MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 14028S plasmid unnamed

Total Repeats: 1356

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016855	CAG	2	6	121	126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448041
2	NC_016855	CCA	2	6	221	226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448041
3	NC_016855	AGT	2	6	262	267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448041
4	NC_016855	GCG	2	6	268	273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448041
5	NC_016855	GCC	3	9	274	282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448041
6	NC_016855	TGA	2	6	383	388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016855	ATG	2	6	391	396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016855	AGG	2	6	404	409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016855	GAA	2	6	417	422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016855	GCG	2	6	440	445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_016855	CCA	2	6	512	517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_016855	CCG	2	6	552	557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_016855	CGT	2	6	562	567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_016855	TAA	2	6	626	631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016855	ACT	2	6	636	641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_016855	CTG	2	6	722	727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_016855	AGC	2	6	791	796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_016855	ATA	2	6	827	832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016855	TTA	2	6	881	886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016855	CAG	2	6	962	967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_016855	CTG	2	6	981	986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_016855	TTC	2	6	1030	1035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_016855	ATT	2	6	1087	1092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016855	GCA	2	6	1098	1103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_016855	GTC	2	6	1130	1135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_016855	GTA	2	6	1306	1311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016855	GAG	2	6	1342	1347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378448042
28	NC_016855	GAA	2	6	1431	1436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448042
29	NC_016855	GAC	2	6	1461	1466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448042
30	NC_016855	GCA	2	6	1515	1520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448042
31	NC_016855	ACT	2	6	1540	1545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448042
32	NC_016855	CTA	2	6	1564	1569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448042
33	NC_016855	AAG	2	6	1603	1608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016855	TGA	2	6	1715	1720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016855	TCT	2	6	1760	1765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378448043
36	NC_016855	CCA	2	6	1816	1821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448043
37	NC_016855	GCC	2	6	2113	2118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448045
38	NC_016855	TGC	2	6	2121	2126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448045
39	NC_016855	CGT	2	6	2129	2134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448045
40	NC_016855	GCT	2	6	2146	2151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448045
41	NC_016855	GCC	2	6	2423	2428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448045
42	NC_016855	CGC	2	6	2429	2434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448045
43	NC_016855	CAG	2	6	2456	2461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448045
44	NC_016855	GCG	2	6	2590	2595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448045
45	NC_016855	CAG	2	6	2639	2644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448045
46	NC_016855	CGG	2	6	2677	2682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448045
47	NC_016855	GCG	2	6	2710	2715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448045
48	NC_016855	ATG	3	9	2729	2737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448045
49	NC_016855	CCA	2	6	2790	2795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_016855	GGA	2	6	2820	2825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016855	GCC	2	6	2848	2853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_016855	TTC	2	6	2876	2881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_016855	CTG	2	6	2902	2907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_016855	CTT	2	6	3075	3080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_016855	TCA	2	6	3122	3127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_016855	ACA	2	6	3197	3202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_016855	ACA	2	6	3251	3256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_016855	CAC	2	6	3311	3316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_016855	GCC	3	9	3325	3333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_016855	TAA	2	6	3365	3370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016855	ATG	2	6	3374	3379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016855	CAG	2	6	3457	3462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_016855	CAG	2	6	3530	3535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_016855	CGG	2	6	3713	3718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_016855	GCG	2	6	3877	3882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_016855	ACG	2	6	3951	3956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_016855	ACT	2	6	4065	4070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448047
68	NC_016855	CCT	2	6	4106	4111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378448047
69	NC_016855	CAG	2	6	4152	4157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448047
70	NC_016855	CAC	2	6	4569	4574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448047
71	NC_016855	ATG	2	6	4575	4580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448047
72	NC_016855	ACC	2	6	4583	4588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448047
73	NC_016855	TCC	2	6	4683	4688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378448047
74	NC_016855	ATT	2	6	4723	4728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378448047
75	NC_016855	AGT	3	9	4820	4828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016855	GCA	2	6	4832	4837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_016855	CAC	2	6	4878	4883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_016855	AAT	2	6	4891	4896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016855	TCA	2	6	4931	4936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_016855	CAT	2	6	5287	5292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448048
81	NC_016855	ACG	2	6	5356	5361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448048
82	NC_016855	GCG	2	6	5374	5379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448048
83	NC_016855	CAG	3	9	5516	5524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448048
84	NC_016855	CGC	2	6	5625	5630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_016855	TCC	2	6	5784	5789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378448049
86	NC_016855	GTT	2	6	5851	5856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378448049
87	NC_016855	CCA	2	6	5991	5996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448049
88	NC_016855	CGG	2	6	6088	6093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448049
89	NC_016855	TGC	2	6	6105	6110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448049
90	NC_016855	CCG	2	6	6170	6175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448049
91	NC_016855	GCA	2	6	6225	6230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448049
92	NC_016855	CCA	2	6	6252	6257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448049
93	NC_016855	GAG	2	6	6260	6265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378448049
94	NC_016855	CTG	2	6	6293	6298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448049
95	NC_016855	GCC	2	6	6325	6330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448049
96	NC_016855	CAG	2	6	6445	6450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448049
97	NC_016855	TGC	2	6	6451	6456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448049
98	NC_016855	GTG	3	9	6485	6493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448049
99	NC_016855	CAT	2	6	6532	6537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448049
100	NC_016855	CAG	3	9	6606	6614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_016855	GGA	2	6	6635	6640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016855	ATC	2	6	6666	6671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448050
103	NC_016855	CAG	2	6	6694	6699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448050
104	NC_016855	ACC	2	6	6707	6712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448050
105	NC_016855	GCA	2	6	6713	6718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448050
106	NC_016855	GGC	2	6	6757	6762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448050
107	NC_016855	TTG	2	6	6764	6769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378448050
108	NC_016855	CCA	2	6	6846	6851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448050
109	NC_016855	CGG	2	6	6861	6866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448050
110	NC_016855	CGG	2	6	6926	6931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448050
111	NC_016855	CCA	2	6	6960	6965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448050
112	NC_016855	GAA	2	6	6976	6981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448050
113	NC_016855	TCA	2	6	7008	7013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448050
114	NC_016855	CAG	2	6	7060	7065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448050
115	NC_016855	CCA	2	6	7182	7187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448050
116	NC_016855	ACC	2	6	7202	7207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448050
117	NC_016855	ATA	2	6	7275	7280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378448050
118	NC_016855	CAG	3	9	7384	7392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_016855	TCA	2	6	7404	7409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_016855	GGC	2	6	7424	7429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_016855	TAA	2	6	7522	7527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016855	CAT	2	6	7542	7547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_016855	CTT	2	6	7600	7605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378448051
124	NC_016855	CAT	2	6	7681	7686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448051
125	NC_016855	GCA	2	6	7758	7763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448051
126	NC_016855	GCA	3	9	7786	7794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448051
127	NC_016855	CCG	2	6	7827	7832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448051
128	NC_016855	GCA	2	6	8015	8020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448052
129	NC_016855	AAT	2	6	8086	8091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378448052
130	NC_016855	TTA	2	6	8426	8431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016855	TTA	2	6	8564	8569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378448053
132	NC_016855	AGT	2	6	8667	8672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448053
133	NC_016855	CCT	2	6	8845	8850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378448053
134	NC_016855	GAA	2	6	8905	8910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448053
135	NC_016855	TCA	2	6	8980	8985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448053
136	NC_016855	CAA	2	6	9074	9079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378448053
137	NC_016855	GCT	2	6	9265	9270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448053
138	NC_016855	TGA	2	6	9371	9376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448053
139	NC_016855	ATG	3	9	9388	9396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448053
140	NC_016855	GTT	2	6	9443	9448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016855	GCA	2	6	9563	9568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_016855	GAT	2	6	9606	9611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016855	TCA	2	6	9650	9655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_016855	ACC	2	6	9700	9705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448054
145	NC_016855	GTT	2	6	9768	9773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378448054
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149	NC_016855	GCT	2	6	9900	9905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448054
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262	NC_016855	ATA	2	6	17825	17830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
263	NC_016855	ATC	2	6	17884	17889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
264	NC_016855	AGA	2	6	17918	17923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
265	NC_016855	TCT	2	6	17931	17936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
266	NC_016855	TTA	2	6	17967	17972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
267	NC_016855	CTG	2	6	18003	18008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
268	NC_016855	AAT	2	6	18037	18042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
269	NC_016855	TTA	2	6	18144	18149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378448062
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278	NC_016855	AGA	2	6	18815	18820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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286	NC_016855	TCT	2	6	19587	19592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
287	NC_016855	CTG	2	6	19648	19653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
288	NC_016855	TGT	2	6	19665	19670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
289	NC_016855	GGC	2	6	19970	19975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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