MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. T000240 plasmid pSTMDT12_L

Total Repeats: 18

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016861	TCGTC	2	10	1630	1639	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_016861	ACCAC	2	10	4850	4859	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
3	NC_016861	ATGTT	2	10	4919	4928	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016861	GCTCC	2	10	4963	4972	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5	NC_016861	AATTT	2	10	14102	14111	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016861	TGCAA	2	10	14905	14914	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_016861	GGCCC	2	10	15494	15503	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
8	NC_016861	GTTGA	2	10	32595	32604	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016861	CTGTT	2	10	37033	37042	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_016861	TTAAA	2	10	41743	41752	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016861	TAATG	2	10	50099	50108	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016861	GTCTG	2	10	51341	51350	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_016861	TATAA	2	10	52248	52257	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016861	ACGGG	2	10	60680	60689	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
15	NC_016861	GAACA	2	10	66880	66889	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_016861	CCCCG	2	10	71253	71262	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
17	NC_016861	TAATT	2	10	73339	73348	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016861	ATTTC	2	10	96611	96620	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.