MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. UK-1 plasmid pSTUK-100

Total Repeats: 16

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016864	TTGTCC	2	12	7	18	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016864	TAATTT	2	12	1855	1866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016864	CCCTGT	2	12	5451	5462	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
4	NC_016864	GGCGCA	2	12	6741	6752	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_016864	AATCTG	2	12	13143	13154	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_016864	TCGGAC	2	12	19281	19292	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_016864	CAAAAT	2	12	25510	25521	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_016864	CTGGCG	2	12	32612	32623	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_016864	CCTCTG	2	12	35075	35086	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
10	NC_016864	CCTGTT	12	72	35484	35555	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_016864	ACTCCA	2	12	42426	42437	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_016864	AAAATT	2	12	42487	42498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016864	TTCATA	2	12	44382	44393	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_016864	CAGTGG	2	12	50264	50275	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_016864	TTAAGG	2	12	50359	50370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016864	CGTGGT	2	12	79332	79343	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.