MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 14028S plasmid unnamed

Total Repeats: 217

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016855	ACAT	2	8	1496	1503	50 %	25 %	0 %	25 %	378448042
2	NC_016855	AAAG	2	8	1504	1511	75 %	0 %	25 %	0 %	378448042
3	NC_016855	GCAG	2	8	1909	1916	25 %	0 %	50 %	25 %	378448044
4	NC_016855	TGAC	2	8	1920	1927	25 %	25 %	25 %	25 %	378448044
5	NC_016855	CGTT	3	12	2079	2090	0 %	50 %	25 %	25 %	378448045
6	NC_016855	TACC	2	8	2314	2321	25 %	25 %	0 %	50 %	378448045
7	NC_016855	CCGA	2	8	2357	2364	25 %	0 %	25 %	50 %	378448045
8	NC_016855	GATG	2	8	2491	2498	25 %	25 %	50 %	0 %	378448045
9	NC_016855	AAAT	2	8	3987	3994	75 %	25 %	0 %	0 %	378448047
10	NC_016855	TCAC	2	8	4255	4262	25 %	25 %	0 %	50 %	378448047
11	NC_016855	ACGG	2	8	4442	4449	25 %	0 %	50 %	25 %	378448047
12	NC_016855	TCTG	2	8	4603	4610	0 %	50 %	25 %	25 %	378448047
13	NC_016855	CAGC	2	8	5497	5504	25 %	0 %	25 %	50 %	378448048
14	NC_016855	TACA	2	8	5836	5843	50 %	25 %	0 %	25 %	378448049
15	NC_016855	TCAC	2	8	5924	5931	25 %	25 %	0 %	50 %	378448049
16	NC_016855	GTGG	2	8	6121	6128	0 %	25 %	75 %	0 %	378448049
17	NC_016855	GGTC	2	8	6270	6277	0 %	25 %	50 %	25 %	378448049
18	NC_016855	GCCG	2	8	6418	6425	0 %	0 %	50 %	50 %	378448049
19	NC_016855	GCCG	2	8	6967	6974	0 %	0 %	50 %	50 %	378448050
20	NC_016855	GGGC	2	8	7156	7163	0 %	0 %	75 %	25 %	378448050
21	NC_016855	CAGC	2	8	7253	7260	25 %	0 %	25 %	50 %	378448050
22	NC_016855	TGAA	2	8	7610	7617	50 %	25 %	25 %	0 %	378448051
23	NC_016855	TGTC	2	8	8586	8593	0 %	50 %	25 %	25 %	378448053
24	NC_016855	ACTG	2	8	9230	9237	25 %	25 %	25 %	25 %	378448053
25	NC_016855	CAGT	2	8	9812	9819	25 %	25 %	25 %	25 %	378448054
26	NC_016855	CCAG	2	8	9842	9849	25 %	0 %	25 %	50 %	378448054
27	NC_016855	GGTT	2	8	10097	10104	0 %	50 %	50 %	0 %	378448054
28	NC_016855	TCAT	2	8	10365	10372	25 %	50 %	0 %	25 %	378448055
29	NC_016855	TGGT	2	8	10797	10804	0 %	50 %	50 %	0 %	378448055
30	NC_016855	TTCT	2	8	10821	10828	0 %	75 %	0 %	25 %	378448055
31	NC_016855	TCCG	2	8	11129	11136	0 %	25 %	25 %	50 %	378448056
32	NC_016855	CCCA	2	8	11688	11695	25 %	0 %	0 %	75 %	378448056
33	NC_016855	CGAC	2	8	12307	12314	25 %	0 %	25 %	50 %	378448056
34	NC_016855	CCGG	2	8	13180	13187	0 %	0 %	50 %	50 %	378448056
35	NC_016855	CTGA	2	8	14394	14401	25 %	25 %	25 %	25 %	378448058
36	NC_016855	AGAT	2	8	15729	15736	50 %	25 %	25 %	0 %	378448059
37	NC_016855	TGGC	2	8	16736	16743	0 %	25 %	50 %	25 %	378448060
38	NC_016855	TGAC	2	8	17256	17263	25 %	25 %	25 %	25 %	378448060
39	NC_016855	GAAT	2	8	17344	17351	50 %	25 %	25 %	0 %	378448060
40	NC_016855	ACAA	2	8	17617	17624	75 %	0 %	0 %	25 %	378448060
41	NC_016855	CATC	2	8	18408	18415	25 %	25 %	0 %	50 %	378448062
42	NC_016855	GCAG	2	8	21497	21504	25 %	0 %	50 %	25 %	378448068
43	NC_016855	GCGG	2	8	21770	21777	0 %	0 %	75 %	25 %	378448068
44	NC_016855	CAGC	2	8	21815	21822	25 %	0 %	25 %	50 %	378448068
45	NC_016855	ACCG	2	8	21957	21964	25 %	0 %	25 %	50 %	378448068
46	NC_016855	GCTG	2	8	22374	22381	0 %	25 %	50 %	25 %	378448069
47	NC_016855	GCCG	2	8	22511	22518	0 %	0 %	50 %	50 %	378448069
48	NC_016855	TCCG	2	8	22572	22579	0 %	25 %	25 %	50 %	378448069
49	NC_016855	GGCA	2	8	23589	23596	25 %	0 %	50 %	25 %	378448070
50	NC_016855	CTGC	2	8	23745	23752	0 %	25 %	25 %	50 %	378448070
51	NC_016855	GCGA	2	8	23855	23862	25 %	0 %	50 %	25 %	378448070
52	NC_016855	CAGC	2	8	25118	25125	25 %	0 %	25 %	50 %	378448071
53	NC_016855	CTGA	2	8	25179	25186	25 %	25 %	25 %	25 %	378448071
54	NC_016855	GATG	2	8	25896	25903	25 %	25 %	50 %	0 %	378448073
55	NC_016855	CAGA	2	8	26118	26125	50 %	0 %	25 %	25 %	378448073
56	NC_016855	ATGT	2	8	26662	26669	25 %	50 %	25 %	0 %	378448074
57	NC_016855	GTAT	2	8	26719	26726	25 %	50 %	25 %	0 %	378448074
58	NC_016855	TACT	2	8	27174	27181	25 %	50 %	0 %	25 %	378448075
59	NC_016855	GGCG	2	8	29091	29098	0 %	0 %	75 %	25 %	378448076
60	NC_016855	CCCA	2	8	29507	29514	25 %	0 %	0 %	75 %	378448076
61	NC_016855	TCCG	2	8	29659	29666	0 %	25 %	25 %	50 %	378448076
62	NC_016855	CTGA	2	8	29868	29875	25 %	25 %	25 %	25 %	378448076
63	NC_016855	TCGG	2	8	30318	30325	0 %	25 %	50 %	25 %	378448077
64	NC_016855	AGAA	2	8	31786	31793	75 %	0 %	25 %	0 %	378448078
65	NC_016855	AATA	2	8	31803	31810	75 %	25 %	0 %	0 %	378448078
66	NC_016855	TGGC	2	8	33229	33236	0 %	25 %	50 %	25 %	378448079
67	NC_016855	AGGC	2	8	33329	33336	25 %	0 %	50 %	25 %	378448079
68	NC_016855	ATTT	2	8	33630	33637	25 %	75 %	0 %	0 %	378448079
69	NC_016855	TACA	2	8	33664	33671	50 %	25 %	0 %	25 %	378448079
70	NC_016855	GGCG	2	8	33672	33679	0 %	0 %	75 %	25 %	378448079
71	NC_016855	GCTG	2	8	33738	33745	0 %	25 %	50 %	25 %	378448079
72	NC_016855	GACC	2	8	34158	34165	25 %	0 %	25 %	50 %	378448080
73	NC_016855	TTGT	2	8	34795	34802	0 %	75 %	25 %	0 %	378448080
74	NC_016855	TCAG	2	8	35187	35194	25 %	25 %	25 %	25 %	378448081
75	NC_016855	GCCA	2	8	35739	35746	25 %	0 %	25 %	50 %	378448081
76	NC_016855	TGCC	2	8	35944	35951	0 %	25 %	25 %	50 %	378448081
77	NC_016855	AATC	2	8	36410	36417	50 %	25 %	0 %	25 %	378448081
78	NC_016855	ATTT	2	8	36487	36494	25 %	75 %	0 %	0 %	378448081
79	NC_016855	GGCG	2	8	36815	36822	0 %	0 %	75 %	25 %	378448082
80	NC_016855	TTCC	2	8	36889	36896	0 %	50 %	0 %	50 %	378448082
81	NC_016855	ATAC	2	8	37559	37566	50 %	25 %	0 %	25 %	378448083
82	NC_016855	GACA	2	8	38183	38190	50 %	0 %	25 %	25 %	378448083
83	NC_016855	GTTT	2	8	38208	38215	0 %	75 %	25 %	0 %	378448083
84	NC_016855	TGGT	2	8	38243	38250	0 %	50 %	50 %	0 %	378448083
85	NC_016855	TCTG	2	8	38932	38939	0 %	50 %	25 %	25 %	378448084
86	NC_016855	CTGC	2	8	39007	39014	0 %	25 %	25 %	50 %	378448084
87	NC_016855	TGTC	2	8	39403	39410	0 %	50 %	25 %	25 %	378448084
88	NC_016855	GGTG	2	8	39760	39767	0 %	25 %	75 %	0 %	378448085
89	NC_016855	GAAA	2	8	40666	40673	75 %	0 %	25 %	0 %	378448085
90	NC_016855	AGCC	2	8	40867	40874	25 %	0 %	25 %	50 %	378448086
91	NC_016855	CAGA	2	8	40974	40981	50 %	0 %	25 %	25 %	378448086
92	NC_016855	GTCA	2	8	41261	41268	25 %	25 %	25 %	25 %	378448086
93	NC_016855	TCAG	2	8	42481	42488	25 %	25 %	25 %	25 %	378448088
94	NC_016855	GCCT	2	8	42732	42739	0 %	25 %	25 %	50 %	378448088
95	NC_016855	CCAG	2	8	42980	42987	25 %	0 %	25 %	50 %	378448088
96	NC_016855	TGTA	2	8	44144	44151	25 %	50 %	25 %	0 %	378448089
97	NC_016855	AGCC	2	8	44672	44679	25 %	0 %	25 %	50 %	378448089
98	NC_016855	TCGA	2	8	44697	44704	25 %	25 %	25 %	25 %	378448089
99	NC_016855	TGAC	2	8	45078	45085	25 %	25 %	25 %	25 %	378448090
100	NC_016855	TCAA	2	8	45495	45502	50 %	25 %	0 %	25 %	378448090
101	NC_016855	GTCT	2	8	45694	45701	0 %	50 %	25 %	25 %	378448090
102	NC_016855	GCCT	2	8	46310	46317	0 %	25 %	25 %	50 %	378448091
103	NC_016855	CTGC	2	8	46543	46550	0 %	25 %	25 %	50 %	378448091
104	NC_016855	CGTT	2	8	46826	46833	0 %	50 %	25 %	25 %	378448091
105	NC_016855	GGTC	2	8	46919	46926	0 %	25 %	50 %	25 %	378448091
106	NC_016855	GAAC	2	8	46959	46966	50 %	0 %	25 %	25 %	378448091
107	NC_016855	TTTC	2	8	47574	47581	0 %	75 %	0 %	25 %	378448092
108	NC_016855	CTGG	2	8	48591	48598	0 %	25 %	50 %	25 %	378448093
109	NC_016855	GACC	2	8	49552	49559	25 %	0 %	25 %	50 %	378448095
110	NC_016855	GGCT	2	8	51031	51038	0 %	25 %	50 %	25 %	378448097
111	NC_016855	GCTG	2	8	52275	52282	0 %	25 %	50 %	25 %	378448098
112	NC_016855	TCGC	2	8	52468	52475	0 %	25 %	25 %	50 %	378448098
113	NC_016855	AAAG	2	8	53435	53442	75 %	0 %	25 %	0 %	378448100
114	NC_016855	GGTC	2	8	54407	54414	0 %	25 %	50 %	25 %	378448101
115	NC_016855	CAGG	2	8	54503	54510	25 %	0 %	50 %	25 %	378448101
116	NC_016855	CAGC	2	8	54725	54732	25 %	0 %	25 %	50 %	378448101
117	NC_016855	GACA	2	8	54950	54957	50 %	0 %	25 %	25 %	378448102
118	NC_016855	CCTG	2	8	54980	54987	0 %	25 %	25 %	50 %	378448102
119	NC_016855	CCCT	2	8	55506	55513	0 %	25 %	0 %	75 %	378448103
120	NC_016855	GGCT	2	8	55800	55807	0 %	25 %	50 %	25 %	378448103
121	NC_016855	GCTG	2	8	55825	55832	0 %	25 %	50 %	25 %	378448103
122	NC_016855	GTGG	2	8	56128	56135	0 %	25 %	75 %	0 %	378448103
123	NC_016855	CGCT	2	8	56964	56971	0 %	25 %	25 %	50 %	378448103
124	NC_016855	AGCC	2	8	57761	57768	25 %	0 %	25 %	50 %	378448105
125	NC_016855	GCCC	2	8	57831	57838	0 %	0 %	25 %	75 %	378448105
126	NC_016855	CAGG	2	8	60301	60308	25 %	0 %	50 %	25 %	378448106
127	NC_016855	TTCC	2	8	60442	60449	0 %	50 %	0 %	50 %	378448106
128	NC_016855	ACAG	2	8	60551	60558	50 %	0 %	25 %	25 %	378448106
129	NC_016855	CAGA	2	8	61174	61181	50 %	0 %	25 %	25 %	378448107
130	NC_016855	AGAA	2	8	61581	61588	75 %	0 %	25 %	0 %	378448108
131	NC_016855	TAAA	2	8	61607	61614	75 %	25 %	0 %	0 %	378448108
132	NC_016855	ATTT	2	8	61928	61935	25 %	75 %	0 %	0 %	378448108
133	NC_016855	GAAC	2	8	62007	62014	50 %	0 %	25 %	25 %	378448108
134	NC_016855	ATTC	2	8	62165	62172	25 %	50 %	0 %	25 %	378448108
135	NC_016855	TTAA	2	8	62251	62258	50 %	50 %	0 %	0 %	378448109
136	NC_016855	ACCA	2	8	63038	63045	50 %	0 %	0 %	50 %	378448111
137	NC_016855	AATT	2	8	63075	63082	50 %	50 %	0 %	0 %	378448111
138	NC_016855	CTGG	2	8	63844	63851	0 %	25 %	50 %	25 %	378448112
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.