MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. ST4/74 chromosome

Total Repeats: 9671

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016857	AT	3	6	55	60	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016857	GC	3	6	575	580	0 %	0 %	50 %	50 %	379699219
3	NC_016857	CT	3	6	1105	1110	0 %	50 %	0 %	50 %	379699219
4	NC_016857	TG	3	6	1417	1422	0 %	50 %	50 %	0 %	379699219
5	NC_016857	GC	3	6	1436	1441	0 %	0 %	50 %	50 %	379699219
6	NC_016857	CT	3	6	2254	2259	0 %	50 %	0 %	50 %	379699219
7	NC_016857	TC	3	6	2292	2297	0 %	50 %	0 %	50 %	379699219
8	NC_016857	GC	3	6	2314	2319	0 %	0 %	50 %	50 %	379699219
9	NC_016857	CG	3	6	2345	2350	0 %	0 %	50 %	50 %	379699219
10	NC_016857	CG	4	8	3503	3510	0 %	0 %	50 %	50 %	379699220
11	NC_016857	GC	3	6	3558	3563	0 %	0 %	50 %	50 %	379699220
12	NC_016857	CG	3	6	3962	3967	0 %	0 %	50 %	50 %	379699221
13	NC_016857	CG	3	6	4206	4211	0 %	0 %	50 %	50 %	379699221
14	NC_016857	CG	3	6	4662	4667	0 %	0 %	50 %	50 %	379699221
15	NC_016857	AG	3	6	4882	4887	50 %	0 %	50 %	0 %	379699221
16	NC_016857	TG	3	6	5148	5153	0 %	50 %	50 %	0 %	379699222
17	NC_016857	CG	3	6	5251	5256	0 %	0 %	50 %	50 %	379699222
18	NC_016857	CG	3	6	5470	5475	0 %	0 %	50 %	50 %	379699222
19	NC_016857	AG	3	6	5552	5557	50 %	0 %	50 %	0 %	379699222
20	NC_016857	CG	3	6	5971	5976	0 %	0 %	50 %	50 %	379699223
21	NC_016857	GC	3	6	6889	6894	0 %	0 %	50 %	50 %	379699223
22	NC_016857	TC	3	6	7773	7778	0 %	50 %	0 %	50 %	379699224
23	NC_016857	CG	3	6	7860	7865	0 %	0 %	50 %	50 %	379699224
24	NC_016857	CG	3	6	7958	7963	0 %	0 %	50 %	50 %	379699224
25	NC_016857	CT	3	6	8451	8456	0 %	50 %	0 %	50 %	379699224
26	NC_016857	GC	3	6	8475	8480	0 %	0 %	50 %	50 %	379699224
27	NC_016857	TG	3	6	8901	8906	0 %	50 %	50 %	0 %	379699225
28	NC_016857	GC	3	6	9573	9578	0 %	0 %	50 %	50 %	379699226
29	NC_016857	CG	3	6	10533	10538	0 %	0 %	50 %	50 %	379699227
30	NC_016857	CG	3	6	12989	12994	0 %	0 %	50 %	50 %	379699230
31	NC_016857	GC	3	6	14550	14555	0 %	0 %	50 %	50 %	379699231
32	NC_016857	GA	3	6	14661	14666	50 %	0 %	50 %	0 %	379699231
33	NC_016857	AT	3	6	15372	15377	50 %	50 %	0 %	0 %	379699232
34	NC_016857	AT	3	6	15647	15652	50 %	50 %	0 %	0 %	379699232
35	NC_016857	AT	3	6	15900	15905	50 %	50 %	0 %	0 %	379699232
36	NC_016857	GA	3	6	17064	17069	50 %	0 %	50 %	0 %	379699235
37	NC_016857	GC	3	6	18366	18371	0 %	0 %	50 %	50 %	379699236
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40	NC_016857	GC	3	6	20776	20781	0 %	0 %	50 %	50 %	379699237
41	NC_016857	GC	3	6	21181	21186	0 %	0 %	50 %	50 %	379699237
42	NC_016857	GC	3	6	22039	22044	0 %	0 %	50 %	50 %	379699237
43	NC_016857	CT	3	6	22794	22799	0 %	50 %	0 %	50 %	379699237
44	NC_016857	AT	3	6	23582	23587	50 %	50 %	0 %	0 %	379699238
45	NC_016857	CG	3	6	23652	23657	0 %	0 %	50 %	50 %	379699238
46	NC_016857	GC	4	8	23795	23802	0 %	0 %	50 %	50 %	379699238
47	NC_016857	AT	3	6	24056	24061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016857	CG	3	6	25064	25069	0 %	0 %	50 %	50 %	379699240
49	NC_016857	CT	3	6	25350	25355	0 %	50 %	0 %	50 %	379699240
50	NC_016857	AT	3	6	25380	25385	50 %	50 %	0 %	0 %	379699240
51	NC_016857	GC	3	6	26083	26088	0 %	0 %	50 %	50 %	379699241
52	NC_016857	CG	3	6	28013	28018	0 %	0 %	50 %	50 %	379699241
53	NC_016857	GC	3	6	28141	28146	0 %	0 %	50 %	50 %	379699241
54	NC_016857	GC	3	6	28177	28182	0 %	0 %	50 %	50 %	379699241
55	NC_016857	TC	3	6	28373	28378	0 %	50 %	0 %	50 %	379699241
56	NC_016857	GT	3	6	28491	28496	0 %	50 %	50 %	0 %	379699242
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58	NC_016857	CT	3	6	30105	30110	0 %	50 %	0 %	50 %	379699244
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60	NC_016857	CG	3	6	30431	30436	0 %	0 %	50 %	50 %	379699244
61	NC_016857	AT	3	6	30532	30537	50 %	50 %	0 %	0 %	379699245
62	NC_016857	GC	3	6	30763	30768	0 %	0 %	50 %	50 %	379699245
63	NC_016857	GC	3	6	31053	31058	0 %	0 %	50 %	50 %	379699245
64	NC_016857	GT	3	6	33041	33046	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016857	TC	3	6	33485	33490	0 %	50 %	0 %	50 %	379699249
66	NC_016857	AT	3	6	33735	33740	50 %	50 %	0 %	0 %	379699249
67	NC_016857	TA	3	6	33938	33943	50 %	50 %	0 %	0 %	379699249
68	NC_016857	AT	3	6	34434	34439	50 %	50 %	0 %	0 %	379699250
69	NC_016857	AT	3	6	34695	34700	50 %	50 %	0 %	0 %	379699250
70	NC_016857	AT	3	6	35441	35446	50 %	50 %	0 %	0 %	379699251
71	NC_016857	TG	4	8	35656	35663	0 %	50 %	50 %	0 %	379699251
72	NC_016857	GC	3	6	36249	36254	0 %	0 %	50 %	50 %	379699251
73	NC_016857	TA	3	6	37199	37204	50 %	50 %	0 %	0 %	379699252
74	NC_016857	AT	3	6	39515	39520	50 %	50 %	0 %	0 %	379699253
75	NC_016857	AT	3	6	39831	39836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016857	AT	3	6	39946	39951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016857	AT	5	10	40033	40042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016857	AT	3	6	40089	40094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016857	CG	3	6	40377	40382	0 %	0 %	50 %	50 %	379699254
80	NC_016857	CG	3	6	41065	41070	0 %	0 %	50 %	50 %	379699254
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83	NC_016857	CG	3	6	43316	43321	0 %	0 %	50 %	50 %	379699256
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88	NC_016857	TA	3	6	46110	46115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016857	GA	3	6	46177	46182	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016857	TA	3	6	46809	46814	50 %	50 %	0 %	0 %	379699258
91	NC_016857	TG	3	6	47190	47195	0 %	50 %	50 %	0 %	379699258
92	NC_016857	GC	4	8	47329	47336	0 %	0 %	50 %	50 %	379699258
93	NC_016857	GA	3	6	47411	47416	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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95	NC_016857	CG	4	8	49310	49317	0 %	0 %	50 %	50 %	379699260
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100	NC_016857	GC	3	6	52512	52517	0 %	0 %	50 %	50 %	379699262
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103	NC_016857	CG	3	6	54353	54358	0 %	0 %	50 %	50 %	379699265
104	NC_016857	GC	3	6	55026	55031	0 %	0 %	50 %	50 %	379699265
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107	NC_016857	CG	3	6	56089	56094	0 %	0 %	50 %	50 %	379699265
108	NC_016857	GC	3	6	57008	57013	0 %	0 %	50 %	50 %	379699266
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110	NC_016857	GC	4	8	58114	58121	0 %	0 %	50 %	50 %	379699268
111	NC_016857	CT	3	6	59104	59109	0 %	50 %	0 %	50 %	379699269
112	NC_016857	TG	3	6	60723	60728	0 %	50 %	50 %	0 %	379699270
113	NC_016857	TC	3	6	61127	61132	0 %	50 %	0 %	50 %	379699271
114	NC_016857	GC	3	6	62389	62394	0 %	0 %	50 %	50 %	379699272
115	NC_016857	AT	3	6	63064	63069	50 %	50 %	0 %	0 %	379699272
116	NC_016857	GC	3	6	64585	64590	0 %	0 %	50 %	50 %	379699273
117	NC_016857	GC	3	6	66229	66234	0 %	0 %	50 %	50 %	379699274
118	NC_016857	CG	3	6	66326	66331	0 %	0 %	50 %	50 %	379699274
119	NC_016857	GC	3	6	66733	66738	0 %	0 %	50 %	50 %	379699275
120	NC_016857	AT	3	6	68157	68162	50 %	50 %	0 %	0 %	379699276
121	NC_016857	GC	3	6	69036	69041	0 %	0 %	50 %	50 %	379699277
122	NC_016857	GC	3	6	69613	69618	0 %	0 %	50 %	50 %	379699277
123	NC_016857	AC	3	6	69665	69670	50 %	0 %	0 %	50 %	379699277
124	NC_016857	AG	3	6	69811	69816	50 %	0 %	50 %	0 %	379699278
125	NC_016857	CG	3	6	69890	69895	0 %	0 %	50 %	50 %	379699278
126	NC_016857	GC	3	6	69918	69923	0 %	0 %	50 %	50 %	379699278
127	NC_016857	CG	3	6	70547	70552	0 %	0 %	50 %	50 %	379699279
128	NC_016857	CG	3	6	70827	70832	0 %	0 %	50 %	50 %	379699279
129	NC_016857	TG	3	6	71468	71473	0 %	50 %	50 %	0 %	379699280
130	NC_016857	GC	3	6	71979	71984	0 %	0 %	50 %	50 %	379699280
131	NC_016857	CG	3	6	72214	72219	0 %	0 %	50 %	50 %	379699280
132	NC_016857	GC	3	6	72286	72291	0 %	0 %	50 %	50 %	379699280
133	NC_016857	GC	3	6	72463	72468	0 %	0 %	50 %	50 %	379699281
134	NC_016857	CG	3	6	73324	73329	0 %	0 %	50 %	50 %	379699282
135	NC_016857	GC	3	6	73470	73475	0 %	0 %	50 %	50 %	379699282
136	NC_016857	TC	3	6	73857	73862	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_016857	GC	3	6	73966	73971	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_016857	AT	3	6	74901	74906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016857	AT	3	6	75467	75472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016857	CT	3	6	76174	76179	0 %	50 %	0 %	50 %	379699285
141	NC_016857	GC	3	6	77342	77347	0 %	0 %	50 %	50 %	379699286
142	NC_016857	CG	3	6	77478	77483	0 %	0 %	50 %	50 %	379699286
143	NC_016857	CG	3	6	77954	77959	0 %	0 %	50 %	50 %	379699286
144	NC_016857	GC	5	10	79000	79009	0 %	0 %	50 %	50 %	379699286
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