MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. UK-1 chromosome

Total Repeats: 69731

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016863	CAG	2	6	64	69	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016863	ACA	2	6	181	186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_016863	CAC	3	9	204	212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378987405
4	NC_016863	ACC	2	6	217	222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378987405
5	NC_016863	AAC	2	6	331	336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_016863	CGG	2	6	355	360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987406
7	NC_016863	TGG	2	6	477	482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378987406
8	NC_016863	CGG	2	6	502	507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987406
9	NC_016863	CTG	2	6	665	670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987406
10	NC_016863	CGC	2	6	694	699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987406
11	NC_016863	CGC	2	6	859	864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987406
12	NC_016863	CCG	2	6	909	914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987406
13	NC_016863	TGG	2	6	933	938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378987406
14	NC_016863	CCG	3	9	966	974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987406
15	NC_016863	GCC	2	6	980	985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987406
16	NC_016863	CTG	2	6	1000	1005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987406
17	NC_016863	GCT	2	6	1069	1074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987406
18	NC_016863	CGA	2	6	1234	1239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987406
19	NC_016863	AAC	2	6	1274	1279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378987406
20	NC_016863	GAT	2	6	1318	1323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987406
21	NC_016863	GGC	2	6	1330	1335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987406
22	NC_016863	CGC	2	6	1345	1350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987406
23	NC_016863	GGT	2	6	1372	1377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378987406
24	NC_016863	TCC	2	6	1391	1396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378987406
25	NC_016863	CCG	2	6	1447	1452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987406
26	NC_016863	GCT	2	6	1492	1497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987406
27	NC_016863	TGT	2	6	1537	1542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378987406
28	NC_016863	TTC	2	6	1583	1588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378987406
29	NC_016863	TCT	2	6	1637	1642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378987406
30	NC_016863	TGG	2	6	1659	1664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378987406
31	NC_016863	ACG	2	6	1671	1676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987406
32	NC_016863	CCA	2	6	1680	1685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378987406
33	NC_016863	CGG	2	6	1756	1761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987406
34	NC_016863	CGG	2	6	1765	1770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987406
35	NC_016863	GAA	2	6	1810	1815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378987406
36	NC_016863	GCG	2	6	1839	1844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987406
37	NC_016863	ATC	2	6	1968	1973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987406
38	NC_016863	TTG	2	6	1989	1994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378987406
39	NC_016863	ACT	2	6	2097	2102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987406
40	NC_016863	CGC	3	9	2119	2127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987406
41	NC_016863	CTG	2	6	2201	2206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987406
42	NC_016863	TGA	2	6	2215	2220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987406
43	NC_016863	GAC	2	6	2513	2518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987406
44	NC_016863	GCC	2	6	2525	2530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987406
45	NC_016863	TGA	2	6	2548	2553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987406
46	NC_016863	TAT	2	6	2687	2692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378987406
47	NC_016863	TGC	2	6	2709	2714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987406
48	NC_016863	ATG	2	6	2733	2738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987406
49	NC_016863	CGG	3	9	2742	2750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987406
50	NC_016863	AGC	2	6	2918	2923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987407
51	NC_016863	GCC	2	6	2969	2974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987407
52	NC_016863	CGT	2	6	3107	3112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987407
53	NC_016863	CGC	2	6	3113	3118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987407
54	NC_016863	GCA	2	6	3208	3213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987407
55	NC_016863	TGA	2	6	3259	3264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987407
56	NC_016863	GAA	2	6	3267	3272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378987407
57	NC_016863	ATT	2	6	3279	3284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378987407
58	NC_016863	CAG	2	6	3288	3293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987407
59	NC_016863	TGA	2	6	3305	3310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987407
60	NC_016863	GCC	2	6	3465	3470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987407
61	NC_016863	TGA	2	6	3475	3480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987407
62	NC_016863	CGG	2	6	3706	3711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987407
63	NC_016863	AGT	2	6	3719	3724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987407
64	NC_016863	CAG	2	6	3810	3815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987408
65	NC_016863	TGA	2	6	3863	3868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987408
66	NC_016863	GCA	2	6	3938	3943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987408
67	NC_016863	CGG	2	6	4061	4066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987408
68	NC_016863	GCG	2	6	4099	4104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987408
69	NC_016863	GTC	2	6	4191	4196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987408
70	NC_016863	GGC	2	6	4254	4259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987408
71	NC_016863	TGA	2	6	4325	4330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987408
72	NC_016863	GAA	2	6	4332	4337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378987408
73	NC_016863	GCC	2	6	4384	4389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987408
74	NC_016863	CTA	2	6	4406	4411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987408
75	NC_016863	GCT	2	6	4502	4507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987408
76	NC_016863	CGC	2	6	4544	4549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987408
77	NC_016863	GGA	2	6	4670	4675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378987408
78	NC_016863	CCG	2	6	4682	4687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987408
79	NC_016863	GCG	2	6	4719	4724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987408
80	NC_016863	GAT	2	6	4728	4733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987408
81	NC_016863	CAG	2	6	4743	4748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987408
82	NC_016863	GCG	2	6	4794	4799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987408
83	NC_016863	GCT	2	6	4955	4960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987408
84	NC_016863	CAT	2	6	4965	4970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987408
85	NC_016863	GCC	2	6	4986	4991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987408
86	NC_016863	TGA	3	9	5002	5010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987408
87	NC_016863	GTG	2	6	5063	5068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016863	TCA	2	6	5164	5169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987409
89	NC_016863	AAT	2	6	5229	5234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378987409
90	NC_016863	TCA	2	6	5243	5248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987409
91	NC_016863	ACC	2	6	5278	5283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378987409
92	NC_016863	TCA	2	6	5302	5307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987409
93	NC_016863	TTC	2	6	5341	5346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378987409
94	NC_016863	CAC	3	9	5385	5393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378987409
95	NC_016863	TGT	2	6	5569	5574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378987409
96	NC_016863	CGT	2	6	5594	5599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987409
97	NC_016863	GCG	2	6	5756	5761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987409
98	NC_016863	GCT	2	6	5789	5794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987409
99	NC_016863	CGC	2	6	5932	5937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_016863	GCC	2	6	5980	5985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987410
101	NC_016863	ACC	2	6	6097	6102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378987410
102	NC_016863	CAA	2	6	6111	6116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378987410
103	NC_016863	CGA	2	6	6302	6307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987410
104	NC_016863	CAG	2	6	6438	6443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987410
105	NC_016863	ATC	2	6	6448	6453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987410
106	NC_016863	GAT	2	6	6468	6473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987410
107	NC_016863	ACG	2	6	6536	6541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987410
108	NC_016863	GCG	2	6	6863	6868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987410
109	NC_016863	CGA	2	6	6941	6946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987410
110	NC_016863	GCC	2	6	7014	7019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987410
111	NC_016863	AGG	2	6	7079	7084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378987410
112	NC_016863	ATG	2	6	7096	7101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987410
113	NC_016863	GCG	2	6	7141	7146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987410
114	NC_016863	GCC	2	6	7227	7232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987410
115	NC_016863	AGC	2	6	7333	7338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987410
116	NC_016863	TAA	2	6	7373	7378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378987410
117	NC_016863	TTG	2	6	7409	7414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016863	ATG	2	6	7454	7459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016863	GGT	2	6	7507	7512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016863	CGT	2	6	7600	7605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_016863	ATC	2	6	7609	7614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_016863	CAC	2	6	7698	7703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378987411
123	NC_016863	CAG	2	6	7846	7851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987411
124	NC_016863	AGC	2	6	7852	7857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987411
125	NC_016863	CAG	2	6	7867	7872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987411
126	NC_016863	GTT	2	6	7873	7878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378987411
127	NC_016863	ATG	2	6	8024	8029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987411
128	NC_016863	AAG	2	6	8108	8113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378987411
129	NC_016863	GCT	2	6	8133	8138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987411
130	NC_016863	TAC	2	6	8299	8304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987411
131	NC_016863	CGT	2	6	8325	8330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987411
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258	NC_016863	ATG	2	6	16002	16007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
259	NC_016863	CCT	2	6	16023	16028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
260	NC_016863	ATT	2	6	16056	16061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
261	NC_016863	TAT	2	6	16154	16159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378987419
262	NC_016863	ATA	2	6	16219	16224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378987419
263	NC_016863	GGC	2	6	16340	16345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987419
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278	NC_016863	GTT	2	6	17705	17710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
279	NC_016863	GTT	2	6	17729	17734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
280	NC_016863	ATC	2	6	17758	17763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
281	NC_016863	GAT	2	6	17770	17775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
282	NC_016863	ACT	2	6	17910	17915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987422
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284	NC_016863	GAT	2	6	17949	17954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987422
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292	NC_016863	GCT	2	6	18626	18631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987422
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301	NC_016863	CGA	2	6	19388	19393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987422
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377	NC_016863	GAA	2	6	24400	24405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
378	NC_016863	CAG	2	6	24410	24415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
379	NC_016863	TGT	2	6	24522	24527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378987425
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