MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Sulfobacillus acidophilus DSM 10332 chromosome

Total Repeats: 88

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016884	CACGCA	2	12	266793	266804	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
2	NC_016884	GGACGA	2	12	266960	266971	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_016884	ATTTTT	2	12	296421	296432	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016884	GACATT	2	12	391031	391042	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_016884	CGGGGG	2	12	402593	402604	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_016884	CCATTT	2	12	424967	424978	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_016884	TTGAAG	2	12	426986	426997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016884	ACTCGA	2	12	453959	453970	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_016884	GGGGAC	2	12	465221	465232	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_016884	GCGGTC	2	12	466978	466989	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_016884	CGGCCG	2	12	477076	477087	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_016884	AAGTGA	2	12	481425	481436	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016884	ACGTAA	2	12	512049	512060	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_016884	TATGAT	2	12	531077	531088	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016884	GGCCGA	2	12	536035	536046	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_016884	GCCGTT	2	12	560378	560389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_016884	GCCTGA	2	12	564068	564079	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_016884	GCCCGG	2	12	571930	571941	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_016884	GGCCGA	2	12	572635	572646	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_016884	TCGGCC	2	12	576046	576057	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
21	NC_016884	CCGGGC	2	12	576751	576762	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_016884	GGCCGT	2	12	590969	590980	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_016884	CCGTTC	2	12	612829	612840	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
24	NC_016884	GCCCGG	2	12	624318	624329	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_016884	GGCCGA	2	12	626187	626198	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_016884	GTCGAG	2	12	631829	631840	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_016884	GATCCG	2	12	645596	645607	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_016884	TGCAAA	2	12	653736	653747	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_016884	TTCGGC	2	12	654735	654746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_016884	TCGGCC	2	12	655200	655211	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
31	NC_016884	CCGCGC	2	12	656697	656708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_016884	CCGGTG	2	12	671007	671018	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_016884	CGTTAT	2	12	673359	673370	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_016884	ACGCCA	2	12	680960	680971	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
35	NC_016884	CACCCC	2	12	693853	693864	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
36	NC_016884	TCGGCC	2	12	783799	783810	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
37	NC_016884	TAATGA	2	12	849796	849807	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016884	CGATGA	2	12	906920	906931	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_016884	CGTGGT	2	12	1011235	1011246	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_016884	TGGCAG	2	12	1120072	1120083	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_016884	GTTCCT	2	12	1128003	1128014	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_016884	CGATTA	2	12	1188212	1188223	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_016884	TTGACC	2	12	1348433	1348444	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_016884	GACGAG	2	12	1350409	1350420	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_016884	CGGGGT	2	12	1514491	1514502	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_016884	CCCCCG	2	12	1561926	1561937	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
47	NC_016884	AATCCC	2	12	1563664	1563675	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_016884	TGGAAG	2	12	1634814	1634825	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016884	GCGGTT	2	12	1637244	1637255	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_016884	GGAGCA	2	12	1638450	1638461	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_016884	GCCCCG	2	12	1667085	1667096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_016884	TTGGTT	2	12	1685708	1685719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016884	CACGAC	2	12	1705149	1705160	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
54	NC_016884	CGCCTC	2	12	1928683	1928694	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_016884	CGGATT	2	12	1972121	1972132	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_016884	CATCGG	2	12	1977812	1977823	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_016884	TGCCGA	2	12	1991456	1991467	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_016884	AACGTA	2	12	2025574	2025585	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_016884	CTTTCC	2	12	2129383	2129394	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_016884	AAAAGT	2	12	2129581	2129592	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016884	CGACCG	2	12	2144460	2144471	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
62	NC_016884	TTATTT	2	12	2250857	2250868	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016884	CGGGTT	2	12	2308821	2308832	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_016884	ACTCGG	2	12	2332354	2332365	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_016884	TCTTCA	2	12	2332640	2332651	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_016884	TAAAGG	2	12	2374501	2374512	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016884	GGCTGG	2	12	2413963	2413974	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_016884	ACTTGT	2	12	2433366	2433377	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_016884	GCTTAG	2	12	2435518	2435529	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_016884	CAACTT	2	12	2855721	2855732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_016884	CCATAA	2	12	2953951	2953962	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_016884	GGCAAA	2	12	3044684	3044695	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_016884	CGGCGT	2	12	3048202	3048213	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_016884	GGCGTT	2	12	3056737	3056748	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_016884	TGACCG	2	12	3062159	3062170	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_016884	CAGCCG	2	12	3063290	3063301	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
77	NC_016884	TCGCCG	2	12	3094747	3094758	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
78	NC_016884	TGGGAT	2	12	3248098	3248109	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016884	AACCGC	2	12	3259634	3259645	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
80	NC_016884	TCGCCG	2	12	3309240	3309251	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
81	NC_016884	TGATCA	2	12	3313462	3313473	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_016884	AAGCCA	2	12	3317190	3317201	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_016884	TGGCTC	2	12	3337298	3337309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_016884	GGCGAT	2	12	3350225	3350236	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_016884	CTTCCG	2	12	3363542	3363553	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
86	NC_016884	ATCCGA	2	12	3380446	3380457	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_016884	TGCCGT	2	12	3447440	3447451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_016884	ATTCCT	2	12	3448209	3448220	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.