MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Sulfobacillus acidophilus DSM 10332 chromosome

Total Repeats: 1831

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016884	CGTGA	2	10	5622	5631	20 %	20 %	40 %	20 %	379005805
2	NC_016884	ACGGG	2	10	5663	5672	20 %	0 %	60 %	20 %	379005805
3	NC_016884	GCCAA	2	10	8575	8584	40 %	0 %	20 %	40 %	379005806
4	NC_016884	CGTGG	2	10	8734	8743	0 %	20 %	60 %	20 %	379005806
5	NC_016884	ATTGG	2	10	12067	12076	20 %	40 %	40 %	0 %	379005810
6	NC_016884	CGGGT	2	10	23178	23187	0 %	20 %	60 %	20 %	379005819
7	NC_016884	CCGGT	2	10	24184	24193	0 %	20 %	40 %	40 %	379005819
8	NC_016884	CCGTG	2	10	24434	24443	0 %	20 %	40 %	40 %	379005819
9	NC_016884	GCCCC	2	10	28118	28127	0 %	0 %	20 %	80 %	379005823
10	NC_016884	CGATC	2	10	28364	28373	20 %	20 %	20 %	40 %	379005823
11	NC_016884	CGGTC	2	10	30407	30416	0 %	20 %	40 %	40 %	379005825
12	NC_016884	GGCCG	2	10	30613	30622	0 %	0 %	60 %	40 %	379005825
13	NC_016884	CGAAC	2	10	33148	33157	40 %	0 %	20 %	40 %	379005827
14	NC_016884	CCACG	2	10	33509	33518	20 %	0 %	20 %	60 %	379005828
15	NC_016884	CGTGA	2	10	36587	36596	20 %	20 %	40 %	20 %	379005832
16	NC_016884	GTCCG	2	10	37691	37700	0 %	20 %	40 %	40 %	379005833
17	NC_016884	CCAGG	2	10	38465	38474	20 %	0 %	40 %	40 %	379005834
18	NC_016884	GACGC	2	10	38952	38961	20 %	0 %	40 %	40 %	379005834
19	NC_016884	TGGAA	2	10	43120	43129	40 %	20 %	40 %	0 %	379005837
20	NC_016884	CCGGT	2	10	43207	43216	0 %	20 %	40 %	40 %	379005837
21	NC_016884	CGGGC	2	10	46008	46017	0 %	0 %	60 %	40 %	379005838
22	NC_016884	ATCGC	2	10	49962	49971	20 %	20 %	20 %	40 %	379005841
23	NC_016884	GGCGC	2	10	50006	50015	0 %	0 %	60 %	40 %	379005841
24	NC_016884	GTCGT	2	10	50534	50543	0 %	40 %	40 %	20 %	379005842
25	NC_016884	AGCCG	2	10	50905	50914	20 %	0 %	40 %	40 %	379005842
26	NC_016884	GCCCG	2	10	51901	51910	0 %	0 %	40 %	60 %	379005844
27	NC_016884	GGGCC	2	10	52299	52308	0 %	0 %	60 %	40 %	379005844
28	NC_016884	CCGGC	2	10	53039	53048	0 %	0 %	40 %	60 %	379005845
29	NC_016884	ATACG	2	10	53642	53651	40 %	20 %	20 %	20 %	379005845
30	NC_016884	CGGGA	2	10	54478	54487	20 %	0 %	60 %	20 %	379005848
31	NC_016884	CCGGG	2	10	56630	56639	0 %	0 %	60 %	40 %	379005848
32	NC_016884	ACCCG	2	10	57812	57821	20 %	0 %	20 %	60 %	379005849
33	NC_016884	GCGGA	2	10	60311	60320	20 %	0 %	60 %	20 %	379005851
34	NC_016884	GACCT	2	10	63424	63433	20 %	20 %	20 %	40 %	379005855
35	NC_016884	TACCG	2	10	64429	64438	20 %	20 %	20 %	40 %	379005856
36	NC_016884	TCGAA	2	10	67086	67095	40 %	20 %	20 %	20 %	379005857
37	NC_016884	CGGGG	2	10	69309	69318	0 %	0 %	80 %	20 %	379005858
38	NC_016884	GGCCT	2	10	69943	69952	0 %	20 %	40 %	40 %	379005858
39	NC_016884	TTGGG	2	10	71950	71959	0 %	40 %	60 %	0 %	379005860
40	NC_016884	AGTCG	2	10	76880	76889	20 %	20 %	40 %	20 %	379005861
41	NC_016884	CGTCC	2	10	80740	80749	0 %	20 %	20 %	60 %	379005862
42	NC_016884	AAAAC	2	10	81445	81454	80 %	0 %	0 %	20 %	379005862
43	NC_016884	AACGA	2	10	85579	85588	60 %	0 %	20 %	20 %	379005864
44	NC_016884	TACGT	2	10	88228	88237	20 %	40 %	20 %	20 %	379005866
45	NC_016884	GAAGC	2	10	92279	92288	40 %	0 %	40 %	20 %	379005867
46	NC_016884	GGGGA	2	10	92822	92831	20 %	0 %	80 %	0 %	379005867
47	NC_016884	GATTA	2	10	92970	92979	40 %	40 %	20 %	0 %	379005868
48	NC_016884	GGCGG	2	10	95503	95512	0 %	0 %	80 %	20 %	379005869
49	NC_016884	GCCCC	2	10	96611	96620	0 %	0 %	20 %	80 %	379005869
50	NC_016884	CGTGG	2	10	98506	98515	0 %	20 %	60 %	20 %	379005871
51	NC_016884	AGACG	2	10	100331	100340	40 %	0 %	40 %	20 %	379005872
52	NC_016884	CAATC	2	10	100678	100687	40 %	20 %	0 %	40 %	379005872
53	NC_016884	ACCGG	2	10	102135	102144	20 %	0 %	40 %	40 %	379005873
54	NC_016884	TGACG	2	10	103259	103268	20 %	20 %	40 %	20 %	379005873
55	NC_016884	CCGGC	2	10	106792	106801	0 %	0 %	40 %	60 %	379005876
56	NC_016884	CCCGG	2	10	106837	106846	0 %	0 %	40 %	60 %	379005876
57	NC_016884	CGGGA	2	10	108309	108318	20 %	0 %	60 %	20 %	379005877
58	NC_016884	TTTCC	2	10	110819	110828	0 %	60 %	0 %	40 %	379005879
59	NC_016884	GGGCG	2	10	111516	111525	0 %	0 %	80 %	20 %	379005879
60	NC_016884	GAAAT	2	10	113611	113620	60 %	20 %	20 %	0 %	379005881
61	NC_016884	CTTCC	2	10	113891	113900	0 %	40 %	0 %	60 %	379005881
62	NC_016884	AGCCG	2	10	114709	114718	20 %	0 %	40 %	40 %	379005882
63	NC_016884	GATCG	2	10	115996	116005	20 %	20 %	40 %	20 %	379005883
64	NC_016884	GAGCG	2	10	117855	117864	20 %	0 %	60 %	20 %	379005885
65	NC_016884	ATCGG	2	10	118210	118219	20 %	20 %	40 %	20 %	379005885
66	NC_016884	ACTTG	2	10	119963	119972	20 %	40 %	20 %	20 %	379005887
67	NC_016884	GGCTC	2	10	120525	120534	0 %	20 %	40 %	40 %	379005888
68	NC_016884	GGTTC	2	10	126396	126405	0 %	40 %	40 %	20 %	379005893
69	NC_016884	GTCCG	2	10	126637	126646	0 %	20 %	40 %	40 %	379005893
70	NC_016884	CCGGG	2	10	126840	126849	0 %	0 %	60 %	40 %	379005893
71	NC_016884	CGGAC	2	10	128306	128315	20 %	0 %	40 %	40 %	379005895
72	NC_016884	TCCCG	2	10	134843	134852	0 %	20 %	20 %	60 %	379005900
73	NC_016884	CGATT	2	10	136273	136282	20 %	40 %	20 %	20 %	379005903
74	NC_016884	TAACG	2	10	140587	140596	40 %	20 %	20 %	20 %	379005907
75	NC_016884	GATCG	2	10	142020	142029	20 %	20 %	40 %	20 %	379005908
76	NC_016884	GCCGC	2	10	145576	145585	0 %	0 %	40 %	60 %	379005911
77	NC_016884	ATTTG	2	10	152577	152586	20 %	60 %	20 %	0 %	379005921
78	NC_016884	GTCCC	2	10	154352	154361	0 %	20 %	20 %	60 %	379005924
79	NC_016884	GAGAG	2	10	155166	155175	40 %	0 %	60 %	0 %	379005926
80	NC_016884	CCGGC	2	10	157013	157022	0 %	0 %	40 %	60 %	379005928
81	NC_016884	GATTT	2	10	161167	161176	20 %	60 %	20 %	0 %	379005933
82	NC_016884	AGATA	2	10	161406	161415	60 %	20 %	20 %	0 %	379005934
83	NC_016884	CGGTC	2	10	164699	164708	0 %	20 %	40 %	40 %	379005937
84	NC_016884	CCGAG	2	10	164999	165008	20 %	0 %	40 %	40 %	379005937
85	NC_016884	AACCG	2	10	170783	170792	40 %	0 %	20 %	40 %	379005938
86	NC_016884	GTGGC	2	10	179179	179188	0 %	20 %	60 %	20 %	379005948
87	NC_016884	CGGTA	2	10	181542	181551	20 %	20 %	40 %	20 %	379005950
88	NC_016884	CGTGG	2	10	182452	182461	0 %	20 %	60 %	20 %	379005951
89	NC_016884	AATTA	2	10	183032	183041	60 %	40 %	0 %	0 %	379005952
90	NC_016884	TTTGA	2	10	186348	186357	20 %	60 %	20 %	0 %	379005956
91	NC_016884	GAGCC	2	10	189226	189235	20 %	0 %	40 %	40 %	379005958
92	NC_016884	GGATC	2	10	189853	189862	20 %	20 %	40 %	20 %	379005958
93	NC_016884	AGTCC	2	10	191267	191276	20 %	20 %	20 %	40 %	379005960
94	NC_016884	TATTT	2	10	191315	191324	20 %	80 %	0 %	0 %	379005960
95	NC_016884	CGGCC	2	10	192568	192577	0 %	0 %	40 %	60 %	379005961
96	NC_016884	CCCAT	2	10	193073	193082	20 %	20 %	0 %	60 %	379005962
97	NC_016884	CACTC	2	10	193132	193141	20 %	20 %	0 %	60 %	379005962
98	NC_016884	TTCGG	2	10	193343	193352	0 %	40 %	40 %	20 %	379005963
99	NC_016884	GGGAC	2	10	194831	194840	20 %	0 %	60 %	20 %	379005965
100	NC_016884	GGGTC	2	10	197265	197274	0 %	20 %	60 %	20 %	379005966
101	NC_016884	CGGAT	2	10	197712	197721	20 %	20 %	40 %	20 %	379005967
102	NC_016884	GGTCA	2	10	199814	199823	20 %	20 %	40 %	20 %	379005970
103	NC_016884	CGGCC	2	10	200687	200696	0 %	0 %	40 %	60 %	379005970
104	NC_016884	GGACG	2	10	200798	200807	20 %	0 %	60 %	20 %	379005970
105	NC_016884	GGTTT	2	10	207968	207977	0 %	60 %	40 %	0 %	379005975
106	NC_016884	ACGGG	2	10	213667	213676	20 %	0 %	60 %	20 %	379005986
107	NC_016884	CCAGG	2	10	214923	214932	20 %	0 %	40 %	40 %	379005987
108	NC_016884	GACGT	2	10	217319	217328	20 %	20 %	40 %	20 %	379005989
109	NC_016884	AGGAT	2	10	217648	217657	40 %	20 %	40 %	0 %	379005989
110	NC_016884	ACCCG	2	10	221123	221132	20 %	0 %	20 %	60 %	379005992
111	NC_016884	ATTTT	2	10	226108	226117	20 %	80 %	0 %	0 %	379005995
112	NC_016884	ATTGG	2	10	228791	228800	20 %	40 %	40 %	0 %	379005996
113	NC_016884	GCCCA	2	10	230343	230352	20 %	0 %	20 %	60 %	379005997
114	NC_016884	AGTGG	2	10	230596	230605	20 %	20 %	60 %	0 %	379005998
115	NC_016884	CCCGG	2	10	231848	231857	0 %	0 %	40 %	60 %	379005999
116	NC_016884	CCGGC	2	10	236885	236894	0 %	0 %	40 %	60 %	379006006
117	NC_016884	GCCCA	2	10	238480	238489	20 %	0 %	20 %	60 %	379006007
118	NC_016884	CGACG	2	10	239510	239519	20 %	0 %	40 %	40 %	379006008
119	NC_016884	CACCG	2	10	239726	239735	20 %	0 %	20 %	60 %	379006008
120	NC_016884	ATCGG	2	10	240530	240539	20 %	20 %	40 %	20 %	379006009
121	NC_016884	CCGAT	2	10	243947	243956	20 %	20 %	20 %	40 %	379006012
122	NC_016884	GGCGC	2	10	245381	245390	0 %	0 %	60 %	40 %	379006013
123	NC_016884	GATTT	2	10	246075	246084	20 %	60 %	20 %	0 %	379006014
124	NC_016884	TTGAT	2	10	250517	250526	20 %	60 %	20 %	0 %	379006018
125	NC_016884	GATTC	2	10	250886	250895	20 %	40 %	20 %	20 %	379006019
126	NC_016884	CGGAG	2	10	253527	253536	20 %	0 %	60 %	20 %	379006021
127	NC_016884	GAATG	2	10	254251	254260	40 %	20 %	40 %	0 %	379006022
128	NC_016884	TTTTG	2	10	255207	255216	0 %	80 %	20 %	0 %	379006023
129	NC_016884	ATCGG	2	10	255742	255751	20 %	20 %	40 %	20 %	379006023
130	NC_016884	CGGTT	2	10	257187	257196	0 %	40 %	40 %	20 %	379006024
131	NC_016884	GGCGT	2	10	259217	259226	0 %	20 %	60 %	20 %	379006025
132	NC_016884	CTTGG	2	10	274880	274889	0 %	40 %	40 %	20 %	379006031
133	NC_016884	GACGG	2	10	276276	276285	20 %	0 %	60 %	20 %	379006033
134	NC_016884	GATCG	2	10	278278	278287	20 %	20 %	40 %	20 %	379006033
135	NC_016884	AACAA	2	10	281659	281668	80 %	0 %	0 %	20 %	379006035
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141	NC_016884	GATTT	2	10	289200	289209	20 %	60 %	20 %	0 %	379006042
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149	NC_016884	GTCGG	2	10	304173	304182	0 %	20 %	60 %	20 %	379006059
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244	NC_016884	CCCGG	2	10	495511	495520	0 %	0 %	40 %	60 %	379006246
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247	NC_016884	GCCAG	2	10	502533	502542	20 %	0 %	40 %	40 %	379006252
248	NC_016884	TTATT	2	10	504561	504570	20 %	80 %	0 %	0 %	379006254
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250	NC_016884	CGGTG	2	10	508095	508104	0 %	20 %	60 %	20 %	379006256
251	NC_016884	GCCGC	2	10	508120	508129	0 %	0 %	40 %	60 %	379006256
252	NC_016884	TCACC	2	10	508438	508447	20 %	20 %	0 %	60 %	379006257
253	NC_016884	ACCAA	2	10	509019	509028	60 %	0 %	0 %	40 %	379006258
254	NC_016884	TGACC	2	10	511141	511150	20 %	20 %	20 %	40 %	379006260
255	NC_016884	GCATG	2	10	514968	514977	20 %	20 %	40 %	20 %	379006263
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259	NC_016884	GTCGC	2	10	522162	522171	0 %	20 %	40 %	40 %	379006269
260	NC_016884	GCGCG	2	10	522493	522502	0 %	0 %	60 %	40 %	379006269
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