MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae HS11286 plasmid pKPHS2

Total Repeats: 238

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016846	ACCC	2	8	25	32	25 %	0 %	0 %	75 %	378975986
2	NC_016846	GCTG	2	8	1605	1612	0 %	25 %	50 %	25 %	378975989
3	NC_016846	CGGC	2	8	1670	1677	0 %	0 %	50 %	50 %	378975989
4	NC_016846	AGCC	2	8	2070	2077	25 %	0 %	25 %	50 %	378975990
5	NC_016846	CAAA	2	8	2096	2103	75 %	0 %	0 %	25 %	378975990
6	NC_016846	GACT	2	8	2360	2367	25 %	25 %	25 %	25 %	378975991
7	NC_016846	ATTC	2	8	2910	2917	25 %	50 %	0 %	25 %	378975991
8	NC_016846	CATC	2	8	3692	3699	25 %	25 %	0 %	50 %	378975993
9	NC_016846	GCCA	2	8	3848	3855	25 %	0 %	25 %	50 %	378975993
10	NC_016846	TCAT	2	8	4479	4486	25 %	50 %	0 %	25 %	378975995
11	NC_016846	CAGC	2	8	4608	4615	25 %	0 %	25 %	50 %	378975995
12	NC_016846	TGAC	2	8	4670	4677	25 %	25 %	25 %	25 %	378975995
13	NC_016846	CAGC	2	8	5063	5070	25 %	0 %	25 %	50 %	378975995
14	NC_016846	CGCC	2	8	5236	5243	0 %	0 %	25 %	75 %	378975995
15	NC_016846	GAGC	2	8	6079	6086	25 %	0 %	50 %	25 %	378975998
16	NC_016846	GGCA	2	8	7019	7026	25 %	0 %	50 %	25 %	378976000
17	NC_016846	GCGT	2	8	7401	7408	0 %	25 %	50 %	25 %	378976000
18	NC_016846	AAGG	2	8	7482	7489	50 %	0 %	50 %	0 %	378976000
19	NC_016846	TGAG	2	8	8330	8337	25 %	25 %	50 %	0 %	378976001
20	NC_016846	CCCA	2	8	8529	8536	25 %	0 %	0 %	75 %	378976001
21	NC_016846	ATTT	2	8	9244	9251	25 %	75 %	0 %	0 %	378976001
22	NC_016846	CAGT	2	8	9810	9817	25 %	25 %	25 %	25 %	378976003
23	NC_016846	GCTG	2	8	9907	9914	0 %	25 %	50 %	25 %	378976004
24	NC_016846	GACG	2	8	10034	10041	25 %	0 %	50 %	25 %	378976004
25	NC_016846	CTGG	2	8	10392	10399	0 %	25 %	50 %	25 %	378976005
26	NC_016846	GCTT	2	8	10614	10621	0 %	50 %	25 %	25 %	378976005
27	NC_016846	GCAT	2	8	11402	11409	25 %	25 %	25 %	25 %	378976006
28	NC_016846	GGTT	2	8	13287	13294	0 %	50 %	50 %	0 %	378976010
29	NC_016846	CCGC	2	8	14185	14192	0 %	0 %	25 %	75 %	378976012
30	NC_016846	GCCA	2	8	14553	14560	25 %	0 %	25 %	50 %	378976012
31	NC_016846	CGGC	2	8	14815	14822	0 %	0 %	50 %	50 %	378976012
32	NC_016846	GCCG	2	8	14879	14886	0 %	0 %	50 %	50 %	378976012
33	NC_016846	GCAG	2	8	15071	15078	25 %	0 %	50 %	25 %	378976012
34	NC_016846	CCTT	2	8	15767	15774	0 %	50 %	0 %	50 %	378976014
35	NC_016846	GTTC	2	8	15816	15823	0 %	50 %	25 %	25 %	378976014
36	NC_016846	GCCA	2	8	16173	16180	25 %	0 %	25 %	50 %	378976015
37	NC_016846	CCTG	2	8	16366	16373	0 %	25 %	25 %	50 %	378976015
38	NC_016846	GCGG	2	8	16466	16473	0 %	0 %	75 %	25 %	378976015
39	NC_016846	CAGC	2	8	16558	16565	25 %	0 %	25 %	50 %	378976015
40	NC_016846	GCTG	2	8	18062	18069	0 %	25 %	50 %	25 %	378976017
41	NC_016846	ACCG	2	8	19925	19932	25 %	0 %	25 %	50 %	378976019
42	NC_016846	GCTG	2	8	20604	20611	0 %	25 %	50 %	25 %	378976021
43	NC_016846	CAGC	2	8	20802	20809	25 %	0 %	25 %	50 %	378976021
44	NC_016846	CGGC	2	8	22515	22522	0 %	0 %	50 %	50 %	378976022
45	NC_016846	GGTT	2	8	22756	22763	0 %	50 %	50 %	0 %	378976023
46	NC_016846	TCAA	2	8	23058	23065	50 %	25 %	0 %	25 %	378976024
47	NC_016846	CGTA	2	8	24273	24280	25 %	25 %	25 %	25 %	378976027
48	NC_016846	GGGA	2	8	24708	24715	25 %	0 %	75 %	0 %	378976028
49	NC_016846	TGTT	2	8	25152	25159	0 %	75 %	25 %	0 %	378976028
50	NC_016846	CAGG	2	8	25500	25507	25 %	0 %	50 %	25 %	378976029
51	NC_016846	AGCG	2	8	26121	26128	25 %	0 %	50 %	25 %	378976030
52	NC_016846	CGGC	2	8	26130	26137	0 %	0 %	50 %	50 %	378976030
53	NC_016846	CTGC	2	8	26383	26390	0 %	25 %	25 %	50 %	378976031
54	NC_016846	ACCT	2	8	26543	26550	25 %	25 %	0 %	50 %	378976031
55	NC_016846	CCGG	2	8	27331	27338	0 %	0 %	50 %	50 %	378976031
56	NC_016846	GCCG	2	8	27433	27440	0 %	0 %	50 %	50 %	378976031
57	NC_016846	GCCG	2	8	27505	27512	0 %	0 %	50 %	50 %	378976031
58	NC_016846	CCAG	2	8	27924	27931	25 %	0 %	25 %	50 %	378976031
59	NC_016846	CGGC	2	8	28479	28486	0 %	0 %	50 %	50 %	378976031
60	NC_016846	CGTG	2	8	28642	28649	0 %	25 %	50 %	25 %	378976031
61	NC_016846	CATC	2	8	30535	30542	25 %	25 %	0 %	50 %	378976034
62	NC_016846	GATT	2	8	30833	30840	25 %	50 %	25 %	0 %	378976035
63	NC_016846	TTCT	2	8	30916	30923	0 %	75 %	0 %	25 %	378976035
64	NC_016846	TTAA	2	8	31971	31978	50 %	50 %	0 %	0 %	378976037
65	NC_016846	TATT	2	8	32571	32578	25 %	75 %	0 %	0 %	378976037
66	NC_016846	TTGC	2	8	32631	32638	0 %	50 %	25 %	25 %	378976037
67	NC_016846	CTAC	2	8	32874	32881	25 %	25 %	0 %	50 %	378976038
68	NC_016846	ATGG	2	8	33288	33295	25 %	25 %	50 %	0 %	378976038
69	NC_016846	TGGT	2	8	33430	33437	0 %	50 %	50 %	0 %	378976038
70	NC_016846	TATT	2	8	34954	34961	25 %	75 %	0 %	0 %	378976039
71	NC_016846	GAAT	2	8	35080	35087	50 %	25 %	25 %	0 %	378976039
72	NC_016846	TTTC	2	8	35119	35126	0 %	75 %	0 %	25 %	378976039
73	NC_016846	TCAT	2	8	35361	35368	25 %	50 %	0 %	25 %	378976039
74	NC_016846	GGGC	2	8	37847	37854	0 %	0 %	75 %	25 %	378976042
75	NC_016846	ACGC	2	8	38366	38373	25 %	0 %	25 %	50 %	378976044
76	NC_016846	CACG	2	8	38473	38480	25 %	0 %	25 %	50 %	378976044
77	NC_016846	TCGG	2	8	38640	38647	0 %	25 %	50 %	25 %	378976044
78	NC_016846	CTGA	2	8	38736	38743	25 %	25 %	25 %	25 %	378976044
79	NC_016846	CAGT	2	8	39784	39791	25 %	25 %	25 %	25 %	378976046
80	NC_016846	TGCC	2	8	40039	40046	0 %	25 %	25 %	50 %	378976046
81	NC_016846	TTCC	2	8	40205	40212	0 %	50 %	0 %	50 %	378976046
82	NC_016846	GGCG	2	8	40761	40768	0 %	0 %	75 %	25 %	378976047
83	NC_016846	CAGC	2	8	41078	41085	25 %	0 %	25 %	50 %	378976047
84	NC_016846	ACTT	2	8	42123	42130	25 %	50 %	0 %	25 %	378976049
85	NC_016846	TGAA	2	8	42222	42229	50 %	25 %	25 %	0 %	378976049
86	NC_016846	TGGA	2	8	42344	42351	25 %	25 %	50 %	0 %	378976049
87	NC_016846	GGCT	2	8	42394	42401	0 %	25 %	50 %	25 %	378976049
88	NC_016846	TTTC	2	8	43126	43133	0 %	75 %	0 %	25 %	378976051
89	NC_016846	GCCT	2	8	43275	43282	0 %	25 %	25 %	50 %	378976051
90	NC_016846	ACCC	2	8	43586	43593	25 %	0 %	0 %	75 %	378976051
91	NC_016846	TAAA	2	8	45024	45031	75 %	25 %	0 %	0 %	378976053
92	NC_016846	CTTT	2	8	45727	45734	0 %	75 %	0 %	25 %	378976054
93	NC_016846	TCAC	2	8	46097	46104	25 %	25 %	0 %	50 %	378976055
94	NC_016846	GGCT	2	8	46298	46305	0 %	25 %	50 %	25 %	378976055
95	NC_016846	ATTC	2	8	46462	46469	25 %	50 %	0 %	25 %	378976055
96	NC_016846	GTCA	2	8	46555	46562	25 %	25 %	25 %	25 %	378976055
97	NC_016846	CTGT	2	8	46637	46644	0 %	50 %	25 %	25 %	378976055
98	NC_016846	CCGG	2	8	46915	46922	0 %	0 %	50 %	50 %	378976056
99	NC_016846	CCGT	2	8	47363	47370	0 %	25 %	25 %	50 %	378976056
100	NC_016846	GCCC	2	8	47556	47563	0 %	0 %	25 %	75 %	378976056
101	NC_016846	CTGT	2	8	48084	48091	0 %	50 %	25 %	25 %	378976056
102	NC_016846	GTCC	2	8	48360	48367	0 %	25 %	25 %	50 %	378976056
103	NC_016846	GCGG	2	8	48955	48962	0 %	0 %	75 %	25 %	378976056
104	NC_016846	CACG	2	8	50233	50240	25 %	0 %	25 %	50 %	378976056
105	NC_016846	CGTG	2	8	50981	50988	0 %	25 %	50 %	25 %	378976056
106	NC_016846	TCTT	2	8	51630	51637	0 %	75 %	0 %	25 %	378976056
107	NC_016846	GCCA	2	8	52118	52125	25 %	0 %	25 %	50 %	378976057
108	NC_016846	GCCG	2	8	52171	52178	0 %	0 %	50 %	50 %	378976057
109	NC_016846	CTGT	2	8	52442	52449	0 %	50 %	25 %	25 %	378976057
110	NC_016846	TTTC	2	8	52716	52723	0 %	75 %	0 %	25 %	378976057
111	NC_016846	GGTC	2	8	53159	53166	0 %	25 %	50 %	25 %	378976057
112	NC_016846	GCAC	2	8	53660	53667	25 %	0 %	25 %	50 %	378976057
113	NC_016846	GCAG	2	8	54552	54559	25 %	0 %	50 %	25 %	378976058
114	NC_016846	TAAC	2	8	54948	54955	50 %	25 %	0 %	25 %	378976058
115	NC_016846	ATAA	2	8	55106	55113	75 %	25 %	0 %	0 %	378976058
116	NC_016846	CGAT	2	8	55314	55321	25 %	25 %	25 %	25 %	378976059
117	NC_016846	CCAG	2	8	55896	55903	25 %	0 %	25 %	50 %	378976059
118	NC_016846	CTTT	2	8	56849	56856	0 %	75 %	0 %	25 %	378976061
119	NC_016846	ATCC	2	8	58096	58103	25 %	25 %	0 %	50 %	378976061
120	NC_016846	TGTC	2	8	59684	59691	0 %	50 %	25 %	25 %	378976062
121	NC_016846	CAAG	2	8	59697	59704	50 %	0 %	25 %	25 %	378976062
122	NC_016846	CCAC	2	8	60494	60501	25 %	0 %	0 %	75 %	378976062
123	NC_016846	GAAG	2	8	60564	60571	50 %	0 %	50 %	0 %	378976062
124	NC_016846	TTTG	2	8	60648	60655	0 %	75 %	25 %	0 %	378976062
125	NC_016846	TGGC	2	8	60838	60845	0 %	25 %	50 %	25 %	378976062
126	NC_016846	TAAA	2	8	61195	61202	75 %	25 %	0 %	0 %	378976063
127	NC_016846	AGAT	2	8	61260	61267	50 %	25 %	25 %	0 %	378976063
128	NC_016846	CCAG	2	8	61935	61942	25 %	0 %	25 %	50 %	378976064
129	NC_016846	CTGA	2	8	62284	62291	25 %	25 %	25 %	25 %	378976066
130	NC_016846	GTCC	2	8	62389	62396	0 %	25 %	25 %	50 %	378976066
131	NC_016846	ATCG	2	8	62500	62507	25 %	25 %	25 %	25 %	378976066
132	NC_016846	CCTG	2	8	62693	62700	0 %	25 %	25 %	50 %	378976066
133	NC_016846	GGTT	2	8	63200	63207	0 %	50 %	50 %	0 %	378976067
134	NC_016846	CCTG	2	8	63224	63231	0 %	25 %	25 %	50 %	378976067
135	NC_016846	CTGT	2	8	63469	63476	0 %	50 %	25 %	25 %	378976068
136	NC_016846	CAGC	2	8	63500	63507	25 %	0 %	25 %	50 %	378976068
137	NC_016846	TTCA	2	8	63540	63547	25 %	50 %	0 %	25 %	378976068
138	NC_016846	AAAT	2	8	63731	63738	75 %	25 %	0 %	0 %	378976069
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.