MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 14028S plasmid unnamed

Total Repeats: 1065

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016855	CAG	2	6	121	126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448041
2	NC_016855	CCA	2	6	221	226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448041
3	NC_016855	AGT	2	6	262	267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448041
4	NC_016855	GCG	2	6	268	273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448041
5	NC_016855	GCC	3	9	274	282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448041
6	NC_016855	GAG	2	6	1342	1347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378448042
7	NC_016855	GAA	2	6	1431	1436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448042
8	NC_016855	GAC	2	6	1461	1466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448042
9	NC_016855	GCA	2	6	1515	1520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448042
10	NC_016855	ACT	2	6	1540	1545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448042
11	NC_016855	CTA	2	6	1564	1569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448042
12	NC_016855	TCT	2	6	1760	1765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378448043
13	NC_016855	CCA	2	6	1816	1821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448043
14	NC_016855	GCC	2	6	2113	2118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448045
15	NC_016855	TGC	2	6	2121	2126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448045
16	NC_016855	CGT	2	6	2129	2134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448045
17	NC_016855	GCT	2	6	2146	2151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448045
18	NC_016855	GCC	2	6	2423	2428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448045
19	NC_016855	CGC	2	6	2429	2434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448045
20	NC_016855	CAG	2	6	2456	2461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448045
21	NC_016855	GCG	2	6	2590	2595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448045
22	NC_016855	CAG	2	6	2639	2644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448045
23	NC_016855	CGG	2	6	2677	2682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448045
24	NC_016855	GCG	2	6	2710	2715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448045
25	NC_016855	ATG	3	9	2729	2737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448045
26	NC_016855	ACT	2	6	4065	4070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448047
27	NC_016855	CCT	2	6	4106	4111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378448047
28	NC_016855	CAG	2	6	4152	4157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448047
29	NC_016855	CAC	2	6	4569	4574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448047
30	NC_016855	ATG	2	6	4575	4580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448047
31	NC_016855	ACC	2	6	4583	4588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448047
32	NC_016855	TCC	2	6	4683	4688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378448047
33	NC_016855	ATT	2	6	4723	4728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378448047
34	NC_016855	CAT	2	6	5287	5292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448048
35	NC_016855	ACG	2	6	5356	5361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448048
36	NC_016855	GCG	2	6	5374	5379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448048
37	NC_016855	CAG	3	9	5516	5524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448048
38	NC_016855	TCC	2	6	5784	5789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378448049
39	NC_016855	GTT	2	6	5851	5856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378448049
40	NC_016855	CCA	2	6	5991	5996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448049
41	NC_016855	CGG	2	6	6088	6093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448049
42	NC_016855	TGC	2	6	6105	6110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448049
43	NC_016855	CCG	2	6	6170	6175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448049
44	NC_016855	GCA	2	6	6225	6230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448049
45	NC_016855	CCA	2	6	6252	6257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448049
46	NC_016855	GAG	2	6	6260	6265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378448049
47	NC_016855	CTG	2	6	6293	6298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448049
48	NC_016855	GCC	2	6	6325	6330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448049
49	NC_016855	CAG	2	6	6445	6450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448049
50	NC_016855	TGC	2	6	6451	6456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448049
51	NC_016855	GTG	3	9	6485	6493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448049
52	NC_016855	CAT	2	6	6532	6537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448049
53	NC_016855	ATC	2	6	6666	6671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448050
54	NC_016855	CAG	2	6	6694	6699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448050
55	NC_016855	ACC	2	6	6707	6712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448050
56	NC_016855	GCA	2	6	6713	6718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448050
57	NC_016855	GGC	2	6	6757	6762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448050
58	NC_016855	TTG	2	6	6764	6769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378448050
59	NC_016855	CCA	2	6	6846	6851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448050
60	NC_016855	CGG	2	6	6861	6866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448050
61	NC_016855	CGG	2	6	6926	6931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448050
62	NC_016855	CCA	2	6	6960	6965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448050
63	NC_016855	GAA	2	6	6976	6981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448050
64	NC_016855	TCA	2	6	7008	7013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448050
65	NC_016855	CAG	2	6	7060	7065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448050
66	NC_016855	CCA	2	6	7182	7187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448050
67	NC_016855	ACC	2	6	7202	7207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448050
68	NC_016855	ATA	2	6	7275	7280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378448050
69	NC_016855	CTT	2	6	7600	7605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378448051
70	NC_016855	CAT	2	6	7681	7686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448051
71	NC_016855	GCA	2	6	7758	7763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448051
72	NC_016855	GCA	3	9	7786	7794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448051
73	NC_016855	CCG	2	6	7827	7832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448051
74	NC_016855	GCA	2	6	8015	8020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448052
75	NC_016855	AAT	2	6	8086	8091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378448052
76	NC_016855	TTA	2	6	8564	8569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378448053
77	NC_016855	AGT	2	6	8667	8672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448053
78	NC_016855	CCT	2	6	8845	8850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378448053
79	NC_016855	GAA	2	6	8905	8910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448053
80	NC_016855	TCA	2	6	8980	8985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448053
81	NC_016855	CAA	2	6	9074	9079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378448053
82	NC_016855	GCT	2	6	9265	9270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448053
83	NC_016855	TGA	2	6	9371	9376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448053
84	NC_016855	ATG	3	9	9388	9396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448053
85	NC_016855	ACC	2	6	9700	9705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448054
86	NC_016855	GTT	2	6	9768	9773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378448054
87	NC_016855	CAT	2	6	9797	9802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448054
88	NC_016855	TAC	2	6	9830	9835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448054
89	NC_016855	ATT	2	6	9861	9866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378448054
90	NC_016855	GCT	2	6	9900	9905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448054
91	NC_016855	GTG	2	6	9931	9936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448054
92	NC_016855	CAC	2	6	9960	9965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448054
93	NC_016855	CCG	2	6	10060	10065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448054
94	NC_016855	CAG	2	6	10161	10166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448054
95	NC_016855	TCA	2	6	10226	10231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448054
96	NC_016855	GCC	2	6	10271	10276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448055
97	NC_016855	AGT	2	6	10429	10434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448055
98	NC_016855	TTC	2	6	10446	10451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378448055
99	NC_016855	CCG	2	6	10464	10469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448055
100	NC_016855	CAA	2	6	10513	10518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378448055
101	NC_016855	CGG	2	6	10598	10603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448055
102	NC_016855	ATG	2	6	10668	10673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448055
103	NC_016855	CGG	2	6	10712	10717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448055
104	NC_016855	CTG	2	6	10740	10745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448055
105	NC_016855	GTG	2	6	10752	10757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448055
106	NC_016855	GCC	2	6	10775	10780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448055
107	NC_016855	CAG	2	6	10901	10906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448055
108	NC_016855	TCA	2	6	10924	10929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448055
109	NC_016855	CCT	2	6	10946	10951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378448056
110	NC_016855	TCA	2	6	11051	11056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448056
111	NC_016855	GCA	2	6	11165	11170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448056
112	NC_016855	CAC	2	6	11217	11222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448056
113	NC_016855	AGG	2	6	11228	11233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378448056
114	NC_016855	CAC	2	6	11310	11315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448056
115	NC_016855	TGG	2	6	11333	11338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448056
116	NC_016855	TCA	3	9	11414	11422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448056
117	NC_016855	GGT	2	6	11472	11477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448056
118	NC_016855	CAT	2	6	11499	11504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448056
119	NC_016855	GCT	3	9	11646	11654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448056
120	NC_016855	CTG	2	6	11671	11676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448056
121	NC_016855	TGG	2	6	11801	11806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448056
122	NC_016855	CCA	2	6	11847	11852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448056
123	NC_016855	TCC	2	6	11857	11862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378448056
124	NC_016855	TGT	2	6	11933	11938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378448056
125	NC_016855	TGT	2	6	12077	12082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378448056
126	NC_016855	CGG	2	6	12119	12124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448056
127	NC_016855	GCC	2	6	12138	12143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448056
128	NC_016855	CCG	2	6	12166	12171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448056
129	NC_016855	GTG	2	6	12211	12216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448056
130	NC_016855	GCA	2	6	12344	12349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448056
131	NC_016855	GTG	2	6	12361	12366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448056
132	NC_016855	GGT	3	9	12378	12386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448056
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134	NC_016855	CAC	2	6	12414	12419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448056
135	NC_016855	CAT	2	6	12446	12451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448056
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137	NC_016855	GCA	2	6	12578	12583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448056
138	NC_016855	GCC	2	6	12604	12609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448056
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140	NC_016855	GCC	2	6	12868	12873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448056
141	NC_016855	GCA	2	6	13012	13017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448056
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149	NC_016855	GCA	2	6	13800	13805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448057
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152	NC_016855	GCG	2	6	13950	13955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448057
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159	NC_016855	AAT	2	6	14511	14516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378448058
160	NC_016855	GAT	2	6	14533	14538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448058
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162	NC_016855	ATA	2	6	14631	14636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378448058
163	NC_016855	CAT	2	6	14658	14663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448058
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498	NC_016855	GAC	2	6	51081	51086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448097
499	NC_016855	CTG	2	6	51124	51129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448097
500	NC_016855	CTG	2	6	51280	51285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448097

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