MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. ST4/74 plasmid TY474p1

Total Repeats: 207

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016858	TGC	2	6	591	596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016858	CAG	2	6	9630	9635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_016858	AAG	2	6	9694	9699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016858	TTA	2	6	9724	9729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016858	CCT	2	6	9898	9903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_016858	TAT	2	6	16253	16258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016858	TCA	2	6	16274	16279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_016858	CGC	2	6	16289	16294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_016858	ATT	2	6	16373	16378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016858	CAG	2	6	25559	25564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_016858	AAT	2	6	30526	30531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016858	CCT	2	6	32277	32282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_016858	AGC	2	6	32972	32977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_016858	TAC	2	6	33018	33023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_016858	CGT	2	6	33034	33039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_016858	ATT	2	6	33101	33106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016858	GTG	2	6	33166	33171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016858	TGG	2	6	33176	33181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016858	TTG	2	6	33196	33201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016858	TTA	2	6	33226	33231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016858	AGA	2	6	33753	33758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016858	ATA	2	6	33763	33768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016858	TCT	2	6	33878	33883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_016858	GAA	2	6	33987	33992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016858	TTA	2	6	34037	34042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016858	ATC	2	6	34071	34076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_016858	TCA	2	6	34173	34178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_016858	TTC	2	6	34181	34186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_016858	TGT	2	6	34201	34206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016858	CGA	2	6	34232	34237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_016858	ATT	2	6	34247	34252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016858	CAA	2	6	34425	34430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_016858	AAT	2	6	34556	34561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016858	ACG	2	6	34595	34600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_016858	GCA	2	6	34606	34611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_016858	TGA	2	6	34699	34704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016858	ACG	2	6	34814	34819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_016858	GAA	2	6	34893	34898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016858	CAA	2	6	34962	34967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_016858	CAG	2	6	35092	35097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_016858	CCA	2	6	35125	35130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_016858	TGC	2	6	35275	35280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_016858	GGC	2	6	35284	35289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_016858	TGC	2	6	36545	36550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_016858	GGC	2	6	36562	36567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_016858	TAA	2	6	38596	38601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016858	GTT	2	6	39476	39481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016858	CTG	2	6	39545	39550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_016858	CGC	2	6	39593	39598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_016858	GTT	2	6	39687	39692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016858	GCG	2	6	39715	39720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_016858	CGC	2	6	39797	39802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_016858	CCG	2	6	39858	39863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_016858	GCG	2	6	39898	39903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_016858	GCA	2	6	39918	39923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_016858	GCA	2	6	40008	40013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_016858	CAG	3	9	40075	40083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_016858	TAT	2	6	40135	40140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016858	GAA	2	6	40150	40155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016858	GCG	2	6	40555	40560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_016858	CAT	2	6	40645	40650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_016858	ACC	2	6	40686	40691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_016858	CTC	2	6	41158	41163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_016858	CGC	2	6	41200	41205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_016858	CCG	2	6	41855	41860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_016858	GTC	2	6	42029	42034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_016858	TCG	2	6	42042	42047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_016858	TGT	2	6	42915	42920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016858	GGT	2	6	42975	42980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016858	CCG	2	6	43428	43433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_016858	AGG	2	6	44374	44379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016858	TCA	2	6	44528	44533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_016858	ATA	2	6	44553	44558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016858	CGC	2	6	44645	44650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_016858	GAG	2	6	44671	44676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016858	CAT	2	6	44685	44690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_016858	AGG	2	6	45578	45583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016858	TCG	2	6	45622	45627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_016858	TCG	2	6	45680	45685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_016858	ACG	2	6	45755	45760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_016858	ACA	2	6	45846	45851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_016858	AGG	2	6	45873	45878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016858	CTC	2	6	45908	45913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_016858	TTA	2	6	45921	45926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016858	AAT	2	6	46024	46029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016858	ATG	2	6	50034	50039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016858	ATA	2	6	50087	50092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016858	AGG	2	6	50111	50116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016858	CAG	2	6	50271	50276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_016858	TGA	2	6	50320	50325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016858	ATG	2	6	52001	52006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016858	TCA	2	6	52011	52016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_016858	ACC	2	6	52495	52500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_016858	CGG	2	6	52526	52531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_016858	CAA	2	6	54220	54225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_016858	CCG	2	6	54292	54297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_016858	CAC	2	6	54340	54345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_016858	GCA	2	6	55534	55539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_016858	CTA	2	6	60991	60996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_016858	ATT	2	6	61264	61269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016858	GTT	2	6	61309	61314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016858	CAT	2	6	61326	61331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_016858	ATT	2	6	61492	61497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016858	TGG	2	6	62569	62574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016858	TGT	2	6	62754	62759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016858	CAG	2	6	62794	62799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_016858	AAT	2	6	62854	62859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016858	TCA	2	6	62913	62918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_016858	AGT	2	6	65747	65752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016858	CTT	2	6	65776	65781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_016858	TAA	2	6	65888	65893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016858	GAA	2	6	68081	68086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016858	GTG	2	6	68103	68108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016858	GTG	2	6	69614	69619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016858	AGG	2	6	69671	69676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016858	CGC	2	6	73865	73870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_016858	ACA	2	6	74171	74176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_016858	CAG	2	6	74188	74193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_016858	AGA	2	6	74249	74254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016858	CGT	2	6	74407	74412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_016858	CTG	2	6	75061	75066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_016858	GTT	2	6	75337	75342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016858	AGG	2	6	75379	75384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016858	CTG	2	6	75398	75403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_016858	ATG	2	6	75411	75416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016858	ATT	2	6	75799	75804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016858	CAG	2	6	75833	75838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_016858	TAA	2	6	75869	75874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016858	AGA	2	6	75905	75910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016858	GGA	2	6	75948	75953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016858	TAT	2	6	76011	76016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016858	CTT	2	6	76077	76082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_016858	GTT	2	6	76108	76113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016858	GCT	2	6	76147	76152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_016858	TTA	2	6	77242	77247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016858	TGA	2	6	77304	77309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016858	AGC	2	6	77311	77316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_016858	CGT	2	6	77392	77397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_016858	GGA	2	6	77482	77487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.