MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. ST4/74 plasmid TY474p1

Total Repeats: 80

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016858	T	8	8	414	421	0 %	100 %	0 %	0 %	379699101
2	NC_016858	A	6	6	691	696	100 %	0 %	0 %	0 %	379699102
3	NC_016858	G	6	6	2706	2711	0 %	0 %	100 %	0 %	379699103
4	NC_016858	A	6	6	7010	7015	100 %	0 %	0 %	0 %	379699104
5	NC_016858	A	6	6	7108	7113	100 %	0 %	0 %	0 %	379699104
6	NC_016858	G	6	6	7538	7543	0 %	0 %	100 %	0 %	379699107
7	NC_016858	T	6	6	7634	7639	0 %	100 %	0 %	0 %	379699107
8	NC_016858	T	6	6	8539	8544	0 %	100 %	0 %	0 %	379699107
9	NC_016858	T	6	6	9041	9046	0 %	100 %	0 %	0 %	379699107
10	NC_016858	A	6	6	9152	9157	100 %	0 %	0 %	0 %	379699107
11	NC_016858	T	7	7	10628	10634	0 %	100 %	0 %	0 %	379699108
12	NC_016858	T	8	8	11010	11017	0 %	100 %	0 %	0 %	379699109
13	NC_016858	T	6	6	11436	11441	0 %	100 %	0 %	0 %	379699110
14	NC_016858	C	6	6	13414	13419	0 %	0 %	0 %	100 %	379699110
15	NC_016858	A	6	6	13438	13443	100 %	0 %	0 %	0 %	379699110
16	NC_016858	C	6	6	14902	14907	0 %	0 %	0 %	100 %	379699111
17	NC_016858	A	6	6	15028	15033	100 %	0 %	0 %	0 %	379699111
18	NC_016858	T	6	6	15176	15181	0 %	100 %	0 %	0 %	379699111
19	NC_016858	A	7	7	16086	16092	100 %	0 %	0 %	0 %	379699113
20	NC_016858	T	6	6	16863	16868	0 %	100 %	0 %	0 %	379699114
21	NC_016858	C	6	6	20562	20567	0 %	0 %	0 %	100 %	379699119
22	NC_016858	T	6	6	22442	22447	0 %	100 %	0 %	0 %	379699122
23	NC_016858	A	6	6	22463	22468	100 %	0 %	0 %	0 %	379699122
24	NC_016858	T	6	6	23503	23508	0 %	100 %	0 %	0 %	379699123
25	NC_016858	T	8	8	24752	24759	0 %	100 %	0 %	0 %	379699123
26	NC_016858	T	6	6	26104	26109	0 %	100 %	0 %	0 %	379699125
27	NC_016858	A	6	6	26519	26524	100 %	0 %	0 %	0 %	379699127
28	NC_016858	T	6	6	27239	27244	0 %	100 %	0 %	0 %	379699129
29	NC_016858	C	6	6	28409	28414	0 %	0 %	0 %	100 %	379699130
30	NC_016858	T	6	6	29949	29954	0 %	100 %	0 %	0 %	379699131
31	NC_016858	A	6	6	30127	30132	100 %	0 %	0 %	0 %	379699132
32	NC_016858	T	6	6	30648	30653	0 %	100 %	0 %	0 %	379699133
33	NC_016858	A	9	9	31545	31553	100 %	0 %	0 %	0 %	379699135
34	NC_016858	A	6	6	31791	31796	100 %	0 %	0 %	0 %	379699136
35	NC_016858	A	7	7	31878	31884	100 %	0 %	0 %	0 %	379699136
36	NC_016858	G	6	6	33578	33583	0 %	0 %	100 %	0 %	379699138
37	NC_016858	A	6	6	35972	35977	100 %	0 %	0 %	0 %	379699139
38	NC_016858	A	6	6	36355	36360	100 %	0 %	0 %	0 %	379699140
39	NC_016858	T	6	6	36801	36806	0 %	100 %	0 %	0 %	379699141
40	NC_016858	A	7	7	40175	40181	100 %	0 %	0 %	0 %	379699144
41	NC_016858	T	6	6	40243	40248	0 %	100 %	0 %	0 %	379699144
42	NC_016858	T	6	6	41088	41093	0 %	100 %	0 %	0 %	379699145
43	NC_016858	T	6	6	41521	41526	0 %	100 %	0 %	0 %	379699146
44	NC_016858	T	6	6	44163	44168	0 %	100 %	0 %	0 %	379699150
45	NC_016858	A	7	7	46619	46625	100 %	0 %	0 %	0 %	379699154
46	NC_016858	C	6	6	47214	47219	0 %	0 %	0 %	100 %	379699154
47	NC_016858	T	6	6	50389	50394	0 %	100 %	0 %	0 %	379699157
48	NC_016858	A	6	6	50774	50779	100 %	0 %	0 %	0 %	379699158
49	NC_016858	A	6	6	56174	56179	100 %	0 %	0 %	0 %	379699166
50	NC_016858	A	6	6	59074	59079	100 %	0 %	0 %	0 %	379699169
51	NC_016858	T	6	6	61214	61219	0 %	100 %	0 %	0 %	379699171
52	NC_016858	A	6	6	61538	61543	100 %	0 %	0 %	0 %	379699172
53	NC_016858	A	6	6	61837	61842	100 %	0 %	0 %	0 %	379699172
54	NC_016858	A	6	6	61875	61880	100 %	0 %	0 %	0 %	379699172
55	NC_016858	A	6	6	62033	62038	100 %	0 %	0 %	0 %	379699172
56	NC_016858	T	7	7	62137	62143	0 %	100 %	0 %	0 %	379699172
57	NC_016858	C	6	6	66758	66763	0 %	0 %	0 %	100 %	379699179
58	NC_016858	A	6	6	66969	66974	100 %	0 %	0 %	0 %	379699180
59	NC_016858	A	6	6	67435	67440	100 %	0 %	0 %	0 %	379699180
60	NC_016858	A	7	7	67503	67509	100 %	0 %	0 %	0 %	379699180
61	NC_016858	A	6	6	68357	68362	100 %	0 %	0 %	0 %	379699182
62	NC_016858	T	6	6	69418	69423	0 %	100 %	0 %	0 %	379699184
63	NC_016858	C	6	6	71136	71141	0 %	0 %	0 %	100 %	379699188
64	NC_016858	T	6	6	72416	72421	0 %	100 %	0 %	0 %	379699190
65	NC_016858	T	6	6	74815	74820	0 %	100 %	0 %	0 %	379699194
66	NC_016858	A	6	6	76210	76215	100 %	0 %	0 %	0 %	379699196
67	NC_016858	A	6	6	81557	81562	100 %	0 %	0 %	0 %	379699200
68	NC_016858	G	6	6	82827	82832	0 %	0 %	100 %	0 %	379699200
69	NC_016858	G	6	6	83923	83928	0 %	0 %	100 %	0 %	379699202
70	NC_016858	G	6	6	84454	84459	0 %	0 %	100 %	0 %	379699203
71	NC_016858	T	6	6	86571	86576	0 %	100 %	0 %	0 %	379699206
72	NC_016858	C	7	7	87570	87576	0 %	0 %	0 %	100 %	379699207
73	NC_016858	A	6	6	87859	87864	100 %	0 %	0 %	0 %	379699207
74	NC_016858	A	7	7	88296	88302	100 %	0 %	0 %	0 %	379699208
75	NC_016858	T	7	7	89139	89145	0 %	100 %	0 %	0 %	379699209
76	NC_016858	T	7	7	89505	89511	0 %	100 %	0 %	0 %	379699209
77	NC_016858	A	6	6	89645	89650	100 %	0 %	0 %	0 %	379699209
78	NC_016858	A	6	6	89702	89707	100 %	0 %	0 %	0 %	379699209
79	NC_016858	T	6	6	92381	92386	0 %	100 %	0 %	0 %	379699214
80	NC_016858	C	10	10	92919	92928	0 %	0 %	0 %	100 %	379699215

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.