MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. UK-1 chromosome

Total Repeats: 7646

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016863	CAG	2	6	64	69	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016863	ACA	2	6	181	186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_016863	AAC	2	6	331	336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_016863	GTG	2	6	5063	5068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016863	CGC	2	6	5932	5937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_016863	TTG	2	6	7409	7414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016863	ATG	2	6	7454	7459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016863	GGT	2	6	7507	7512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016863	CGT	2	6	7600	7605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_016863	ATC	2	6	7609	7614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_016863	AAT	2	6	8723	8728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016863	TAG	2	6	9335	9340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016863	TCC	2	6	9347	9352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_016863	GGA	2	6	9360	9365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016863	ATC	2	6	9955	9960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_016863	ATA	2	6	10018	10023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016863	TAA	2	6	10052	10057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016863	TTA	2	6	11333	11338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016863	TGA	2	6	11447	11452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016863	GTG	2	6	11487	11492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016863	TTA	2	6	11541	11546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016863	ATG	2	6	11562	11567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016863	TTC	2	6	14754	14759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_016863	TTG	2	6	14835	14840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016863	CAG	2	6	14878	14883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_016863	TAT	2	6	14971	14976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016863	ATG	2	6	16002	16007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016863	CCT	2	6	16023	16028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_016863	ATT	2	6	16056	16061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016863	ATT	2	6	17613	17618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016863	GTT	2	6	17705	17710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016863	GTT	2	6	17729	17734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016863	ATC	2	6	17758	17763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_016863	GAT	2	6	17770	17775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016863	CCA	2	6	20032	20037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_016863	TTA	2	6	23167	23172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016863	GTT	2	6	24117	24122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016863	ACA	2	6	24196	24201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_016863	GAT	2	6	24233	24238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016863	TAA	2	6	24260	24265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016863	TAA	2	6	24267	24272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016863	ACG	2	6	24307	24312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_016863	AAG	2	6	24354	24359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016863	GAA	2	6	24400	24405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016863	CAG	2	6	24410	24415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_016863	ATA	2	6	33135	33140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016863	CAT	2	6	33202	33207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_016863	TAA	2	6	33256	33261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016863	GTG	2	6	33301	33306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016863	ATG	2	6	33328	33333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016863	ATA	3	9	34850	34858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016863	ATG	2	6	34938	34943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016863	TAG	2	6	34996	35001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016863	TTG	2	6	35044	35049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016863	AAT	2	6	35056	35061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016863	TAG	2	6	35153	35158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016863	ATT	2	6	35235	35240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016863	TTG	2	6	35254	35259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016863	TGT	2	6	35293	35298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016863	TCA	2	6	38755	38760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_016863	TGT	2	6	39568	39573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016863	AAG	2	6	39577	39582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016863	TGT	2	6	39673	39678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016863	TTA	2	6	39679	39684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016863	TGT	2	6	39718	39723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016863	AAT	2	6	39769	39774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016863	AAT	2	6	39981	39986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016863	GAA	2	6	40012	40017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016863	AAT	2	6	41629	41634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016863	GTA	2	6	42917	42922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016863	TGA	2	6	44206	44211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016863	GTT	2	6	44215	44220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016863	ATC	2	6	46035	46040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_016863	TCA	2	6	46105	46110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_016863	TAG	2	6	46151	46156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016863	GAA	2	6	46161	46166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016863	AAC	2	6	51863	51868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_016863	ATT	2	6	51895	51900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016863	AGT	2	6	51960	51965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016863	ATT	2	6	51986	51991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016863	TTA	2	6	52014	52019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016863	GGT	2	6	52052	52057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016863	CTT	2	6	52608	52613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_016863	GTG	2	6	57257	57262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016863	TGA	2	6	58772	58777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016863	GAA	2	6	58830	58835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016863	GTC	2	6	58845	58850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_016863	ACG	2	6	66919	66924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_016863	GAC	2	6	66933	66938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_016863	TGC	2	6	67025	67030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_016863	CCG	2	6	67038	67043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_016863	TAA	2	6	68438	68443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016863	ATT	2	6	68504	68509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016863	TTA	2	6	68511	68516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016863	TCT	2	6	73844	73849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_016863	GGC	2	6	73952	73957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_016863	TTA	2	6	75395	75400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016863	ATG	2	6	75434	75439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016863	GTT	2	6	75562	75567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016863	GTT	2	6	75572	75577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016863	GCC	2	6	75776	75781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_016863	TAA	2	6	77038	77043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016863	CGG	2	6	80287	80292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_016863	TAA	2	6	80412	80417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016863	TTA	2	6	80496	80501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016863	CTG	2	6	80958	80963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_016863	GGC	2	6	81645	81650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_016863	CGG	2	6	82539	82544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_016863	TAA	2	6	86679	86684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016863	TAT	2	6	88269	88274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016863	TTG	2	6	88282	88287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016863	ATG	2	6	88327	88332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016863	ATT	2	6	88383	88388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016863	TTG	2	6	88473	88478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016863	CCG	2	6	88643	88648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_016863	GGC	2	6	92116	92121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_016863	AAC	2	6	93583	93588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_016863	AAT	2	6	93865	93870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016863	ATG	2	6	94103	94108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016863	CAT	2	6	94551	94556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_016863	TAT	2	6	94730	94735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016863	TGA	2	6	95083	95088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016863	ATT	2	6	95123	95128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016863	TAT	2	6	95477	95482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016863	TAA	2	6	95721	95726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016863	AAT	2	6	95794	95799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016863	TAA	2	6	95915	95920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016863	TAA	2	6	95954	95959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016863	TCG	2	6	97877	97882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_016863	ATC	2	6	97947	97952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_016863	AAG	2	6	98010	98015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016863	CTA	2	6	98046	98051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_016863	TCA	2	6	98052	98057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_016863	AAT	2	6	98183	98188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016863	TAA	2	6	98227	98232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016863	ATC	2	6	98240	98245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_016863	ACT	2	6	100694	100699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_016863	CAG	2	6	100737	100742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_016863	CGA	2	6	100780	100785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_016863	GGC	2	6	100808	100813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_016863	GGC	2	6	101337	101342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_016863	CAT	2	6	108191	108196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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144	NC_016863	GAT	2	6	115436	115441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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146	NC_016863	GGC	2	6	116224	116229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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158	NC_016863	CAT	2	6	128737	128742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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