MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. ST4/74 chromosome

Total Repeats: 7283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016857	CAG	2	6	64	69	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016857	ACA	2	6	181	186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_016857	AAC	2	6	330	335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_016857	GTG	2	6	5062	5067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016857	CGC	2	6	5931	5936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_016857	ATG	2	6	7453	7458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016857	GGT	2	6	7506	7511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016857	AAT	2	6	8722	8727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016857	TAG	2	6	9334	9339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016857	TCC	2	6	9346	9351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_016857	GGA	2	6	9359	9364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016857	ATC	2	6	9954	9959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_016857	ATA	2	6	10017	10022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016857	TAA	2	6	10051	10056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016857	TGA	2	6	11446	11451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016857	GTG	2	6	11486	11491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016857	TTA	2	6	11540	11545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016857	ATG	2	6	11561	11566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016857	TTC	2	6	14753	14758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_016857	TTG	2	6	14834	14839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016857	CAG	2	6	14877	14882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_016857	TAT	2	6	14970	14975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016857	ATG	2	6	16001	16006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016857	CCT	2	6	16022	16027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_016857	ATT	2	6	16055	16060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016857	ATT	2	6	17612	17617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016857	GTT	2	6	17704	17709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016857	GTT	2	6	17728	17733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016857	ATC	2	6	17757	17762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_016857	GAT	2	6	17769	17774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016857	CCA	2	6	20031	20036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_016857	TTA	2	6	23166	23171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016857	GTT	2	6	24116	24121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016857	ACA	2	6	24195	24200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_016857	GAT	2	6	24232	24237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016857	TAA	2	6	24259	24264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016857	TAA	2	6	24266	24271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016857	ACG	2	6	24306	24311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_016857	AAG	2	6	24353	24358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016857	GAA	2	6	24399	24404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016857	CAG	2	6	24409	24414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_016857	ATA	2	6	33134	33139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016857	CAT	2	6	33201	33206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_016857	TAA	2	6	33255	33260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016857	GTG	2	6	33300	33305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016857	ATG	2	6	33327	33332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016857	ATA	3	9	34849	34857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016857	ATG	2	6	34937	34942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016857	TAG	2	6	34995	35000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016857	TTG	2	6	35043	35048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016857	AAT	2	6	35055	35060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016857	TAG	2	6	35152	35157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016857	ATT	2	6	35234	35239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016857	TTG	2	6	35253	35258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016857	TGT	2	6	35292	35297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016857	TCA	2	6	38754	38759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_016857	TGT	2	6	39567	39572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016857	AAG	2	6	39576	39581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016857	TGT	2	6	39672	39677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016857	TTA	2	6	39678	39683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016857	TGT	2	6	39717	39722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016857	AAT	2	6	39768	39773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016857	AAT	2	6	39980	39985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016857	GAA	2	6	40011	40016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016857	AAT	2	6	41628	41633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016857	GTA	2	6	42916	42921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016857	TGA	2	6	44205	44210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016857	GTT	2	6	44214	44219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016857	ATC	2	6	46034	46039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_016857	TCA	2	6	46104	46109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_016857	TAG	2	6	46150	46155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016857	GAA	2	6	46160	46165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016857	AAC	2	6	51862	51867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_016857	ATT	2	6	51894	51899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016857	AGT	2	6	51959	51964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016857	ATT	2	6	51985	51990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016857	TTA	2	6	52013	52018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016857	GGT	2	6	52051	52056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016857	CTT	2	6	52607	52612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_016857	GTG	2	6	57256	57261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016857	TGA	2	6	58771	58776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016857	GAA	2	6	58829	58834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016857	GTC	2	6	58844	58849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_016857	ACG	2	6	66918	66923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_016857	GAC	2	6	66932	66937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_016857	TGC	2	6	67024	67029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_016857	CCG	2	6	67037	67042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_016857	TAA	2	6	68437	68442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016857	ATT	2	6	68503	68508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016857	TTA	2	6	68510	68515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016857	TCT	2	6	73846	73851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_016857	GGC	2	6	73954	73959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_016857	TTA	2	6	75397	75402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016857	TTG	2	6	75424	75429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016857	ATG	2	6	75435	75440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016857	GTT	2	6	75563	75568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016857	GTT	2	6	75573	75578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016857	GCC	2	6	75777	75782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_016857	TAA	2	6	77039	77044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016857	CGG	2	6	80288	80293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_016857	TAA	2	6	80413	80418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016857	TTA	2	6	80497	80502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016857	CTG	2	6	80959	80964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_016857	GGC	2	6	81646	81651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_016857	CGG	2	6	82540	82545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_016857	GGC	2	6	84261	84266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_016857	GTT	2	6	84312	84317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016857	ATG	2	6	84331	84336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016857	CGA	2	6	84524	84529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_016857	GTA	2	6	84702	84707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016857	CGC	2	6	84743	84748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_016857	AGT	2	6	84755	84760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016857	CAT	2	6	84762	84767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_016857	GCA	2	6	84785	84790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_016857	GTC	2	6	84868	84873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_016857	CGG	2	6	84896	84901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_016857	CTC	2	6	85002	85007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_016857	TCA	2	6	85075	85080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_016857	CGG	2	6	85090	85095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_016857	GGT	2	6	85134	85139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016857	GCG	2	6	85209	85214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_016857	TCA	2	6	85397	85402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_016857	TAA	2	6	86680	86685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016857	TAT	2	6	88270	88275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016857	TTG	2	6	88283	88288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016857	ATG	2	6	88328	88333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016857	ATT	2	6	88384	88389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016857	CCG	2	6	88644	88649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_016857	AAT	2	6	93866	93871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016857	ATG	2	6	94104	94109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016857	CAT	2	6	94552	94557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_016857	TAT	2	6	94731	94736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016857	TGA	2	6	95084	95089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016857	ATT	2	6	95124	95129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016857	GCC	2	6	95298	95303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_016857	ATT	2	6	95318	95323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016857	TAA	2	6	95329	95334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016857	TGT	3	9	95406	95414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016857	AAT	2	6	95423	95428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016857	ATA	2	6	95465	95470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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