MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae HS11286 plasmid pKPHS2

Total Repeats: 166

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016846	GCG	2	6	455	460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016846	CTG	2	6	465	470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_016846	TAC	2	6	497	502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_016846	TCC	2	6	503	508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_016846	TTA	2	6	593	598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016846	CGT	2	6	610	615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_016846	AGG	2	6	909	914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016846	CAT	2	6	1207	1212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_016846	TCC	2	6	3435	3440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_016846	CTG	2	6	9561	9566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_016846	CCT	2	6	9569	9574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_016846	TGA	2	6	10679	10684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016846	ATC	2	6	10759	10764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_016846	AGG	2	6	11871	11876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016846	CGG	2	6	13530	13535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_016846	GCG	2	6	13873	13878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_016846	AGG	2	6	15260	15265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016846	CCG	2	6	15880	15885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_016846	CGG	2	6	15892	15897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_016846	GGT	2	6	17917	17922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016846	ATC	2	6	17932	17937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_016846	ATA	2	6	20294	20299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016846	ATC	2	6	21449	21454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_016846	CAC	2	6	21463	21468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_016846	CGC	2	6	21469	21474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_016846	GGC	3	9	21572	21580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_016846	GCG	2	6	21626	21631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_016846	GAC	2	6	21645	21650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_016846	GCC	2	6	21665	21670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_016846	CCT	2	6	23257	23262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_016846	CTG	2	6	24501	24506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_016846	AGC	2	6	24590	24595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_016846	AAC	2	6	29321	29326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_016846	ATC	2	6	30203	30208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_016846	TTA	2	6	30212	30217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016846	TAA	2	6	30228	30233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016846	ATC	2	6	30559	30564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_016846	ATC	2	6	31506	31511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_016846	TTA	2	6	31558	31563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016846	ACA	2	6	31620	31625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_016846	TGA	3	9	31779	31787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016846	GGT	2	6	31808	31813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016846	TTA	2	6	36985	36990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016846	CTG	2	6	37061	37066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_016846	GAA	2	6	37280	37285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016846	ACG	2	6	37333	37338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_016846	GCG	2	6	37365	37370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_016846	GCT	2	6	37588	37593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_016846	GAA	2	6	37608	37613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016846	AGT	2	6	37615	37620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016846	ACA	2	6	37622	37627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_016846	CAT	2	6	37630	37635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_016846	TGT	2	6	37645	37650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016846	GCG	3	9	37670	37678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_016846	GTG	2	6	37686	37691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016846	ATG	2	6	37729	37734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016846	GAA	2	6	39230	39235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016846	TCA	2	6	39277	39282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_016846	GCA	2	6	39334	39339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_016846	TAC	2	6	39674	39679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_016846	TGG	2	6	40257	40262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016846	ATA	2	6	41570	41575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016846	AAT	2	6	41700	41705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016846	ACG	2	6	42797	42802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_016846	GTC	2	6	43817	43822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_016846	ATG	2	6	45149	45154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016846	TAA	2	6	45899	45904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016846	CTA	2	6	45908	45913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_016846	GAA	2	6	54324	54329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016846	CCG	2	6	55142	55147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_016846	GGC	2	6	55150	55155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_016846	ATT	2	6	55219	55224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016846	AAT	2	6	56153	56158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016846	ACC	2	6	56188	56193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_016846	GCA	2	6	63841	63846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_016846	TAA	2	6	71640	71645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016846	AAG	2	6	71651	71656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016846	ATT	2	6	72078	72083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016846	TCT	2	6	72133	72138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_016846	TGC	2	6	72867	72872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_016846	ATG	2	6	77903	77908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016846	TAA	2	6	78162	78167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016846	GGA	2	6	78178	78183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016846	ATT	2	6	78221	78226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016846	CCT	2	6	78978	78983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_016846	CAA	2	6	79042	79047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_016846	ATT	2	6	79115	79120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016846	CTG	2	6	79130	79135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_016846	ACC	2	6	79148	79153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_016846	TTA	2	6	79590	79595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016846	CTT	2	6	79621	79626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_016846	CGA	2	6	79761	79766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_016846	TAC	2	6	79769	79774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_016846	GAG	2	6	79904	79909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016846	AAG	2	6	80480	80485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016846	ATT	2	6	81681	81686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016846	CTG	2	6	81762	81767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_016846	CGG	2	6	82200	82205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_016846	CGA	2	6	82244	82249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_016846	CAG	2	6	82333	82338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_016846	GAA	2	6	82342	82347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016846	CAG	2	6	82363	82368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_016846	GCA	2	6	82369	82374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_016846	CGC	2	6	83772	83777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_016846	CGC	2	6	84289	84294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_016846	CAG	2	6	84319	84324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_016846	GAT	2	6	84367	84372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016846	CGG	2	6	84623	84628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_016846	CGG	2	6	84633	84638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_016846	AGC	2	6	84645	84650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_016846	CGA	2	6	84671	84676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_016846	TAA	2	6	84899	84904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016846	TTA	2	6	84942	84947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016846	CAT	2	6	86591	86596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_016846	CTT	2	6	86798	86803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_016846	TGT	2	6	86839	86844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016846	ACC	2	6	86925	86930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_016846	TGC	2	6	87016	87021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_016846	CGC	2	6	88947	88952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_016846	GCG	2	6	88961	88966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_016846	TGA	2	6	91054	91059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016846	CTT	3	9	91089	91097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_016846	GTT	2	6	91961	91966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016846	CTG	2	6	92030	92035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_016846	GCC	2	6	92440	92445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_016846	CGG	2	6	92470	92475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_016846	CGA	2	6	92514	92519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_016846	CAG	2	6	92603	92608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_016846	GAA	2	6	92612	92617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016846	CAG	2	6	92633	92638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_016846	GCA	2	6	92639	92644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_016846	CCG	2	6	92755	92760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_016846	GCC	2	6	94764	94769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_016846	GGC	2	6	94778	94783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_016846	GCC	2	6	95827	95832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_016846	CGG	2	6	95857	95862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_016846	CGA	2	6	95901	95906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_016846	AGC	3	9	95990	95998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_016846	TCC	2	6	96348	96353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_016846	ATA	2	6	96668	96673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016846	GCG	2	6	96719	96724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_016846	GCG	2	6	96733	96738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_016846	CGG	2	6	97026	97031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_016846	CCG	2	6	97038	97043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_016846	CAC	2	6	98646	98651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_016846	CCT	2	6	98653	98658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_016846	CGC	2	6	99506	99511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_016846	CTG	2	6	99525	99530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_016846	GCA	2	6	100884	100889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_016846	AGG	2	6	100910	100915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
151	NC_016846	ACG	2	6	101249	101254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_016846	CCA	2	6	101277	101282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
153	NC_016846	AAC	2	6	101300	101305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_016846	GTA	2	6	101587	101592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_016846	CCG	2	6	105110	105115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
157	NC_016846	ATG	2	6	105147	105152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_016846	CGC	2	6	109648	109653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
163	NC_016846	AAG	2	6	109736	109741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
164	NC_016846	GGC	2	6	109852	109857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_016846	GGC	2	6	109924	109929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
166	NC_016846	CAA	2	6	110437	110442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.