MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. UK-1 plasmid pSTUK-100

Total Repeats: 86

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016864	ATTT	2	8	978	985	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016864	ACAG	2	8	1071	1078	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_016864	CAGT	2	8	1089	1096	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_016864	GGCA	2	8	5393	5400	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_016864	CCCG	2	8	5676	5683	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6	NC_016864	CCGG	2	8	5710	5717	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_016864	GTGA	2	8	5726	5733	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016864	CCCG	2	8	5772	5779	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9	NC_016864	GGCA	2	8	5811	5818	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_016864	GCCT	2	8	6361	6368	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_016864	CTGA	2	8	6967	6974	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_016864	TATT	2	8	7470	7477	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016864	GTAA	2	8	7554	7561	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016864	CCCG	2	8	7965	7972	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15	NC_016864	TTTA	2	8	12795	12802	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016864	ATTC	2	8	12949	12956	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_016864	CGAA	2	8	14543	14550	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_016864	AATA	2	8	20135	20142	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016864	ATTT	2	8	20632	20639	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016864	CCCG	2	8	21277	21284	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
21	NC_016864	TTTG	2	8	21367	21374	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016864	TTAG	2	8	21375	21382	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016864	GTTT	2	8	21394	21401	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016864	ATGA	2	8	23159	23166	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016864	TGGC	2	8	23417	23424	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_016864	CAGG	2	8	23698	23705	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_016864	GCTG	2	8	23751	23758	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_016864	CCGG	2	8	23997	24004	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_016864	TGGC	2	8	24157	24164	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_016864	CTTT	2	8	25275	25282	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_016864	GCTT	2	8	25294	25301	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_016864	ATTT	2	8	25528	25535	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016864	TGAA	2	8	30913	30920	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016864	CCGG	2	8	31004	31011	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_016864	CGGG	2	8	32509	32516	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
36	NC_016864	CGGG	2	8	32652	32659	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
37	NC_016864	ATCA	2	8	32662	32669	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_016864	GAAA	2	8	33508	33515	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016864	GCCG	2	8	33644	33651	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_016864	CATC	2	8	33707	33714	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_016864	TCCT	2	8	33767	33774	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_016864	TCAT	2	8	34434	34441	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_016864	ATTA	2	8	40762	40769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016864	TGCC	2	8	40979	40986	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_016864	ACTG	2	8	41340	41347	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_016864	AATA	2	8	41387	41394	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016864	CAGT	2	8	41801	41808	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_016864	TAAA	2	8	43206	43213	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016864	GTCA	2	8	49174	49181	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_016864	GCCG	2	8	49198	49205	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_016864	CCTG	2	8	49223	49230	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_016864	TGAA	2	8	50046	50053	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016864	TCTG	2	8	50319	50326	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_016864	TGGT	2	8	64976	64983	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016864	CTGA	2	8	65763	65770	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_016864	GAAA	2	8	65800	65807	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016864	AAAT	2	8	65841	65848	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016864	GTTA	2	8	66045	66052	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016864	AATT	2	8	66061	66068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016864	TCTT	2	8	66087	66094	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_016864	CCGT	2	8	76395	76402	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_016864	TGGC	2	8	76512	76519	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_016864	AAGT	2	8	76923	76930	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016864	AGTG	2	8	77283	77290	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016864	TGGC	2	8	77321	77328	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_016864	TAAA	2	8	78749	78756	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016864	GCCC	2	8	78799	78806	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
68	NC_016864	TCCC	2	8	80381	80388	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
69	NC_016864	CCGG	2	8	80431	80438	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_016864	TAAA	2	8	83782	83789	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016864	TGTT	2	8	83875	83882	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016864	CTAA	2	8	83907	83914	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_016864	GCCT	2	8	84156	84163	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_016864	TAAA	2	8	89177	89184	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016864	TGGC	2	8	89799	89806	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_016864	TTCC	2	8	89811	89818	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_016864	AAAC	2	8	90356	90363	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_016864	TGTT	2	8	90388	90395	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016864	CAAA	2	8	90432	90439	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_016864	CATA	2	8	90497	90504	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_016864	CTTT	2	8	91061	91068	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_016864	TTGC	2	8	91073	91080	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_016864	GTGG	2	8	91193	91200	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016864	TTCC	2	8	91524	91531	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_016864	GCAG	2	8	91756	91763	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_016864	TCAC	2	8	92030	92037	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.