MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Sulfobacillus acidophilus DSM 10332 chromosome

Total Repeats: 1164

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016884	TTGC	2	8	13529	13536	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_016884	CTCC	2	8	13618	13625	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3	NC_016884	TGAA	2	8	14310	14317	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016884	TGGA	2	8	25943	25950	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016884	CTCA	2	8	40702	40709	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_016884	CAAC	2	8	41262	41269	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_016884	TCAT	2	8	42085	42092	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_016884	AATC	2	8	42429	42436	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_016884	AGAC	2	8	47522	47529	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_016884	GGCG	2	8	47825	47832	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11	NC_016884	GCGG	2	8	48071	48078	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12	NC_016884	AAGC	2	8	50390	50397	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_016884	ATTG	2	8	50446	50453	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016884	CTTA	2	8	50951	50958	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_016884	CCTC	2	8	52501	52508	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
16	NC_016884	GGAA	2	8	62142	62149	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016884	TAAA	2	8	82063	82070	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016884	GCCG	2	8	96802	96809	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_016884	CGTT	2	8	97230	97237	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_016884	TCAT	2	8	110084	110091	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_016884	ATAA	2	8	110181	110188	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016884	GTTC	2	8	128084	128091	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_016884	GGGA	2	8	136697	136704	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016884	TTGG	2	8	139588	139595	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016884	CACG	2	8	141025	141032	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_016884	TCGA	2	8	146945	146952	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_016884	TCCT	2	8	157555	157562	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_016884	GTTA	2	8	157582	157589	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016884	CCCG	2	8	157649	157656	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
30	NC_016884	TTAT	2	8	162777	162784	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016884	AATC	2	8	163080	163087	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_016884	GTGA	2	8	165762	165769	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016884	CTGT	2	8	165794	165801	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_016884	TCGG	2	8	166489	166496	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_016884	CGGT	2	8	166790	166797	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_016884	GGAC	2	8	167136	167143	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_016884	GAGT	2	8	167227	167234	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016884	GATC	2	8	167709	167716	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_016884	GTCG	2	8	167969	167976	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_016884	GGCG	2	8	168255	168262	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
41	NC_016884	GGGA	2	8	169712	169719	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016884	TCCG	2	8	169767	169774	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_016884	TCGG	2	8	169868	169875	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_016884	CCCG	2	8	169981	169988	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
45	NC_016884	GGAC	2	8	174029	174036	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_016884	TTCG	2	8	174054	174061	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_016884	TCCC	2	8	174759	174766	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
48	NC_016884	TCGG	2	8	178484	178491	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_016884	AGGA	2	8	185171	185178	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016884	GCTA	2	8	193640	193647	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_016884	ACCG	2	8	193964	193971	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_016884	GTTT	2	8	194082	194089	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016884	AAAG	2	8	199366	199373	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016884	TCCG	2	8	204495	204502	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_016884	ATTT	2	8	211684	211691	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016884	CCTG	2	8	211736	211743	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_016884	GAGG	2	8	219049	219056	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016884	GGCC	2	8	249302	249309	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_016884	AAAG	2	8	257893	257900	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016884	GTGA	2	8	261282	261289	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016884	CTGT	2	8	261314	261321	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_016884	TCGG	2	8	262009	262016	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_016884	CGGT	2	8	262310	262317	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_016884	GGAC	2	8	262742	262749	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_016884	GAGT	2	8	262833	262840	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016884	GATC	2	8	263315	263322	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_016884	GTCG	2	8	263575	263582	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_016884	GGCG	2	8	263861	263868	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
69	NC_016884	GGGA	2	8	265318	265325	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016884	TCCG	2	8	265373	265380	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_016884	TCGG	2	8	265474	265481	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_016884	CCCG	2	8	265587	265594	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
73	NC_016884	GACG	2	8	267303	267310	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_016884	CCTT	2	8	267450	267457	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_016884	TACA	2	8	267690	267697	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_016884	GTCC	2	8	267811	267818	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_016884	GTGA	2	8	269130	269137	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016884	CTGT	2	8	269162	269169	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_016884	TCGG	2	8	269857	269864	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_016884	CGGT	2	8	270158	270165	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_016884	GGAC	2	8	270590	270597	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_016884	GAGT	2	8	270681	270688	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016884	GATC	2	8	271163	271170	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_016884	GTCG	2	8	271423	271430	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_016884	GCGA	2	8	271710	271717	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_016884	GGGA	2	8	273166	273173	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016884	TCCG	2	8	273221	273228	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_016884	TCGG	2	8	273322	273329	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_016884	CCCG	2	8	273435	273442	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
90	NC_016884	TGGG	2	8	278815	278822	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016884	GTCA	2	8	278871	278878	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_016884	GGAT	2	8	280293	280300	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016884	GAAC	2	8	280534	280541	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_016884	CGGT	2	8	284039	284046	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_016884	TGAG	2	8	288434	288441	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016884	CAAC	2	8	296338	296345	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_016884	TTGA	2	8	298752	298759	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016884	GGGC	2	8	302336	302343	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
99	NC_016884	CCTG	2	8	307046	307053	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
100	NC_016884	AGGA	2	8	320802	320809	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016884	AAGG	2	8	330662	330669	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016884	AGGA	2	8	337168	337175	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016884	GAAA	2	8	338835	338842	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016884	TGGG	2	8	339242	339249	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016884	AGTT	2	8	340947	340954	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016884	AAAG	2	8	342873	342880	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016884	GTCG	2	8	349336	349343	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_016884	CGGT	2	8	365746	365753	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_016884	CTTT	2	8	372331	372338	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_016884	AGAC	2	8	374007	374014	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_016884	AGGA	2	8	374023	374030	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016884	CGTC	2	8	387738	387745	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_016884	CTGA	2	8	388745	388752	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_016884	AAGT	2	8	391133	391140	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016884	CCGG	2	8	391145	391152	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_016884	GAAT	2	8	394320	394327	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016884	AGCT	2	8	396089	396096	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_016884	CGCA	2	8	401792	401799	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_016884	GGCG	2	8	402264	402271	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
120	NC_016884	GCCA	2	8	402333	402340	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_016884	CTGA	2	8	413960	413967	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_016884	TGGC	2	8	414261	414268	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_016884	GTTT	2	8	416353	416360	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016884	CCGC	2	8	416459	416466	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
125	NC_016884	GACG	2	8	416488	416495	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_016884	ATTA	2	8	416645	416652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016884	CTTC	2	8	416695	416702	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_016884	CCGC	2	8	419313	419320	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
129	NC_016884	TGTC	2	8	419390	419397	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_016884	TGGT	2	8	419873	419880	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016884	GATG	2	8	419895	419902	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016884	ATTG	2	8	423312	423319	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016884	ACCC	2	8	423824	423831	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
134	NC_016884	CGTA	2	8	424309	424316	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_016884	TGAA	2	8	424758	424765	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016884	TATG	2	8	426725	426732	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016884	GGGA	2	8	429481	429488	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016884	CGGG	2	8	429676	429683	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
139	NC_016884	CGTT	2	8	429829	429836	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_016884	AAAT	2	8	430490	430497	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016884	ATCG	2	8	430565	430572	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_016884	AGAA	2	8	430640	430647	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016884	ACGA	2	8	430781	430788	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_016884	GGCC	2	8	430938	430945	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_016884	TCCT	2	8	438429	438436	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_016884	GATT	2	8	440955	440962	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_016884	GCAT	2	8	447970	447977	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_016884	GGGT	2	8	448147	448154	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
149	NC_016884	CAGG	2	8	448158	448165	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_016884	GCAA	2	8	448237	448244	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_016884	CCAG	2	8	448477	448484	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
152	NC_016884	CGGA	2	8	448827	448834	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
153	NC_016884	CTTT	2	8	449039	449046	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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155	NC_016884	CCCA	2	8	449730	449737	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
156	NC_016884	ATCC	2	8	450969	450976	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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186	NC_016884	CTTT	2	8	479424	479431	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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480	NC_016884	GATT	2	8	1138782	1138789	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
481	NC_016884	AATT	2	8	1141647	1141654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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483	NC_016884	AGGG	2	8	1144967	1144974	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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485	NC_016884	GGAT	2	8	1149980	1149987	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
486	NC_016884	AAGG	2	8	1163380	1163387	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
487	NC_016884	GGGC	2	8	1179181	1179188	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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489	NC_016884	GTCA	2	8	1187616	1187623	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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494	NC_016884	TGCC	2	8	1206560	1206567	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
495	NC_016884	TGGC	2	8	1208158	1208165	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
496	NC_016884	CGGT	2	8	1213175	1213182	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
497	NC_016884	GACA	2	8	1215265	1215272	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
498	NC_016884	AGGA	2	8	1215359	1215366	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
499	NC_016884	GAAT	2	8	1215633	1215640	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
500	NC_016884	GCCG	2	8	1215974	1215981	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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