MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. T000240 plasmid pSTMDT12_L

Total Repeats: 230

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016861	TGA	2	6	383	388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016861	CCG	2	6	552	557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_016861	CGT	2	6	562	567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_016861	TAA	2	6	626	631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016861	ACT	2	6	636	641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_016861	GTA	2	6	1306	1311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016861	GAG	2	6	1342	1347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016861	AAG	2	6	1603	1608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016861	TGA	2	6	1715	1720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016861	TCT	2	6	1760	1765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_016861	CCA	2	6	1816	1821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_016861	CCA	2	6	2790	2795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_016861	GGA	2	6	2820	2825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016861	GCC	2	6	2848	2853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_016861	TTC	2	6	2876	2881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_016861	CTG	2	6	2902	2907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_016861	CTT	2	6	3075	3080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_016861	TCA	2	6	3122	3127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_016861	ACA	2	6	3197	3202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_016861	ACA	2	6	3251	3256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_016861	CAC	2	6	3311	3316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_016861	GCC	3	9	3325	3333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_016861	TAA	2	6	3365	3370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016861	ATG	2	6	3374	3379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016861	CAG	2	6	3457	3462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_016861	CAG	2	6	3530	3535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_016861	CGG	2	6	3713	3718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_016861	GCG	2	6	3877	3882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_016861	ACG	2	6	3951	3956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_016861	AGT	3	9	4820	4828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016861	GCA	2	6	4832	4837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_016861	CAC	2	6	4878	4883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_016861	AAT	2	6	4891	4896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016861	TCA	2	6	4931	4936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_016861	CGC	2	6	5625	5630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_016861	GTG	3	9	6485	6493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016861	CAG	3	9	7384	7392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_016861	TCA	2	6	7404	7409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_016861	GGC	2	6	7424	7429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_016861	TAA	2	6	7522	7527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016861	CAT	2	6	7542	7547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_016861	TTA	2	6	8426	8431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016861	TTA	2	6	8564	8569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016861	AGT	2	6	8667	8672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016861	CCT	2	6	8845	8850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_016861	GAA	2	6	8905	8910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016861	TCA	2	6	8980	8985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_016861	CAA	2	6	9074	9079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_016861	GCT	2	6	9265	9270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_016861	TGA	2	6	9371	9376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016861	ATG	3	9	9388	9396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016861	GTT	2	6	9443	9448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016861	GCA	2	6	9563	9568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_016861	GAT	2	6	9606	9611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016861	TCA	2	6	9650	9655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_016861	TCA	2	6	10226	10231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_016861	GGA	2	6	13373	13378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016861	TAA	2	6	13414	13419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016861	TAA	2	6	14246	14251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016861	AAC	2	6	14349	14354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_016861	CAC	2	6	14813	14818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_016861	ATA	2	6	15011	15016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016861	ATT	2	6	15042	15047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016861	AAG	2	6	15120	15125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016861	ATT	2	6	15451	15456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016861	GGA	2	6	15482	15487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016861	GAT	2	6	15542	15547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016861	ACA	2	6	15871	15876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_016861	GTT	2	6	15916	15921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016861	ACG	2	6	15958	15963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_016861	GAT	2	6	16039	16044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016861	CAC	2	6	16045	16050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_016861	ACG	2	6	16444	16449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_016861	GCT	2	6	16525	16530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_016861	TCA	2	6	16532	16537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_016861	TAA	2	6	16594	16599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016861	AGC	2	6	17689	17694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_016861	AAC	2	6	17728	17733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_016861	GAA	2	6	17758	17763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016861	ATA	2	6	17825	17830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016861	ATC	2	6	17884	17889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_016861	AGA	2	6	17918	17923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016861	TCT	2	6	17931	17936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_016861	TTA	2	6	17967	17972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016861	CTG	2	6	18003	18008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_016861	AAT	2	6	18037	18042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016861	CAT	2	6	18425	18430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_016861	CAG	2	6	18438	18443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_016861	TCC	2	6	18456	18461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_016861	AAC	2	6	18499	18504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_016861	CAG	2	6	18775	18780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_016861	AGA	2	6	18815	18820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016861	GAC	2	6	19428	19433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_016861	TCT	2	6	19587	19592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_016861	CTG	2	6	19648	19653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_016861	TGT	2	6	19665	19670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016861	GGC	2	6	19970	19975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_016861	GGC	2	6	22849	22854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_016861	GCG	2	6	22899	22904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_016861	GCT	2	6	23972	23977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_016861	TCC	2	6	24164	24169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_016861	ATC	2	6	25265	25270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_016861	CAC	2	6	25724	25729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_016861	TTC	2	6	25746	25751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_016861	ATA	2	6	26960	26965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016861	TAA	2	6	27106	27111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016861	ATT	2	6	27938	27943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016861	AAG	2	6	28052	28057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016861	ACT	2	6	28081	28086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_016861	ATG	2	6	30914	30919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016861	ATT	2	6	30974	30979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016861	CTG	2	6	31034	31039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_016861	CAA	2	6	31075	31080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_016861	CCA	2	6	31259	31264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_016861	GGA	2	6	31342	31347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016861	AAT	2	6	32336	32341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016861	ATG	2	6	32502	32507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016861	AAC	2	6	32519	32524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_016861	AAT	2	6	32564	32569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016861	TTA	2	6	32708	32713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016861	TAG	2	6	32837	32842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016861	GAT	2	6	37834	37839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016861	CAC	2	6	37848	37853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_016861	CCG	2	6	39268	39273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_016861	GTG	2	6	39692	39697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016861	GAA	2	6	39750	39755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016861	GCA	2	6	39840	39845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_016861	GCG	2	6	39978	39983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_016861	TCA	2	6	40031	40036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_016861	CGG	2	6	40039	40044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_016861	GGT	2	6	40055	40060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016861	CGT	2	6	40101	40106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_016861	CAC	2	6	40110	40115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_016861	GAT	2	6	40134	40139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016861	CTC	2	6	41632	41637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_016861	GGT	2	6	41812	41817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016861	ATC	2	6	41827	41832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_016861	AAT	2	6	43975	43980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016861	TAC	2	6	44037	44042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_016861	CCG	2	6	44324	44329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_016861	TTA	2	6	45635	45640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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179	NC_016861	GCC	2	6	65259	65264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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192	NC_016861	CGC	2	6	66718	66723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
193	NC_016861	GCG	2	6	66840	66845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
194	NC_016861	AAC	2	6	66957	66962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
195	NC_016861	ATT	2	6	67836	67841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.