MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae HS11286 plasmid pKPHS2

Total Repeats: 109

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016846	GAACT	2	10	120	129	40 %	20 %	20 %	20 %	378975986
2	NC_016846	ACGGT	2	10	1502	1511	20 %	20 %	40 %	20 %	378975989
3	NC_016846	AAACG	2	10	3390	3399	60 %	0 %	20 %	20 %	378975992
4	NC_016846	GTCGC	2	10	4197	4206	0 %	20 %	40 %	40 %	378975994
5	NC_016846	TGTTC	2	10	4431	4440	0 %	60 %	20 %	20 %	378975994
6	NC_016846	GAGGG	2	10	5710	5719	20 %	0 %	80 %	0 %	378975997
7	NC_016846	CGTCC	2	10	6122	6131	0 %	20 %	20 %	60 %	378975998
8	NC_016846	AAAAC	2	10	6652	6661	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_016846	GCGCC	2	10	6946	6955	0 %	0 %	40 %	60 %	378976000
10	NC_016846	CCTGA	2	10	7007	7016	20 %	20 %	20 %	40 %	378976000
11	NC_016846	TCGCG	2	10	7966	7975	0 %	20 %	40 %	40 %	378976000
12	NC_016846	GATCA	2	10	10276	10285	40 %	20 %	20 %	20 %	378976005
13	NC_016846	GCAAA	2	10	10318	10327	60 %	0 %	20 %	20 %	378976005
14	NC_016846	ATCCA	2	10	12382	12391	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_016846	CGGCG	2	10	12575	12584	0 %	0 %	60 %	40 %	378976008
16	NC_016846	GGGCT	2	10	13197	13206	0 %	20 %	60 %	20 %	378976010
17	NC_016846	CGGCC	2	10	13334	13343	0 %	0 %	40 %	60 %	378976010
18	NC_016846	GGCCT	2	10	13407	13416	0 %	20 %	40 %	40 %	378976010
19	NC_016846	CGGAC	2	10	13469	13478	20 %	0 %	40 %	40 %	378976010
20	NC_016846	CGCAG	2	10	15514	15523	20 %	0 %	40 %	40 %	378976013
21	NC_016846	TGCTC	2	10	18401	18410	0 %	40 %	20 %	40 %	378976017
22	NC_016846	AGGCC	2	10	18590	18599	20 %	0 %	40 %	40 %	378976017
23	NC_016846	CGGTT	2	10	18886	18895	0 %	40 %	40 %	20 %	378976018
24	NC_016846	CGGCC	2	10	20982	20991	0 %	0 %	40 %	60 %	378976021
25	NC_016846	GCAAT	2	10	22498	22507	40 %	20 %	20 %	20 %	378976022
26	NC_016846	CAAGC	2	10	23069	23078	40 %	0 %	20 %	40 %	378976024
27	NC_016846	GCTAA	2	10	25295	25304	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_016846	GCCGC	2	10	25508	25517	0 %	0 %	40 %	60 %	378976029
29	NC_016846	CGCGC	2	10	28534	28543	0 %	0 %	40 %	60 %	378976031
30	NC_016846	TGCTC	2	10	29257	29266	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
31	NC_016846	AGGCC	2	10	29446	29455	20 %	0 %	40 %	40 %	378976032
32	NC_016846	TCGAT	2	10	30930	30939	20 %	40 %	20 %	20 %	378976035
33	NC_016846	TTTTC	2	10	31585	31594	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_016846	GAAGA	2	10	32329	32338	60 %	0 %	40 %	0 %	378976037
35	NC_016846	GCCAG	2	10	32655	32664	20 %	0 %	40 %	40 %	378976037
36	NC_016846	ATTTT	2	10	32911	32920	20 %	80 %	0 %	0 %	378976038
37	NC_016846	GAGTT	2	10	34828	34837	20 %	40 %	40 %	0 %	378976039
38	NC_016846	TTTAT	2	10	36544	36553	20 %	80 %	0 %	0 %	378976040
39	NC_016846	CCCTG	2	10	37244	37253	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
40	NC_016846	AAGAT	2	10	38142	38151	60 %	20 %	20 %	0 %	378976043
41	NC_016846	ACTCT	2	10	39323	39332	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
42	NC_016846	TTAAT	2	10	39708	39717	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016846	TCCAG	2	10	40058	40067	20 %	20 %	20 %	40 %	378976046
44	NC_016846	GGTGA	2	10	40126	40135	20 %	20 %	60 %	0 %	378976046
45	NC_016846	GCTAA	2	10	40294	40303	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_016846	GGCCT	2	10	40548	40557	0 %	20 %	40 %	40 %	378976047
47	NC_016846	GAGCA	2	10	40737	40746	40 %	0 %	40 %	20 %	378976047
48	NC_016846	TTTAA	2	10	42636	42645	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016846	CGTGC	2	10	46449	46458	0 %	20 %	40 %	40 %	378976055
50	NC_016846	GCCCG	2	10	47523	47532	0 %	0 %	40 %	60 %	378976056
51	NC_016846	TCCTT	2	10	48072	48081	0 %	60 %	0 %	40 %	378976056
52	NC_016846	CGCTG	2	10	48652	48661	0 %	20 %	40 %	40 %	378976056
53	NC_016846	AGGTC	2	10	49366	49375	20 %	20 %	40 %	20 %	378976056
54	NC_016846	CCGTC	2	10	50518	50527	0 %	20 %	20 %	60 %	378976056
55	NC_016846	TCCAC	2	10	51181	51190	20 %	20 %	0 %	60 %	378976056
56	NC_016846	TGTCC	2	10	52185	52194	0 %	40 %	20 %	40 %	378976057
57	NC_016846	ACAGG	2	10	52657	52666	40 %	0 %	40 %	20 %	378976057
58	NC_016846	GCACG	2	10	53262	53271	20 %	0 %	40 %	40 %	378976057
59	NC_016846	AATAA	2	10	54182	54191	80 %	20 %	0 %	0 %	378976057
60	NC_016846	CAGAG	2	10	55984	55993	40 %	0 %	40 %	20 %	378976059
61	NC_016846	ACCCC	2	10	61087	61096	20 %	0 %	0 %	80 %	378976063
62	NC_016846	CCTTC	2	10	65101	65110	0 %	40 %	0 %	60 %	378976070
63	NC_016846	GGACT	2	10	66805	66814	20 %	20 %	40 %	20 %	378976072
64	NC_016846	CAGAA	2	10	66868	66877	60 %	0 %	20 %	20 %	378976072
65	NC_016846	ACGGT	2	10	68210	68219	20 %	20 %	40 %	20 %	378976074
66	NC_016846	CCGAA	2	10	69216	69225	40 %	0 %	20 %	40 %	378976076
67	NC_016846	CATTT	2	10	72444	72453	20 %	60 %	0 %	20 %	378976078
68	NC_016846	GGTTG	2	10	74101	74110	0 %	40 %	60 %	0 %	378976083
69	NC_016846	GCACG	2	10	76268	76277	20 %	0 %	40 %	40 %	378976085
70	NC_016846	ACTGA	2	10	76639	76648	40 %	20 %	20 %	20 %	378976086
71	NC_016846	GGTTT	2	10	77800	77809	0 %	60 %	40 %	0 %	378976088
72	NC_016846	TCTTT	2	10	79383	79392	0 %	80 %	0 %	20 %	378976091
73	NC_016846	GAATG	2	10	81641	81650	40 %	20 %	40 %	0 %	378976094
74	NC_016846	GGAAA	2	10	82389	82398	60 %	0 %	40 %	0 %	378976096
75	NC_016846	GCTAC	2	10	86342	86351	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
76	NC_016846	CCTTG	2	10	86806	86815	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
77	NC_016846	ACCAT	2	10	87316	87325	40 %	20 %	0 %	40 %	378976111
78	NC_016846	CCAGT	2	10	87910	87919	20 %	20 %	20 %	40 %	378976113
79	NC_016846	AACGC	2	10	89508	89517	40 %	0 %	20 %	40 %	378976115
80	NC_016846	TTCAT	2	10	89874	89883	20 %	60 %	0 %	20 %	378976115
81	NC_016846	CCACA	2	10	90766	90775	40 %	0 %	0 %	60 %	378976115
82	NC_016846	CTGCG	2	10	91268	91277	0 %	20 %	40 %	40 %	378976116
83	NC_016846	GGAAA	2	10	92659	92668	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016846	CGGGG	2	10	93227	93236	0 %	0 %	80 %	20 %	378976119
85	NC_016846	GGTCA	2	10	96014	96023	20 %	20 %	40 %	20 %	378976124
86	NC_016846	CTGTA	2	10	96049	96058	20 %	40 %	20 %	20 %	378976124
87	NC_016846	GGAGA	2	10	96705	96714	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016846	GTGAT	2	10	97644	97653	20 %	40 %	40 %	0 %	378976128
89	NC_016846	TGCCG	2	10	98071	98080	0 %	20 %	40 %	40 %	378976128
90	NC_016846	CGCAG	2	10	98130	98139	20 %	0 %	40 %	40 %	378976128
91	NC_016846	GGCAC	2	10	98291	98300	20 %	0 %	40 %	40 %	378976129
92	NC_016846	GGCAC	2	10	98535	98544	20 %	0 %	40 %	40 %	378976129
93	NC_016846	CACGG	2	10	98553	98562	20 %	0 %	40 %	40 %	378976129
94	NC_016846	CCGGG	2	10	98602	98611	0 %	0 %	60 %	40 %	378976129
95	NC_016846	CCCCT	2	10	98686	98695	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
96	NC_016846	CCGGA	2	10	98779	98788	20 %	0 %	40 %	40 %	378976130
97	NC_016846	CACGG	2	10	100820	100829	20 %	0 %	40 %	40 %	378976133
98	NC_016846	CATCA	2	10	100844	100853	40 %	20 %	0 %	40 %	378976133
99	NC_016846	CCCGT	2	10	101115	101124	0 %	20 %	20 %	60 %	378976134
100	NC_016846	AGGCC	2	10	102370	102379	20 %	0 %	40 %	40 %	378976137
101	NC_016846	TGCCC	2	10	102850	102859	0 %	20 %	20 %	60 %	378976137
102	NC_016846	ATCGT	2	10	104061	104070	20 %	40 %	20 %	20 %	378976139
103	NC_016846	CCGAT	2	10	104308	104317	20 %	20 %	20 %	40 %	378976139
104	NC_016846	TCTCC	2	10	104975	104984	0 %	40 %	0 %	60 %	378976139
105	NC_016846	GAAAG	2	10	105896	105905	60 %	0 %	40 %	0 %	378976142
106	NC_016846	GCTGA	2	10	106941	106950	20 %	20 %	40 %	20 %	378976142
107	NC_016846	GCGGG	2	10	107001	107010	0 %	0 %	80 %	20 %	378976142
108	NC_016846	GAGCT	2	10	107460	107469	20 %	20 %	40 %	20 %	378976143
109	NC_016846	TTTTC	2	10	108138	108147	0 %	80 %	0 %	20 %	378976143

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.