MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Sulfobacillus acidophilus DSM 10332 plasmid unnamed

Total Repeats: 134

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016888	GA	3	6	11	16	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016888	GT	3	6	36	41	0 %	50 %	50 %	0 %	379009185
3	NC_016888	GA	3	6	336	341	50 %	0 %	50 %	0 %	379009185
4	NC_016888	TG	3	6	1630	1635	0 %	50 %	50 %	0 %	379009186
5	NC_016888	CG	4	8	2345	2352	0 %	0 %	50 %	50 %	379009186
6	NC_016888	GC	3	6	2583	2588	0 %	0 %	50 %	50 %	379009187
7	NC_016888	CT	3	6	2653	2658	0 %	50 %	0 %	50 %	379009187
8	NC_016888	CG	3	6	2755	2760	0 %	0 %	50 %	50 %	379009187
9	NC_016888	GC	3	6	3794	3799	0 %	0 %	50 %	50 %	379009188
10	NC_016888	GA	3	6	3831	3836	50 %	0 %	50 %	0 %	379009188
11	NC_016888	GC	3	6	4135	4140	0 %	0 %	50 %	50 %	379009188
12	NC_016888	GT	3	6	4173	4178	0 %	50 %	50 %	0 %	379009188
13	NC_016888	GA	3	6	5097	5102	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016888	GT	3	6	5513	5518	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016888	TG	3	6	5699	5704	0 %	50 %	50 %	0 %	379009192
16	NC_016888	CG	4	8	6174	6181	0 %	0 %	50 %	50 %	379009193
17	NC_016888	GC	3	6	6210	6215	0 %	0 %	50 %	50 %	379009193
18	NC_016888	CG	3	6	6596	6601	0 %	0 %	50 %	50 %	379009193
19	NC_016888	CG	3	6	6650	6655	0 %	0 %	50 %	50 %	379009193
20	NC_016888	GT	3	6	7576	7581	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016888	CG	3	6	8453	8458	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_016888	CA	3	6	9028	9033	50 %	0 %	0 %	50 %	379009194
23	NC_016888	GC	3	6	9788	9793	0 %	0 %	50 %	50 %	379009196
24	NC_016888	CG	3	6	10008	10013	0 %	0 %	50 %	50 %	379009196
25	NC_016888	CG	4	8	10459	10466	0 %	0 %	50 %	50 %	379009196
26	NC_016888	AC	4	8	11007	11014	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_016888	CA	4	8	11167	11174	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_016888	AC	3	6	12566	12571	50 %	0 %	0 %	50 %	379009197
29	NC_016888	GC	3	6	12873	12878	0 %	0 %	50 %	50 %	379009197
30	NC_016888	AG	4	8	13260	13267	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016888	CG	3	6	15151	15156	0 %	0 %	50 %	50 %	379009200
32	NC_016888	TG	3	6	17480	17485	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016888	TG	3	6	17889	17894	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016888	CG	3	6	18008	18013	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_016888	CG	3	6	18716	18721	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_016888	AC	3	6	19282	19287	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_016888	CT	3	6	19968	19973	0 %	50 %	0 %	50 %	379009204
38	NC_016888	AG	3	6	19982	19987	50 %	0 %	50 %	0 %	379009204
39	NC_016888	GC	4	8	22394	22401	0 %	0 %	50 %	50 %	379009207
40	NC_016888	TC	3	6	22947	22952	0 %	50 %	0 %	50 %	379009208
41	NC_016888	CG	3	6	23348	23353	0 %	0 %	50 %	50 %	379009210
42	NC_016888	GC	3	6	23406	23411	0 %	0 %	50 %	50 %	379009210
43	NC_016888	AT	3	6	23724	23729	50 %	50 %	0 %	0 %	379009210
44	NC_016888	TG	3	6	24203	24208	0 %	50 %	50 %	0 %	379009210
45	NC_016888	AG	3	6	24241	24246	50 %	0 %	50 %	0 %	379009211
46	NC_016888	CG	3	6	24344	24349	0 %	0 %	50 %	50 %	379009211
47	NC_016888	TG	3	6	24397	24402	0 %	50 %	50 %	0 %	379009211
48	NC_016888	TG	3	6	24714	24719	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016888	AC	3	6	24795	24800	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_016888	CG	3	6	24912	24917	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_016888	GC	3	6	27047	27052	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_016888	CT	3	6	28103	28108	0 %	50 %	0 %	50 %	379009215
53	NC_016888	GC	3	6	28244	28249	0 %	0 %	50 %	50 %	379009215
54	NC_016888	GC	3	6	28824	28829	0 %	0 %	50 %	50 %	379009215
55	NC_016888	TA	3	6	29471	29476	50 %	50 %	0 %	0 %	379009216
56	NC_016888	TC	3	6	29620	29625	0 %	50 %	0 %	50 %	379009216
57	NC_016888	GT	3	6	29739	29744	0 %	50 %	50 %	0 %	379009217
58	NC_016888	GC	3	6	30949	30954	0 %	0 %	50 %	50 %	379009218
59	NC_016888	GC	3	6	31243	31248	0 %	0 %	50 %	50 %	379009218
60	NC_016888	CG	3	6	31498	31503	0 %	0 %	50 %	50 %	379009219
61	NC_016888	GT	3	6	32211	32216	0 %	50 %	50 %	0 %	379009220
62	NC_016888	GC	3	6	32243	32248	0 %	0 %	50 %	50 %	379009220
63	NC_016888	GT	3	6	32572	32577	0 %	50 %	50 %	0 %	379009220
64	NC_016888	GT	3	6	33708	33713	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016888	AC	3	6	35755	35760	50 %	0 %	0 %	50 %	379009225
66	NC_016888	TA	3	6	36154	36159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016888	CG	3	6	36700	36705	0 %	0 %	50 %	50 %	379009226
68	NC_016888	AC	3	6	37677	37682	50 %	0 %	0 %	50 %	379009227
69	NC_016888	TG	3	6	37852	37857	0 %	50 %	50 %	0 %	379009227
70	NC_016888	TC	3	6	39342	39347	0 %	50 %	0 %	50 %	379009228
71	NC_016888	AT	3	6	39765	39770	50 %	50 %	0 %	0 %	379009229
72	NC_016888	GC	3	6	40277	40282	0 %	0 %	50 %	50 %	379009230
73	NC_016888	CG	3	6	40397	40402	0 %	0 %	50 %	50 %	379009230
74	NC_016888	GT	3	6	40942	40947	0 %	50 %	50 %	0 %	379009230
75	NC_016888	GA	3	6	41167	41172	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016888	CG	3	6	42784	42789	0 %	0 %	50 %	50 %	379009232
77	NC_016888	AC	3	6	43870	43875	50 %	0 %	0 %	50 %	379009235
78	NC_016888	GC	3	6	44218	44223	0 %	0 %	50 %	50 %	379009235
79	NC_016888	CG	3	6	44480	44485	0 %	0 %	50 %	50 %	379009235
80	NC_016888	GC	3	6	44879	44884	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_016888	CG	3	6	45400	45405	0 %	0 %	50 %	50 %	379009236
82	NC_016888	AC	3	6	45532	45537	50 %	0 %	0 %	50 %	379009236
83	NC_016888	CG	3	6	46693	46698	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_016888	CG	3	6	48287	48292	0 %	0 %	50 %	50 %	379009238
85	NC_016888	GC	3	6	48459	48464	0 %	0 %	50 %	50 %	379009238
86	NC_016888	GC	3	6	50122	50127	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_016888	CG	3	6	50614	50619	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_016888	AC	3	6	51206	51211	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_016888	GC	3	6	52207	52212	0 %	0 %	50 %	50 %	379009239
90	NC_016888	GC	4	8	52214	52221	0 %	0 %	50 %	50 %	379009239
91	NC_016888	CA	3	6	52951	52956	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_016888	GC	3	6	53120	53125	0 %	0 %	50 %	50 %	379009240
93	NC_016888	CT	3	6	54073	54078	0 %	50 %	0 %	50 %	379009240
94	NC_016888	GC	3	6	56561	56566	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_016888	GC	3	6	57358	57363	0 %	0 %	50 %	50 %	379009242
96	NC_016888	CG	3	6	57366	57371	0 %	0 %	50 %	50 %	379009242
97	NC_016888	CG	3	6	57534	57539	0 %	0 %	50 %	50 %	379009242
98	NC_016888	AG	3	6	59332	59337	50 %	0 %	50 %	0 %	379009244
99	NC_016888	CT	3	6	60356	60361	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_016888	AG	3	6	60370	60375	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016888	CA	3	6	62153	62158	50 %	0 %	0 %	50 %	379009246
102	NC_016888	CG	3	6	63480	63485	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_016888	CG	3	6	63524	63529	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_016888	CT	3	6	63742	63747	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_016888	CG	3	6	64112	64117	0 %	0 %	50 %	50 %	379009247
106	NC_016888	CG	3	6	64509	64514	0 %	0 %	50 %	50 %	379009247
107	NC_016888	GA	3	6	64774	64779	50 %	0 %	50 %	0 %	379009248
108	NC_016888	CG	3	6	66236	66241	0 %	0 %	50 %	50 %	379009249
109	NC_016888	AC	3	6	66424	66429	50 %	0 %	0 %	50 %	379009249
110	NC_016888	GC	3	6	66561	66566	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_016888	TC	3	6	67020	67025	0 %	50 %	0 %	50 %	379009250
112	NC_016888	GC	3	6	67452	67457	0 %	0 %	50 %	50 %	379009251
113	NC_016888	CG	3	6	67592	67597	0 %	0 %	50 %	50 %	379009251
114	NC_016888	CG	3	6	67961	67966	0 %	0 %	50 %	50 %	379009252
115	NC_016888	AT	3	6	68473	68478	50 %	50 %	0 %	0 %	379009252
116	NC_016888	GC	3	6	69128	69133	0 %	0 %	50 %	50 %	379009253
117	NC_016888	AT	3	6	69800	69805	50 %	50 %	0 %	0 %	379009254
118	NC_016888	CA	3	6	71040	71045	50 %	0 %	0 %	50 %	379009256
119	NC_016888	TG	3	6	71443	71448	0 %	50 %	50 %	0 %	379009256
120	NC_016888	CA	3	6	73059	73064	50 %	0 %	0 %	50 %	379009256
121	NC_016888	AC	4	8	73366	73373	50 %	0 %	0 %	50 %	379009257
122	NC_016888	TG	3	6	73454	73459	0 %	50 %	50 %	0 %	379009258
123	NC_016888	AT	3	6	73673	73678	50 %	50 %	0 %	0 %	379009259
124	NC_016888	GC	4	8	74124	74131	0 %	0 %	50 %	50 %	379009259
125	NC_016888	CG	3	6	75573	75578	0 %	0 %	50 %	50 %	379009260
126	NC_016888	TG	3	6	76925	76930	0 %	50 %	50 %	0 %	379009262
127	NC_016888	GC	3	6	77181	77186	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_016888	CG	3	6	77724	77729	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_016888	AC	3	6	77944	77949	50 %	0 %	0 %	50 %	379009263
130	NC_016888	GA	3	6	78067	78072	50 %	0 %	50 %	0 %	379009263
131	NC_016888	TG	3	6	78175	78180	0 %	50 %	50 %	0 %	379009263
132	NC_016888	AT	3	6	78585	78590	50 %	50 %	0 %	0 %	379009263
133	NC_016888	CG	3	6	78881	78886	0 %	0 %	50 %	50 %	379009263
134	NC_016888	TC	3	6	83699	83704	0 %	50 %	0 %	50 %	379009269

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.