MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae HS11286 plasmid pKPHS2

Total Repeats: 164

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016846	GC	4	8	1786	1793	0 %	0 %	50 %	50 %	378975989
2	NC_016846	CG	3	6	3639	3644	0 %	0 %	50 %	50 %	378975993
3	NC_016846	GC	3	6	5227	5232	0 %	0 %	50 %	50 %	378975995
4	NC_016846	GC	3	6	5782	5787	0 %	0 %	50 %	50 %	378975997
5	NC_016846	AG	3	6	5841	5846	50 %	0 %	50 %	0 %	378975997
6	NC_016846	CA	4	8	7651	7658	50 %	0 %	0 %	50 %	378976000
7	NC_016846	TG	3	6	8121	8126	0 %	50 %	50 %	0 %	378976000
8	NC_016846	AG	3	6	8273	8278	50 %	0 %	50 %	0 %	378976000
9	NC_016846	CG	3	6	8734	8739	0 %	0 %	50 %	50 %	378976001
10	NC_016846	GC	3	6	9232	9237	0 %	0 %	50 %	50 %	378976001
11	NC_016846	AC	3	6	9697	9702	50 %	0 %	0 %	50 %	378976003
12	NC_016846	GC	3	6	10524	10529	0 %	0 %	50 %	50 %	378976005
13	NC_016846	GC	3	6	12025	12030	0 %	0 %	50 %	50 %	378976007
14	NC_016846	GC	3	6	12671	12676	0 %	0 %	50 %	50 %	378976008
15	NC_016846	GC	3	6	13120	13125	0 %	0 %	50 %	50 %	378976010
16	NC_016846	TG	3	6	13977	13982	0 %	50 %	50 %	0 %	378976012
17	NC_016846	AC	3	6	14543	14548	50 %	0 %	0 %	50 %	378976012
18	NC_016846	GC	3	6	14624	14629	0 %	0 %	50 %	50 %	378976012
19	NC_016846	CG	3	6	14655	14660	0 %	0 %	50 %	50 %	378976012
20	NC_016846	AC	3	6	14665	14670	50 %	0 %	0 %	50 %	378976012
21	NC_016846	CG	4	8	14992	14999	0 %	0 %	50 %	50 %	378976012
22	NC_016846	CG	3	6	15016	15021	0 %	0 %	50 %	50 %	378976012
23	NC_016846	GC	3	6	15430	15435	0 %	0 %	50 %	50 %	378976013
24	NC_016846	CG	3	6	15557	15562	0 %	0 %	50 %	50 %	378976013
25	NC_016846	GC	3	6	15843	15848	0 %	0 %	50 %	50 %	378976014
26	NC_016846	GC	3	6	15918	15923	0 %	0 %	50 %	50 %	378976015
27	NC_016846	GC	3	6	16316	16321	0 %	0 %	50 %	50 %	378976015
28	NC_016846	GC	3	6	16715	16720	0 %	0 %	50 %	50 %	378976016
29	NC_016846	GC	3	6	17045	17050	0 %	0 %	50 %	50 %	378976016
30	NC_016846	CG	3	6	17749	17754	0 %	0 %	50 %	50 %	378976016
31	NC_016846	TC	3	6	18275	18280	0 %	50 %	0 %	50 %	378976017
32	NC_016846	CG	3	6	18393	18398	0 %	0 %	50 %	50 %	378976017
33	NC_016846	CG	3	6	19566	19571	0 %	0 %	50 %	50 %	378976019
34	NC_016846	CA	3	6	19969	19974	50 %	0 %	0 %	50 %	378976019
35	NC_016846	CG	3	6	20174	20179	0 %	0 %	50 %	50 %	378976019
36	NC_016846	TC	3	6	20592	20597	0 %	50 %	0 %	50 %	378976021
37	NC_016846	GT	3	6	20690	20695	0 %	50 %	50 %	0 %	378976021
38	NC_016846	AC	3	6	20828	20833	50 %	0 %	0 %	50 %	378976021
39	NC_016846	GC	3	6	21082	21087	0 %	0 %	50 %	50 %	378976021
40	NC_016846	GC	3	6	21102	21107	0 %	0 %	50 %	50 %	378976021
41	NC_016846	CG	3	6	21217	21222	0 %	0 %	50 %	50 %	378976021
42	NC_016846	GC	3	6	21315	21320	0 %	0 %	50 %	50 %	378976021
43	NC_016846	GC	3	6	22354	22359	0 %	0 %	50 %	50 %	378976022
44	NC_016846	GC	3	6	22366	22371	0 %	0 %	50 %	50 %	378976022
45	NC_016846	AG	3	6	22588	22593	50 %	0 %	50 %	0 %	378976022
46	NC_016846	CT	3	6	22807	22812	0 %	50 %	0 %	50 %	378976023
47	NC_016846	TG	3	6	23400	23405	0 %	50 %	50 %	0 %	378976025
48	NC_016846	TG	3	6	24101	24106	0 %	50 %	50 %	0 %	378976026
49	NC_016846	GC	3	6	24199	24204	0 %	0 %	50 %	50 %	378976027
50	NC_016846	CT	3	6	24886	24891	0 %	50 %	0 %	50 %	378976028
51	NC_016846	GA	3	6	25166	25171	50 %	0 %	50 %	0 %	378976028
52	NC_016846	GC	3	6	26008	26013	0 %	0 %	50 %	50 %	378976030
53	NC_016846	GC	3	6	27424	27429	0 %	0 %	50 %	50 %	378976031
54	NC_016846	CG	3	6	28271	28276	0 %	0 %	50 %	50 %	378976031
55	NC_016846	GC	3	6	28868	28873	0 %	0 %	50 %	50 %	378976031
56	NC_016846	AG	3	6	29991	29996	50 %	0 %	50 %	0 %	378976033
57	NC_016846	AC	3	6	30004	30009	50 %	0 %	0 %	50 %	378976033
58	NC_016846	TA	3	6	30445	30450	50 %	50 %	0 %	0 %	378976034
59	NC_016846	TC	3	6	31305	31310	0 %	50 %	0 %	50 %	378976036
60	NC_016846	CA	3	6	31442	31447	50 %	0 %	0 %	50 %	378976036
61	NC_016846	AT	3	6	31925	31930	50 %	50 %	0 %	0 %	378976037
62	NC_016846	AT	4	8	32048	32055	50 %	50 %	0 %	0 %	378976037
63	NC_016846	TC	3	6	32666	32671	0 %	50 %	0 %	50 %	378976037
64	NC_016846	TA	3	6	33857	33862	50 %	50 %	0 %	0 %	378976038
65	NC_016846	TA	3	6	33935	33940	50 %	50 %	0 %	0 %	378976038
66	NC_016846	AT	3	6	34514	34519	50 %	50 %	0 %	0 %	378976038
67	NC_016846	AT	3	6	34903	34908	50 %	50 %	0 %	0 %	378976039
68	NC_016846	TG	3	6	35261	35266	0 %	50 %	50 %	0 %	378976039
69	NC_016846	AT	3	6	35437	35442	50 %	50 %	0 %	0 %	378976039
70	NC_016846	AT	3	6	35477	35482	50 %	50 %	0 %	0 %	378976039
71	NC_016846	TA	3	6	36279	36284	50 %	50 %	0 %	0 %	378976040
72	NC_016846	CT	4	8	37801	37808	0 %	50 %	0 %	50 %	378976042
73	NC_016846	CG	3	6	38260	38265	0 %	0 %	50 %	50 %	378976044
74	NC_016846	CG	3	6	38574	38579	0 %	0 %	50 %	50 %	378976044
75	NC_016846	GC	3	6	40109	40114	0 %	0 %	50 %	50 %	378976046
76	NC_016846	GC	3	6	40748	40753	0 %	0 %	50 %	50 %	378976047
77	NC_016846	GA	3	6	40867	40872	50 %	0 %	50 %	0 %	378976047
78	NC_016846	GA	3	6	43465	43470	50 %	0 %	50 %	0 %	378976051
79	NC_016846	GT	3	6	43576	43581	0 %	50 %	50 %	0 %	378976051
80	NC_016846	CG	3	6	43884	43889	0 %	0 %	50 %	50 %	378976052
81	NC_016846	GC	3	6	44408	44413	0 %	0 %	50 %	50 %	378976052
82	NC_016846	AT	3	6	44967	44972	50 %	50 %	0 %	0 %	378976053
83	NC_016846	GC	3	6	45683	45688	0 %	0 %	50 %	50 %	378976054
84	NC_016846	TG	3	6	46657	46662	0 %	50 %	50 %	0 %	378976055
85	NC_016846	GC	3	6	48887	48892	0 %	0 %	50 %	50 %	378976056
86	NC_016846	GC	3	6	49544	49549	0 %	0 %	50 %	50 %	378976056
87	NC_016846	GT	3	6	49828	49833	0 %	50 %	50 %	0 %	378976056
88	NC_016846	AC	3	6	50950	50955	50 %	0 %	0 %	50 %	378976056
89	NC_016846	GA	3	6	51401	51406	50 %	0 %	50 %	0 %	378976056
90	NC_016846	TG	5	10	51535	51544	0 %	50 %	50 %	0 %	378976056
91	NC_016846	GC	3	6	51561	51566	0 %	0 %	50 %	50 %	378976056
92	NC_016846	CG	3	6	51686	51691	0 %	0 %	50 %	50 %	378976056
93	NC_016846	GC	3	6	53339	53344	0 %	0 %	50 %	50 %	378976057
94	NC_016846	AG	3	6	54758	54763	50 %	0 %	50 %	0 %	378976058
95	NC_016846	CA	3	6	54799	54804	50 %	0 %	0 %	50 %	378976058
96	NC_016846	AG	3	6	54987	54992	50 %	0 %	50 %	0 %	378976058
97	NC_016846	CT	3	6	57339	57344	0 %	50 %	0 %	50 %	378976061
98	NC_016846	GC	3	6	57973	57978	0 %	0 %	50 %	50 %	378976061
99	NC_016846	AG	3	6	58418	58423	50 %	0 %	50 %	0 %	378976061
100	NC_016846	CA	3	6	59108	59113	50 %	0 %	0 %	50 %	378976061
101	NC_016846	AT	3	6	59588	59593	50 %	50 %	0 %	0 %	378976061
102	NC_016846	TA	3	6	61388	61393	50 %	50 %	0 %	0 %	378976063
103	NC_016846	AG	3	6	63481	63486	50 %	0 %	50 %	0 %	378976068
104	NC_016846	AT	3	6	63574	63579	50 %	50 %	0 %	0 %	378976068
105	NC_016846	TG	3	6	65271	65276	0 %	50 %	50 %	0 %	378976070
106	NC_016846	AG	3	6	65556	65561	50 %	0 %	50 %	0 %	378976070
107	NC_016846	TA	3	6	66047	66052	50 %	50 %	0 %	0 %	378976071
108	NC_016846	CA	3	6	67396	67401	50 %	0 %	0 %	50 %	378976072
109	NC_016846	CT	4	8	67775	67782	0 %	50 %	0 %	50 %	378976073
110	NC_016846	GC	3	6	68632	68637	0 %	0 %	50 %	50 %	378976075
111	NC_016846	AG	3	6	68729	68734	50 %	0 %	50 %	0 %	378976075
112	NC_016846	GA	3	6	68853	68858	50 %	0 %	50 %	0 %	378976075
113	NC_016846	AG	3	6	68922	68927	50 %	0 %	50 %	0 %	378976075
114	NC_016846	GC	3	6	69082	69087	0 %	0 %	50 %	50 %	378976076
115	NC_016846	CG	3	6	69425	69430	0 %	0 %	50 %	50 %	378976076
116	NC_016846	AG	3	6	69590	69595	50 %	0 %	50 %	0 %	378976076
117	NC_016846	CA	3	6	70026	70031	50 %	0 %	0 %	50 %	378976076
118	NC_016846	AG	3	6	70454	70459	50 %	0 %	50 %	0 %	378976076
119	NC_016846	AC	3	6	70886	70891	50 %	0 %	0 %	50 %	378976076
120	NC_016846	AC	3	6	71899	71904	50 %	0 %	0 %	50 %	378976077
121	NC_016846	TA	3	6	72465	72470	50 %	50 %	0 %	0 %	378976079
122	NC_016846	TA	3	6	72835	72840	50 %	50 %	0 %	0 %	378976079
123	NC_016846	GA	3	6	73600	73605	50 %	0 %	50 %	0 %	378976082
124	NC_016846	AT	3	6	74015	74020	50 %	50 %	0 %	0 %	378976083
125	NC_016846	TC	4	8	74070	74077	0 %	50 %	0 %	50 %	378976083
126	NC_016846	GA	3	6	74463	74468	50 %	0 %	50 %	0 %	378976084
127	NC_016846	AT	3	6	75812	75817	50 %	50 %	0 %	0 %	378976084
128	NC_016846	GC	3	6	76063	76068	0 %	0 %	50 %	50 %	378976085
129	NC_016846	AT	3	6	78518	78523	50 %	50 %	0 %	0 %	378976090
130	NC_016846	GA	3	6	78749	78754	50 %	0 %	50 %	0 %	378976090
131	NC_016846	CA	3	6	78966	78971	50 %	0 %	0 %	50 %	378976090
132	NC_016846	AG	3	6	79287	79292	50 %	0 %	50 %	0 %	378976091
133	NC_016846	CA	3	6	81295	81300	50 %	0 %	0 %	50 %	378976094
134	NC_016846	GC	3	6	82443	82448	0 %	0 %	50 %	50 %	378976096
135	NC_016846	GC	3	6	83844	83849	0 %	0 %	50 %	50 %	378976101
136	NC_016846	TG	3	6	84140	84145	0 %	50 %	50 %	0 %	378976101
137	NC_016846	AT	3	6	87115	87120	50 %	50 %	0 %	0 %	378976111
138	NC_016846	GA	3	6	89212	89217	50 %	0 %	50 %	0 %	378976115
139	NC_016846	TG	3	6	89230	89235	0 %	50 %	50 %	0 %	378976115
140	NC_016846	AC	3	6	89560	89565	50 %	0 %	0 %	50 %	378976115
141	NC_016846	TC	3	6	91798	91803	0 %	50 %	0 %	50 %	378976117
142	NC_016846	GC	3	6	93279	93284	0 %	0 %	50 %	50 %	378976119
143	NC_016846	GT	3	6	93481	93486	0 %	50 %	50 %	0 %	378976120
144	NC_016846	CG	3	6	93847	93852	0 %	0 %	50 %	50 %	378976120
145	NC_016846	GA	3	6	93982	93987	50 %	0 %	50 %	0 %	378976120
146	NC_016846	AG	3	6	94232	94237	50 %	0 %	50 %	0 %	378976120
147	NC_016846	GC	4	8	94242	94249	0 %	0 %	50 %	50 %	378976120
148	NC_016846	GC	3	6	94265	94270	0 %	0 %	50 %	50 %	378976120
149	NC_016846	GC	4	8	94324	94331	0 %	0 %	50 %	50 %	378976120
150	NC_016846	GC	3	6	94460	94465	0 %	0 %	50 %	50 %	378976120
151	NC_016846	GC	3	6	94952	94957	0 %	0 %	50 %	50 %	378976121
152	NC_016846	GC	3	6	96422	96427	0 %	0 %	50 %	50 %	378976125
153	NC_016846	CG	3	6	97107	97112	0 %	0 %	50 %	50 %	378976127
154	NC_016846	TC	3	6	98336	98341	0 %	50 %	0 %	50 %	378976129
155	NC_016846	CT	3	6	98737	98742	0 %	50 %	0 %	50 %	378976130
156	NC_016846	GA	3	6	99334	99339	50 %	0 %	50 %	0 %	378976130
157	NC_016846	GC	3	6	102627	102632	0 %	0 %	50 %	50 %	378976137
158	NC_016846	AC	3	6	102657	102662	50 %	0 %	0 %	50 %	378976137
159	NC_016846	GT	3	6	103677	103682	0 %	50 %	50 %	0 %	378976139
160	NC_016846	TG	3	6	104870	104875	0 %	50 %	50 %	0 %	378976139
161	NC_016846	GC	3	6	106071	106076	0 %	0 %	50 %	50 %	378976142
162	NC_016846	CG	3	6	107299	107304	0 %	0 %	50 %	50 %	378976143
163	NC_016846	TG	3	6	110654	110659	0 %	50 %	50 %	0 %	378976145
164	NC_016846	AG	3	6	110745	110750	50 %	0 %	50 %	0 %	378976145

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.