MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 14028S plasmid unnamed

Total Repeats: 130

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016855	G	9	9	914	922	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016855	A	6	6	1455	1460	100 %	0 %	0 %	0 %	378448042
3	NC_016855	A	6	6	3642	3647	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016855	T	6	6	4134	4139	0 %	100 %	0 %	0 %	378448047
5	NC_016855	T	6	6	4191	4196	0 %	100 %	0 %	0 %	378448047
6	NC_016855	A	7	7	4330	4336	100 %	0 %	0 %	0 %	378448047
7	NC_016855	A	7	7	4696	4702	100 %	0 %	0 %	0 %	378448047
8	NC_016855	C	7	7	4774	4780	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9	NC_016855	A	6	6	4903	4908	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016855	T	7	7	5539	5545	0 %	100 %	0 %	0 %	378448048
11	NC_016855	T	6	6	5977	5982	0 %	100 %	0 %	0 %	378448049
12	NC_016855	A	6	6	7265	7270	100 %	0 %	0 %	0 %	378448050
13	NC_016855	A	6	6	7464	7469	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016855	T	6	6	8482	8487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016855	C	6	6	9382	9387	0 %	0 %	0 %	100 %	378448053
16	NC_016855	C	6	6	9913	9918	0 %	0 %	0 %	100 %	378448054
17	NC_016855	C	6	6	11009	11014	0 %	0 %	0 %	100 %	378448056
18	NC_016855	T	6	6	12279	12284	0 %	100 %	0 %	0 %	378448056
19	NC_016855	C	6	6	13346	13351	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
20	NC_016855	T	6	6	14109	14114	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016855	A	6	6	14889	14894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016855	A	6	6	14944	14949	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016855	A	6	6	14951	14956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016855	A	6	6	14980	14985	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016855	A	6	6	15004	15009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016855	A	6	6	15129	15134	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016855	T	7	7	15361	15367	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016855	A	6	6	15386	15391	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016855	A	6	6	15530	15535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016855	A	6	6	15739	15744	100 %	0 %	0 %	0 %	378448059
31	NC_016855	A	6	6	15945	15950	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016855	T	6	6	17626	17631	0 %	100 %	0 %	0 %	378448061
33	NC_016855	T	7	7	18087	18093	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016855	A	6	6	19021	19026	100 %	0 %	0 %	0 %	378448063
35	NC_016855	A	6	6	19569	19574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016855	A	6	6	19767	19772	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016855	A	6	6	20079	20084	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016855	A	6	6	21420	21425	100 %	0 %	0 %	0 %	378448067
39	NC_016855	G	6	6	22700	22705	0 %	0 %	100 %	0 %	378448069
40	NC_016855	G	6	6	22870	22875	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016855	A	6	6	22944	22949	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016855	A	6	6	24409	24414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016855	T	6	6	25470	25475	0 %	100 %	0 %	0 %	378448072
44	NC_016855	A	6	6	26256	26261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016855	T	7	7	26323	26329	0 %	100 %	0 %	0 %	378448074
46	NC_016855	T	6	6	26392	26397	0 %	100 %	0 %	0 %	378448074
47	NC_016855	T	6	6	26858	26863	0 %	100 %	0 %	0 %	378448074
48	NC_016855	A	6	6	26972	26977	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016855	G	6	6	27069	27074	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016855	T	8	8	27960	27967	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016855	T	6	6	27999	28004	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016855	A	6	6	28013	28018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016855	A	7	7	31689	31695	100 %	0 %	0 %	0 %	378448078
54	NC_016855	T	6	6	31794	31799	0 %	100 %	0 %	0 %	378448078
55	NC_016855	T	6	6	31952	31957	0 %	100 %	0 %	0 %	378448078
56	NC_016855	T	6	6	31990	31995	0 %	100 %	0 %	0 %	378448078
57	NC_016855	T	6	6	32289	32294	0 %	100 %	0 %	0 %	378448078
58	NC_016855	T	10	10	32322	32331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016855	A	6	6	32345	32350	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016855	A	6	6	32613	32618	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016855	C	6	6	33995	34000	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
62	NC_016855	T	6	6	34753	34758	0 %	100 %	0 %	0 %	378448080
63	NC_016855	A	6	6	37434	37439	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016855	T	6	6	37653	37658	0 %	100 %	0 %	0 %	378448083
65	NC_016855	G	6	6	38563	38568	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016855	T	6	6	43053	43058	0 %	100 %	0 %	0 %	378448088
67	NC_016855	A	6	6	43438	43443	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016855	T	6	6	43499	43504	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016855	A	6	6	43787	43792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016855	G	6	6	46613	46618	0 %	0 %	100 %	0 %	378448091
71	NC_016855	T	7	7	47207	47213	0 %	100 %	0 %	0 %	378448091
72	NC_016855	T	6	6	49162	49167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016855	A	6	6	49664	49669	100 %	0 %	0 %	0 %	378448095
74	NC_016855	T	6	6	51758	51763	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016855	A	6	6	52306	52311	100 %	0 %	0 %	0 %	378448098
76	NC_016855	A	6	6	52739	52744	100 %	0 %	0 %	0 %	378448099
77	NC_016855	A	6	6	53220	53225	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016855	G	6	6	53245	53250	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016855	A	6	6	53584	53589	100 %	0 %	0 %	0 %	378448100
80	NC_016855	T	7	7	53651	53657	0 %	100 %	0 %	0 %	378448100
81	NC_016855	A	6	6	57026	57031	100 %	0 %	0 %	0 %	378448103
82	NC_016855	T	6	6	57472	57477	0 %	100 %	0 %	0 %	378448104
83	NC_016855	T	6	6	57855	57860	0 %	100 %	0 %	0 %	378448105
84	NC_016855	A	6	6	58708	58713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016855	T	6	6	58944	58949	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016855	T	6	6	59065	59070	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016855	A	6	6	59690	59695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016855	A	6	6	60037	60042	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016855	C	6	6	60249	60254	0 %	0 %	0 %	100 %	378448106
90	NC_016855	A	6	6	60829	60834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016855	A	6	6	60971	60976	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016855	A	7	7	61480	61486	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016855	T	7	7	61948	61954	0 %	100 %	0 %	0 %	378448108
94	NC_016855	T	6	6	62036	62041	0 %	100 %	0 %	0 %	378448108
95	NC_016855	T	9	9	62279	62287	0 %	100 %	0 %	0 %	378448109
96	NC_016855	A	6	6	63179	63184	100 %	0 %	0 %	0 %	378448111
97	NC_016855	T	6	6	63700	63705	0 %	100 %	0 %	0 %	378448112
98	NC_016855	A	6	6	63878	63883	100 %	0 %	0 %	0 %	378448112
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100	NC_016855	A	6	6	66588	66593	100 %	0 %	0 %	0 %	378448115
101	NC_016855	T	6	6	67308	67313	0 %	100 %	0 %	0 %	378448117
102	NC_016855	A	6	6	67723	67728	100 %	0 %	0 %	0 %	378448119
103	NC_016855	A	8	8	69073	69080	100 %	0 %	0 %	0 %	378448120
104	NC_016855	A	6	6	70324	70329	100 %	0 %	0 %	0 %	378448120
105	NC_016855	T	6	6	71364	71369	0 %	100 %	0 %	0 %	378448121
106	NC_016855	A	6	6	71385	71390	100 %	0 %	0 %	0 %	378448121
107	NC_016855	G	6	6	73265	73270	0 %	0 %	100 %	0 %	378448124
108	NC_016855	G	6	6	76651	76656	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016855	A	6	6	76964	76969	100 %	0 %	0 %	0 %	378448128
110	NC_016855	T	6	6	77544	77549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016855	T	7	7	77740	77746	0 %	100 %	0 %	0 %	378448129
112	NC_016855	A	6	6	78651	78656	100 %	0 %	0 %	0 %	378448131
113	NC_016855	T	6	6	78799	78804	0 %	100 %	0 %	0 %	378448131
114	NC_016855	G	6	6	78925	78930	0 %	0 %	100 %	0 %	378448131
115	NC_016855	T	6	6	80389	80394	0 %	100 %	0 %	0 %	378448132
116	NC_016855	G	6	6	80413	80418	0 %	0 %	100 %	0 %	378448132
117	NC_016855	A	6	6	82391	82396	100 %	0 %	0 %	0 %	378448132
118	NC_016855	A	8	8	82815	82822	100 %	0 %	0 %	0 %	378448133
119	NC_016855	A	7	7	83198	83204	100 %	0 %	0 %	0 %	378448134
120	NC_016855	A	6	6	84217	84222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016855	T	6	6	84675	84680	0 %	100 %	0 %	0 %	378448135
122	NC_016855	A	6	6	84786	84791	100 %	0 %	0 %	0 %	378448135
123	NC_016855	A	6	6	85288	85293	100 %	0 %	0 %	0 %	378448135
124	NC_016855	A	6	6	86193	86198	100 %	0 %	0 %	0 %	378448135
125	NC_016855	C	6	6	86289	86294	0 %	0 %	0 %	100 %	378448135
126	NC_016855	T	6	6	86719	86724	0 %	100 %	0 %	0 %	378448136
127	NC_016855	T	6	6	86817	86822	0 %	100 %	0 %	0 %	378448136
128	NC_016855	C	6	6	91121	91126	0 %	0 %	0 %	100 %	378448139
129	NC_016855	T	6	6	93136	93141	0 %	100 %	0 %	0 %	378448140
130	NC_016855	A	8	8	93411	93418	100 %	0 %	0 %	0 %	378448141

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.