MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 14028S chromosome

Total Repeats: 3382

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016856	AGGTA	2	10	2553	2562	40 %	20 %	40 %	0 %	378448276
2	NC_016856	ATTGC	2	10	3396	3405	20 %	40 %	20 %	20 %	378448277
3	NC_016856	CGGCG	2	10	4144	4153	0 %	0 %	60 %	40 %	378448278
4	NC_016856	CCGCG	2	10	7184	7193	0 %	0 %	40 %	60 %	378448280
5	NC_016856	CCTTC	2	10	8674	8683	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
6	NC_016856	GATGA	2	10	8915	8924	40 %	20 %	40 %	0 %	378448282
7	NC_016856	GAAAA	2	10	10061	10070	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016856	TCTTT	2	10	11322	11331	0 %	80 %	0 %	20 %	378448286
9	NC_016856	ATTTA	2	10	11364	11373	40 %	60 %	0 %	0 %	378448286
10	NC_016856	GCGTG	2	10	13990	13999	0 %	20 %	60 %	20 %	378448288
11	NC_016856	GTGAT	2	10	14912	14921	20 %	40 %	40 %	0 %	378448289
12	NC_016856	AATCA	2	10	15506	15515	60 %	20 %	0 %	20 %	378448290
13	NC_016856	TATTG	2	10	17576	17585	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016856	GGCTG	2	10	18851	18860	0 %	20 %	60 %	20 %	378448296
15	NC_016856	AGAGC	2	10	19372	19381	40 %	0 %	40 %	20 %	378448296
16	NC_016856	CCTGA	2	10	19913	19922	20 %	20 %	20 %	40 %	378448296
17	NC_016856	TACCG	2	10	21050	21059	20 %	20 %	20 %	40 %	378448297
18	NC_016856	GGCCG	2	10	21674	21683	0 %	0 %	60 %	40 %	378448297
19	NC_016856	CTTTT	2	10	23393	23402	0 %	80 %	0 %	20 %	378448299
20	NC_016856	CGGTA	2	10	24561	24570	20 %	20 %	40 %	20 %	378448302
21	NC_016856	CTGTT	2	10	24600	24609	0 %	60 %	20 %	20 %	378448302
22	NC_016856	TATTT	2	10	25434	25443	20 %	80 %	0 %	0 %	410023154
23	NC_016856	GCGTC	2	10	28357	28366	0 %	20 %	40 %	40 %	378448304
24	NC_016856	ATCTG	2	10	30965	30974	20 %	40 %	20 %	20 %	378448308
25	NC_016856	TTACG	2	10	31020	31029	20 %	40 %	20 %	20 %	378448308
26	NC_016856	GGGCG	2	10	31789	31798	0 %	0 %	80 %	20 %	378448309
27	NC_016856	TGCGT	2	10	32168	32177	0 %	40 %	40 %	20 %	378448310
28	NC_016856	AAAAG	2	10	32562	32571	80 %	0 %	20 %	0 %	378448311
29	NC_016856	TTTTA	2	10	33211	33220	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016856	TATAA	2	10	34165	34174	60 %	40 %	0 %	0 %	378448312
31	NC_016856	ATCGT	2	10	34918	34927	20 %	40 %	20 %	20 %	378448314
32	NC_016856	ATTTT	2	10	34962	34971	20 %	80 %	0 %	0 %	378448314
33	NC_016856	TTTTA	2	10	35223	35232	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016856	AGCGA	2	10	35591	35600	40 %	0 %	40 %	20 %	378448315
35	NC_016856	TCCTG	2	10	35801	35810	0 %	40 %	20 %	40 %	378448315
36	NC_016856	GGTCA	2	10	38036	38045	20 %	20 %	40 %	20 %	378448316
37	NC_016856	TTCAT	2	10	39308	39317	20 %	60 %	0 %	20 %	378448317
38	NC_016856	TGAAA	2	10	40127	40136	60 %	20 %	20 %	0 %	378448318
39	NC_016856	TAAAA	2	10	44191	44200	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016856	ACGGC	2	10	44487	44496	20 %	0 %	40 %	40 %	378448321
41	NC_016856	TTTTA	2	10	44813	44822	20 %	80 %	0 %	0 %	378448321
42	NC_016856	GGGCT	2	10	46561	46570	0 %	20 %	60 %	20 %	378448322
43	NC_016856	GCGTA	2	10	48437	48446	20 %	20 %	40 %	20 %	378448324
44	NC_016856	GACCA	2	10	49042	49051	40 %	0 %	20 %	40 %	378448324
45	NC_016856	CCGGC	2	10	49184	49193	0 %	0 %	40 %	60 %	378448324
46	NC_016856	CAGAC	2	10	50374	50383	40 %	0 %	20 %	40 %	378448324
47	NC_016856	TGTGC	2	10	53135	53144	0 %	40 %	40 %	20 %	378448328
48	NC_016856	GTTTG	2	10	55457	55466	0 %	60 %	40 %	0 %	378448329
49	NC_016856	CACTA	2	10	56588	56597	40 %	20 %	0 %	40 %	378448329
50	NC_016856	CGGCG	2	10	57126	57135	0 %	0 %	60 %	40 %	378448330
51	NC_016856	AGCGC	2	10	57234	57243	20 %	0 %	40 %	40 %	378448331
52	NC_016856	TTCAC	2	10	57381	57390	20 %	40 %	0 %	40 %	378448332
53	NC_016856	AAAAT	2	10	58952	58961	80 %	20 %	0 %	0 %	378448334
54	NC_016856	GGAAA	2	10	59739	59748	60 %	0 %	40 %	0 %	378448334
55	NC_016856	CGCTG	2	10	60229	60238	0 %	20 %	40 %	40 %	378448335
56	NC_016856	GCCTG	2	10	64788	64797	0 %	20 %	40 %	40 %	378448338
57	NC_016856	GCGCG	2	10	64942	64951	0 %	0 %	60 %	40 %	378448339
58	NC_016856	CGTGC	2	10	71365	71374	0 %	20 %	40 %	40 %	378448346
59	NC_016856	TTGAT	2	10	71535	71544	20 %	60 %	20 %	0 %	378448346
60	NC_016856	ACCGC	2	10	72095	72104	20 %	0 %	20 %	60 %	378448346
61	NC_016856	ATTTG	2	10	75440	75449	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016856	CGATG	2	10	77758	77767	20 %	20 %	40 %	20 %	378448352
63	NC_016856	GCGAA	2	10	78699	78708	40 %	0 %	40 %	20 %	378448352
64	NC_016856	CGTAC	2	10	79589	79598	20 %	20 %	20 %	40 %	378448352
65	NC_016856	TTGCC	2	10	81936	81945	0 %	40 %	20 %	40 %	378448356
66	NC_016856	CGTCC	2	10	82046	82055	0 %	20 %	20 %	60 %	378448356
67	NC_016856	AAGCG	2	10	82409	82418	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_016856	TTCAG	2	10	85163	85172	20 %	40 %	20 %	20 %	378448359
69	NC_016856	GGCCA	2	10	85312	85321	20 %	0 %	40 %	40 %	378448359
70	NC_016856	GTACG	2	10	87883	87892	20 %	20 %	40 %	20 %	378448362
71	NC_016856	CAGAA	2	10	88596	88605	60 %	0 %	20 %	20 %	378448362
72	NC_016856	CCGCA	2	10	90715	90724	20 %	0 %	20 %	60 %	378448365
73	NC_016856	CGGTT	2	10	91220	91229	0 %	40 %	40 %	20 %	378448366
74	NC_016856	GCTCC	2	10	92356	92365	0 %	20 %	20 %	60 %	378448366
75	NC_016856	TGGCG	2	10	93000	93009	0 %	20 %	60 %	20 %	378448368
76	NC_016856	TAAAA	2	10	96475	96484	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016856	TTTCC	2	10	96914	96923	0 %	60 %	0 %	40 %	378448374
78	NC_016856	GTGGC	2	10	97483	97492	0 %	20 %	60 %	20 %	378448374
79	NC_016856	GCGCT	2	10	98635	98644	0 %	20 %	40 %	40 %	378448375
80	NC_016856	AGCGC	2	10	98702	98711	20 %	0 %	40 %	40 %	378448375
81	NC_016856	TGCAC	2	10	99400	99409	20 %	20 %	20 %	40 %	378448377
82	NC_016856	TGGCA	2	10	99469	99478	20 %	20 %	40 %	20 %	378448377
83	NC_016856	TCTGT	2	10	99795	99804	0 %	60 %	20 %	20 %	378448378
84	NC_016856	GCGCT	2	10	100105	100114	0 %	20 %	40 %	40 %	378448378
85	NC_016856	GGCGC	2	10	100519	100528	0 %	0 %	60 %	40 %	378448378
86	NC_016856	GCGAC	2	10	100832	100841	20 %	0 %	40 %	40 %	378448378
87	NC_016856	AACGT	2	10	103289	103298	40 %	20 %	20 %	20 %	378448382
88	NC_016856	CCCAA	2	10	105439	105448	40 %	0 %	0 %	60 %	378448385
89	NC_016856	TTGTT	2	10	106146	106155	0 %	80 %	20 %	0 %	378448385
90	NC_016856	GCTTC	2	10	107526	107535	0 %	40 %	20 %	40 %	378448386
91	NC_016856	TGCGT	2	10	107813	107822	0 %	40 %	40 %	20 %	378448386
92	NC_016856	TGATC	2	10	109513	109522	20 %	40 %	20 %	20 %	378448388
93	NC_016856	AAGCG	2	10	110009	110018	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_016856	TGGCG	2	10	112673	112682	0 %	20 %	60 %	20 %	378448390
95	NC_016856	AGCGC	2	10	113233	113242	20 %	0 %	40 %	40 %	378448390
96	NC_016856	ACGTT	2	10	114050	114059	20 %	40 %	20 %	20 %	378448391
97	NC_016856	CCGCG	2	10	114318	114327	0 %	0 %	40 %	60 %	378448391
98	NC_016856	TAATT	2	10	117436	117445	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016856	ATTTT	2	10	117462	117471	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016856	ACAGA	2	10	117645	117654	60 %	0 %	20 %	20 %	378448393
101	NC_016856	CAGCG	2	10	118820	118829	20 %	0 %	40 %	40 %	378448395
102	NC_016856	GCCGG	2	10	119120	119129	0 %	0 %	60 %	40 %	378448395
103	NC_016856	CGAGC	2	10	119245	119254	20 %	0 %	40 %	40 %	378448395
104	NC_016856	ATTTG	2	10	119688	119697	20 %	60 %	20 %	0 %	378448395
105	NC_016856	TTGCC	2	10	124192	124201	0 %	40 %	20 %	40 %	378448399
106	NC_016856	AGCAG	2	10	124869	124878	40 %	0 %	40 %	20 %	378448400
107	NC_016856	AGTTT	2	10	127099	127108	20 %	60 %	20 %	0 %	378448401
108	NC_016856	TAGTG	2	10	127517	127526	20 %	40 %	40 %	0 %	378448402
109	NC_016856	TCGAT	2	10	128947	128956	20 %	40 %	20 %	20 %	378448403
110	NC_016856	CGGCG	2	10	131258	131267	0 %	0 %	60 %	40 %	378448406
111	NC_016856	CGTTT	2	10	131720	131729	0 %	60 %	20 %	20 %	378448406
112	NC_016856	GACCG	2	10	133164	133173	20 %	0 %	40 %	40 %	378448408
113	NC_016856	GGTTT	2	10	134876	134885	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016856	ATTCC	2	10	136821	136830	20 %	40 %	0 %	40 %	378448413
115	NC_016856	CCCAA	2	10	138890	138899	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
116	NC_016856	AAAGC	2	10	139118	139127	60 %	0 %	20 %	20 %	378448416
117	NC_016856	CCGCA	2	10	139651	139660	20 %	0 %	20 %	60 %	378448416
118	NC_016856	TTGTT	2	10	140237	140246	0 %	80 %	20 %	0 %	378448417
119	NC_016856	AGTTC	2	10	142022	142031	20 %	40 %	20 %	20 %	378448420
120	NC_016856	TGCCT	2	10	142122	142131	0 %	40 %	20 %	40 %	378448421
121	NC_016856	AAGCG	2	10	146775	146784	40 %	0 %	40 %	20 %	378448424
122	NC_016856	GTTTG	2	10	148678	148687	0 %	60 %	40 %	0 %	378448426
123	NC_016856	CGTAT	2	10	150149	150158	20 %	40 %	20 %	20 %	378448427
124	NC_016856	ATCAG	2	10	151985	151994	40 %	20 %	20 %	20 %	378448429
125	NC_016856	CTGCC	2	10	153994	154003	0 %	20 %	20 %	60 %	378448430
126	NC_016856	CGGCG	2	10	156724	156733	0 %	0 %	60 %	40 %	378448433
127	NC_016856	CGCGG	2	10	159374	159383	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
128	NC_016856	CCGGC	2	10	160078	160087	0 %	0 %	40 %	60 %	378448436
129	NC_016856	GATCA	2	10	163396	163405	40 %	20 %	20 %	20 %	378448440
130	NC_016856	CGTCA	2	10	164142	164151	20 %	20 %	20 %	40 %	378448441
131	NC_016856	ATCCC	2	10	165842	165851	20 %	20 %	0 %	60 %	378448443
132	NC_016856	AGCGC	2	10	166550	166559	20 %	0 %	40 %	40 %	378448443
133	NC_016856	TGAGC	2	10	168399	168408	20 %	20 %	40 %	20 %	378448444
134	NC_016856	CGCAT	2	10	168661	168670	20 %	20 %	20 %	40 %	378448445
135	NC_016856	CGAAC	2	10	169390	169399	40 %	0 %	20 %	40 %	378448447
136	NC_016856	GTTCA	2	10	169656	169665	20 %	40 %	20 %	20 %	378448447
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262	NC_016856	TCTGT	2	10	348855	348864	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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264	NC_016856	GTTGA	2	10	351164	351173	20 %	40 %	40 %	0 %	378448620
265	NC_016856	TTTCA	2	10	351292	351301	20 %	60 %	0 %	20 %	378448620
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395	NC_016856	CAGGT	2	10	525157	525166	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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