MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. UK-1 chromosome

Total Repeats: 3346

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016863	AGGTA	2	10	2554	2563	40 %	20 %	40 %	0 %	378987406
2	NC_016863	ATTGC	2	10	3397	3406	20 %	40 %	20 %	20 %	378987407
3	NC_016863	CGGCG	2	10	4145	4154	0 %	0 %	60 %	40 %	378987408
4	NC_016863	CCGCG	2	10	7185	7194	0 %	0 %	40 %	60 %	378987410
5	NC_016863	CCTTC	2	10	8675	8684	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
6	NC_016863	GATGA	2	10	8916	8925	40 %	20 %	40 %	0 %	378987412
7	NC_016863	GAAAA	2	10	10062	10071	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016863	TCTTT	2	10	11323	11332	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_016863	ATTTA	2	10	11365	11374	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016863	GCGTG	2	10	13991	14000	0 %	20 %	60 %	20 %	378987417
11	NC_016863	GTGAT	2	10	14913	14922	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016863	AATCA	2	10	15507	15516	60 %	20 %	0 %	20 %	378987418
13	NC_016863	TATTG	2	10	17577	17586	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016863	GGCTG	2	10	18852	18861	0 %	20 %	60 %	20 %	378987422
15	NC_016863	AGAGC	2	10	19373	19382	40 %	0 %	40 %	20 %	378987422
16	NC_016863	CCTGA	2	10	19914	19923	20 %	20 %	20 %	40 %	378987422
17	NC_016863	TACCG	2	10	21051	21060	20 %	20 %	20 %	40 %	378987423
18	NC_016863	GGCCG	2	10	21675	21684	0 %	0 %	60 %	40 %	378987423
19	NC_016863	CTTTT	2	10	23394	23403	0 %	80 %	0 %	20 %	378987424
20	NC_016863	CGGTA	2	10	24562	24571	20 %	20 %	40 %	20 %	378987425
21	NC_016863	CTGTT	2	10	24601	24610	0 %	60 %	20 %	20 %	378987425
22	NC_016863	TATTT	2	10	25435	25444	20 %	80 %	0 %	0 %	378987426
23	NC_016863	GCGTC	2	10	28358	28367	0 %	20 %	40 %	40 %	378987427
24	NC_016863	ATCTG	2	10	30966	30975	20 %	40 %	20 %	20 %	378987431
25	NC_016863	TTACG	2	10	31021	31030	20 %	40 %	20 %	20 %	378987431
26	NC_016863	GGGCG	2	10	31790	31799	0 %	0 %	80 %	20 %	378987432
27	NC_016863	TGCGT	2	10	32169	32178	0 %	40 %	40 %	20 %	378987433
28	NC_016863	AAAAG	2	10	32563	32572	80 %	0 %	20 %	0 %	378987434
29	NC_016863	TTTTA	2	10	33212	33221	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016863	TATAA	2	10	34166	34175	60 %	40 %	0 %	0 %	378987435
31	NC_016863	ATCGT	2	10	34919	34928	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_016863	ATTTT	2	10	34963	34972	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016863	TTTTA	2	10	35224	35233	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016863	AGCGA	2	10	35592	35601	40 %	0 %	40 %	20 %	378987437
35	NC_016863	TCCTG	2	10	35802	35811	0 %	40 %	20 %	40 %	378987437
36	NC_016863	GGTCA	2	10	38037	38046	20 %	20 %	40 %	20 %	378987438
37	NC_016863	TTCAT	2	10	39309	39318	20 %	60 %	0 %	20 %	378987439
38	NC_016863	TGAAA	2	10	40128	40137	60 %	20 %	20 %	0 %	378987440
39	NC_016863	TAAAA	2	10	44192	44201	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016863	ACGGC	2	10	44488	44497	20 %	0 %	40 %	40 %	378987443
41	NC_016863	TTTTA	2	10	44814	44823	20 %	80 %	0 %	0 %	378987443
42	NC_016863	GGGCT	2	10	46562	46571	0 %	20 %	60 %	20 %	378987444
43	NC_016863	GCGTA	2	10	48438	48447	20 %	20 %	40 %	20 %	378987446
44	NC_016863	GACCA	2	10	49043	49052	40 %	0 %	20 %	40 %	378987446
45	NC_016863	CCGGC	2	10	49185	49194	0 %	0 %	40 %	60 %	378987446
46	NC_016863	CAGAC	2	10	50375	50384	40 %	0 %	20 %	40 %	378987446
47	NC_016863	TGTGC	2	10	53136	53145	0 %	40 %	40 %	20 %	378987450
48	NC_016863	GTTTG	2	10	55458	55467	0 %	60 %	40 %	0 %	378987451
49	NC_016863	CACTA	2	10	56589	56598	40 %	20 %	0 %	40 %	378987451
50	NC_016863	CGGCG	2	10	57127	57136	0 %	0 %	60 %	40 %	378987452
51	NC_016863	AGCGC	2	10	57235	57244	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
52	NC_016863	TTCAC	2	10	57382	57391	20 %	40 %	0 %	40 %	378987453
53	NC_016863	AAAAT	2	10	58953	58962	80 %	20 %	0 %	0 %	378987455
54	NC_016863	GGAAA	2	10	59740	59749	60 %	0 %	40 %	0 %	378987455
55	NC_016863	CGCTG	2	10	60230	60239	0 %	20 %	40 %	40 %	378987456
56	NC_016863	GCCTG	2	10	64789	64798	0 %	20 %	40 %	40 %	378987459
57	NC_016863	GCGCG	2	10	64943	64952	0 %	0 %	60 %	40 %	378987460
58	NC_016863	CGTGC	2	10	71366	71375	0 %	20 %	40 %	40 %	378987466
59	NC_016863	TTGAT	2	10	71536	71545	20 %	60 %	20 %	0 %	378987466
60	NC_016863	ACCGC	2	10	72096	72105	20 %	0 %	20 %	60 %	378987466
61	NC_016863	ATTTG	2	10	75441	75450	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016863	CGATG	2	10	77759	77768	20 %	20 %	40 %	20 %	378987472
63	NC_016863	GCGAA	2	10	78700	78709	40 %	0 %	40 %	20 %	378987472
64	NC_016863	CGTAC	2	10	79590	79599	20 %	20 %	20 %	40 %	378987472
65	NC_016863	TTGCC	2	10	81226	81235	0 %	40 %	20 %	40 %	378987474
66	NC_016863	CGTCC	2	10	81336	81345	0 %	20 %	20 %	60 %	378987474
67	NC_016863	AAGCG	2	10	81699	81708	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_016863	TTCAG	2	10	84453	84462	20 %	40 %	20 %	20 %	378987477
69	NC_016863	GGCCA	2	10	84602	84611	20 %	0 %	40 %	40 %	378987477
70	NC_016863	GTACG	2	10	87173	87182	20 %	20 %	40 %	20 %	378987479
71	NC_016863	CAGAA	2	10	87886	87895	60 %	0 %	20 %	20 %	378987479
72	NC_016863	CCGCA	2	10	90005	90014	20 %	0 %	20 %	60 %	378987481
73	NC_016863	CGGTT	2	10	90510	90519	0 %	40 %	40 %	20 %	378987482
74	NC_016863	GCTCC	2	10	91646	91655	0 %	20 %	20 %	60 %	378987482
75	NC_016863	TGGCG	2	10	92290	92299	0 %	20 %	60 %	20 %	378987484
76	NC_016863	TAAAA	2	10	95765	95774	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016863	TTTCC	2	10	96204	96213	0 %	60 %	0 %	40 %	378987489
78	NC_016863	GTGGC	2	10	96773	96782	0 %	20 %	60 %	20 %	378987489
79	NC_016863	GCGCT	2	10	97925	97934	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
80	NC_016863	AGCGC	2	10	97992	98001	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
81	NC_016863	TGCAC	2	10	98690	98699	20 %	20 %	20 %	40 %	378987490
82	NC_016863	TGGCA	2	10	98759	98768	20 %	20 %	40 %	20 %	378987490
83	NC_016863	TCTGT	2	10	99085	99094	0 %	60 %	20 %	20 %	378987491
84	NC_016863	GCGCT	2	10	99395	99404	0 %	20 %	40 %	40 %	378987491
85	NC_016863	GGCGC	2	10	99809	99818	0 %	0 %	60 %	40 %	378987491
86	NC_016863	GCGAC	2	10	100122	100131	20 %	0 %	40 %	40 %	378987491
87	NC_016863	AACGT	2	10	102579	102588	40 %	20 %	20 %	20 %	378987494
88	NC_016863	CCCAA	2	10	104729	104738	40 %	0 %	0 %	60 %	378987497
89	NC_016863	TTGTT	2	10	105436	105445	0 %	80 %	20 %	0 %	378987497
90	NC_016863	GCTTC	2	10	106816	106825	0 %	40 %	20 %	40 %	378987498
91	NC_016863	TGCGT	2	10	107103	107112	0 %	40 %	40 %	20 %	378987498
92	NC_016863	TGATC	2	10	108803	108812	20 %	40 %	20 %	20 %	378987499
93	NC_016863	AAGCG	2	10	109299	109308	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_016863	TGGCG	2	10	111963	111972	0 %	20 %	60 %	20 %	378987501
95	NC_016863	AGCGC	2	10	112523	112532	20 %	0 %	40 %	40 %	378987501
96	NC_016863	ACGTT	2	10	113340	113349	20 %	40 %	20 %	20 %	378987502
97	NC_016863	CCGCG	2	10	113608	113617	0 %	0 %	40 %	60 %	378987502
98	NC_016863	TAATT	2	10	116726	116735	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016863	ATTTT	2	10	116752	116761	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016863	ACAGA	2	10	116935	116944	60 %	0 %	20 %	20 %	378987505
101	NC_016863	CAGCG	2	10	118110	118119	20 %	0 %	40 %	40 %	378987507
102	NC_016863	GCCGG	2	10	118410	118419	0 %	0 %	60 %	40 %	378987507
103	NC_016863	CGAGC	2	10	118535	118544	20 %	0 %	40 %	40 %	378987507
104	NC_016863	ATTTG	2	10	118978	118987	20 %	60 %	20 %	0 %	378987507
105	NC_016863	TTGCC	2	10	123482	123491	0 %	40 %	20 %	40 %	378987511
106	NC_016863	AGCAG	2	10	124159	124168	40 %	0 %	40 %	20 %	378987512
107	NC_016863	AGTTT	2	10	126389	126398	20 %	60 %	20 %	0 %	378987513
108	NC_016863	TAGTG	2	10	126807	126816	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016863	TCGAT	2	10	128237	128246	20 %	40 %	20 %	20 %	378987514
110	NC_016863	CGGCG	2	10	130548	130557	0 %	0 %	60 %	40 %	378987517
111	NC_016863	CGTTT	2	10	131010	131019	0 %	60 %	20 %	20 %	378987517
112	NC_016863	GACCG	2	10	132454	132463	20 %	0 %	40 %	40 %	378987519
113	NC_016863	GGTTT	2	10	134166	134175	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016863	ATTCC	2	10	136111	136120	20 %	40 %	0 %	40 %	378987522
115	NC_016863	CCCAA	2	10	138180	138189	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
116	NC_016863	AAAGC	2	10	138408	138417	60 %	0 %	20 %	20 %	378987524
117	NC_016863	CCGCA	2	10	138941	138950	20 %	0 %	20 %	60 %	378987524
118	NC_016863	TTGTT	2	10	139527	139536	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016863	AGTTC	2	10	141312	141321	20 %	40 %	20 %	20 %	378987526
120	NC_016863	TGCCT	2	10	141412	141421	0 %	40 %	20 %	40 %	378987527
121	NC_016863	AAGCG	2	10	146065	146074	40 %	0 %	40 %	20 %	378987530
122	NC_016863	GTTTG	2	10	147968	147977	0 %	60 %	40 %	0 %	378987532
123	NC_016863	CGTAT	2	10	149439	149448	20 %	40 %	20 %	20 %	378987533
124	NC_016863	ATCAG	2	10	151275	151284	40 %	20 %	20 %	20 %	378987535
125	NC_016863	CTGCC	2	10	153284	153293	0 %	20 %	20 %	60 %	378987536
126	NC_016863	CGGCG	2	10	156014	156023	0 %	0 %	60 %	40 %	378987539
127	NC_016863	CGCGG	2	10	158664	158673	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
128	NC_016863	CCGGC	2	10	159368	159377	0 %	0 %	40 %	60 %	378987542
129	NC_016863	GATCA	2	10	162686	162695	40 %	20 %	20 %	20 %	378987545
130	NC_016863	CGTCA	2	10	163432	163441	20 %	20 %	20 %	40 %	378987546
131	NC_016863	ATCCC	2	10	165132	165141	20 %	20 %	0 %	60 %	378987548
132	NC_016863	AGCGC	2	10	165840	165849	20 %	0 %	40 %	40 %	378987548
133	NC_016863	TGAGC	2	10	167689	167698	20 %	20 %	40 %	20 %	378987549
134	NC_016863	CGCAT	2	10	167951	167960	20 %	20 %	20 %	40 %	378987550
135	NC_016863	CGAAC	2	10	168680	168689	40 %	0 %	20 %	40 %	378987551
136	NC_016863	GTTCA	2	10	168946	168955	20 %	40 %	20 %	20 %	378987551
137	NC_016863	ATGAC	2	10	169912	169921	40 %	20 %	20 %	20 %	378987552
138	NC_016863	CTGGA	2	10	170502	170511	20 %	20 %	40 %	20 %	378987553
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