MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. UK-1 chromosome

Total Repeats: 11222

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016863	AGAC	2	8	153	160	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_016863	ACCA	2	8	467	474	50 %	0 %	0 %	50 %	378987406
3	NC_016863	GATC	2	8	778	785	25 %	25 %	25 %	25 %	378987406
4	NC_016863	ATGA	2	8	3129	3136	50 %	25 %	25 %	0 %	378987407
5	NC_016863	GATG	2	8	4634	4641	25 %	25 %	50 %	0 %	378987408
6	NC_016863	CAGC	2	8	4643	4650	25 %	0 %	25 %	50 %	378987408
7	NC_016863	CTGA	2	8	4701	4708	25 %	25 %	25 %	25 %	378987408
8	NC_016863	CTGC	2	8	4971	4978	0 %	25 %	25 %	50 %	378987408
9	NC_016863	GCCA	2	8	6665	6672	25 %	0 %	25 %	50 %	378987410
10	NC_016863	TGAA	2	8	7291	7298	50 %	25 %	25 %	0 %	378987410
11	NC_016863	GCGT	2	8	8157	8164	0 %	25 %	50 %	25 %	378987411
12	NC_016863	AAGA	2	8	8239	8246	75 %	0 %	25 %	0 %	378987411
13	NC_016863	CTGT	2	8	8667	8674	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_016863	GAAC	2	8	9719	9726	50 %	0 %	25 %	25 %	378987413
15	NC_016863	CAGG	2	8	10123	10130	25 %	0 %	50 %	25 %	378987414
16	NC_016863	TTGA	2	8	10978	10985	25 %	50 %	25 %	0 %	378987415
17	NC_016863	TGGC	2	8	11005	11012	0 %	25 %	50 %	25 %	378987415
18	NC_016863	TCGT	2	8	11125	11132	0 %	50 %	25 %	25 %	378987415
19	NC_016863	TCTG	2	8	11390	11397	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_016863	ATGG	2	8	11648	11655	25 %	25 %	50 %	0 %	378987416
21	NC_016863	TGGT	2	8	11739	11746	0 %	50 %	50 %	0 %	378987416
22	NC_016863	CAAC	2	8	12252	12259	50 %	0 %	0 %	50 %	378987416
23	NC_016863	AAGA	2	8	12326	12333	75 %	0 %	25 %	0 %	378987416
24	NC_016863	CCAT	2	8	12903	12910	25 %	25 %	0 %	50 %	378987416
25	NC_016863	GCGT	2	8	12931	12938	0 %	25 %	50 %	25 %	378987416
26	NC_016863	GGCT	2	8	13423	13430	0 %	25 %	50 %	25 %	378987416
27	NC_016863	CGGT	2	8	14593	14600	0 %	25 %	50 %	25 %	378987417
28	NC_016863	TCAG	2	8	15244	15251	25 %	25 %	25 %	25 %	378987418
29	NC_016863	TTTG	2	8	15534	15541	0 %	75 %	25 %	0 %	378987418
30	NC_016863	CGAA	2	8	15749	15756	50 %	0 %	25 %	25 %	378987418
31	NC_016863	ATTG	2	8	15761	15768	25 %	50 %	25 %	0 %	378987418
32	NC_016863	ATTA	2	8	16429	16436	50 %	50 %	0 %	0 %	378987419
33	NC_016863	ATAA	2	8	16521	16528	75 %	25 %	0 %	0 %	378987420
34	NC_016863	AATA	2	8	17997	18004	75 %	25 %	0 %	0 %	378987422
35	NC_016863	GGGC	2	8	18583	18590	0 %	0 %	75 %	25 %	378987422
36	NC_016863	CGTG	2	8	19283	19290	0 %	25 %	50 %	25 %	378987422
37	NC_016863	CCAA	2	8	21284	21291	50 %	0 %	0 %	50 %	378987423
38	NC_016863	GACG	2	8	21630	21637	25 %	0 %	50 %	25 %	378987423
39	NC_016863	TGGC	2	8	22283	22290	0 %	25 %	50 %	25 %	378987423
40	NC_016863	TGGC	2	8	22389	22396	0 %	25 %	50 %	25 %	378987423
41	NC_016863	CGCC	2	8	22655	22662	0 %	0 %	25 %	75 %	378987423
42	NC_016863	CTGG	2	8	23001	23008	0 %	25 %	50 %	25 %	378987423
43	NC_016863	TTAT	2	8	23266	23273	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016863	TTTA	2	8	23499	23506	25 %	75 %	0 %	0 %	378987424
45	NC_016863	TCTG	2	8	23956	23963	0 %	50 %	25 %	25 %	378987424
46	NC_016863	TGAA	2	8	24467	24474	50 %	25 %	25 %	0 %	378987425
47	NC_016863	CCAG	2	8	24738	24745	25 %	0 %	25 %	50 %	378987425
48	NC_016863	ACCG	2	8	25415	25422	25 %	0 %	25 %	50 %	378987426
49	NC_016863	AAAT	2	8	25475	25482	75 %	25 %	0 %	0 %	378987426
50	NC_016863	TCTG	2	8	25932	25939	0 %	50 %	25 %	25 %	378987427
51	NC_016863	GCCT	2	8	26113	26120	0 %	25 %	25 %	50 %	378987427
52	NC_016863	CCTT	2	8	26619	26626	0 %	50 %	0 %	50 %	378987427
53	NC_016863	TCAG	2	8	26978	26985	25 %	25 %	25 %	25 %	378987427
54	NC_016863	ATCA	2	8	27391	27398	50 %	25 %	0 %	25 %	378987427
55	NC_016863	CAGC	2	8	27435	27442	25 %	0 %	25 %	50 %	378987427
56	NC_016863	AGCC	2	8	27925	27932	25 %	0 %	25 %	50 %	378987427
57	NC_016863	CCGA	2	8	28132	28139	25 %	0 %	25 %	50 %	378987427
58	NC_016863	ATTA	2	8	28525	28532	50 %	50 %	0 %	0 %	378987428
59	NC_016863	GGCG	2	8	28767	28774	0 %	0 %	75 %	25 %	378987428
60	NC_016863	ATGA	2	8	29972	29979	50 %	25 %	25 %	0 %	378987429
61	NC_016863	TGCT	2	8	30542	30549	0 %	50 %	25 %	25 %	378987431
62	NC_016863	TATC	2	8	30598	30605	25 %	50 %	0 %	25 %	378987431
63	NC_016863	GTAA	2	8	30635	30642	50 %	25 %	25 %	0 %	378987431
64	NC_016863	TTCG	2	8	30897	30904	0 %	50 %	25 %	25 %	378987431
65	NC_016863	GTCA	2	8	31407	31414	25 %	25 %	25 %	25 %	378987432
66	NC_016863	ACCG	2	8	32227	32234	25 %	0 %	25 %	50 %	378987433
67	NC_016863	AGGC	2	8	32265	32272	25 %	0 %	50 %	25 %	378987433
68	NC_016863	CCTG	2	8	32701	32708	0 %	25 %	25 %	50 %	378987434
69	NC_016863	CGCA	2	8	32891	32898	25 %	0 %	25 %	50 %	378987434
70	NC_016863	TAAA	2	8	32961	32968	75 %	25 %	0 %	0 %	378987434
71	NC_016863	CCAG	2	8	33347	33354	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_016863	TTAT	2	8	33530	33537	25 %	75 %	0 %	0 %	378987435
73	NC_016863	TTGG	2	8	33914	33921	0 %	50 %	50 %	0 %	378987435
74	NC_016863	CTTT	2	8	34294	34301	0 %	75 %	0 %	25 %	378987435
75	NC_016863	GAAG	2	8	34334	34341	50 %	0 %	50 %	0 %	378987435
76	NC_016863	TAAA	2	8	34386	34393	75 %	25 %	0 %	0 %	378987436
77	NC_016863	ATAA	2	8	34665	34672	75 %	25 %	0 %	0 %	378987436
78	NC_016863	GTGC	2	8	34788	34795	0 %	25 %	50 %	25 %	378987436
79	NC_016863	TTAA	2	8	34798	34805	50 %	50 %	0 %	0 %	378987436
80	NC_016863	TGAT	2	8	35033	35040	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016863	TGGA	2	8	35550	35557	25 %	25 %	50 %	0 %	378987437
82	NC_016863	GGGA	2	8	36494	36501	25 %	0 %	75 %	0 %	378987437
83	NC_016863	ATAC	2	8	37479	37486	50 %	25 %	0 %	25 %	378987438
84	NC_016863	GAAG	2	8	37551	37558	50 %	0 %	50 %	0 %	378987438
85	NC_016863	CACG	2	8	38114	38121	25 %	0 %	25 %	50 %	378987438
86	NC_016863	TAAT	2	8	38216	38223	50 %	50 %	0 %	0 %	378987438
87	NC_016863	CCAT	2	8	38672	38679	25 %	25 %	0 %	50 %	378987438
88	NC_016863	ATTA	2	8	38766	38773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016863	AATT	2	8	40049	40056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016863	GCGG	2	8	40540	40547	0 %	0 %	75 %	25 %	378987440
91	NC_016863	CTGG	2	8	40758	40765	0 %	25 %	50 %	25 %	378987440
92	NC_016863	CCGA	2	8	41275	41282	25 %	0 %	25 %	50 %	378987440
93	NC_016863	ATCG	2	8	41431	41438	25 %	25 %	25 %	25 %	378987440
94	NC_016863	TCAA	2	8	41492	41499	50 %	25 %	0 %	25 %	378987440
95	NC_016863	ACCG	2	8	41759	41766	25 %	0 %	25 %	50 %	378987441
96	NC_016863	GAAA	2	8	41810	41817	75 %	0 %	25 %	0 %	378987441
97	NC_016863	GGTC	2	8	42382	42389	0 %	25 %	50 %	25 %	378987441
98	NC_016863	TTTG	2	8	42906	42913	0 %	75 %	25 %	0 %	378987441
99	NC_016863	GTAT	2	8	43201	43208	25 %	50 %	25 %	0 %	378987442
100	NC_016863	TCCG	2	8	43595	43602	0 %	25 %	25 %	50 %	378987442
101	NC_016863	ATGA	2	8	45657	45664	50 %	25 %	25 %	0 %	378987443
102	NC_016863	AACG	2	8	45959	45966	50 %	0 %	25 %	25 %	378987443
103	NC_016863	TGAC	2	8	46043	46050	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_016863	GAAA	2	8	46907	46914	75 %	0 %	25 %	0 %	378987444
105	NC_016863	TCGC	2	8	46922	46929	0 %	25 %	25 %	50 %	378987444
106	NC_016863	GCTG	2	8	47113	47120	0 %	25 %	50 %	25 %	378987444
107	NC_016863	CACG	2	8	47811	47818	25 %	0 %	25 %	50 %	378987445
108	NC_016863	CAGC	2	8	47838	47845	25 %	0 %	25 %	50 %	378987445
109	NC_016863	CTGC	2	8	47975	47982	0 %	25 %	25 %	50 %	378987445
110	NC_016863	TACC	2	8	48322	48329	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_016863	CATG	2	8	48543	48550	25 %	25 %	25 %	25 %	378987446
112	NC_016863	AAGT	2	8	49337	49344	50 %	25 %	25 %	0 %	378987446
113	NC_016863	CCAG	2	8	49395	49402	25 %	0 %	25 %	50 %	378987446
114	NC_016863	TTGA	2	8	50176	50183	25 %	50 %	25 %	0 %	378987446
115	NC_016863	GAAA	2	8	50511	50518	75 %	0 %	25 %	0 %	378987447
116	NC_016863	GCCA	2	8	50852	50859	25 %	0 %	25 %	50 %	378987447
117	NC_016863	TAAA	2	8	51245	51252	75 %	25 %	0 %	0 %	378987447
118	NC_016863	TCTT	2	8	51364	51371	0 %	75 %	0 %	25 %	378987447
119	NC_016863	AGTA	2	8	51938	51945	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016863	ATCA	2	8	51978	51985	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_016863	GAAA	2	8	52098	52105	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016863	AGGG	2	8	52131	52138	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016863	CATA	2	8	52890	52897	50 %	25 %	0 %	25 %	378987450
124	NC_016863	TCAG	2	8	52901	52908	25 %	25 %	25 %	25 %	378987450
125	NC_016863	TGGC	2	8	53615	53622	0 %	25 %	50 %	25 %	378987450
126	NC_016863	GTTC	2	8	56032	56039	0 %	50 %	25 %	25 %	378987451
127	NC_016863	AGCC	2	8	57442	57449	25 %	0 %	25 %	50 %	378987453
128	NC_016863	AAAG	2	8	57521	57528	75 %	0 %	25 %	0 %	378987453
129	NC_016863	ATGG	2	8	57654	57661	25 %	25 %	50 %	0 %	378987453
130	NC_016863	TGAT	2	8	58326	58333	25 %	50 %	25 %	0 %	378987454
131	NC_016863	TGGA	2	8	58995	59002	25 %	25 %	50 %	0 %	378987455
132	NC_016863	CCTG	2	8	59031	59038	0 %	25 %	25 %	50 %	378987455
133	NC_016863	GATT	2	8	59393	59400	25 %	50 %	25 %	0 %	378987455
134	NC_016863	GATC	2	8	59762	59769	25 %	25 %	25 %	25 %	378987455
135	NC_016863	CTGG	2	8	60887	60894	0 %	25 %	50 %	25 %	378987456
136	NC_016863	GTGG	2	8	61052	61059	0 %	25 %	75 %	0 %	378987456
137	NC_016863	CTGC	2	8	61262	61269	0 %	25 %	25 %	50 %	378987457
138	NC_016863	ACCA	2	8	61898	61905	50 %	0 %	0 %	50 %	378987458
139	NC_016863	GTGG	2	8	61933	61940	0 %	25 %	75 %	0 %	378987458
140	NC_016863	CATT	2	8	62123	62130	25 %	50 %	0 %	25 %	378987458
141	NC_016863	TCAA	2	8	63164	63171	50 %	25 %	0 %	25 %	378987458
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