MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. ST4/74 plasmid TY474p1

Total Repeats: 131

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016858	T	8	8	414	421	0 %	100 %	0 %	0 %	379699101
2	NC_016858	A	6	6	691	696	100 %	0 %	0 %	0 %	379699102
3	NC_016858	G	6	6	2706	2711	0 %	0 %	100 %	0 %	379699103
4	NC_016858	A	6	6	7010	7015	100 %	0 %	0 %	0 %	379699104
5	NC_016858	A	6	6	7108	7113	100 %	0 %	0 %	0 %	379699104
6	NC_016858	G	6	6	7538	7543	0 %	0 %	100 %	0 %	379699107
7	NC_016858	T	6	6	7634	7639	0 %	100 %	0 %	0 %	379699107
8	NC_016858	T	6	6	8539	8544	0 %	100 %	0 %	0 %	379699107
9	NC_016858	T	6	6	9041	9046	0 %	100 %	0 %	0 %	379699107
10	NC_016858	A	6	6	9152	9157	100 %	0 %	0 %	0 %	379699107
11	NC_016858	T	6	6	9610	9615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016858	T	7	7	10628	10634	0 %	100 %	0 %	0 %	379699108
13	NC_016858	T	8	8	11010	11017	0 %	100 %	0 %	0 %	379699109
14	NC_016858	T	6	6	11436	11441	0 %	100 %	0 %	0 %	379699110
15	NC_016858	C	6	6	13414	13419	0 %	0 %	0 %	100 %	379699110
16	NC_016858	A	6	6	13438	13443	100 %	0 %	0 %	0 %	379699110
17	NC_016858	C	6	6	14902	14907	0 %	0 %	0 %	100 %	379699111
18	NC_016858	A	6	6	15028	15033	100 %	0 %	0 %	0 %	379699111
19	NC_016858	T	6	6	15176	15181	0 %	100 %	0 %	0 %	379699111
20	NC_016858	A	7	7	16086	16092	100 %	0 %	0 %	0 %	379699113
21	NC_016858	A	6	6	16283	16288	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016858	T	6	6	16863	16868	0 %	100 %	0 %	0 %	379699114
23	NC_016858	C	6	6	17176	17181	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
24	NC_016858	C	6	6	20562	20567	0 %	0 %	0 %	100 %	379699119
25	NC_016858	T	6	6	22442	22447	0 %	100 %	0 %	0 %	379699122
26	NC_016858	A	6	6	22463	22468	100 %	0 %	0 %	0 %	379699122
27	NC_016858	T	6	6	23503	23508	0 %	100 %	0 %	0 %	379699123
28	NC_016858	T	8	8	24752	24759	0 %	100 %	0 %	0 %	379699123
29	NC_016858	T	6	6	26104	26109	0 %	100 %	0 %	0 %	379699125
30	NC_016858	A	6	6	26519	26524	100 %	0 %	0 %	0 %	379699127
31	NC_016858	T	6	6	27239	27244	0 %	100 %	0 %	0 %	379699129
32	NC_016858	C	6	6	28409	28414	0 %	0 %	0 %	100 %	379699130
33	NC_016858	T	6	6	29949	29954	0 %	100 %	0 %	0 %	379699131
34	NC_016858	A	6	6	30127	30132	100 %	0 %	0 %	0 %	379699132
35	NC_016858	T	6	6	30648	30653	0 %	100 %	0 %	0 %	379699133
36	NC_016858	A	9	9	31545	31553	100 %	0 %	0 %	0 %	379699135
37	NC_016858	A	6	6	31791	31796	100 %	0 %	0 %	0 %	379699136
38	NC_016858	A	7	7	31878	31884	100 %	0 %	0 %	0 %	379699136
39	NC_016858	T	7	7	32346	32352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016858	T	6	6	32856	32861	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016858	T	6	6	32998	33003	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016858	G	6	6	33578	33583	0 %	0 %	100 %	0 %	379699138
43	NC_016858	T	6	6	33790	33795	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016858	T	6	6	34137	34142	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016858	A	6	6	34762	34767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016858	A	6	6	34883	34888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016858	T	6	6	35119	35124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016858	A	6	6	35972	35977	100 %	0 %	0 %	0 %	379699139
49	NC_016858	A	6	6	36355	36360	100 %	0 %	0 %	0 %	379699140
50	NC_016858	T	6	6	36801	36806	0 %	100 %	0 %	0 %	379699141
51	NC_016858	A	7	7	40175	40181	100 %	0 %	0 %	0 %	379699144
52	NC_016858	T	6	6	40243	40248	0 %	100 %	0 %	0 %	379699144
53	NC_016858	C	6	6	40582	40587	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
54	NC_016858	T	6	6	40607	40612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016858	T	6	6	41088	41093	0 %	100 %	0 %	0 %	379699145
56	NC_016858	T	6	6	41521	41526	0 %	100 %	0 %	0 %	379699146
57	NC_016858	A	6	6	42069	42074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016858	T	6	6	44163	44168	0 %	100 %	0 %	0 %	379699150
59	NC_016858	A	6	6	44665	44670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016858	A	7	7	46619	46625	100 %	0 %	0 %	0 %	379699154
61	NC_016858	C	6	6	47214	47219	0 %	0 %	0 %	100 %	379699154
62	NC_016858	T	6	6	50040	50045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016858	A	6	6	50328	50333	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016858	T	6	6	50389	50394	0 %	100 %	0 %	0 %	379699157
65	NC_016858	A	6	6	50774	50779	100 %	0 %	0 %	0 %	379699158
66	NC_016858	C	6	6	55264	55269	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
67	NC_016858	A	6	6	56174	56179	100 %	0 %	0 %	0 %	379699166
68	NC_016858	T	6	6	56393	56398	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016858	A	6	6	59074	59079	100 %	0 %	0 %	0 %	379699169
70	NC_016858	G	6	6	59832	59837	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016858	T	6	6	61214	61219	0 %	100 %	0 %	0 %	379699171
72	NC_016858	T	6	6	61482	61487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016858	A	10	10	61501	61510	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016858	A	6	6	61538	61543	100 %	0 %	0 %	0 %	379699172
75	NC_016858	A	6	6	61837	61842	100 %	0 %	0 %	0 %	379699172
76	NC_016858	A	6	6	61875	61880	100 %	0 %	0 %	0 %	379699172
77	NC_016858	A	6	6	62033	62038	100 %	0 %	0 %	0 %	379699172
78	NC_016858	T	7	7	62137	62143	0 %	100 %	0 %	0 %	379699172
79	NC_016858	T	6	6	65814	65819	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016858	A	6	6	65828	65833	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016858	A	8	8	65865	65872	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016858	C	6	6	66758	66763	0 %	0 %	0 %	100 %	379699179
83	NC_016858	T	6	6	66855	66860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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85	NC_016858	A	6	6	67435	67440	100 %	0 %	0 %	0 %	379699180
86	NC_016858	A	7	7	67503	67509	100 %	0 %	0 %	0 %	379699180
87	NC_016858	T	6	6	67571	67576	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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89	NC_016858	T	6	6	69418	69423	0 %	100 %	0 %	0 %	379699184
90	NC_016858	T	6	6	70892	70897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016858	C	6	6	70966	70971	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
92	NC_016858	C	6	6	71136	71141	0 %	0 %	0 %	100 %	379699188
93	NC_016858	T	6	6	72416	72421	0 %	100 %	0 %	0 %	379699190
94	NC_016858	T	6	6	73757	73762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016858	T	6	6	74069	74074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016858	T	6	6	74267	74272	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016858	T	6	6	74815	74820	0 %	100 %	0 %	0 %	379699194
98	NC_016858	A	7	7	75748	75754	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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100	NC_016858	T	6	6	77891	77896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016858	T	6	6	78097	78102	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016858	T	6	6	78306	78311	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016858	T	6	6	78450	78455	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016858	A	7	7	78474	78480	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016858	T	6	6	78707	78712	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016858	T	6	6	78832	78837	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016858	T	6	6	78856	78861	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016858	T	6	6	78885	78890	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016858	T	6	6	78892	78897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016858	T	6	6	78947	78952	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016858	A	6	6	79727	79732	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016858	G	7	7	80490	80496	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016858	A	6	6	81557	81562	100 %	0 %	0 %	0 %	379699200
114	NC_016858	G	6	6	82827	82832	0 %	0 %	100 %	0 %	379699200
115	NC_016858	G	6	6	83923	83928	0 %	0 %	100 %	0 %	379699202
116	NC_016858	G	6	6	84454	84459	0 %	0 %	100 %	0 %	379699203
117	NC_016858	A	6	6	85354	85359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016858	T	6	6	86372	86377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016858	T	6	6	86571	86576	0 %	100 %	0 %	0 %	379699206
120	NC_016858	C	7	7	87570	87576	0 %	0 %	0 %	100 %	379699207
121	NC_016858	A	6	6	87859	87864	100 %	0 %	0 %	0 %	379699207
122	NC_016858	A	7	7	88296	88302	100 %	0 %	0 %	0 %	379699208
123	NC_016858	T	6	6	88933	88938	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016858	G	7	7	89061	89067	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016858	T	7	7	89139	89145	0 %	100 %	0 %	0 %	379699209
126	NC_016858	T	7	7	89505	89511	0 %	100 %	0 %	0 %	379699209
127	NC_016858	A	6	6	89645	89650	100 %	0 %	0 %	0 %	379699209
128	NC_016858	A	6	6	89702	89707	100 %	0 %	0 %	0 %	379699209
129	NC_016858	T	6	6	90194	90199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016858	T	6	6	92381	92386	0 %	100 %	0 %	0 %	379699214
131	NC_016858	C	10	10	92919	92928	0 %	0 %	0 %	100 %	379699215

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.