MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. UK-1 chromosome

Total Repeats: 9567

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016863	AT	3	6	55	60	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016863	GC	3	6	576	581	0 %	0 %	50 %	50 %	378987406
3	NC_016863	CT	3	6	1106	1111	0 %	50 %	0 %	50 %	378987406
4	NC_016863	TG	3	6	1418	1423	0 %	50 %	50 %	0 %	378987406
5	NC_016863	GC	3	6	1437	1442	0 %	0 %	50 %	50 %	378987406
6	NC_016863	CT	3	6	2255	2260	0 %	50 %	0 %	50 %	378987406
7	NC_016863	TC	3	6	2293	2298	0 %	50 %	0 %	50 %	378987406
8	NC_016863	GC	3	6	2315	2320	0 %	0 %	50 %	50 %	378987406
9	NC_016863	CG	3	6	2346	2351	0 %	0 %	50 %	50 %	378987406
10	NC_016863	CG	4	8	3504	3511	0 %	0 %	50 %	50 %	378987407
11	NC_016863	GC	3	6	3559	3564	0 %	0 %	50 %	50 %	378987407
12	NC_016863	CG	3	6	3963	3968	0 %	0 %	50 %	50 %	378987408
13	NC_016863	CG	3	6	4207	4212	0 %	0 %	50 %	50 %	378987408
14	NC_016863	CG	3	6	4663	4668	0 %	0 %	50 %	50 %	378987408
15	NC_016863	AG	3	6	4883	4888	50 %	0 %	50 %	0 %	378987408
16	NC_016863	TG	3	6	5149	5154	0 %	50 %	50 %	0 %	378987409
17	NC_016863	CG	3	6	5252	5257	0 %	0 %	50 %	50 %	378987409
18	NC_016863	CG	3	6	5471	5476	0 %	0 %	50 %	50 %	378987409
19	NC_016863	AG	3	6	5553	5558	50 %	0 %	50 %	0 %	378987409
20	NC_016863	CG	3	6	5972	5977	0 %	0 %	50 %	50 %	378987410
21	NC_016863	GC	3	6	6890	6895	0 %	0 %	50 %	50 %	378987410
22	NC_016863	TC	3	6	7774	7779	0 %	50 %	0 %	50 %	378987411
23	NC_016863	CG	3	6	7861	7866	0 %	0 %	50 %	50 %	378987411
24	NC_016863	CG	3	6	7959	7964	0 %	0 %	50 %	50 %	378987411
25	NC_016863	CT	3	6	8452	8457	0 %	50 %	0 %	50 %	378987411
26	NC_016863	GC	3	6	8476	8481	0 %	0 %	50 %	50 %	378987411
27	NC_016863	TG	3	6	8902	8907	0 %	50 %	50 %	0 %	378987412
28	NC_016863	GC	3	6	9574	9579	0 %	0 %	50 %	50 %	378987413
29	NC_016863	CG	3	6	10534	10539	0 %	0 %	50 %	50 %	378987414
30	NC_016863	CG	3	6	12990	12995	0 %	0 %	50 %	50 %	378987416
31	NC_016863	GC	3	6	14551	14556	0 %	0 %	50 %	50 %	378987417
32	NC_016863	GA	3	6	14662	14667	50 %	0 %	50 %	0 %	378987417
33	NC_016863	AT	3	6	15373	15378	50 %	50 %	0 %	0 %	378987418
34	NC_016863	AT	3	6	15648	15653	50 %	50 %	0 %	0 %	378987418
35	NC_016863	AT	3	6	15901	15906	50 %	50 %	0 %	0 %	378987418
36	NC_016863	GA	3	6	17065	17070	50 %	0 %	50 %	0 %	378987421
37	NC_016863	GC	3	6	18367	18372	0 %	0 %	50 %	50 %	378987422
38	NC_016863	CT	3	6	20341	20346	0 %	50 %	0 %	50 %	378987423
39	NC_016863	GC	3	6	20657	20662	0 %	0 %	50 %	50 %	378987423
40	NC_016863	GC	3	6	20777	20782	0 %	0 %	50 %	50 %	378987423
41	NC_016863	GC	3	6	21182	21187	0 %	0 %	50 %	50 %	378987423
42	NC_016863	GC	3	6	22040	22045	0 %	0 %	50 %	50 %	378987423
43	NC_016863	CT	3	6	22795	22800	0 %	50 %	0 %	50 %	378987423
44	NC_016863	AT	3	6	23583	23588	50 %	50 %	0 %	0 %	378987424
45	NC_016863	CG	3	6	23653	23658	0 %	0 %	50 %	50 %	378987424
46	NC_016863	GC	4	8	23796	23803	0 %	0 %	50 %	50 %	378987424
47	NC_016863	AT	3	6	24057	24062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016863	CG	3	6	25065	25070	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_016863	CT	3	6	25351	25356	0 %	50 %	0 %	50 %	378987426
50	NC_016863	AT	3	6	25381	25386	50 %	50 %	0 %	0 %	378987426
51	NC_016863	GC	3	6	26084	26089	0 %	0 %	50 %	50 %	378987427
52	NC_016863	CG	3	6	28014	28019	0 %	0 %	50 %	50 %	378987427
53	NC_016863	GC	3	6	28142	28147	0 %	0 %	50 %	50 %	378987427
54	NC_016863	GC	3	6	28178	28183	0 %	0 %	50 %	50 %	378987427
55	NC_016863	TC	3	6	28374	28379	0 %	50 %	0 %	50 %	378987427
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57	NC_016863	GT	3	6	28621	28626	0 %	50 %	50 %	0 %	378987428
58	NC_016863	CT	3	6	30106	30111	0 %	50 %	0 %	50 %	378987430
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60	NC_016863	CG	3	6	30432	30437	0 %	0 %	50 %	50 %	378987430
61	NC_016863	AT	3	6	30533	30538	50 %	50 %	0 %	0 %	378987431
62	NC_016863	GC	3	6	30764	30769	0 %	0 %	50 %	50 %	378987431
63	NC_016863	GC	3	6	31054	31059	0 %	0 %	50 %	50 %	378987431
64	NC_016863	GT	3	6	33042	33047	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016863	TC	3	6	33486	33491	0 %	50 %	0 %	50 %	378987435
66	NC_016863	AT	3	6	33736	33741	50 %	50 %	0 %	0 %	378987435
67	NC_016863	TA	3	6	33939	33944	50 %	50 %	0 %	0 %	378987435
68	NC_016863	AT	3	6	34435	34440	50 %	50 %	0 %	0 %	378987436
69	NC_016863	AT	3	6	34696	34701	50 %	50 %	0 %	0 %	378987436
70	NC_016863	AT	3	6	35442	35447	50 %	50 %	0 %	0 %	378987437
71	NC_016863	TG	4	8	35657	35664	0 %	50 %	50 %	0 %	378987437
72	NC_016863	GC	3	6	36250	36255	0 %	0 %	50 %	50 %	378987437
73	NC_016863	TA	3	6	37200	37205	50 %	50 %	0 %	0 %	378987438
74	NC_016863	AT	3	6	39516	39521	50 %	50 %	0 %	0 %	378987439
75	NC_016863	AT	3	6	39832	39837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016863	AT	3	6	39947	39952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016863	AT	5	10	40034	40043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016863	AT	3	6	40090	40095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016863	CG	3	6	40378	40383	0 %	0 %	50 %	50 %	378987440
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82	NC_016863	TG	3	6	42802	42807	0 %	50 %	50 %	0 %	378987441
83	NC_016863	CG	3	6	43317	43322	0 %	0 %	50 %	50 %	378987442
84	NC_016863	TA	3	6	43690	43695	50 %	50 %	0 %	0 %	378987442
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86	NC_016863	CA	3	6	45003	45008	50 %	0 %	0 %	50 %	378987443
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88	NC_016863	TA	3	6	46111	46116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016863	GA	3	6	46178	46183	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016863	TA	3	6	46810	46815	50 %	50 %	0 %	0 %	378987444
91	NC_016863	TG	3	6	47191	47196	0 %	50 %	50 %	0 %	378987444
92	NC_016863	GC	4	8	47330	47337	0 %	0 %	50 %	50 %	378987444
93	NC_016863	GA	3	6	47412	47417	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016863	GA	3	6	48244	48249	50 %	0 %	50 %	0 %	378987445
95	NC_016863	CG	4	8	49311	49318	0 %	0 %	50 %	50 %	378987446
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99	NC_016863	GC	3	6	51510	51515	0 %	0 %	50 %	50 %	378987447
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103	NC_016863	CG	3	6	54354	54359	0 %	0 %	50 %	50 %	378987451
104	NC_016863	GC	3	6	55027	55032	0 %	0 %	50 %	50 %	378987451
105	NC_016863	CG	3	6	55101	55106	0 %	0 %	50 %	50 %	378987451
106	NC_016863	CG	3	6	55835	55840	0 %	0 %	50 %	50 %	378987451
107	NC_016863	CG	3	6	56090	56095	0 %	0 %	50 %	50 %	378987451
108	NC_016863	GC	3	6	57009	57014	0 %	0 %	50 %	50 %	378987452
109	NC_016863	GC	3	6	57885	57890	0 %	0 %	50 %	50 %	378987454
110	NC_016863	GC	4	8	58115	58122	0 %	0 %	50 %	50 %	378987454
111	NC_016863	CT	3	6	59105	59110	0 %	50 %	0 %	50 %	378987455
112	NC_016863	TG	3	6	60724	60729	0 %	50 %	50 %	0 %	378987456
113	NC_016863	TC	3	6	61128	61133	0 %	50 %	0 %	50 %	378987457
114	NC_016863	GC	3	6	62390	62395	0 %	0 %	50 %	50 %	378987458
115	NC_016863	AT	3	6	63065	63070	50 %	50 %	0 %	0 %	378987458
116	NC_016863	GC	3	6	64586	64591	0 %	0 %	50 %	50 %	378987459
117	NC_016863	GC	3	6	66230	66235	0 %	0 %	50 %	50 %	378987460
118	NC_016863	CG	3	6	66327	66332	0 %	0 %	50 %	50 %	378987460
119	NC_016863	GC	3	6	66734	66739	0 %	0 %	50 %	50 %	378987461
120	NC_016863	AT	3	6	68158	68163	50 %	50 %	0 %	0 %	378987462
121	NC_016863	GC	3	6	69037	69042	0 %	0 %	50 %	50 %	378987463
122	NC_016863	GC	3	6	69611	69616	0 %	0 %	50 %	50 %	378987463
123	NC_016863	AC	3	6	69663	69668	50 %	0 %	0 %	50 %	378987463
124	NC_016863	AG	3	6	69809	69814	50 %	0 %	50 %	0 %	378987464
125	NC_016863	CG	3	6	69888	69893	0 %	0 %	50 %	50 %	378987464
126	NC_016863	GC	3	6	69916	69921	0 %	0 %	50 %	50 %	378987464
127	NC_016863	CG	3	6	70545	70550	0 %	0 %	50 %	50 %	378987465
128	NC_016863	CG	3	6	70825	70830	0 %	0 %	50 %	50 %	378987465
129	NC_016863	TG	3	6	71466	71471	0 %	50 %	50 %	0 %	378987466
130	NC_016863	GC	3	6	71977	71982	0 %	0 %	50 %	50 %	378987466
131	NC_016863	CG	3	6	72212	72217	0 %	0 %	50 %	50 %	378987466
132	NC_016863	GC	3	6	72284	72289	0 %	0 %	50 %	50 %	378987466
133	NC_016863	GC	3	6	72461	72466	0 %	0 %	50 %	50 %	378987467
134	NC_016863	CG	3	6	73322	73327	0 %	0 %	50 %	50 %	378987468
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136	NC_016863	TC	3	6	73855	73860	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_016863	GC	3	6	73964	73969	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_016863	AT	3	6	74899	74904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016863	AT	3	6	75466	75471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016863	CT	3	6	76173	76178	0 %	50 %	0 %	50 %	378987471
141	NC_016863	GC	3	6	77341	77346	0 %	0 %	50 %	50 %	378987472
142	NC_016863	CG	3	6	77477	77482	0 %	0 %	50 %	50 %	378987472
143	NC_016863	CG	3	6	77953	77958	0 %	0 %	50 %	50 %	378987472
144	NC_016863	GC	5	10	78999	79008	0 %	0 %	50 %	50 %	378987472
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