MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. CDC2 chromosome

Total Repeats: 12406

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016848	GAA	2	6	397	402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378981477
2	NC_016848	GCT	2	6	421	426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378981477
3	NC_016848	ACA	2	6	538	543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378981477
4	NC_016848	CTT	2	6	658	663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378981477
5	NC_016848	AAG	2	6	704	709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378981477
6	NC_016848	TGT	2	6	945	950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378981477
7	NC_016848	TTC	2	6	972	977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378981477
8	NC_016848	TTC	2	6	1078	1083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378981477
9	NC_016848	TTC	2	6	1121	1126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378981477
10	NC_016848	GTT	2	6	1192	1197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378981477
11	NC_016848	ACT	2	6	1249	1254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378981477
12	NC_016848	TGG	2	6	1272	1277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378981477
13	NC_016848	TTC	2	6	1506	1511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378981478
14	NC_016848	TAT	2	6	1582	1587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378981478
15	NC_016848	TAA	2	6	1621	1626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378981478
16	NC_016848	GGA	2	6	1627	1632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378981478
17	NC_016848	AAG	2	6	1660	1665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378981478
18	NC_016848	GCT	2	6	1746	1751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378981479
19	NC_016848	TGT	2	6	1868	1873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378981479
20	NC_016848	CAA	2	6	1885	1890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378981479
21	NC_016848	GAA	2	6	1914	1919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378981479
22	NC_016848	AGG	2	6	2009	2014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378981479
23	NC_016848	AGA	2	6	2081	2086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378981479
24	NC_016848	ATT	2	6	2139	2144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378981479
25	NC_016848	GCA	2	6	2300	2305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981479
26	NC_016848	TCT	2	6	2337	2342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378981479
27	NC_016848	ATC	2	6	2389	2394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378981479
28	NC_016848	GTT	2	6	2453	2458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378981479
29	NC_016848	TTA	2	6	2485	2490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378981479
30	NC_016848	CAG	2	6	2496	2501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981479
31	NC_016848	TTG	2	6	2505	2510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378981479
32	NC_016848	GAA	2	6	2562	2567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378981479
33	NC_016848	GAA	2	6	2625	2630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378981479
34	NC_016848	AGG	2	6	2653	2658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378981479
35	NC_016848	CAT	2	6	2729	2734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378981479
36	NC_016848	TGC	2	6	2895	2900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378981480
37	NC_016848	CAG	2	6	3087	3092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981480
38	NC_016848	CTT	2	6	3159	3164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378981480
39	NC_016848	TAT	2	6	3373	3378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378981480
40	NC_016848	CTC	2	6	3435	3440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378981480
41	NC_016848	GAG	2	6	3445	3450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378981480
42	NC_016848	GAT	2	6	3667	3672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378981480
43	NC_016848	ATG	2	6	3712	3717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378981480
44	NC_016848	AAT	2	6	3830	3835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378981480
45	NC_016848	CGT	2	6	4080	4085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378981481
46	NC_016848	GAA	2	6	4141	4146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378981481
47	NC_016848	GAA	2	6	4247	4252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378981481
48	NC_016848	GAA	2	6	4394	4399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378981482
49	NC_016848	GGA	2	6	4558	4563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378981482
50	NC_016848	TTC	2	6	4875	4880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378981482
51	NC_016848	TCT	2	6	4897	4902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378981482
52	NC_016848	TTG	2	6	5121	5126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378981482
53	NC_016848	ATT	2	6	5174	5179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378981482
54	NC_016848	TAC	2	6	5206	5211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378981482
55	NC_016848	ACG	2	6	5277	5282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981482
56	NC_016848	GTA	2	6	5345	5350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378981482
57	NC_016848	ATC	2	6	5579	5584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378981482
58	NC_016848	TCT	2	6	5756	5761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378981482
59	NC_016848	GGA	2	6	5764	5769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378981482
60	NC_016848	GTT	2	6	5801	5806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378981482
61	NC_016848	GAT	2	6	5843	5848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378981482
62	NC_016848	AGA	2	6	5893	5898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378981482
63	NC_016848	GGA	2	6	5990	5995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378981482
64	NC_016848	GGC	2	6	6019	6024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378981482
65	NC_016848	TTA	2	6	6033	6038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378981482
66	NC_016848	TAA	2	6	6226	6231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378981482
67	NC_016848	ACT	2	6	6278	6283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378981482
68	NC_016848	TAT	2	6	6313	6318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378981482
69	NC_016848	TTA	2	6	6390	6395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378981482
70	NC_016848	AAC	2	6	6522	6527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378981482
71	NC_016848	AGA	2	6	6615	6620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378981482
72	NC_016848	GTG	2	6	6753	6758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378981482
73	NC_016848	TAG	3	9	6798	6806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378981482
74	NC_016848	TGT	2	6	6873	6878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378981483
75	NC_016848	GAG	2	6	6936	6941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378981483
76	NC_016848	GGA	2	6	6966	6971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378981483
77	NC_016848	GGA	2	6	7135	7140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378981484
78	NC_016848	CTT	2	6	7141	7146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378981484
79	NC_016848	GAT	2	6	7188	7193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378981484
80	NC_016848	TGC	2	6	7462	7467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378981484
81	NC_016848	ACT	2	6	7498	7503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378981484
82	NC_016848	TGA	2	6	7618	7623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378981484
83	NC_016848	GCA	2	6	7626	7631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981484
84	NC_016848	TCA	2	6	7801	7806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378981484
85	NC_016848	TTG	2	6	7812	7817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378981484
86	NC_016848	GAT	2	6	8049	8054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378981484
87	NC_016848	TCA	2	6	8341	8346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378981485
88	NC_016848	TCT	2	6	8402	8407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378981485
89	NC_016848	AAG	2	6	8746	8751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378981485
90	NC_016848	GCA	2	6	8771	8776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981485
91	NC_016848	CTG	2	6	8785	8790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378981485
92	NC_016848	ACG	2	6	8810	8815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981485
93	NC_016848	ATC	2	6	8917	8922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378981485
94	NC_016848	GCA	2	6	8951	8956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981485
95	NC_016848	CGC	2	6	9010	9015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378981485
96	NC_016848	CCT	2	6	9035	9040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378981485
97	NC_016848	ACG	2	6	9118	9123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981485
98	NC_016848	TCT	2	6	9147	9152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378981485
99	NC_016848	CGA	2	6	9174	9179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981485
100	NC_016848	TGT	2	6	9312	9317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378981485
101	NC_016848	CCT	2	6	9357	9362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378981485
102	NC_016848	CTT	2	6	9403	9408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378981485
103	NC_016848	TCT	2	6	9542	9547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378981485
104	NC_016848	GTG	2	6	9620	9625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378981485
105	NC_016848	GCT	2	6	9832	9837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378981485
106	NC_016848	GAT	2	6	9933	9938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378981485
107	NC_016848	AGT	2	6	10144	10149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378981485
108	NC_016848	CAC	2	6	10162	10167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378981485
109	NC_016848	TCC	2	6	10498	10503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378981486
110	NC_016848	CTG	2	6	10520	10525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378981486
111	NC_016848	GTC	2	6	10540	10545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378981486
112	NC_016848	AGC	2	6	10612	10617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981486
113	NC_016848	TTG	2	6	10636	10641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378981486
114	NC_016848	GAC	2	6	10767	10772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981486
115	NC_016848	GAA	2	6	10796	10801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378981486
116	NC_016848	TAC	2	6	10908	10913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378981486
117	NC_016848	TGG	2	6	10953	10958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378981486
118	NC_016848	TCG	2	6	11035	11040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378981486
119	NC_016848	GCA	2	6	11200	11205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981486
120	NC_016848	CAT	2	6	11254	11259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378981486
121	NC_016848	AAG	2	6	11362	11367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378981486
122	NC_016848	TTG	2	6	11459	11464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378981486
123	NC_016848	CTG	2	6	11465	11470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378981486
124	NC_016848	CGC	2	6	11490	11495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378981486
125	NC_016848	CAC	2	6	11513	11518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378981486
126	NC_016848	CCT	2	6	11560	11565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378981486
127	NC_016848	CGT	2	6	11586	11591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378981486
128	NC_016848	GGT	2	6	11680	11685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378981486
129	NC_016848	AGT	2	6	11803	11808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378981486
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500	NC_016848	TCG	2	6	48301	48306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378981513

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