MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae HS11286 plasmid pKPHS2

Total Repeats: 39

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016846	AGGGCG	2	12	1919	1930	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	378975989
2	NC_016846	CGGTTC	2	12	9363	9374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378976002
3	NC_016846	CTGGTC	2	12	12711	12722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378976008
4	NC_016846	CCTGCC	2	12	15710	15721	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	378976014
5	NC_016846	CGCGCT	2	12	15795	15806	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378976014
6	NC_016846	AGGTAA	2	12	16894	16905	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	378976016
7	NC_016846	GAGCTG	2	12	21049	21060	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378976021
8	NC_016846	TAGAGG	2	12	23422	23433	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	378976025
9	NC_016846	TGGACG	2	12	27966	27977	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378976031
10	NC_016846	CCAATT	2	12	31884	31895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378976037
11	NC_016846	TTTGTT	2	12	33327	33338	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	378976038
12	NC_016846	CGGGTT	2	12	39029	39040	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	378976044
13	NC_016846	ATACCG	2	12	44068	44079	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378976052
14	NC_016846	GTCATC	2	12	45113	45124	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378976053
15	NC_016846	CCGGCG	2	12	45664	45675	0 %	0 %	50 %	50 %	378976054
16	NC_016846	TCCTGC	2	12	45935	45946	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
17	NC_016846	GGCAAA	2	12	46333	46344	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	378976055
18	NC_016846	TTATCC	2	12	48108	48119	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	378976056
19	NC_016846	CCCGCT	2	12	50665	50676	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	378976056
20	NC_016846	CTGCAG	2	12	52236	52247	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378976057
21	NC_016846	CATCAG	2	12	54154	54165	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378976057
22	NC_016846	AACACC	2	12	56551	56562	50 %	0 %	0 %	50 %	378976060
23	NC_016846	CGGTTT	2	12	64804	64815	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	378976070
24	NC_016846	GTGACC	2	12	64830	64841	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378976070
25	NC_016846	CTTCCC	2	12	64946	64957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378976070
26	NC_016846	GTGATG	2	12	69395	69406	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	378976076
27	NC_016846	TCAGCG	2	12	70674	70685	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378976076
28	NC_016846	TCTCCA	2	12	71058	71069	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	378976076
29	NC_016846	TCCTTT	2	12	79461	79472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378976091
30	NC_016846	GATATC	2	12	83385	83396	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378976099
31	NC_016846	CAGCGG	2	12	88210	88221	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	378976113
32	NC_016846	TTTTCA	2	12	88925	88936	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	378976114
33	NC_016846	GTCCTC	2	12	94492	94503	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	378976120
34	NC_016846	TTTTTC	2	12	95341	95352	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	378976122
35	NC_016846	TTCGTC	2	12	97445	97456	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	378976127
36	NC_016846	TTCGTC	2	12	98932	98943	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	378976130
37	NC_016846	CTGCAG	2	12	101704	101715	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378976136
38	NC_016846	TTGCGG	2	12	102566	102577	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	378976137
39	NC_016846	GCAGCT	2	12	106898	106909	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378976142

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.