MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Sulfobacillus acidophilus DSM 10332 plasmid unnamed

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016888	GTATC	2	10	1408	1417	20 %	40 %	20 %	20 %	379009186
2	NC_016888	GCGCC	2	10	2735	2744	0 %	0 %	40 %	60 %	379009187
3	NC_016888	TCCGC	2	10	11063	11072	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4	NC_016888	TCTCG	2	10	11438	11447	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_016888	TGACG	2	10	12780	12789	20 %	20 %	40 %	20 %	379009197
6	NC_016888	GGTTC	2	10	13061	13070	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_016888	TGATG	2	10	13575	13584	20 %	40 %	40 %	0 %	379009198
8	NC_016888	CGTCC	2	10	14249	14258	0 %	20 %	20 %	60 %	379009199
9	NC_016888	GGGCT	2	10	14685	14694	0 %	20 %	60 %	20 %	379009199
10	NC_016888	CTTAT	2	10	17506	17515	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_016888	CCGTG	2	10	20064	20073	0 %	20 %	40 %	40 %	379009205
12	NC_016888	CGGGC	2	10	21997	22006	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
13	NC_016888	ACAAA	2	10	26808	26817	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_016888	GCCGG	2	10	28772	28781	0 %	0 %	60 %	40 %	379009215
15	NC_016888	CGTAT	2	10	30733	30742	20 %	40 %	20 %	20 %	379009217
16	NC_016888	CCTGG	2	10	32312	32321	0 %	20 %	40 %	40 %	379009220
17	NC_016888	ATCCC	2	10	34754	34763	20 %	20 %	0 %	60 %	379009223
18	NC_016888	GTTTG	2	10	36061	36070	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016888	AACGG	2	10	36727	36736	40 %	0 %	40 %	20 %	379009226
20	NC_016888	TTCGT	2	10	42635	42644	0 %	60 %	20 %	20 %	379009232
21	NC_016888	GAACC	2	10	45862	45871	40 %	0 %	20 %	40 %	379009236
22	NC_016888	TCCCG	2	10	49162	49171	0 %	20 %	20 %	60 %	379009238
23	NC_016888	TCGCG	2	10	51321	51330	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
24	NC_016888	GACGC	2	10	51886	51895	20 %	0 %	40 %	40 %	379009239
25	NC_016888	CTTGC	2	10	53112	53121	0 %	40 %	20 %	40 %	379009240
26	NC_016888	CTCGC	2	10	53578	53587	0 %	20 %	20 %	60 %	379009240
27	NC_016888	CCTTC	2	10	54110	54119	0 %	40 %	0 %	60 %	379009240
28	NC_016888	TGGGC	2	10	54996	55005	0 %	20 %	60 %	20 %	379009241
29	NC_016888	CAAGG	2	10	56424	56433	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_016888	TGGGG	2	10	58464	58473	0 %	20 %	80 %	0 %	379009243
31	NC_016888	CTGAC	2	10	58835	58844	20 %	20 %	20 %	40 %	379009243
32	NC_016888	CCGTG	2	10	60452	60461	0 %	20 %	40 %	40 %	379009245
33	NC_016888	AACCG	2	10	61822	61831	40 %	0 %	20 %	40 %	379009246
34	NC_016888	AGCGG	2	10	63113	63122	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
35	NC_016888	AGCGG	2	10	64995	65004	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
36	NC_016888	CTCGA	2	10	66901	66910	20 %	20 %	20 %	40 %	379009250
37	NC_016888	TGCCG	2	10	68135	68144	0 %	20 %	40 %	40 %	379009252
38	NC_016888	ACCAT	2	10	68851	68860	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
39	NC_016888	TCGTA	2	10	69170	69179	20 %	40 %	20 %	20 %	379009253
40	NC_016888	ATCGG	2	10	71640	71649	20 %	20 %	40 %	20 %	379009256
41	NC_016888	TGGGG	2	10	72331	72340	0 %	20 %	80 %	0 %	379009256
42	NC_016888	TCGCG	2	10	82497	82506	0 %	20 %	40 %	40 %	379009268
43	NC_016888	GGATT	2	10	83738	83747	20 %	40 %	40 %	0 %	379009269

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.