MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 14028S plasmid unnamed

Total Repeats: 35

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016855	GAATG	2	10	10110	10119	40 %	20 %	40 %	0 %	378448054
2	NC_016855	CCTTT	2	10	11834	11843	0 %	60 %	0 %	40 %	378448056
3	NC_016855	CTGTA	2	10	11954	11963	20 %	40 %	20 %	20 %	378448056
4	NC_016855	GGTCA	2	10	13970	13979	20 %	20 %	40 %	20 %	378448057
5	NC_016855	CTGGT	2	10	27414	27423	0 %	40 %	40 %	20 %	378448075
6	NC_016855	TGAGT	2	10	28186	28195	20 %	40 %	40 %	0 %	378448076
7	NC_016855	AGGTC	2	10	30286	30295	20 %	20 %	40 %	20 %	378448077
8	NC_016855	TGAAC	2	10	31626	31635	40 %	20 %	20 %	20 %	378448078
9	NC_016855	TTTAC	2	10	33110	33119	20 %	60 %	0 %	20 %	378448079
10	NC_016855	ACGGG	2	10	33587	33596	20 %	0 %	60 %	20 %	378448079
11	NC_016855	ATTTT	2	10	34907	34916	20 %	80 %	0 %	0 %	378448080
12	NC_016855	CGCAG	2	10	36108	36117	20 %	0 %	40 %	40 %	378448081
13	NC_016855	CTGTT	2	10	37032	37041	0 %	60 %	20 %	20 %	378448082
14	NC_016855	TCCGG	2	10	37185	37194	0 %	20 %	40 %	40 %	378448082
15	NC_016855	CTGCC	2	10	39117	39126	0 %	20 %	20 %	60 %	378448084
16	NC_016855	GCACA	2	10	40256	40265	40 %	0 %	20 %	40 %	378448085
17	NC_016855	GAACC	2	10	51601	51610	40 %	0 %	20 %	40 %	378448097
18	NC_016855	GGCGC	2	10	57071	57080	0 %	0 %	60 %	40 %	378448103
19	NC_016855	AATAA	2	10	61027	61036	80 %	20 %	0 %	0 %	378448107
20	NC_016855	TTGTG	2	10	61910	61919	0 %	60 %	40 %	0 %	378448108
21	NC_016855	ACGGT	2	10	62797	62806	20 %	20 %	40 %	20 %	378448110
22	NC_016855	ACATT	2	10	63805	63814	40 %	40 %	0 %	20 %	378448112
23	NC_016855	AAAAT	2	10	64465	64474	80 %	20 %	0 %	0 %	378448113
24	NC_016855	TCCGG	2	10	66248	66257	0 %	20 %	40 %	40 %	378448115
25	NC_016855	AGCGA	2	10	69515	69524	40 %	0 %	40 %	20 %	378448120
26	NC_016855	AAAAT	2	10	73515	73524	80 %	20 %	0 %	0 %	378448124
27	NC_016855	CTGAA	2	10	73654	73663	40 %	20 %	20 %	20 %	378448125
28	NC_016855	GCGCA	2	10	81590	81599	20 %	0 %	40 %	40 %	378448132
29	NC_016855	GACCT	2	10	85920	85929	20 %	20 %	20 %	40 %	378448135
30	NC_016855	GGCGC	2	10	88741	88750	0 %	0 %	60 %	40 %	378448139
31	NC_016855	GGCAG	2	10	88850	88859	20 %	0 %	60 %	20 %	378448139
32	NC_016855	CCGGA	2	10	88891	88900	20 %	0 %	40 %	40 %	378448139
33	NC_016855	CGAAA	2	10	90114	90123	60 %	0 %	20 %	20 %	378448139
34	NC_016855	GGGTT	2	10	91515	91524	0 %	40 %	60 %	0 %	378448139
35	NC_016855	GCCGT	2	10	91652	91661	0 %	20 %	40 %	40 %	378448139

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.