MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. ST4/74 plasmid TY474p1

Total Repeats: 115

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016858	CG	3	6	42	47	0 %	0 %	50 %	50 %	379699101
2	NC_016858	TG	3	6	233	238	0 %	50 %	50 %	0 %	379699101
3	NC_016858	TC	3	6	1285	1290	0 %	50 %	0 %	50 %	379699102
4	NC_016858	TG	3	6	4280	4285	0 %	50 %	50 %	0 %	379699103
5	NC_016858	TC	3	6	4593	4598	0 %	50 %	0 %	50 %	379699103
6	NC_016858	CT	3	6	4871	4876	0 %	50 %	0 %	50 %	379699103
7	NC_016858	GC	3	6	5022	5027	0 %	0 %	50 %	50 %	379699103
8	NC_016858	CG	3	6	6052	6057	0 %	0 %	50 %	50 %	379699103
9	NC_016858	TG	3	6	6339	6344	0 %	50 %	50 %	0 %	379699103
10	NC_016858	TG	3	6	8364	8369	0 %	50 %	50 %	0 %	379699107
11	NC_016858	CG	3	6	8805	8810	0 %	0 %	50 %	50 %	379699107
12	NC_016858	CA	3	6	9182	9187	50 %	0 %	0 %	50 %	379699107
13	NC_016858	GC	3	6	12268	12273	0 %	0 %	50 %	50 %	379699110
14	NC_016858	AG	3	6	12767	12772	50 %	0 %	50 %	0 %	379699110
15	NC_016858	GA	3	6	12817	12822	50 %	0 %	50 %	0 %	379699110
16	NC_016858	CA	3	6	13517	13522	50 %	0 %	0 %	50 %	379699110
17	NC_016858	TG	3	6	15251	15256	0 %	50 %	50 %	0 %	379699111
18	NC_016858	GT	3	6	15481	15486	0 %	50 %	50 %	0 %	379699112
19	NC_016858	GA	3	6	15920	15925	50 %	0 %	50 %	0 %	379699112
20	NC_016858	GC	3	6	17465	17470	0 %	0 %	50 %	50 %	379699116
21	NC_016858	TG	3	6	18601	18606	0 %	50 %	50 %	0 %	379699116
22	NC_016858	CT	3	6	18729	18734	0 %	50 %	0 %	50 %	379699116
23	NC_016858	GC	3	6	18833	18838	0 %	0 %	50 %	50 %	379699116
24	NC_016858	AC	3	6	21605	21610	50 %	0 %	0 %	50 %	379699120
25	NC_016858	CG	3	6	22023	22028	0 %	0 %	50 %	50 %	379699121
26	NC_016858	GC	3	6	22315	22320	0 %	0 %	50 %	50 %	379699122
27	NC_016858	CG	3	6	23022	23027	0 %	0 %	50 %	50 %	379699123
28	NC_016858	CG	3	6	24472	24477	0 %	0 %	50 %	50 %	379699123
29	NC_016858	TG	3	6	24673	24678	0 %	50 %	50 %	0 %	379699123
30	NC_016858	GC	3	6	24767	24772	0 %	0 %	50 %	50 %	379699123
31	NC_016858	AC	3	6	24973	24978	50 %	0 %	0 %	50 %	379699123
32	NC_016858	CG	3	6	24989	24994	0 %	0 %	50 %	50 %	379699123
33	NC_016858	AC	3	6	25953	25958	50 %	0 %	0 %	50 %	379699125
34	NC_016858	AC	3	6	26167	26172	50 %	0 %	0 %	50 %	379699126
35	NC_016858	GA	3	6	26629	26634	50 %	0 %	50 %	0 %	379699127
36	NC_016858	GC	3	6	26953	26958	0 %	0 %	50 %	50 %	379699127
37	NC_016858	CG	3	6	28389	28394	0 %	0 %	50 %	50 %	379699130
38	NC_016858	CA	3	6	29406	29411	50 %	0 %	0 %	50 %	379699131
39	NC_016858	AT	3	6	30214	30219	50 %	50 %	0 %	0 %	379699132
40	NC_016858	CT	3	6	31468	31473	0 %	50 %	0 %	50 %	379699135
41	NC_016858	GC	3	6	31567	31572	0 %	0 %	50 %	50 %	379699135
42	NC_016858	GA	4	8	31844	31851	50 %	0 %	50 %	0 %	379699136
43	NC_016858	GA	3	6	32575	32580	50 %	0 %	50 %	0 %	379699137
44	NC_016858	TC	3	6	32756	32761	0 %	50 %	0 %	50 %	379699137
45	NC_016858	TA	4	8	32821	32828	50 %	50 %	0 %	0 %	379699137
46	NC_016858	GA	3	6	33339	33344	50 %	0 %	50 %	0 %	379699138
47	NC_016858	CG	3	6	35576	35581	0 %	0 %	50 %	50 %	379699139
48	NC_016858	GC	3	6	35764	35769	0 %	0 %	50 %	50 %	379699139
49	NC_016858	GC	3	6	36661	36666	0 %	0 %	50 %	50 %	379699141
50	NC_016858	CA	3	6	37259	37264	50 %	0 %	0 %	50 %	379699141
51	NC_016858	GC	3	6	37429	37434	0 %	0 %	50 %	50 %	379699141
52	NC_016858	CG	3	6	38121	38126	0 %	0 %	50 %	50 %	379699141
53	NC_016858	CT	3	6	38389	38394	0 %	50 %	0 %	50 %	379699141
54	NC_016858	GT	3	6	39300	39305	0 %	50 %	50 %	0 %	379699143
55	NC_016858	CA	3	6	40159	40164	50 %	0 %	0 %	50 %	379699144
56	NC_016858	CT	3	6	40329	40334	0 %	50 %	0 %	50 %	379699144
57	NC_016858	GC	3	6	40997	41002	0 %	0 %	50 %	50 %	379699145
58	NC_016858	GC	3	6	43601	43606	0 %	0 %	50 %	50 %	379699149
59	NC_016858	GC	3	6	43723	43728	0 %	0 %	50 %	50 %	379699150
60	NC_016858	AT	3	6	43789	43794	50 %	50 %	0 %	0 %	379699150
61	NC_016858	GT	4	8	43867	43874	0 %	50 %	50 %	0 %	379699150
62	NC_016858	GC	3	6	44296	44301	0 %	0 %	50 %	50 %	379699150
63	NC_016858	CG	3	6	46601	46606	0 %	0 %	50 %	50 %	379699154
64	NC_016858	GC	3	6	46930	46935	0 %	0 %	50 %	50 %	379699154
65	NC_016858	CG	3	6	47112	47117	0 %	0 %	50 %	50 %	379699154
66	NC_016858	GA	3	6	47157	47162	50 %	0 %	50 %	0 %	379699154
67	NC_016858	TC	3	6	47859	47864	0 %	50 %	0 %	50 %	379699155
68	NC_016858	GC	3	6	47958	47963	0 %	0 %	50 %	50 %	379699155
69	NC_016858	GT	3	6	49113	49118	0 %	50 %	50 %	0 %	379699156
70	NC_016858	CA	3	6	49363	49368	50 %	0 %	0 %	50 %	379699156
71	NC_016858	TA	3	6	49882	49887	50 %	50 %	0 %	0 %	379699156
72	NC_016858	AT	3	6	50665	50670	50 %	50 %	0 %	0 %	379699158
73	NC_016858	TA	3	6	51083	51088	50 %	50 %	0 %	0 %	379699158
74	NC_016858	GA	3	6	51565	51570	50 %	0 %	50 %	0 %	379699159
75	NC_016858	GA	3	6	51892	51897	50 %	0 %	50 %	0 %	379699159
76	NC_016858	AG	3	6	52411	52416	50 %	0 %	50 %	0 %	379699160
77	NC_016858	GC	3	6	52705	52710	0 %	0 %	50 %	50 %	379699161
78	NC_016858	TG	3	6	53212	53217	0 %	50 %	50 %	0 %	379699163
79	NC_016858	GC	4	8	53344	53351	0 %	0 %	50 %	50 %	379699163
80	NC_016858	AC	3	6	56018	56023	50 %	0 %	0 %	50 %	379699166
81	NC_016858	GT	4	8	57689	57696	0 %	50 %	50 %	0 %	379699168
82	NC_016858	AT	3	6	59310	59315	50 %	50 %	0 %	0 %	379699169
83	NC_016858	AG	3	6	61649	61654	50 %	0 %	50 %	0 %	379699172
84	NC_016858	TA	3	6	65221	65226	50 %	50 %	0 %	0 %	379699177
85	NC_016858	TA	3	6	66401	66406	50 %	50 %	0 %	0 %	379699178
86	NC_016858	AG	3	6	67038	67043	50 %	0 %	50 %	0 %	379699180
87	NC_016858	AT	3	6	67181	67186	50 %	50 %	0 %	0 %	379699180
88	NC_016858	AT	3	6	68198	68203	50 %	50 %	0 %	0 %	379699182
89	NC_016858	GC	3	6	68784	68789	0 %	0 %	50 %	50 %	379699183
90	NC_016858	GT	3	6	69713	69718	0 %	50 %	50 %	0 %	379699185
91	NC_016858	GC	3	6	69883	69888	0 %	0 %	50 %	50 %	379699185
92	NC_016858	GC	3	6	69940	69945	0 %	0 %	50 %	50 %	379699185
93	NC_016858	CA	3	6	69966	69971	50 %	0 %	0 %	50 %	379699185
94	NC_016858	GA	3	6	69992	69997	50 %	0 %	50 %	0 %	379699185
95	NC_016858	GC	3	6	71058	71063	0 %	0 %	50 %	50 %	379699188
96	NC_016858	GC	3	6	71897	71902	0 %	0 %	50 %	50 %	379699189
97	NC_016858	GC	3	6	72619	72624	0 %	0 %	50 %	50 %	379699190
98	NC_016858	CA	3	6	73166	73171	50 %	0 %	0 %	50 %	379699191
99	NC_016858	CT	3	6	74671	74676	0 %	50 %	0 %	50 %	379699194
100	NC_016858	AG	3	6	76858	76863	50 %	0 %	50 %	0 %	379699197
101	NC_016858	GT	3	6	79359	79364	0 %	50 %	50 %	0 %	379699198
102	NC_016858	GT	3	6	82050	82055	0 %	50 %	50 %	0 %	379699200
103	NC_016858	GC	3	6	82457	82462	0 %	0 %	50 %	50 %	379699200
104	NC_016858	GC	3	6	82728	82733	0 %	0 %	50 %	50 %	379699200
105	NC_016858	GC	3	6	82800	82805	0 %	0 %	50 %	50 %	379699200
106	NC_016858	TG	4	8	83647	83654	0 %	50 %	50 %	0 %	379699202
107	NC_016858	TA	3	6	84779	84784	50 %	50 %	0 %	0 %	379699203
108	NC_016858	GC	3	6	85790	85795	0 %	0 %	50 %	50 %	379699204
109	NC_016858	AC	3	6	87925	87930	50 %	0 %	0 %	50 %	379699207
110	NC_016858	GA	3	6	89439	89444	50 %	0 %	50 %	0 %	379699209
111	NC_016858	AC	3	6	89673	89678	50 %	0 %	0 %	50 %	379699209
112	NC_016858	GA	3	6	90943	90948	50 %	0 %	50 %	0 %	379699211
113	NC_016858	TC	3	6	91849	91854	0 %	50 %	0 %	50 %	379699212
114	NC_016858	AC	3	6	92818	92823	50 %	0 %	0 %	50 %	379699215
115	NC_016858	GC	3	6	93598	93603	0 %	0 %	50 %	50 %	379699216

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.