MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. UK-1 plasmid pSTUK-100

Total Repeats: 130

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016864	T	7	7	453	459	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016864	A	6	6	1387	1392	100 %	0 %	0 %	0 %	378991863
3	NC_016864	A	6	6	1935	1940	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016864	A	6	6	2133	2138	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016864	A	6	6	2445	2450	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016864	A	6	6	3786	3791	100 %	0 %	0 %	0 %	378991867
7	NC_016864	G	6	6	5066	5071	0 %	0 %	100 %	0 %	378991869
8	NC_016864	G	6	6	5236	5241	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016864	A	6	6	5310	5315	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016864	A	6	6	6775	6780	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016864	T	6	6	7258	7263	0 %	100 %	0 %	0 %	378991871
12	NC_016864	A	6	6	8044	8049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016864	T	7	7	8111	8117	0 %	100 %	0 %	0 %	378991873
14	NC_016864	T	6	6	8180	8185	0 %	100 %	0 %	0 %	378991873
15	NC_016864	T	6	6	8646	8651	0 %	100 %	0 %	0 %	378991873
16	NC_016864	A	6	6	8760	8765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016864	G	6	6	8857	8862	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016864	T	8	8	9748	9755	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016864	T	6	6	9787	9792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016864	A	6	6	9801	9806	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016864	A	7	7	13471	13477	100 %	0 %	0 %	0 %	378991877
22	NC_016864	T	6	6	13576	13581	0 %	100 %	0 %	0 %	378991877
23	NC_016864	T	6	6	13734	13739	0 %	100 %	0 %	0 %	378991877
24	NC_016864	T	6	6	13772	13777	0 %	100 %	0 %	0 %	378991877
25	NC_016864	T	6	6	14071	14076	0 %	100 %	0 %	0 %	378991877
26	NC_016864	T	9	9	14104	14112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016864	A	6	6	14126	14131	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016864	A	6	6	14394	14399	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016864	C	6	6	15776	15781	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
30	NC_016864	T	6	6	16534	16539	0 %	100 %	0 %	0 %	378991879
31	NC_016864	A	6	6	19215	19220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016864	T	6	6	19434	19439	0 %	100 %	0 %	0 %	378991882
33	NC_016864	G	6	6	20344	20349	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016864	T	6	6	24834	24839	0 %	100 %	0 %	0 %	378991887
35	NC_016864	A	6	6	25219	25224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016864	T	6	6	25280	25285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016864	A	6	6	25568	25573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016864	G	6	6	28394	28399	0 %	0 %	100 %	0 %	378991890
39	NC_016864	T	7	7	28988	28994	0 %	100 %	0 %	0 %	378991890
40	NC_016864	T	6	6	30943	30948	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016864	A	6	6	31445	31450	100 %	0 %	0 %	0 %	378991894
42	NC_016864	T	6	6	33539	33544	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016864	A	6	6	34087	34092	100 %	0 %	0 %	0 %	378991897
44	NC_016864	A	6	6	34520	34525	100 %	0 %	0 %	0 %	378991898
45	NC_016864	A	6	6	35001	35006	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016864	G	6	6	35026	35031	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016864	A	6	6	35365	35370	100 %	0 %	0 %	0 %	378991899
48	NC_016864	T	7	7	35432	35438	0 %	100 %	0 %	0 %	378991899
49	NC_016864	A	6	6	38837	38842	100 %	0 %	0 %	0 %	378991902
50	NC_016864	T	6	6	39283	39288	0 %	100 %	0 %	0 %	378991903
51	NC_016864	T	6	6	39666	39671	0 %	100 %	0 %	0 %	378991904
52	NC_016864	A	6	6	40519	40524	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016864	T	6	6	40755	40760	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016864	T	6	6	40876	40881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016864	A	6	6	41501	41506	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016864	A	6	6	41848	41853	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016864	C	6	6	42060	42065	0 %	0 %	0 %	100 %	378991905
58	NC_016864	A	6	6	42640	42645	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016864	A	6	6	42782	42787	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016864	A	7	7	43291	43297	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016864	T	7	7	43759	43765	0 %	100 %	0 %	0 %	378991907
62	NC_016864	T	6	6	43847	43852	0 %	100 %	0 %	0 %	378991907
63	NC_016864	T	9	9	44090	44098	0 %	100 %	0 %	0 %	378991908
64	NC_016864	A	6	6	44990	44995	100 %	0 %	0 %	0 %	378991910
65	NC_016864	T	6	6	45511	45516	0 %	100 %	0 %	0 %	378991911
66	NC_016864	A	6	6	45689	45694	100 %	0 %	0 %	0 %	378991911
67	NC_016864	G	6	6	47229	47234	0 %	0 %	100 %	0 %	378991913
68	NC_016864	A	6	6	48399	48404	100 %	0 %	0 %	0 %	378991914
69	NC_016864	T	6	6	49119	49124	0 %	100 %	0 %	0 %	378991916
70	NC_016864	A	6	6	49534	49539	100 %	0 %	0 %	0 %	378991918
71	NC_016864	A	8	8	50884	50891	100 %	0 %	0 %	0 %	378991919
72	NC_016864	A	6	6	52135	52140	100 %	0 %	0 %	0 %	378991919
73	NC_016864	T	6	6	53175	53180	0 %	100 %	0 %	0 %	378991920
74	NC_016864	A	6	6	53196	53201	100 %	0 %	0 %	0 %	378991920
75	NC_016864	G	6	6	55076	55081	0 %	0 %	100 %	0 %	378991923
76	NC_016864	G	6	6	58462	58467	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016864	A	6	6	58775	58780	100 %	0 %	0 %	0 %	378991927
78	NC_016864	T	6	6	59355	59360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016864	T	7	7	59551	59557	0 %	100 %	0 %	0 %	378991928
80	NC_016864	A	6	6	60462	60467	100 %	0 %	0 %	0 %	378991930
81	NC_016864	T	6	6	60610	60615	0 %	100 %	0 %	0 %	378991930
82	NC_016864	G	6	6	60736	60741	0 %	0 %	100 %	0 %	378991930
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85	NC_016864	A	6	6	64202	64207	100 %	0 %	0 %	0 %	378991931
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88	NC_016864	A	6	6	66028	66033	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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90	NC_016864	A	6	6	66597	66602	100 %	0 %	0 %	0 %	378991934
91	NC_016864	A	6	6	67099	67104	100 %	0 %	0 %	0 %	378991934
92	NC_016864	A	6	6	68004	68009	100 %	0 %	0 %	0 %	378991934
93	NC_016864	C	6	6	68100	68105	0 %	0 %	0 %	100 %	378991934
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95	NC_016864	T	6	6	68628	68633	0 %	100 %	0 %	0 %	378991935
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99	NC_016864	G	9	9	76557	76565	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016864	A	6	6	77098	77103	100 %	0 %	0 %	0 %	378991942
101	NC_016864	A	6	6	79285	79290	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016864	T	6	6	79777	79782	0 %	100 %	0 %	0 %	378991947
103	NC_016864	T	6	6	79834	79839	0 %	100 %	0 %	0 %	378991947
104	NC_016864	A	7	7	79973	79979	100 %	0 %	0 %	0 %	378991947
105	NC_016864	A	7	7	80339	80345	100 %	0 %	0 %	0 %	378991947
106	NC_016864	C	7	7	80417	80423	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
107	NC_016864	A	6	6	80546	80551	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016864	T	7	7	81182	81188	0 %	100 %	0 %	0 %	378991948
109	NC_016864	T	6	6	81620	81625	0 %	100 %	0 %	0 %	378991949
110	NC_016864	A	6	6	82908	82913	100 %	0 %	0 %	0 %	378991950
111	NC_016864	A	6	6	83107	83112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016864	T	6	6	84125	84130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016864	C	6	6	85025	85030	0 %	0 %	0 %	100 %	378991953
114	NC_016864	C	6	6	85556	85561	0 %	0 %	0 %	100 %	378991954
115	NC_016864	C	6	6	86652	86657	0 %	0 %	0 %	100 %	378991956
116	NC_016864	T	6	6	87922	87927	0 %	100 %	0 %	0 %	378991956
117	NC_016864	C	6	6	88989	88994	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
118	NC_016864	T	6	6	89752	89757	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016864	A	6	6	90532	90537	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016864	A	6	6	90587	90592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016864	A	6	6	90594	90599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016864	A	6	6	90623	90628	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016864	A	6	6	90647	90652	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016864	A	6	6	90772	90777	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016864	T	7	7	91004	91010	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016864	A	6	6	91029	91034	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016864	A	6	6	91173	91178	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016864	A	6	6	91382	91387	100 %	0 %	0 %	0 %	378991959
129	NC_016864	A	6	6	91588	91593	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016864	T	6	6	93269	93274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.