MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. ST4/74 chromosome

Total Repeats: 3382

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016857	AGGTA	2	10	2553	2562	40 %	20 %	40 %	0 %	379699219
2	NC_016857	ATTGC	2	10	3396	3405	20 %	40 %	20 %	20 %	379699220
3	NC_016857	CGGCG	2	10	4144	4153	0 %	0 %	60 %	40 %	379699221
4	NC_016857	CCGCG	2	10	7184	7193	0 %	0 %	40 %	60 %	379699223
5	NC_016857	CCTTC	2	10	8674	8683	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
6	NC_016857	GATGA	2	10	8915	8924	40 %	20 %	40 %	0 %	379699225
7	NC_016857	GAAAA	2	10	10061	10070	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016857	TCTTT	2	10	11322	11331	0 %	80 %	0 %	20 %	379699229
9	NC_016857	ATTTA	2	10	11364	11373	40 %	60 %	0 %	0 %	379699229
10	NC_016857	GCGTG	2	10	13990	13999	0 %	20 %	60 %	20 %	379699231
11	NC_016857	GTGAT	2	10	14912	14921	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016857	AATCA	2	10	15506	15515	60 %	20 %	0 %	20 %	379699232
13	NC_016857	TATTG	2	10	17576	17585	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016857	GGCTG	2	10	18851	18860	0 %	20 %	60 %	20 %	379699236
15	NC_016857	AGAGC	2	10	19372	19381	40 %	0 %	40 %	20 %	379699236
16	NC_016857	CCTGA	2	10	19913	19922	20 %	20 %	20 %	40 %	379699236
17	NC_016857	TACCG	2	10	21050	21059	20 %	20 %	20 %	40 %	379699237
18	NC_016857	GGCCG	2	10	21674	21683	0 %	0 %	60 %	40 %	379699237
19	NC_016857	CTTTT	2	10	23393	23402	0 %	80 %	0 %	20 %	379699238
20	NC_016857	CGGTA	2	10	24561	24570	20 %	20 %	40 %	20 %	379699239
21	NC_016857	CTGTT	2	10	24600	24609	0 %	60 %	20 %	20 %	379699239
22	NC_016857	TATTT	2	10	25434	25443	20 %	80 %	0 %	0 %	379699240
23	NC_016857	GCGTC	2	10	28357	28366	0 %	20 %	40 %	40 %	379699241
24	NC_016857	ATCTG	2	10	30965	30974	20 %	40 %	20 %	20 %	379699245
25	NC_016857	TTACG	2	10	31020	31029	20 %	40 %	20 %	20 %	379699245
26	NC_016857	GGGCG	2	10	31789	31798	0 %	0 %	80 %	20 %	379699246
27	NC_016857	TGCGT	2	10	32168	32177	0 %	40 %	40 %	20 %	379699247
28	NC_016857	AAAAG	2	10	32562	32571	80 %	0 %	20 %	0 %	379699248
29	NC_016857	TTTTA	2	10	33211	33220	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016857	TATAA	2	10	34165	34174	60 %	40 %	0 %	0 %	379699249
31	NC_016857	ATCGT	2	10	34918	34927	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_016857	ATTTT	2	10	34962	34971	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016857	TTTTA	2	10	35223	35232	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016857	AGCGA	2	10	35591	35600	40 %	0 %	40 %	20 %	379699251
35	NC_016857	TCCTG	2	10	35801	35810	0 %	40 %	20 %	40 %	379699251
36	NC_016857	GGTCA	2	10	38036	38045	20 %	20 %	40 %	20 %	379699252
37	NC_016857	TTCAT	2	10	39308	39317	20 %	60 %	0 %	20 %	379699253
38	NC_016857	TGAAA	2	10	40127	40136	60 %	20 %	20 %	0 %	379699254
39	NC_016857	TAAAA	2	10	44191	44200	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016857	ACGGC	2	10	44487	44496	20 %	0 %	40 %	40 %	379699257
41	NC_016857	TTTTA	2	10	44813	44822	20 %	80 %	0 %	0 %	379699257
42	NC_016857	GGGCT	2	10	46561	46570	0 %	20 %	60 %	20 %	379699258
43	NC_016857	GCGTA	2	10	48437	48446	20 %	20 %	40 %	20 %	379699260
44	NC_016857	GACCA	2	10	49042	49051	40 %	0 %	20 %	40 %	379699260
45	NC_016857	CCGGC	2	10	49184	49193	0 %	0 %	40 %	60 %	379699260
46	NC_016857	CAGAC	2	10	50374	50383	40 %	0 %	20 %	40 %	379699260
47	NC_016857	TGTGC	2	10	53135	53144	0 %	40 %	40 %	20 %	379699264
48	NC_016857	GTTTG	2	10	55457	55466	0 %	60 %	40 %	0 %	379699265
49	NC_016857	CACTA	2	10	56588	56597	40 %	20 %	0 %	40 %	379699265
50	NC_016857	CGGCG	2	10	57126	57135	0 %	0 %	60 %	40 %	379699266
51	NC_016857	AGCGC	2	10	57234	57243	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
52	NC_016857	TTCAC	2	10	57381	57390	20 %	40 %	0 %	40 %	379699267
53	NC_016857	AAAAT	2	10	58952	58961	80 %	20 %	0 %	0 %	379699269
54	NC_016857	GGAAA	2	10	59739	59748	60 %	0 %	40 %	0 %	379699269
55	NC_016857	CGCTG	2	10	60229	60238	0 %	20 %	40 %	40 %	379699270
56	NC_016857	GCCTG	2	10	64788	64797	0 %	20 %	40 %	40 %	379699273
57	NC_016857	GCGCG	2	10	64942	64951	0 %	0 %	60 %	40 %	379699274
58	NC_016857	CGTGC	2	10	71368	71377	0 %	20 %	40 %	40 %	379699280
59	NC_016857	TTGAT	2	10	71538	71547	20 %	60 %	20 %	0 %	379699280
60	NC_016857	ACCGC	2	10	72098	72107	20 %	0 %	20 %	60 %	379699280
61	NC_016857	ATTTG	2	10	75442	75451	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016857	CGATG	2	10	77760	77769	20 %	20 %	40 %	20 %	379699286
63	NC_016857	GCGAA	2	10	78701	78710	40 %	0 %	40 %	20 %	379699286
64	NC_016857	CGTAC	2	10	79591	79600	20 %	20 %	20 %	40 %	379699286
65	NC_016857	TTGCC	2	10	81227	81236	0 %	40 %	20 %	40 %	379699288
66	NC_016857	CGTCC	2	10	81337	81346	0 %	20 %	20 %	60 %	379699288
67	NC_016857	AAGCG	2	10	81700	81709	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_016857	TTCAG	2	10	84454	84463	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_016857	GGCCA	2	10	84603	84612	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
70	NC_016857	GTACG	2	10	87174	87183	20 %	20 %	40 %	20 %	379699292
71	NC_016857	CAGAA	2	10	87887	87896	60 %	0 %	20 %	20 %	379699292
72	NC_016857	CCGCA	2	10	90006	90015	20 %	0 %	20 %	60 %	379699295
73	NC_016857	CGGTT	2	10	90511	90520	0 %	40 %	40 %	20 %	379699296
74	NC_016857	GCTCC	2	10	91647	91656	0 %	20 %	20 %	60 %	379699296
75	NC_016857	TGGCG	2	10	92291	92300	0 %	20 %	60 %	20 %	379699299
76	NC_016857	TAAAA	2	10	95766	95775	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016857	TTTCC	2	10	96205	96214	0 %	60 %	0 %	40 %	379699303
78	NC_016857	GTGGC	2	10	96774	96783	0 %	20 %	60 %	20 %	379699303
79	NC_016857	GCGCT	2	10	97926	97935	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
80	NC_016857	AGCGC	2	10	97993	98002	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
81	NC_016857	TGCAC	2	10	98691	98700	20 %	20 %	20 %	40 %	379699304
82	NC_016857	TGGCA	2	10	98760	98769	20 %	20 %	40 %	20 %	379699304
83	NC_016857	TCTGT	2	10	99086	99095	0 %	60 %	20 %	20 %	379699305
84	NC_016857	GCGCT	2	10	99396	99405	0 %	20 %	40 %	40 %	379699305
85	NC_016857	GGCGC	2	10	99810	99819	0 %	0 %	60 %	40 %	379699305
86	NC_016857	GCGAC	2	10	100123	100132	20 %	0 %	40 %	40 %	379699305
87	NC_016857	AACGT	2	10	102580	102589	40 %	20 %	20 %	20 %	379699308
88	NC_016857	CCCAA	2	10	104730	104739	40 %	0 %	0 %	60 %	379699311
89	NC_016857	TTGTT	2	10	105437	105446	0 %	80 %	20 %	0 %	379699311
90	NC_016857	GCTTC	2	10	106817	106826	0 %	40 %	20 %	40 %	379699312
91	NC_016857	TGCGT	2	10	107104	107113	0 %	40 %	40 %	20 %	379699312
92	NC_016857	TGATC	2	10	108804	108813	20 %	40 %	20 %	20 %	379699313
93	NC_016857	AAGCG	2	10	109300	109309	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_016857	TGGCG	2	10	111964	111973	0 %	20 %	60 %	20 %	379699315
95	NC_016857	AGCGC	2	10	112524	112533	20 %	0 %	40 %	40 %	379699315
96	NC_016857	ACGTT	2	10	113341	113350	20 %	40 %	20 %	20 %	379699316
97	NC_016857	CCGCG	2	10	113609	113618	0 %	0 %	40 %	60 %	379699316
98	NC_016857	TAATT	2	10	116727	116736	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016857	ATTTT	2	10	116753	116762	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016857	ACAGA	2	10	116936	116945	60 %	0 %	20 %	20 %	379699318
101	NC_016857	CAGCG	2	10	118111	118120	20 %	0 %	40 %	40 %	379699320
102	NC_016857	GCCGG	2	10	118411	118420	0 %	0 %	60 %	40 %	379699320
103	NC_016857	CGAGC	2	10	118536	118545	20 %	0 %	40 %	40 %	379699320
104	NC_016857	ATTTG	2	10	118979	118988	20 %	60 %	20 %	0 %	379699320
105	NC_016857	TTGCC	2	10	123483	123492	0 %	40 %	20 %	40 %	379699324
106	NC_016857	AGCAG	2	10	124160	124169	40 %	0 %	40 %	20 %	379699325
107	NC_016857	AGTTT	2	10	126390	126399	20 %	60 %	20 %	0 %	379699326
108	NC_016857	TAGTG	2	10	126808	126817	20 %	40 %	40 %	0 %	379699327
109	NC_016857	TCGAT	2	10	128238	128247	20 %	40 %	20 %	20 %	379699328
110	NC_016857	CGGCG	2	10	130549	130558	0 %	0 %	60 %	40 %	379699332
111	NC_016857	CGTTT	2	10	131011	131020	0 %	60 %	20 %	20 %	379699332
112	NC_016857	GACCG	2	10	132455	132464	20 %	0 %	40 %	40 %	379699334
113	NC_016857	GGTTT	2	10	134167	134176	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016857	ATTCC	2	10	136112	136121	20 %	40 %	0 %	40 %	379699337
115	NC_016857	CCCAA	2	10	138181	138190	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
116	NC_016857	AAAGC	2	10	138409	138418	60 %	0 %	20 %	20 %	379699339
117	NC_016857	CCGCA	2	10	138942	138951	20 %	0 %	20 %	60 %	379699339
118	NC_016857	TTGTT	2	10	139528	139537	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016857	AGTTC	2	10	141313	141322	20 %	40 %	20 %	20 %	379699341
120	NC_016857	TGCCT	2	10	141413	141422	0 %	40 %	20 %	40 %	379699342
121	NC_016857	AAGCG	2	10	146066	146075	40 %	0 %	40 %	20 %	379699345
122	NC_016857	GTTTG	2	10	147969	147978	0 %	60 %	40 %	0 %	379699347
123	NC_016857	CGTAT	2	10	149440	149449	20 %	40 %	20 %	20 %	379699348
124	NC_016857	ATCAG	2	10	151276	151285	40 %	20 %	20 %	20 %	379699350
125	NC_016857	CTGCC	2	10	153285	153294	0 %	20 %	20 %	60 %	379699351
126	NC_016857	CGGCG	2	10	156015	156024	0 %	0 %	60 %	40 %	379699354
127	NC_016857	CGCGG	2	10	158665	158674	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
128	NC_016857	CCGGC	2	10	159369	159378	0 %	0 %	40 %	60 %	379699357
129	NC_016857	GATCA	2	10	162687	162696	40 %	20 %	20 %	20 %	379699360
130	NC_016857	CGTCA	2	10	163433	163442	20 %	20 %	20 %	40 %	379699361
131	NC_016857	ATCCC	2	10	165133	165142	20 %	20 %	0 %	60 %	379699363
132	NC_016857	AGCGC	2	10	165841	165850	20 %	0 %	40 %	40 %	379699363
133	NC_016857	TGAGC	2	10	167690	167699	20 %	20 %	40 %	20 %	379699364
134	NC_016857	CGCAT	2	10	167952	167961	20 %	20 %	20 %	40 %	379699365
135	NC_016857	CGAAC	2	10	168681	168690	40 %	0 %	20 %	40 %	379699366
136	NC_016857	GTTCA	2	10	168947	168956	20 %	40 %	20 %	20 %	379699366
137	NC_016857	ATGAC	2	10	169913	169922	40 %	20 %	20 %	20 %	379699367
138	NC_016857	CTGGA	2	10	170503	170512	20 %	20 %	40 %	20 %	379699368
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