MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. UK-1 plasmid pSTUK-100

Total Repeats: 1057

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016864	TTA	2	6	510	515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378991862
2	NC_016864	CAG	2	6	580	585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991862
3	NC_016864	TCT	2	6	608	613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378991862
4	NC_016864	GCT	2	6	623	628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991862
5	NC_016864	ATC	2	6	1351	1356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378991863
6	NC_016864	TAA	2	6	1432	1437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378991863
7	NC_016864	GTT	2	6	1464	1469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378991863
8	NC_016864	CCT	2	6	1524	1529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378991863
9	NC_016864	TGC	3	9	1538	1546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991863
10	NC_016864	CAT	2	6	1627	1632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378991863
11	NC_016864	AGC	2	6	2465	2470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991864
12	NC_016864	GCT	2	6	2505	2510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991864
13	NC_016864	ACG	2	6	2519	2524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991864
14	NC_016864	CCG	2	6	2568	2573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378991864
15	NC_016864	GAA	2	6	2596	2601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378991864
16	NC_016864	GAC	2	6	2659	2664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991864
17	NC_016864	CAT	2	6	2749	2754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378991865
18	NC_016864	CGG	2	6	2768	2773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378991865
19	NC_016864	CTG	2	6	2801	2806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991865
20	NC_016864	CTG	2	6	2867	2872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991865
21	NC_016864	TGC	2	6	3007	3012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991866
22	NC_016864	AGT	2	6	3015	3020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378991866
23	NC_016864	GGT	2	6	3164	3169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378991866
24	NC_016864	CGG	2	6	3227	3232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378991866
25	NC_016864	ACC	2	6	3267	3272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378991866
26	NC_016864	GAC	2	6	3352	3357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991867
27	NC_016864	CTG	2	6	3398	3403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991867
28	NC_016864	ACG	2	6	3422	3427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991867
29	NC_016864	CGT	2	6	3536	3541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991867
30	NC_016864	GCT	2	6	3655	3660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991867
31	NC_016864	GCG	2	6	3729	3734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378991867
32	NC_016864	ATG	2	6	3793	3798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378991867
33	NC_016864	CTG	2	6	3850	3855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991868
34	NC_016864	CTG	2	6	3879	3884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991868
35	NC_016864	CGG	2	6	3904	3909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378991868
36	NC_016864	GCA	2	6	3935	3940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991868
37	NC_016864	GAC	2	6	3942	3947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991868
38	NC_016864	CTG	2	6	3960	3965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991868
39	NC_016864	TGC	2	6	4018	4023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991868
40	NC_016864	CAC	2	6	4096	4101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378991868
41	NC_016864	GGC	2	6	4148	4153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378991868
42	NC_016864	GAT	2	6	4238	4243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378991868
43	NC_016864	CGT	2	6	4272	4277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991868
44	NC_016864	GAC	2	6	4377	4382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991868
45	NC_016864	TGC	2	6	4468	4473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991868
46	NC_016864	AGG	2	6	4601	4606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378991868
47	NC_016864	AGG	2	6	4705	4710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378991869
48	NC_016864	GGT	2	6	4714	4719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378991869
49	NC_016864	CTG	2	6	4763	4768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991869
50	NC_016864	CGG	2	6	4810	4815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378991869
51	NC_016864	GCT	2	6	4819	4824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991869
52	NC_016864	CGA	2	6	4837	4842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991869
53	NC_016864	TGA	3	9	4890	4898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378991869
54	NC_016864	CGC	2	6	4929	4934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378991869
55	NC_016864	CTG	2	6	4949	4954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991869
56	NC_016864	GGC	2	6	5038	5043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378991869
57	NC_016864	GCC	2	6	5060	5065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378991869
58	NC_016864	GAC	2	6	5087	5092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991869
59	NC_016864	GAT	2	6	5137	5142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378991869
60	NC_016864	CAT	2	6	5838	5843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378991870
61	NC_016864	GGT	2	6	5933	5938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378991870
62	NC_016864	CGC	2	6	5948	5953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378991870
63	NC_016864	TGC	2	6	5969	5974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991870
64	NC_016864	GGC	2	6	5976	5981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378991870
65	NC_016864	GCT	2	6	6054	6059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991870
66	NC_016864	AGG	2	6	6066	6071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378991870
67	NC_016864	CAG	2	6	6159	6164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991870
68	NC_016864	GGC	2	6	6188	6193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378991870
69	NC_016864	CGA	2	6	6197	6202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991870
70	NC_016864	CGC	2	6	6312	6317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378991870
71	NC_016864	CTG	2	6	7712	7717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991872
72	NC_016864	AAT	2	6	7757	7762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378991872
73	NC_016864	TCG	2	6	7775	7780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991872
74	NC_016864	CAG	2	6	7793	7798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991872
75	NC_016864	GCT	2	6	7831	7836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991872
76	NC_016864	GGT	2	6	7868	7873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378991872
77	NC_016864	TCA	2	6	8067	8072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378991873
78	NC_016864	TGA	3	9	8096	8104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378991873
79	NC_016864	ATT	2	6	8235	8240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378991873
80	NC_016864	CAA	2	6	8380	8385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378991873
81	NC_016864	TTC	2	6	8421	8426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378991873
82	NC_016864	ATA	2	6	8476	8481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378991873
83	NC_016864	ATT	3	9	8633	8641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378991873
84	NC_016864	TCA	2	6	8973	8978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378991874
85	NC_016864	CCA	2	6	9023	9028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378991874
86	NC_016864	ACG	2	6	9177	9182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991874
87	NC_016864	TTG	2	6	9253	9258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378991874
88	NC_016864	CGA	2	6	9419	9424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991874
89	NC_016864	ATT	2	6	9583	9588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378991874
90	NC_016864	CAT	2	6	9624	9629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378991874
91	NC_016864	AGC	2	6	9631	9636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991874
92	NC_016864	AGG	2	6	9649	9654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378991874
93	NC_016864	TAT	2	6	9995	10000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378991875
94	NC_016864	CAG	2	6	10021	10026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991875
95	NC_016864	CAT	2	6	10030	10035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378991875
96	NC_016864	TAT	3	9	10262	10270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378991875
97	NC_016864	TAG	2	6	10279	10284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378991875
98	NC_016864	CTC	2	6	10421	10426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378991875
99	NC_016864	ATC	2	6	10496	10501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378991875
100	NC_016864	TTA	2	6	10515	10520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378991875
101	NC_016864	CAT	2	6	10622	10627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378991875
102	NC_016864	GGA	2	6	10629	10634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378991875
103	NC_016864	CAT	2	6	10643	10648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378991875
104	NC_016864	TTG	2	6	10650	10655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378991875
105	NC_016864	AGC	2	6	10700	10705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991875
106	NC_016864	CAG	3	9	10742	10750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991875
107	NC_016864	TCA	2	6	10782	10787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378991875
108	NC_016864	GTG	2	6	10793	10798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378991875
109	NC_016864	GGC	2	6	10813	10818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378991875
110	NC_016864	CGG	3	9	11005	11013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378991875
111	NC_016864	CTC	2	6	11156	11161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378991875
112	NC_016864	GGC	2	6	11186	11191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378991875
113	NC_016864	TGC	2	6	11210	11215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991875
114	NC_016864	CAG	2	6	11228	11233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991875
115	NC_016864	ATC	2	6	11270	11275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378991875
116	NC_016864	GCG	2	6	11498	11503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378991875
117	NC_016864	GCC	2	6	11552	11557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378991875
118	NC_016864	GCT	2	6	11561	11566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991875
119	NC_016864	CGG	2	6	12032	12037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378991876
120	NC_016864	TGT	2	6	12089	12094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378991876
121	NC_016864	CTG	2	6	12114	12119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991876
122	NC_016864	TGC	2	6	12206	12211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991876
123	NC_016864	ATA	2	6	12220	12225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378991876
124	NC_016864	CAG	2	6	12249	12254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991876
125	NC_016864	GCA	2	6	12290	12295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991876
126	NC_016864	CAT	2	6	12320	12325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378991876
127	NC_016864	ACC	2	6	12328	12333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378991876
128	NC_016864	CCG	2	6	12379	12384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378991876
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499	NC_016864	GCG	2	6	49441	49446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378991917
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