MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. T000240 plasmid pSTMDT12_L

Total Repeats: 273

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016861	CCGT	2	8	752	759	0 %	25 %	25 %	50 %	378987267
2	NC_016861	TGGC	2	8	869	876	0 %	25 %	50 %	25 %	378987267
3	NC_016861	ACAT	2	8	1496	1503	50 %	25 %	0 %	25 %	378987269
4	NC_016861	AAAG	2	8	1504	1511	75 %	0 %	25 %	0 %	378987269
5	NC_016861	TGAC	2	8	1920	1927	25 %	25 %	25 %	25 %	378987270
6	NC_016861	CGTT	3	12	2079	2090	0 %	50 %	25 %	25 %	378987270
7	NC_016861	TACC	2	8	2314	2321	25 %	25 %	0 %	50 %	378987270
8	NC_016861	CCGA	2	8	2357	2364	25 %	0 %	25 %	50 %	378987270
9	NC_016861	GATG	2	8	2491	2498	25 %	25 %	50 %	0 %	378987270
10	NC_016861	AAAT	2	8	3987	3994	75 %	25 %	0 %	0 %	378987272
11	NC_016861	TCAC	2	8	4255	4262	25 %	25 %	0 %	50 %	378987272
12	NC_016861	ACGG	2	8	4442	4449	25 %	0 %	50 %	25 %	378987272
13	NC_016861	TCTG	2	8	4603	4610	0 %	50 %	25 %	25 %	378987272
14	NC_016861	CAGC	2	8	5497	5504	25 %	0 %	25 %	50 %	378987273
15	NC_016861	TACA	2	8	5836	5843	50 %	25 %	0 %	25 %	378987274
16	NC_016861	TCAC	2	8	5924	5931	25 %	25 %	0 %	50 %	378987274
17	NC_016861	GTGG	2	8	6121	6128	0 %	25 %	75 %	0 %	378987274
18	NC_016861	GGTC	2	8	6270	6277	0 %	25 %	50 %	25 %	378987274
19	NC_016861	GCCG	2	8	6418	6425	0 %	0 %	50 %	50 %	378987274
20	NC_016861	GCCG	2	8	6967	6974	0 %	0 %	50 %	50 %	378987276
21	NC_016861	GGGC	2	8	7156	7163	0 %	0 %	75 %	25 %	378987276
22	NC_016861	CAGC	2	8	7253	7260	25 %	0 %	25 %	50 %	378987276
23	NC_016861	TGAA	2	8	7610	7617	50 %	25 %	25 %	0 %	378987277
24	NC_016861	CAGT	2	8	9812	9819	25 %	25 %	25 %	25 %	378987279
25	NC_016861	CCAG	2	8	9842	9849	25 %	0 %	25 %	50 %	378987279
26	NC_016861	GGTT	2	8	10097	10104	0 %	50 %	50 %	0 %	378987279
27	NC_016861	TCAT	2	8	10365	10372	25 %	50 %	0 %	25 %	378987280
28	NC_016861	TGGT	2	8	10797	10804	0 %	50 %	50 %	0 %	378987280
29	NC_016861	TTCT	2	8	10821	10828	0 %	75 %	0 %	25 %	378987280
30	NC_016861	TCCG	2	8	11129	11136	0 %	25 %	25 %	50 %	378987281
31	NC_016861	CCCA	2	8	11688	11695	25 %	0 %	0 %	75 %	378987281
32	NC_016861	CGAC	2	8	12307	12314	25 %	0 %	25 %	50 %	378987281
33	NC_016861	CCGG	2	8	13180	13187	0 %	0 %	50 %	50 %	378987281
34	NC_016861	TAAA	2	8	13534	13541	75 %	25 %	0 %	0 %	378987282
35	NC_016861	CTGA	2	8	14394	14401	25 %	25 %	25 %	25 %	378987284
36	NC_016861	GTGG	2	8	15550	15557	0 %	25 %	75 %	0 %	378987285
37	NC_016861	AGAT	2	8	15729	15736	50 %	25 %	25 %	0 %	378987285
38	NC_016861	TGGC	2	8	16736	16743	0 %	25 %	50 %	25 %	378987287
39	NC_016861	TGAC	2	8	17256	17263	25 %	25 %	25 %	25 %	378987287
40	NC_016861	GAAT	2	8	17344	17351	50 %	25 %	25 %	0 %	378987287
41	NC_016861	ACAA	2	8	17617	17624	75 %	0 %	0 %	25 %	378987287
42	NC_016861	CATC	2	8	18408	18415	25 %	25 %	0 %	50 %	378987288
43	NC_016861	ATTT	2	8	18612	18619	25 %	75 %	0 %	0 %	378987289
44	NC_016861	GCAG	2	8	21497	21504	25 %	0 %	50 %	25 %	378987295
45	NC_016861	GCGG	2	8	21770	21777	0 %	0 %	75 %	25 %	378987295
46	NC_016861	CAGC	2	8	21815	21822	25 %	0 %	25 %	50 %	378987295
47	NC_016861	ACCG	2	8	21957	21964	25 %	0 %	25 %	50 %	378987295
48	NC_016861	GCTG	2	8	22374	22381	0 %	25 %	50 %	25 %	378987296
49	NC_016861	GCCG	2	8	22511	22518	0 %	0 %	50 %	50 %	378987296
50	NC_016861	TCCG	2	8	22572	22579	0 %	25 %	25 %	50 %	378987296
51	NC_016861	GGCA	2	8	23027	23034	25 %	0 %	50 %	25 %	378987297
52	NC_016861	CCCG	2	8	23310	23317	0 %	0 %	25 %	75 %	378987297
53	NC_016861	CCGG	2	8	23344	23351	0 %	0 %	50 %	50 %	378987297
54	NC_016861	GTGA	2	8	23360	23367	25 %	25 %	50 %	0 %	378987297
55	NC_016861	CCCG	2	8	23406	23413	0 %	0 %	25 %	75 %	378987297
56	NC_016861	GGCA	2	8	23445	23452	25 %	0 %	50 %	25 %	378987297
57	NC_016861	GGCA	2	8	23589	23596	25 %	0 %	50 %	25 %	378987298
58	NC_016861	CTGC	2	8	23745	23752	0 %	25 %	25 %	50 %	378987298
59	NC_016861	GCGA	2	8	23855	23862	25 %	0 %	50 %	25 %	378987298
60	NC_016861	GCCT	2	8	23995	24002	0 %	25 %	25 %	50 %	378987299
61	NC_016861	GCCA	2	8	24619	24626	25 %	0 %	25 %	50 %	378987300
62	NC_016861	CAGC	2	8	25118	25125	25 %	0 %	25 %	50 %	378987301
63	NC_016861	CTGA	2	8	25179	25186	25 %	25 %	25 %	25 %	378987301
64	NC_016861	GATG	2	8	25896	25903	25 %	25 %	50 %	0 %	378987303
65	NC_016861	CAGA	2	8	26118	26125	50 %	0 %	25 %	25 %	378987303
66	NC_016861	ATGT	2	8	26662	26669	25 %	50 %	25 %	0 %	378987304
67	NC_016861	GTAT	2	8	26719	26726	25 %	50 %	25 %	0 %	378987304
68	NC_016861	TACT	2	8	27174	27181	25 %	50 %	0 %	25 %	378987305
69	NC_016861	GGCG	2	8	29092	29099	0 %	0 %	75 %	25 %	378987306
70	NC_016861	CCCA	2	8	29508	29515	25 %	0 %	0 %	75 %	378987306
71	NC_016861	TCCG	2	8	29660	29667	0 %	25 %	25 %	50 %	378987306
72	NC_016861	CTGA	2	8	29869	29876	25 %	25 %	25 %	25 %	378987306
73	NC_016861	TCGG	2	8	30319	30326	0 %	25 %	50 %	25 %	378987308
74	NC_016861	ATTC	2	8	31168	31175	25 %	50 %	0 %	25 %	378987309
75	NC_016861	AGAA	2	8	31787	31794	75 %	0 %	25 %	0 %	378987310
76	NC_016861	AATA	2	8	31804	31811	75 %	25 %	0 %	0 %	378987310
77	NC_016861	TGGC	2	8	33230	33237	0 %	25 %	50 %	25 %	378987311
78	NC_016861	AGGC	2	8	33330	33337	25 %	0 %	50 %	25 %	378987311
79	NC_016861	ATTT	2	8	33631	33638	25 %	75 %	0 %	0 %	378987311
80	NC_016861	TACA	2	8	33665	33672	50 %	25 %	0 %	25 %	378987311
81	NC_016861	GGCG	2	8	33673	33680	0 %	0 %	75 %	25 %	378987311
82	NC_016861	GCTG	2	8	33739	33746	0 %	25 %	50 %	25 %	378987311
83	NC_016861	GACC	2	8	34159	34166	25 %	0 %	25 %	50 %	378987312
84	NC_016861	TTGT	2	8	34796	34803	0 %	75 %	25 %	0 %	378987312
85	NC_016861	TCAG	2	8	35188	35195	25 %	25 %	25 %	25 %	378987313
86	NC_016861	GCCA	2	8	35740	35747	25 %	0 %	25 %	50 %	378987313
87	NC_016861	TGCC	2	8	35945	35952	0 %	25 %	25 %	50 %	378987313
88	NC_016861	AATC	2	8	36411	36418	50 %	25 %	0 %	25 %	378987313
89	NC_016861	ATTT	2	8	36488	36495	25 %	75 %	0 %	0 %	378987313
90	NC_016861	GGCG	2	8	36816	36823	0 %	0 %	75 %	25 %	378987314
91	NC_016861	TTCC	2	8	36890	36897	0 %	50 %	0 %	50 %	378987314
92	NC_016861	GGCG	2	8	37385	37392	0 %	0 %	75 %	25 %	378987315
93	NC_016861	CAGC	2	8	37702	37709	25 %	0 %	25 %	50 %	378987315
94	NC_016861	CGCC	2	8	38231	38238	0 %	0 %	25 %	75 %	378987317
95	NC_016861	AAGA	2	8	38272	38279	75 %	0 %	25 %	0 %	378987317
96	NC_016861	CGGG	2	8	38569	38576	0 %	0 %	75 %	25 %	378987317
97	NC_016861	TTGC	2	8	39042	39049	0 %	50 %	25 %	25 %	378987317
98	NC_016861	TCAG	2	8	40482	40489	25 %	25 %	25 %	25 %	378987319
99	NC_016861	CGCT	2	8	40606	40613	0 %	25 %	25 %	50 %	378987319
100	NC_016861	TTTC	2	8	40627	40634	0 %	75 %	0 %	25 %	378987319
101	NC_016861	AGCG	2	8	40700	40707	25 %	0 %	50 %	25 %	378987319
102	NC_016861	CACC	2	8	41072	41079	25 %	0 %	0 %	75 %	378987320
103	NC_016861	CGAA	2	8	41172	41179	50 %	0 %	25 %	25 %	378987320
104	NC_016861	CAGC	2	8	41242	41249	25 %	0 %	25 %	50 %	378987320
105	NC_016861	GCTG	2	8	41957	41964	0 %	25 %	50 %	25 %	378987321
106	NC_016861	GTCA	2	8	42717	42724	25 %	25 %	25 %	25 %	378987322
107	NC_016861	TGAC	2	8	43349	43356	25 %	25 %	25 %	25 %	378987323
108	NC_016861	TAGG	2	8	43362	43369	25 %	25 %	50 %	0 %	378987323
109	NC_016861	AGCC	2	8	43671	43678	25 %	0 %	25 %	50 %	378987323
110	NC_016861	AAGA	2	8	43894	43901	75 %	0 %	25 %	0 %	378987323
111	NC_016861	GGCG	2	8	44187	44194	0 %	0 %	75 %	25 %	378987324
112	NC_016861	GCGG	2	8	44406	44413	0 %	0 %	75 %	25 %	378987325
113	NC_016861	CGGC	2	8	45090	45097	0 %	0 %	50 %	50 %	378987326
114	NC_016861	TGGC	2	8	45119	45126	0 %	25 %	50 %	25 %	378987326
115	NC_016861	GGAT	2	8	45446	45453	25 %	25 %	50 %	0 %	378987327
116	NC_016861	AGAA	2	8	45465	45472	75 %	0 %	25 %	0 %	378987327
117	NC_016861	AGCC	2	8	45595	45602	25 %	0 %	25 %	50 %	378987327
118	NC_016861	GCTT	2	8	45875	45882	0 %	50 %	25 %	25 %	378987328
119	NC_016861	TGGC	2	8	46188	46195	0 %	25 %	50 %	25 %	378987328
120	NC_016861	CCGC	2	8	47158	47165	0 %	0 %	25 %	75 %	378987330
121	NC_016861	CTGG	2	8	47810	47817	0 %	25 %	50 %	25 %	378987331
122	NC_016861	GGCG	2	8	49180	49187	0 %	0 %	75 %	25 %	378987333
123	NC_016861	CAGC	2	8	49497	49504	25 %	0 %	25 %	50 %	378987333
124	NC_016861	ATAC	2	8	50183	50190	50 %	25 %	0 %	25 %	378987335
125	NC_016861	GACA	2	8	50807	50814	50 %	0 %	25 %	25 %	378987335
126	NC_016861	GTTT	2	8	50832	50839	0 %	75 %	25 %	0 %	378987335
127	NC_016861	TGGT	2	8	50867	50874	0 %	50 %	50 %	0 %	378987335
128	NC_016861	TCTG	2	8	51556	51563	0 %	50 %	25 %	25 %	378987337
129	NC_016861	CTGC	2	8	51631	51638	0 %	25 %	25 %	50 %	378987337
130	NC_016861	TGTC	2	8	52027	52034	0 %	50 %	25 %	25 %	378987337
131	NC_016861	GGTG	2	8	52384	52391	0 %	25 %	75 %	0 %	378987338
132	NC_016861	GAAA	2	8	53290	53297	75 %	0 %	25 %	0 %	378987338
133	NC_016861	AGCC	2	8	53491	53498	25 %	0 %	25 %	50 %	378987339
134	NC_016861	CAGA	2	8	53598	53605	50 %	0 %	25 %	25 %	378987339
135	NC_016861	GTCA	2	8	53885	53892	25 %	25 %	25 %	25 %	378987339
136	NC_016861	ATGA	2	8	54002	54009	50 %	25 %	25 %	0 %	378987340
137	NC_016861	TGGC	2	8	54260	54267	0 %	25 %	50 %	25 %	378987340
138	NC_016861	CAGG	2	8	54541	54548	25 %	0 %	50 %	25 %	378987341
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.