MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. UK-1 plasmid pSTUK-100

Total Repeats: 215

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016864	CATC	2	8	774	781	25 %	25 %	0 %	50 %	378991862
2	NC_016864	GCAG	2	8	3863	3870	25 %	0 %	50 %	25 %	378991868
3	NC_016864	GCGG	2	8	4136	4143	0 %	0 %	75 %	25 %	378991868
4	NC_016864	CAGC	2	8	4181	4188	25 %	0 %	25 %	50 %	378991868
5	NC_016864	ACCG	2	8	4323	4330	25 %	0 %	25 %	50 %	378991868
6	NC_016864	GCTG	2	8	4740	4747	0 %	25 %	50 %	25 %	378991869
7	NC_016864	GCCG	2	8	4877	4884	0 %	0 %	50 %	50 %	378991869
8	NC_016864	TCCG	2	8	4938	4945	0 %	25 %	25 %	50 %	378991869
9	NC_016864	GGCA	2	8	5955	5962	25 %	0 %	50 %	25 %	378991870
10	NC_016864	CTGC	2	8	6111	6118	0 %	25 %	25 %	50 %	378991870
11	NC_016864	GCGA	2	8	6221	6228	25 %	0 %	50 %	25 %	378991870
12	NC_016864	GATG	2	8	7684	7691	25 %	25 %	50 %	0 %	378991872
13	NC_016864	CAGA	2	8	7906	7913	50 %	0 %	25 %	25 %	378991872
14	NC_016864	ATGT	2	8	8450	8457	25 %	50 %	25 %	0 %	378991873
15	NC_016864	GTAT	2	8	8507	8514	25 %	50 %	25 %	0 %	378991873
16	NC_016864	TACT	2	8	8962	8969	25 %	50 %	0 %	25 %	378991874
17	NC_016864	GGCG	2	8	10873	10880	0 %	0 %	75 %	25 %	378991875
18	NC_016864	CCCA	2	8	11289	11296	25 %	0 %	0 %	75 %	378991875
19	NC_016864	TCCG	2	8	11441	11448	0 %	25 %	25 %	50 %	378991875
20	NC_016864	CTGA	2	8	11650	11657	25 %	25 %	25 %	25 %	378991875
21	NC_016864	TCGG	2	8	12100	12107	0 %	25 %	50 %	25 %	378991876
22	NC_016864	AGAA	2	8	13568	13575	75 %	0 %	25 %	0 %	378991877
23	NC_016864	AATA	2	8	13585	13592	75 %	25 %	0 %	0 %	378991877
24	NC_016864	TGGC	2	8	15010	15017	0 %	25 %	50 %	25 %	378991878
25	NC_016864	AGGC	2	8	15110	15117	25 %	0 %	50 %	25 %	378991878
26	NC_016864	ATTT	2	8	15411	15418	25 %	75 %	0 %	0 %	378991878
27	NC_016864	TACA	2	8	15445	15452	50 %	25 %	0 %	25 %	378991878
28	NC_016864	GGCG	2	8	15453	15460	0 %	0 %	75 %	25 %	378991878
29	NC_016864	GCTG	2	8	15519	15526	0 %	25 %	50 %	25 %	378991878
30	NC_016864	GACC	2	8	15939	15946	25 %	0 %	25 %	50 %	378991879
31	NC_016864	TTGT	2	8	16576	16583	0 %	75 %	25 %	0 %	378991879
32	NC_016864	TCAG	2	8	16968	16975	25 %	25 %	25 %	25 %	378991880
33	NC_016864	GCCA	2	8	17520	17527	25 %	0 %	25 %	50 %	378991880
34	NC_016864	TGCC	2	8	17725	17732	0 %	25 %	25 %	50 %	378991880
35	NC_016864	AATC	2	8	18191	18198	50 %	25 %	0 %	25 %	378991880
36	NC_016864	ATTT	2	8	18268	18275	25 %	75 %	0 %	0 %	378991880
37	NC_016864	GGCG	2	8	18596	18603	0 %	0 %	75 %	25 %	378991881
38	NC_016864	TTCC	2	8	18670	18677	0 %	50 %	0 %	50 %	378991881
39	NC_016864	ATAC	2	8	19340	19347	50 %	25 %	0 %	25 %	378991882
40	NC_016864	GACA	2	8	19964	19971	50 %	0 %	25 %	25 %	378991882
41	NC_016864	GTTT	2	8	19989	19996	0 %	75 %	25 %	0 %	378991882
42	NC_016864	TGGT	2	8	20024	20031	0 %	50 %	50 %	0 %	378991882
43	NC_016864	TCTG	2	8	20713	20720	0 %	50 %	25 %	25 %	378991883
44	NC_016864	CTGC	2	8	20788	20795	0 %	25 %	25 %	50 %	378991883
45	NC_016864	TGTC	2	8	21184	21191	0 %	50 %	25 %	25 %	378991883
46	NC_016864	GGTG	2	8	21541	21548	0 %	25 %	75 %	0 %	378991884
47	NC_016864	GAAA	2	8	22447	22454	75 %	0 %	25 %	0 %	378991884
48	NC_016864	AGCC	2	8	22648	22655	25 %	0 %	25 %	50 %	378991885
49	NC_016864	CAGA	2	8	22755	22762	50 %	0 %	25 %	25 %	378991885
50	NC_016864	GTCA	2	8	23042	23049	25 %	25 %	25 %	25 %	378991885
51	NC_016864	TCAG	2	8	24262	24269	25 %	25 %	25 %	25 %	378991887
52	NC_016864	GCCT	2	8	24513	24520	0 %	25 %	25 %	50 %	378991887
53	NC_016864	CCAG	2	8	24761	24768	25 %	0 %	25 %	50 %	378991887
54	NC_016864	TGTA	2	8	25925	25932	25 %	50 %	25 %	0 %	378991888
55	NC_016864	AGCC	2	8	26453	26460	25 %	0 %	25 %	50 %	378991888
56	NC_016864	TCGA	2	8	26478	26485	25 %	25 %	25 %	25 %	378991888
57	NC_016864	TGAC	2	8	26859	26866	25 %	25 %	25 %	25 %	378991889
58	NC_016864	TCAA	2	8	27276	27283	50 %	25 %	0 %	25 %	378991889
59	NC_016864	GTCT	2	8	27475	27482	0 %	50 %	25 %	25 %	378991889
60	NC_016864	GCCT	2	8	28091	28098	0 %	25 %	25 %	50 %	378991890
61	NC_016864	CTGC	2	8	28324	28331	0 %	25 %	25 %	50 %	378991890
62	NC_016864	CGTT	2	8	28607	28614	0 %	50 %	25 %	25 %	378991890
63	NC_016864	GGTC	2	8	28700	28707	0 %	25 %	50 %	25 %	378991890
64	NC_016864	GAAC	2	8	28740	28747	50 %	0 %	25 %	25 %	378991890
65	NC_016864	TTTC	2	8	29355	29362	0 %	75 %	0 %	25 %	378991891
66	NC_016864	CTGG	2	8	30372	30379	0 %	25 %	50 %	25 %	378991892
67	NC_016864	GACC	2	8	31333	31340	25 %	0 %	25 %	50 %	378991894
68	NC_016864	GGCT	2	8	32812	32819	0 %	25 %	50 %	25 %	378991896
69	NC_016864	GCTG	2	8	34056	34063	0 %	25 %	50 %	25 %	378991897
70	NC_016864	TCGC	2	8	34249	34256	0 %	25 %	25 %	50 %	378991897
71	NC_016864	AAAG	2	8	35216	35223	75 %	0 %	25 %	0 %	378991899
72	NC_016864	GGTC	2	8	36218	36225	0 %	25 %	50 %	25 %	378991900
73	NC_016864	CAGG	2	8	36314	36321	25 %	0 %	50 %	25 %	378991900
74	NC_016864	CAGC	2	8	36536	36543	25 %	0 %	25 %	50 %	378991900
75	NC_016864	GACA	2	8	36761	36768	50 %	0 %	25 %	25 %	378991901
76	NC_016864	CCTG	2	8	36791	36798	0 %	25 %	25 %	50 %	378991901
77	NC_016864	CCCT	2	8	37317	37324	0 %	25 %	0 %	75 %	378991902
78	NC_016864	GGCT	2	8	37611	37618	0 %	25 %	50 %	25 %	378991902
79	NC_016864	GCTG	2	8	37636	37643	0 %	25 %	50 %	25 %	378991902
80	NC_016864	GTGG	2	8	37939	37946	0 %	25 %	75 %	0 %	378991902
81	NC_016864	CGCT	2	8	38775	38782	0 %	25 %	25 %	50 %	378991902
82	NC_016864	AGCC	2	8	39572	39579	25 %	0 %	25 %	50 %	378991904
83	NC_016864	GCCC	2	8	39642	39649	0 %	0 %	25 %	75 %	378991904
84	NC_016864	CAGG	2	8	42112	42119	25 %	0 %	50 %	25 %	378991905
85	NC_016864	TTCC	2	8	42253	42260	0 %	50 %	0 %	50 %	378991905
86	NC_016864	ACAG	2	8	42362	42369	50 %	0 %	25 %	25 %	378991905
87	NC_016864	CAGA	2	8	42985	42992	50 %	0 %	25 %	25 %	378991906
88	NC_016864	AGAA	2	8	43392	43399	75 %	0 %	25 %	0 %	378991907
89	NC_016864	TAAA	2	8	43418	43425	75 %	25 %	0 %	0 %	378991907
90	NC_016864	ATTT	2	8	43739	43746	25 %	75 %	0 %	0 %	378991907
91	NC_016864	GAAC	2	8	43818	43825	50 %	0 %	25 %	25 %	378991907
92	NC_016864	ATTC	2	8	43976	43983	25 %	50 %	0 %	25 %	378991907
93	NC_016864	TTAA	2	8	44062	44069	50 %	50 %	0 %	0 %	378991908
94	NC_016864	ACCA	2	8	44849	44856	50 %	0 %	0 %	50 %	378991910
95	NC_016864	AATT	2	8	44886	44893	50 %	50 %	0 %	0 %	378991910
96	NC_016864	CTGG	2	8	45655	45662	0 %	25 %	50 %	25 %	378991911
97	NC_016864	TCCG	2	8	45999	46006	0 %	25 %	25 %	50 %	378991912
98	NC_016864	CTGC	2	8	46152	46159	0 %	25 %	25 %	50 %	378991912
99	NC_016864	GTCT	2	8	46210	46217	0 %	50 %	25 %	25 %	378991912
100	NC_016864	CAGC	2	8	46349	46356	25 %	0 %	25 %	50 %	378991912
101	NC_016864	CTGG	2	8	46465	46472	0 %	25 %	50 %	25 %	378991913
102	NC_016864	TCCC	2	8	47041	47048	0 %	25 %	0 %	75 %	378991913
103	NC_016864	GTAC	2	8	47258	47265	25 %	25 %	25 %	25 %	378991913
104	NC_016864	GCTG	2	8	47902	47909	0 %	25 %	50 %	25 %	378991914
105	NC_016864	ACAA	2	8	48303	48310	75 %	0 %	0 %	25 %	378991914
106	NC_016864	TCTG	2	8	48597	48604	0 %	50 %	25 %	25 %	378991915
107	NC_016864	GAAC	2	8	48712	48719	50 %	0 %	25 %	25 %	378991916
108	NC_016864	CCGT	2	8	49134	49141	0 %	25 %	25 %	50 %	378991916
109	NC_016864	ATTA	2	8	49158	49165	50 %	50 %	0 %	0 %	378991916
110	NC_016864	GGCA	2	8	49505	49512	25 %	0 %	50 %	25 %	378991917
111	NC_016864	ATGA	2	8	50546	50553	50 %	25 %	25 %	0 %	378991919
112	NC_016864	CCAG	2	8	50682	50689	25 %	0 %	25 %	50 %	378991919
113	NC_016864	GGAA	2	8	50815	50822	50 %	0 %	50 %	0 %	378991919
114	NC_016864	ATCC	3	12	51031	51042	25 %	25 %	0 %	50 %	378991919
115	NC_016864	CAGG	2	8	51115	51122	25 %	0 %	50 %	25 %	378991919
116	NC_016864	GAAG	2	8	51403	51410	50 %	0 %	50 %	0 %	378991919
117	NC_016864	GCCT	2	8	51608	51615	0 %	25 %	25 %	50 %	378991919
118	NC_016864	GAAG	2	8	51652	51659	50 %	0 %	50 %	0 %	378991919
119	NC_016864	GCGG	2	8	51673	51680	0 %	0 %	75 %	25 %	378991919
120	NC_016864	CGCC	2	8	51732	51739	0 %	0 %	25 %	75 %	378991919
121	NC_016864	GGGC	2	8	51843	51850	0 %	0 %	75 %	25 %	378991919
122	NC_016864	CCCT	2	8	52307	52314	0 %	25 %	0 %	75 %	378991919
123	NC_016864	GACG	2	8	54288	54295	25 %	0 %	50 %	25 %	378991922
124	NC_016864	GGAC	2	8	54524	54531	25 %	0 %	50 %	25 %	378991922
125	NC_016864	TGGA	2	8	55204	55211	25 %	25 %	50 %	0 %	378991923
126	NC_016864	TTTA	2	8	55293	55300	25 %	75 %	0 %	0 %	378991923
127	NC_016864	GCAG	2	8	55903	55910	25 %	0 %	50 %	25 %	378991924
128	NC_016864	AAGG	2	8	56745	56752	50 %	0 %	50 %	0 %	378991925
129	NC_016864	GTGG	2	8	57304	57311	0 %	25 %	75 %	0 %	378991925
130	NC_016864	GGAA	2	8	57394	57401	50 %	0 %	50 %	0 %	378991925
131	NC_016864	CCTG	2	8	57549	57556	0 %	25 %	25 %	50 %	378991925
132	NC_016864	GTCT	2	8	57947	57954	0 %	50 %	25 %	25 %	378991925
133	NC_016864	CAGG	2	8	58216	58223	25 %	0 %	50 %	25 %	378991925
134	NC_016864	GCTG	2	8	58894	58901	0 %	25 %	50 %	25 %	378991927
135	NC_016864	GTCC	2	8	59132	59139	0 %	25 %	25 %	50 %	378991927
136	NC_016864	GCGT	2	8	59644	59651	0 %	25 %	50 %	25 %	378991928
137	NC_016864	GGAC	2	8	60041	60048	25 %	0 %	50 %	25 %	378991929
138	NC_016864	GGAT	2	8	60217	60224	25 %	25 %	50 %	0 %	378991929
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.