MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 14028S plasmid unnamed

Total Repeats: 86

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016855	CCGT	2	8	752	759	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_016855	TGGC	2	8	869	876	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_016855	AAGT	2	8	1280	1287	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016855	AGTG	2	8	1640	1647	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016855	TGGC	2	8	1678	1685	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_016855	TAAA	2	8	3106	3113	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016855	GCCC	2	8	3156	3163	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8	NC_016855	TCCC	2	8	4738	4745	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
9	NC_016855	CCGG	2	8	4788	4795	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_016855	TAAA	2	8	8139	8146	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016855	TGTT	2	8	8232	8239	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016855	CTAA	2	8	8264	8271	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_016855	GCCT	2	8	8513	8520	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_016855	TAAA	2	8	13534	13541	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016855	TGGC	2	8	14156	14163	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_016855	TTCC	2	8	14168	14175	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_016855	AAAC	2	8	14713	14720	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_016855	TGTT	2	8	14745	14752	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016855	CAAA	2	8	14789	14796	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_016855	CATA	2	8	14854	14861	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_016855	CTTT	2	8	15418	15425	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_016855	TTGC	2	8	15430	15437	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_016855	GTGG	2	8	15550	15557	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016855	TTCC	2	8	15881	15888	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_016855	GCAG	2	8	16113	16120	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_016855	TCAC	2	8	16387	16394	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_016855	ATTT	2	8	18612	18619	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016855	ACAG	2	8	18705	18712	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_016855	CAGT	2	8	18723	18730	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_016855	GGCA	2	8	23027	23034	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_016855	CCCG	2	8	23310	23317	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
32	NC_016855	CCGG	2	8	23344	23351	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_016855	GTGA	2	8	23360	23367	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016855	CCCG	2	8	23406	23413	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
35	NC_016855	GGCA	2	8	23445	23452	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_016855	GCCT	2	8	23995	24002	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_016855	GCCA	2	8	24619	24626	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_016855	TATT	2	8	25682	25689	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016855	GTAA	2	8	25766	25773	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016855	CCCG	2	8	26177	26184	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
41	NC_016855	TTTA	2	8	31013	31020	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016855	ATTC	2	8	31167	31174	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_016855	CGAA	2	8	32762	32769	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_016855	AATA	2	8	38354	38361	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016855	ATTT	2	8	38851	38858	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016855	CCCG	2	8	39496	39503	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
47	NC_016855	TTTG	2	8	39586	39593	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016855	TTAG	2	8	39594	39601	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016855	GTTT	2	8	39613	39620	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016855	ATGA	2	8	41378	41385	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016855	TGGC	2	8	41636	41643	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_016855	CAGG	2	8	41917	41924	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_016855	GCTG	2	8	41970	41977	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_016855	CCGG	2	8	42216	42223	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_016855	TGGC	2	8	42376	42383	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_016855	CTTT	2	8	43494	43501	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_016855	GCTT	2	8	43513	43520	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_016855	ATTT	2	8	43747	43754	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016855	TGAA	2	8	49132	49139	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016855	CCGG	2	8	49223	49230	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_016855	CGGG	2	8	50728	50735	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
62	NC_016855	CGGG	2	8	50871	50878	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
63	NC_016855	ATCA	2	8	50881	50888	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_016855	GAAA	2	8	51727	51734	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016855	GCCG	2	8	51863	51870	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_016855	CATC	2	8	51926	51933	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_016855	TCCT	2	8	51986	51993	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_016855	TCAT	2	8	52653	52660	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_016855	ATTA	2	8	58951	58958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016855	TGCC	2	8	59168	59175	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_016855	ACTG	2	8	59529	59536	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_016855	AATA	2	8	59576	59583	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016855	CAGT	2	8	59990	59997	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_016855	TAAA	2	8	61395	61402	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016855	GTCA	2	8	67363	67370	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_016855	GCCG	2	8	67387	67394	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_016855	CCTG	2	8	67412	67419	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_016855	TGAA	2	8	68235	68242	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016855	TCTG	2	8	68508	68515	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_016855	TGGT	2	8	83165	83172	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016855	CTGA	2	8	83952	83959	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_016855	GAAA	2	8	83989	83996	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016855	AAAT	2	8	84030	84037	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016855	GTTA	2	8	84234	84241	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016855	AATT	2	8	84250	84257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016855	TCTT	2	8	84276	84283	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.