MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae HS11286 plasmid pKPHS2

Total Repeats: 41

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016846	GTGG	2	8	2163	2170	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016846	TCCT	2	8	5427	5434	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_016846	TCAG	2	8	6690	6697	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_016846	ATGA	2	8	10788	10795	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016846	TAAA	2	8	11892	11899	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016846	GCGG	2	8	21479	21486	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7	NC_016846	ACCA	2	8	21495	21502	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_016846	TCAC	2	8	24624	24631	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_016846	TCGC	2	8	25207	25214	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_016846	GCAA	2	8	25441	25448	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_016846	CGTT	2	8	29611	29618	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_016846	ACTC	2	8	29691	29698	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_016846	CTGA	2	8	37028	37035	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_016846	CTGG	2	8	37703	37710	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_016846	GCCG	2	8	38194	38201	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_016846	AAGG	2	8	38210	38217	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016846	AAGT	2	8	40417	40424	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016846	GATT	2	8	42616	42623	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016846	CTTT	2	8	43793	43800	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_016846	TCTG	2	8	45130	45137	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_016846	AAAT	2	8	55174	55181	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016846	GAAT	2	8	55229	55236	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016846	CCCT	2	8	65812	65819	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
24	NC_016846	GAAT	2	8	73478	73485	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016846	TTTC	2	8	73487	73494	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_016846	ATTT	2	8	77853	77860	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016846	AAAC	2	8	78193	78200	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_016846	AATT	2	8	79136	79143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016846	CAGA	2	8	82355	82362	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_016846	CAAT	2	8	86385	86392	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_016846	CAGA	2	8	92625	92632	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_016846	GCGG	2	8	92670	92677	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
33	NC_016846	TCCT	2	8	94750	94757	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_016846	AGGG	2	8	98676	98683	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016846	CCGT	2	8	100999	101006	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_016846	GTTA	2	8	103269	103276	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016846	TGGC	2	8	105215	105222	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_016846	GCAA	2	8	109413	109420	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_016846	AGCG	2	8	109672	109679	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_016846	ACGG	2	8	109957	109964	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_016846	AAAT	2	8	110459	110466	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.