MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. UK-1 plasmid pSTUK-100

Total Repeats: 74

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016864	A	6	6	1387	1392	100 %	0 %	0 %	0 %	378991863
2	NC_016864	A	6	6	3786	3791	100 %	0 %	0 %	0 %	378991867
3	NC_016864	G	6	6	5066	5071	0 %	0 %	100 %	0 %	378991869
4	NC_016864	T	6	6	7258	7263	0 %	100 %	0 %	0 %	378991871
5	NC_016864	T	7	7	8111	8117	0 %	100 %	0 %	0 %	378991873
6	NC_016864	T	6	6	8180	8185	0 %	100 %	0 %	0 %	378991873
7	NC_016864	T	6	6	8646	8651	0 %	100 %	0 %	0 %	378991873
8	NC_016864	A	7	7	13471	13477	100 %	0 %	0 %	0 %	378991877
9	NC_016864	T	6	6	13576	13581	0 %	100 %	0 %	0 %	378991877
10	NC_016864	T	6	6	13734	13739	0 %	100 %	0 %	0 %	378991877
11	NC_016864	T	6	6	13772	13777	0 %	100 %	0 %	0 %	378991877
12	NC_016864	T	6	6	14071	14076	0 %	100 %	0 %	0 %	378991877
13	NC_016864	T	6	6	16534	16539	0 %	100 %	0 %	0 %	378991879
14	NC_016864	T	6	6	19434	19439	0 %	100 %	0 %	0 %	378991882
15	NC_016864	T	6	6	24834	24839	0 %	100 %	0 %	0 %	378991887
16	NC_016864	G	6	6	28394	28399	0 %	0 %	100 %	0 %	378991890
17	NC_016864	T	7	7	28988	28994	0 %	100 %	0 %	0 %	378991890
18	NC_016864	A	6	6	31445	31450	100 %	0 %	0 %	0 %	378991894
19	NC_016864	A	6	6	34087	34092	100 %	0 %	0 %	0 %	378991897
20	NC_016864	A	6	6	34520	34525	100 %	0 %	0 %	0 %	378991898
21	NC_016864	A	6	6	35365	35370	100 %	0 %	0 %	0 %	378991899
22	NC_016864	T	7	7	35432	35438	0 %	100 %	0 %	0 %	378991899
23	NC_016864	A	6	6	38837	38842	100 %	0 %	0 %	0 %	378991902
24	NC_016864	T	6	6	39283	39288	0 %	100 %	0 %	0 %	378991903
25	NC_016864	T	6	6	39666	39671	0 %	100 %	0 %	0 %	378991904
26	NC_016864	C	6	6	42060	42065	0 %	0 %	0 %	100 %	378991905
27	NC_016864	T	7	7	43759	43765	0 %	100 %	0 %	0 %	378991907
28	NC_016864	T	6	6	43847	43852	0 %	100 %	0 %	0 %	378991907
29	NC_016864	T	9	9	44090	44098	0 %	100 %	0 %	0 %	378991908
30	NC_016864	A	6	6	44990	44995	100 %	0 %	0 %	0 %	378991910
31	NC_016864	T	6	6	45511	45516	0 %	100 %	0 %	0 %	378991911
32	NC_016864	A	6	6	45689	45694	100 %	0 %	0 %	0 %	378991911
33	NC_016864	G	6	6	47229	47234	0 %	0 %	100 %	0 %	378991913
34	NC_016864	A	6	6	48399	48404	100 %	0 %	0 %	0 %	378991914
35	NC_016864	T	6	6	49119	49124	0 %	100 %	0 %	0 %	378991916
36	NC_016864	A	6	6	49534	49539	100 %	0 %	0 %	0 %	378991918
37	NC_016864	A	8	8	50884	50891	100 %	0 %	0 %	0 %	378991919
38	NC_016864	A	6	6	52135	52140	100 %	0 %	0 %	0 %	378991919
39	NC_016864	T	6	6	53175	53180	0 %	100 %	0 %	0 %	378991920
40	NC_016864	A	6	6	53196	53201	100 %	0 %	0 %	0 %	378991920
41	NC_016864	G	6	6	55076	55081	0 %	0 %	100 %	0 %	378991923
42	NC_016864	A	6	6	58775	58780	100 %	0 %	0 %	0 %	378991927
43	NC_016864	T	7	7	59551	59557	0 %	100 %	0 %	0 %	378991928
44	NC_016864	A	6	6	60462	60467	100 %	0 %	0 %	0 %	378991930
45	NC_016864	T	6	6	60610	60615	0 %	100 %	0 %	0 %	378991930
46	NC_016864	G	6	6	60736	60741	0 %	0 %	100 %	0 %	378991930
47	NC_016864	T	6	6	62200	62205	0 %	100 %	0 %	0 %	378991931
48	NC_016864	G	6	6	62224	62229	0 %	0 %	100 %	0 %	378991931
49	NC_016864	A	6	6	64202	64207	100 %	0 %	0 %	0 %	378991931
50	NC_016864	A	8	8	64626	64633	100 %	0 %	0 %	0 %	378991932
51	NC_016864	A	7	7	65009	65015	100 %	0 %	0 %	0 %	378991933
52	NC_016864	T	6	6	66486	66491	0 %	100 %	0 %	0 %	378991934
53	NC_016864	A	6	6	66597	66602	100 %	0 %	0 %	0 %	378991934
54	NC_016864	A	6	6	67099	67104	100 %	0 %	0 %	0 %	378991934
55	NC_016864	A	6	6	68004	68009	100 %	0 %	0 %	0 %	378991934
56	NC_016864	C	6	6	68100	68105	0 %	0 %	0 %	100 %	378991934
57	NC_016864	T	6	6	68530	68535	0 %	100 %	0 %	0 %	378991935
58	NC_016864	T	6	6	68628	68633	0 %	100 %	0 %	0 %	378991935
59	NC_016864	C	6	6	72932	72937	0 %	0 %	0 %	100 %	378991938
60	NC_016864	T	6	6	74947	74952	0 %	100 %	0 %	0 %	378991939
61	NC_016864	A	8	8	75222	75229	100 %	0 %	0 %	0 %	378991940
62	NC_016864	A	6	6	77098	77103	100 %	0 %	0 %	0 %	378991942
63	NC_016864	T	6	6	79777	79782	0 %	100 %	0 %	0 %	378991947
64	NC_016864	T	6	6	79834	79839	0 %	100 %	0 %	0 %	378991947
65	NC_016864	A	7	7	79973	79979	100 %	0 %	0 %	0 %	378991947
66	NC_016864	A	7	7	80339	80345	100 %	0 %	0 %	0 %	378991947
67	NC_016864	T	7	7	81182	81188	0 %	100 %	0 %	0 %	378991948
68	NC_016864	T	6	6	81620	81625	0 %	100 %	0 %	0 %	378991949
69	NC_016864	A	6	6	82908	82913	100 %	0 %	0 %	0 %	378991950
70	NC_016864	C	6	6	85025	85030	0 %	0 %	0 %	100 %	378991953
71	NC_016864	C	6	6	85556	85561	0 %	0 %	0 %	100 %	378991954
72	NC_016864	C	6	6	86652	86657	0 %	0 %	0 %	100 %	378991956
73	NC_016864	T	6	6	87922	87927	0 %	100 %	0 %	0 %	378991956
74	NC_016864	A	6	6	91382	91387	100 %	0 %	0 %	0 %	378991959

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.