MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. UK-1 plasmid pSTUK-100

Total Repeats: 290

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016864	AGC	2	6	55	60	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016864	AAC	2	6	94	99	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_016864	GAA	2	6	124	129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016864	ATA	2	6	191	196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016864	ATC	2	6	250	255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_016864	AGA	2	6	284	289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016864	TCT	2	6	297	302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_016864	TTA	2	6	333	338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016864	CTG	2	6	369	374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_016864	AAT	2	6	403	408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016864	CAT	2	6	791	796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_016864	CAG	2	6	804	809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_016864	TCC	2	6	822	827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_016864	AAC	2	6	865	870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_016864	CAG	2	6	1141	1146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_016864	AGA	2	6	1181	1186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016864	GAC	2	6	1794	1799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_016864	TCT	2	6	1953	1958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_016864	CTG	2	6	2014	2019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_016864	TGT	2	6	2031	2036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016864	GGC	2	6	2336	2341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_016864	GGC	2	6	5215	5220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_016864	GCG	2	6	5265	5270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_016864	GTT	2	6	5371	5376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016864	TGG	2	6	5477	5482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016864	CCG	2	6	5545	5550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_016864	GAC	3	9	5591	5599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_016864	GTG	2	6	5651	5656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016864	CCG	2	6	5692	5697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_016864	GCT	2	6	5764	5769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_016864	CGG	2	6	5782	5787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_016864	GCC	2	6	5804	5809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_016864	GCT	2	6	6338	6343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_016864	GCG	2	6	6375	6380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_016864	ATG	2	6	6390	6395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016864	CGC	2	6	6409	6414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_016864	CAG	2	6	6422	6427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_016864	GAC	2	6	6431	6436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_016864	TCC	2	6	6530	6535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_016864	CCA	2	6	6587	6592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_016864	GCC	2	6	6685	6690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_016864	ACC	2	6	6815	6820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_016864	CGA	2	6	6831	6836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_016864	CGG	2	6	6848	6853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_016864	CGG	2	6	6864	6869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_016864	TGC	2	6	6909	6914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_016864	AGG	2	6	7010	7015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016864	CAC	2	6	7512	7517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_016864	TTC	2	6	7534	7539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_016864	ATA	2	6	8748	8753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016864	TAA	2	6	8894	8899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016864	ATT	2	6	9726	9731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016864	AAG	2	6	9839	9844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016864	ACT	2	6	9868	9873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_016864	TGC	2	6	11824	11829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_016864	CTG	2	6	11891	11896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_016864	ACT	2	6	11900	11905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_016864	ATG	2	6	12695	12700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016864	ATT	2	6	12755	12760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016864	CTG	2	6	12815	12820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_016864	CAA	2	6	12856	12861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_016864	AAC	2	6	12877	12882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_016864	AAC	2	6	12914	12919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_016864	TTC	2	6	12987	12992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_016864	CCA	2	6	13040	13045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_016864	GGA	2	6	13123	13128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016864	AAT	2	6	14116	14121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016864	ATG	2	6	14282	14287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016864	AAC	2	6	14299	14304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_016864	AAT	2	6	14344	14349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016864	TTA	2	6	14488	14493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016864	TAG	2	6	14617	14622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016864	GAT	2	6	19124	19129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016864	AAC	2	6	19157	19162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_016864	TGC	2	6	20074	20079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_016864	CGG	2	6	21316	21321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_016864	TGA	2	6	22580	22585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016864	GGA	2	6	22598	22603	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016864	GGC	2	6	22621	22626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_016864	CCG	2	6	23082	23087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_016864	GGT	2	6	23113	23118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016864	GCT	2	6	23193	23198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_016864	GTG	2	6	23292	23297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016864	GGC	2	6	23408	23413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_016864	GAG	2	6	23425	23430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016864	AGG	2	6	23443	23448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016864	TCG	2	6	23458	23463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_016864	TCC	2	6	23476	23481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_016864	GAG	2	6	23486	23491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016864	ATT	2	6	23502	23507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016864	GAA	2	6	23525	23530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016864	GCG	2	6	23549	23554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_016864	TGA	2	6	23597	23602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016864	CAT	2	6	23607	23612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_016864	GTG	2	6	23668	23673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016864	TGG	2	6	23679	23684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016864	TGG	2	6	23707	23712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016864	CTG	2	6	23975	23980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_016864	CCA	2	6	24186	24191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_016864	ATC	2	6	25287	25292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_016864	CTG	2	6	25337	25342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_016864	CCT	2	6	25497	25502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_016864	CAT	2	6	25574	25579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_016864	ATT	2	6	29584	29589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016864	TAA	2	6	29687	29692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016864	GGA	2	6	29699	29704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016864	TCC	2	6	29734	29739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_016864	TGT	2	6	29762	29767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016864	CGT	2	6	29853	29858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_016864	CGA	2	6	29928	29933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_016864	CGA	2	6	29986	29991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_016864	CCT	2	6	30030	30035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_016864	ATG	2	6	30923	30928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016864	CTC	2	6	30937	30942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_016864	CGG	2	6	30961	30966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_016864	TAT	2	6	31055	31060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016864	TGA	2	6	31080	31085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016864	CCT	2	6	31234	31239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_016864	GCG	2	6	32179	32184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_016864	GCC	2	6	32187	32192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_016864	ATG	2	6	32216	32221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016864	ACG	2	6	32271	32276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_016864	CTG	2	6	32288	32293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_016864	CTG	2	6	32483	32488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_016864	GGA	2	6	32527	32532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016864	ACC	2	6	32633	32638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_016864	AAC	2	6	32692	32697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_016864	CGA	2	6	33566	33571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_016864	GAC	2	6	33579	33584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_016864	CGG	2	6	33753	33758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_016864	GCG	2	6	34408	34413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_016864	GCC	2	6	34416	34421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_016864	GGT	2	6	34922	34927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016864	ATG	2	6	34963	34968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016864	CGC	2	6	35053	35058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_016864	GGA	2	6	35122	35127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016864	TTC	2	6	35458	35463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_016864	ATA	2	6	35473	35478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016864	CTG	3	9	35560	35568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_016864	TGC	2	6	35630	35635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_016864	TGC	2	6	35720	35725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_016864	CGC	2	6	35740	35745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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279	NC_016864	ACA	2	6	91514	91519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
280	NC_016864	GTT	2	6	91559	91564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
281	NC_016864	ACG	2	6	91601	91606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
282	NC_016864	GAT	2	6	91682	91687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
283	NC_016864	CAC	2	6	91688	91693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
284	NC_016864	GGC	2	6	91944	91949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
285	NC_016864	ATG	2	6	91982	91987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
286	NC_016864	TCC	2	6	91997	92002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
287	NC_016864	ACG	2	6	92087	92092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
288	NC_016864	GCT	2	6	92168	92173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
289	NC_016864	TCA	2	6	92175	92180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
290	NC_016864	TAA	2	6	92237	92242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.