	12	9279	9290	0 %	0 %	50 %	50 %	379009194
7	NC_016888	AGGGGC	2	12	14744	14755	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	379009199
8	NC_016888	CCCGAT	2	12	15204	15215	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	379009200
9	NC_016888	TGGGCC	2	12	15313	15324	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	379009200
10	NC_016888	CCGGTC	2	12	18394	18405	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
11	NC_016888	ATGCCG	2	12	20412	20423	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379009205
12	NC_016888	AACGCC	2	12	23995	24006	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	379009210
13	NC_016888	CTGAGG	2	12	28483	28494	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	379009215
14	NC_016888	CGAAGC	2	12	42088	42099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379009232
15	NC_016888	CACCGG	2	12	42281	42292	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	379009232
16	NC_016888	CGGTGC	2	12	43594	43605	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	379009234
17	NC_016888	GCGCGA	2	12	47264	47275	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	379009237
18	NC_016888	GCGGCT	2	12	48042	48053	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	379009238
19	NC_016888	CCGGTC	2	12	50343	50354	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
20	NC_016888	GTCCGC	2	12	53233	53244	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	379009240
21	NC_016888	ATCGAG	2	12	58597	58608	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	379009243
22	NC_016888	ATGCCG	2	12	60800	60811	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379009245
23	NC_016888	TCTGCA	2	12	66200	66211	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	379009249
24	NC_016888	GGAATC	2	12	66955	66966	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	379009250
25	NC_016888	TCCTGC	2	12	67200	67211	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	379009251
26	NC_016888	GAAATC	2	12	69540	69551	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379009254
27	NC_016888	CATTCG	2	12	70455	70466	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_016888	ACCGCT	2	12	72086	72097	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	379009256
29	NC_016888	GGAATT	2	12	75344	75355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379009260
30	NC_016888	CCGGTC	2	12	77402	77413	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
31	NC_016888	TCCGCA	2	12	79818	79829	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	379009264
32	NC_016888	GGACAA	2	12	80518	80529	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	379009264

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.