MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae HS11286 plasmid pKPHS5

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016847	TTG	2	6	4	9	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016847	GTG	2	6	62	67	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016847	CCA	2	6	174	179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378976154
4	NC_016847	TGT	2	6	319	324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378976154
5	NC_016847	CAT	2	6	377	382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378976154
6	NC_016847	TAA	2	6	425	430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378976154
7	NC_016847	ACA	2	6	472	477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378976154
8	NC_016847	ATC	2	6	505	510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378976154
9	NC_016847	GAC	2	6	524	529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378976154
10	NC_016847	GAG	2	6	606	611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378976155
11	NC_016847	CAT	2	6	634	639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378976155
12	NC_016847	CAG	2	6	698	703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378976155
13	NC_016847	TGT	2	6	753	758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378976156
14	NC_016847	GCG	2	6	857	862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378976156
15	NC_016847	AGG	2	6	910	915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378976156
16	NC_016847	GTG	2	6	1000	1005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378976156
17	NC_016847	GGC	2	6	1049	1054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378976156
18	NC_016847	CTG	2	6	1207	1212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_016847	GCA	2	6	1274	1279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_016847	ACC	2	6	1435	1440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_016847	GGT	2	6	1450	1455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016847	TAC	2	6	1474	1479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_016847	CTC	2	6	1480	1485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_016847	CAA	2	6	1555	1560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378976157
25	NC_016847	ATC	2	6	1644	1649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378976157
26	NC_016847	AAG	2	6	1688	1693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378976157
27	NC_016847	AAT	2	6	1765	1770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378976157
28	NC_016847	ATA	2	6	1781	1786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378976157
29	NC_016847	TCA	2	6	2024	2029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378976158
30	NC_016847	TCA	2	6	2069	2074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378976158
31	NC_016847	AAG	2	6	2207	2212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378976158
32	NC_016847	TCA	2	6	2255	2260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378976158
33	NC_016847	ATT	2	6	2416	2421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378976158
34	NC_016847	CTT	2	6	2552	2557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378976158
35	NC_016847	CTT	2	6	2561	2566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378976158
36	NC_016847	TCT	2	6	2660	2665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378976158
37	NC_016847	CAA	2	6	2846	2851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_016847	ACC	2	6	2852	2857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_016847	TTC	2	6	2972	2977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_016847	TCC	2	6	2978	2983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_016847	TCG	2	6	3078	3083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_016847	GAC	2	6	3116	3121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_016847	TGA	2	6	3195	3200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016847	TCA	2	6	3219	3224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_016847	ATA	2	6	3235	3240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016847	GTC	2	6	3293	3298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.