MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 14028S plasmid unnamed

Total Repeats: 60

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016855	ACTGG	2	10	923	932	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_016855	TCGTC	2	10	1630	1639	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_016855	ACCAC	2	10	4850	4859	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
4	NC_016855	ATGTT	2	10	4919	4928	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016855	GCTCC	2	10	4963	4972	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
6	NC_016855	GAATG	2	10	10110	10119	40 %	20 %	40 %	0 %	378448054
7	NC_016855	CCTTT	2	10	11834	11843	0 %	60 %	0 %	40 %	378448056
8	NC_016855	CTGTA	2	10	11954	11963	20 %	40 %	20 %	20 %	378448056
9	NC_016855	GGTCA	2	10	13970	13979	20 %	20 %	40 %	20 %	378448057
10	NC_016855	AATTT	2	10	14102	14111	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016855	TGCAA	2	10	14905	14914	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_016855	GGCCC	2	10	15494	15503	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
13	NC_016855	GCCGT	2	10	16314	16323	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
14	NC_016855	TGACA	2	10	16374	16383	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_016855	CTGGT	2	10	27414	27423	0 %	40 %	40 %	20 %	378448075
16	NC_016855	TGAGT	2	10	28186	28195	20 %	40 %	40 %	0 %	378448076
17	NC_016855	AGGTC	2	10	30286	30295	20 %	20 %	40 %	20 %	378448077
18	NC_016855	TGAAC	2	10	31626	31635	40 %	20 %	20 %	20 %	378448078
19	NC_016855	GTTGA	2	10	32594	32603	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016855	TTTAC	2	10	33110	33119	20 %	60 %	0 %	20 %	378448079
21	NC_016855	ACGGG	2	10	33587	33596	20 %	0 %	60 %	20 %	378448079
22	NC_016855	ATTTT	2	10	34907	34916	20 %	80 %	0 %	0 %	378448080
23	NC_016855	CGCAG	2	10	36108	36117	20 %	0 %	40 %	40 %	378448081
24	NC_016855	CTGTT	2	10	37032	37041	0 %	60 %	20 %	20 %	378448082
25	NC_016855	TCCGG	2	10	37185	37194	0 %	20 %	40 %	40 %	378448082
26	NC_016855	TAATG	2	10	37475	37484	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016855	GTCTG	2	10	38717	38726	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_016855	CTGCC	2	10	39117	39126	0 %	20 %	20 %	60 %	378448084
29	NC_016855	TATAA	2	10	39624	39633	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016855	GCACA	2	10	40256	40265	40 %	0 %	20 %	40 %	378448085
31	NC_016855	GGACG	2	10	41558	41567	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
32	NC_016855	ACGGG	2	10	48056	48065	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
33	NC_016855	ACGGG	2	10	49233	49242	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
34	NC_016855	GAACT	2	10	50456	50465	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_016855	GGCCT	2	10	50758	50767	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
36	NC_016855	GAACC	2	10	51601	51610	40 %	0 %	20 %	40 %	378448097
37	NC_016855	GAACA	2	10	54274	54283	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_016855	GGCGC	2	10	57071	57080	0 %	0 %	60 %	40 %	378448103
39	NC_016855	GAACT	2	10	58608	58617	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_016855	CCCCG	2	10	58647	58656	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
41	NC_016855	AAAAT	2	10	59552	59561	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016855	TAATT	2	10	60733	60742	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016855	AATAA	2	10	61027	61036	80 %	20 %	0 %	0 %	378448107
44	NC_016855	TTGTG	2	10	61910	61919	0 %	60 %	40 %	0 %	378448108
45	NC_016855	ACGGT	2	10	62797	62806	20 %	20 %	40 %	20 %	378448110
46	NC_016855	ACATT	2	10	63805	63814	40 %	40 %	0 %	20 %	378448112
47	NC_016855	AAAAT	2	10	64465	64474	80 %	20 %	0 %	0 %	378448113
48	NC_016855	TCCGG	2	10	66248	66257	0 %	20 %	40 %	40 %	378448115
49	NC_016855	AGCGA	2	10	69515	69524	40 %	0 %	40 %	20 %	378448120
50	NC_016855	AAAAT	2	10	73515	73524	80 %	20 %	0 %	0 %	378448124
51	NC_016855	CTGAA	2	10	73654	73663	40 %	20 %	20 %	20 %	378448125
52	NC_016855	GCGCA	2	10	81590	81599	20 %	0 %	40 %	40 %	378448132
53	NC_016855	ATTTC	2	10	84005	84014	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_016855	GACCT	2	10	85920	85929	20 %	20 %	20 %	40 %	378448135
55	NC_016855	GGCGC	2	10	88741	88750	0 %	0 %	60 %	40 %	378448139
56	NC_016855	GGCAG	2	10	88850	88859	20 %	0 %	60 %	20 %	378448139
57	NC_016855	CCGGA	2	10	88891	88900	20 %	0 %	40 %	40 %	378448139
58	NC_016855	CGAAA	2	10	90114	90123	60 %	0 %	20 %	20 %	378448139
59	NC_016855	GGGTT	2	10	91515	91524	0 %	40 %	60 %	0 %	378448139
60	NC_016855	GCCGT	2	10	91652	91661	0 %	20 %	40 %	40 %	378448139

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.