MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 14028S plasmid unnamed

Total Repeats: 146

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016855	GC	3	6	239	244	0 %	0 %	50 %	50 %	378448041
2	NC_016855	GT	3	6	1018	1023	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016855	GA	3	6	1987	1992	50 %	0 %	50 %	0 %	378448045
4	NC_016855	TC	3	6	2893	2898	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_016855	TC	3	6	3097	3102	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_016855	GT	3	6	4163	4168	0 %	50 %	50 %	0 %	378448047
7	NC_016855	TC	3	6	4397	4402	0 %	50 %	0 %	50 %	378448047
8	NC_016855	GT	3	6	5911	5916	0 %	50 %	50 %	0 %	378448049
9	NC_016855	AC	3	6	7475	7480	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_016855	GC	3	6	8046	8051	0 %	0 %	50 %	50 %	378448052
11	NC_016855	TA	3	6	9057	9062	50 %	50 %	0 %	0 %	378448053
12	NC_016855	CA	4	8	10187	10194	50 %	0 %	0 %	50 %	378448054
13	NC_016855	GC	3	6	11036	11041	0 %	0 %	50 %	50 %	378448056
14	NC_016855	GC	3	6	11108	11113	0 %	0 %	50 %	50 %	378448056
15	NC_016855	GC	3	6	11379	11384	0 %	0 %	50 %	50 %	378448056
16	NC_016855	AC	3	6	11786	11791	50 %	0 %	0 %	50 %	378448056
17	NC_016855	TA	3	6	14088	14093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016855	AT	3	6	14239	14244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016855	GC	3	6	14268	14273	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_016855	AC	3	6	14477	14482	50 %	0 %	0 %	50 %	378448058
21	NC_016855	TA	3	6	14735	14740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016855	AT	3	6	14937	14942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016855	TA	3	6	16402	16407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016855	AT	3	6	16429	16434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016855	TA	3	6	16543	16548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016855	CT	3	6	16978	16983	0 %	50 %	0 %	50 %	378448060
27	NC_016855	GA	3	6	17436	17441	50 %	0 %	50 %	0 %	378448060
28	NC_016855	TA	3	6	18871	18876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016855	GA	3	6	19164	19169	50 %	0 %	50 %	0 %	378448063
30	NC_016855	GC	3	6	19695	19700	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_016855	TG	3	6	20670	20675	0 %	50 %	50 %	0 %	378448066
32	NC_016855	GC	3	6	21217	21222	0 %	0 %	50 %	50 %	378448067
33	NC_016855	GA	3	6	21455	21460	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016855	GC	3	6	21939	21944	0 %	0 %	50 %	50 %	378448068
35	NC_016855	GC	3	6	22778	22783	0 %	0 %	50 %	50 %	378448069
36	NC_016855	GC	3	6	22853	22858	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_016855	TC	3	6	23844	23849	0 %	50 %	0 %	50 %	378448070
38	NC_016855	TG	3	6	23870	23875	0 %	50 %	50 %	0 %	378448070
39	NC_016855	CG	3	6	23895	23900	0 %	0 %	50 %	50 %	378448070
40	NC_016855	GC	3	6	23953	23958	0 %	0 %	50 %	50 %	378448070
41	NC_016855	AC	3	6	24123	24128	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_016855	GC	3	6	25043	25048	0 %	0 %	50 %	50 %	378448071
43	NC_016855	AT	3	6	25629	25634	50 %	50 %	0 %	0 %	378448072
44	NC_016855	AT	3	6	25674	25679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016855	CT	3	6	26220	26225	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_016855	AT	3	6	26646	26651	50 %	50 %	0 %	0 %	378448074
47	NC_016855	TC	3	6	26788	26793	0 %	50 %	0 %	50 %	378448074
48	NC_016855	TA	3	6	27426	27431	50 %	50 %	0 %	0 %	378448075
49	NC_016855	AT	3	6	27926	27931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016855	TA	3	6	28606	28611	50 %	50 %	0 %	0 %	378448076
51	NC_016855	CT	3	6	32178	32183	0 %	50 %	0 %	50 %	378448078
52	NC_016855	AT	3	6	34517	34522	50 %	50 %	0 %	0 %	378448080
53	NC_016855	AC	4	8	36136	36143	50 %	0 %	0 %	50 %	378448081
54	NC_016855	GT	3	6	37809	37814	0 %	50 %	50 %	0 %	378448083
55	NC_016855	TG	3	6	38602	38607	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016855	GC	4	8	40481	40488	0 %	0 %	50 %	50 %	378448085
57	NC_016855	CA	3	6	40615	40620	50 %	0 %	0 %	50 %	378448085
58	NC_016855	GC	3	6	41122	41127	0 %	0 %	50 %	50 %	378448086
59	NC_016855	CT	3	6	41416	41421	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_016855	TC	3	6	41935	41940	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_016855	TC	3	6	42262	42267	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_016855	TA	3	6	42744	42749	50 %	50 %	0 %	0 %	378448088
63	NC_016855	AT	3	6	43162	43167	50 %	50 %	0 %	0 %	378448088
64	NC_016855	TA	3	6	43945	43950	50 %	50 %	0 %	0 %	378448089
65	NC_016855	TG	3	6	44464	44469	0 %	50 %	50 %	0 %	378448089
66	NC_016855	AC	3	6	44714	44719	50 %	0 %	0 %	50 %	378448089
67	NC_016855	GA	3	6	45023	45028	50 %	0 %	50 %	0 %	378448090
68	NC_016855	CG	3	6	45868	45873	0 %	0 %	50 %	50 %	378448090
69	NC_016855	GA	3	6	45968	45973	50 %	0 %	50 %	0 %	378448090
70	NC_016855	TC	3	6	46670	46675	0 %	50 %	0 %	50 %	378448091
71	NC_016855	CG	3	6	46715	46720	0 %	0 %	50 %	50 %	378448091
72	NC_016855	GC	3	6	46897	46902	0 %	0 %	50 %	50 %	378448091
73	NC_016855	GC	3	6	47225	47230	0 %	0 %	50 %	50 %	378448091
74	NC_016855	TA	3	6	47793	47798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016855	GC	3	6	49531	49536	0 %	0 %	50 %	50 %	378448095
76	NC_016855	CA	4	8	49957	49964	50 %	0 %	0 %	50 %	378448095
77	NC_016855	AT	3	6	50038	50043	50 %	50 %	0 %	0 %	378448095
78	NC_016855	GC	3	6	50104	50109	0 %	0 %	50 %	50 %	378448095
79	NC_016855	GC	3	6	50226	50231	0 %	0 %	50 %	50 %	378448096
80	NC_016855	TG	3	6	51691	51696	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016855	GC	3	6	52830	52835	0 %	0 %	50 %	50 %	378448099
82	NC_016855	CG	3	6	53214	53219	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_016855	GA	3	6	53497	53502	50 %	0 %	50 %	0 %	378448100
84	NC_016855	GT	3	6	53667	53672	0 %	50 %	50 %	0 %	378448100
85	NC_016855	GC	3	6	53940	53945	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_016855	AC	3	6	54527	54532	50 %	0 %	0 %	50 %	378448101
87	NC_016855	AG	3	6	55438	55443	50 %	0 %	50 %	0 %	378448103
88	NC_016855	CG	3	6	55706	55711	0 %	0 %	50 %	50 %	378448103
89	NC_016855	GC	3	6	56398	56403	0 %	0 %	50 %	50 %	378448103
90	NC_016855	TG	3	6	56568	56573	0 %	50 %	50 %	0 %	378448103
91	NC_016855	GC	3	6	57166	57171	0 %	0 %	50 %	50 %	378448103
92	NC_016855	CG	3	6	58062	58067	0 %	0 %	50 %	50 %	378448105
93	NC_016855	CG	3	6	58251	58256	0 %	0 %	50 %	50 %	378448105
94	NC_016855	TA	3	6	58957	58962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016855	CA	3	6	59387	59392	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_016855	TC	3	6	60488	60493	0 %	50 %	0 %	50 %	378448106
97	NC_016855	TA	4	8	61004	61011	50 %	50 %	0 %	0 %	378448107
98	NC_016855	GA	3	6	61071	61076	50 %	0 %	50 %	0 %	378448107
99	NC_016855	TC	3	6	61252	61257	0 %	50 %	0 %	50 %	378448107
100	NC_016855	TC	4	8	61981	61988	0 %	50 %	0 %	50 %	378448108
101	NC_016855	GC	3	6	62260	62265	0 %	0 %	50 %	50 %	378448109
102	NC_016855	AG	3	6	62359	62364	50 %	0 %	50 %	0 %	378448109
103	NC_016855	AT	3	6	63613	63618	50 %	50 %	0 %	0 %	378448112
104	NC_016855	TG	3	6	64421	64426	0 %	50 %	50 %	0 %	378448113
105	NC_016855	CG	3	6	65438	65443	0 %	0 %	50 %	50 %	378448114
106	NC_016855	GC	3	6	66874	66879	0 %	0 %	50 %	50 %	378448117
107	NC_016855	TC	3	6	67198	67203	0 %	50 %	0 %	50 %	378448117
108	NC_016855	TG	3	6	67659	67664	0 %	50 %	50 %	0 %	378448118
109	NC_016855	TG	3	6	67873	67878	0 %	50 %	50 %	0 %	378448119
110	NC_016855	CG	3	6	68838	68843	0 %	0 %	50 %	50 %	378448120
111	NC_016855	TG	3	6	68853	68858	0 %	50 %	50 %	0 %	378448120
112	NC_016855	GC	3	6	69060	69065	0 %	0 %	50 %	50 %	378448120
113	NC_016855	CA	3	6	69154	69159	50 %	0 %	0 %	50 %	378448120
114	NC_016855	CG	3	6	69355	69360	0 %	0 %	50 %	50 %	378448120
115	NC_016855	CG	3	6	70805	70810	0 %	0 %	50 %	50 %	378448120
116	NC_016855	GC	3	6	71512	71517	0 %	0 %	50 %	50 %	378448121
117	NC_016855	GC	3	6	71803	71808	0 %	0 %	50 %	50 %	378448122
118	NC_016855	TG	3	6	72221	72226	0 %	50 %	50 %	0 %	378448123
119	NC_016855	AG	3	6	73206	73211	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016855	GC	3	6	74994	74999	0 %	0 %	50 %	50 %	378448126
121	NC_016855	GA	4	8	75097	75104	50 %	0 %	50 %	0 %	378448126
122	NC_016855	CA	3	6	75226	75231	50 %	0 %	0 %	50 %	378448126
123	NC_016855	GC	3	6	76362	76367	0 %	0 %	50 %	50 %	378448126
124	NC_016855	AT	3	6	77593	77598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016855	TC	3	6	77907	77912	0 %	50 %	0 %	50 %	378448129
126	NC_016855	TA	3	6	77989	77994	50 %	50 %	0 %	0 %	378448130
127	NC_016855	AC	3	6	78346	78351	50 %	0 %	0 %	50 %	378448130
128	NC_016855	CA	3	6	78576	78581	50 %	0 %	0 %	50 %	378448131
129	NC_016855	TG	3	6	80310	80315	0 %	50 %	50 %	0 %	378448132
130	NC_016855	CT	3	6	81009	81014	0 %	50 %	0 %	50 %	378448132
131	NC_016855	TC	3	6	81059	81064	0 %	50 %	0 %	50 %	378448132
132	NC_016855	GC	3	6	81559	81564	0 %	0 %	50 %	50 %	378448132
133	NC_016855	TC	3	6	84013	84018	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_016855	TG	3	6	84645	84650	0 %	50 %	50 %	0 %	378448135
135	NC_016855	CG	3	6	85022	85027	0 %	0 %	50 %	50 %	378448135
136	NC_016855	AC	3	6	85462	85467	50 %	0 %	0 %	50 %	378448135
137	NC_016855	GA	3	6	85534	85539	50 %	0 %	50 %	0 %	378448135
138	NC_016855	CA	3	6	87488	87493	50 %	0 %	0 %	50 %	378448139
139	NC_016855	CG	3	6	87775	87780	0 %	0 %	50 %	50 %	378448139
140	NC_016855	GC	3	6	88805	88810	0 %	0 %	50 %	50 %	378448139
141	NC_016855	AG	3	6	88956	88961	50 %	0 %	50 %	0 %	378448139
142	NC_016855	GA	3	6	89234	89239	50 %	0 %	50 %	0 %	378448139
143	NC_016855	CA	3	6	89547	89552	50 %	0 %	0 %	50 %	378448139
144	NC_016855	AG	3	6	92541	92546	50 %	0 %	50 %	0 %	378448140
145	NC_016855	CA	3	6	93594	93599	50 %	0 %	0 %	50 %	378448141
146	NC_016855	CG	3	6	93785	93790	0 %	0 %	50 %	50 %	378448141

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.